Characterization of Associated Nonclassical Phenotypes in Patients with Deletion in the WAGR Region Identified by Chromosomal Microarray: New Insights and Literature Review.

WAGR syndrome (Wilms' tumor, aniridia, genitourinary changes, and intellectual disability) is a contiguous gene deletion syndrome characterized by the joint deletion of PAX6 and WT1 genes, located in the short arm of chromosome 11. However, most deletions include other genes, leading to multiple associated phenotypes. Therefore, understanding how genes deleted together can contribute to other clinical phenotypes is still considered a challenge. In order to establish genotype-phenotype correlation in patients with interstitial deletions of the short arm of chromosome 11, we selected 17 patients with deletions identified by chromosomal microarray analysis: 4 new subjects and 13 subjects previously described in the literature with detailed clinical data. Through the analysis of deleted regions and the phenotypic changes, it was possible to suggest the contribution of specific genes to several nonclassical phenotypes, contributing to the accuracy of clinical characterization of the syndrome and emphasizing the broad phenotypic spectrum found in the patients. This study reports the first patient with a PAX6 partial deletion who does not present any eye anomaly thus opening a new set of questions about the functional activity of PAX6.

Expanding the spectrum of TBL1XR1 deletion: Report of a patient with brain and cardiac malformations.

The TBL1XR1 gene product is a nuclear protein ubiquitously produced. The protein is a component of SMRT/N-CoR co-repressor complexes and participates in the molecular switch of specific gene transcription. Deletions of the TBL1XR1 gene have been described in two families to date, both presenting intellectual disability and dysmorphisms. Rare recurrent chromosomal micro-rearrangements, particularly those involving single genes, represent a challenge for clinicians to ensure correlation with phenotype due to the paucity of previously described cases. Here we present a patient harbouring a TBL1XR1 gene deletion detected by chromosome microarray analysis. In addition to intellectual disability, the patient presents dysmorphic features and multiple cardiac malformations, together with brain malformation, thus contributing to the phenotypic characterization of this rare microdeletion and to the TBL1XR1 gene function.

Resistência do vírus da imunodeficiência humana tipo 1 aos inibidores de protease em amostragem do Laboratório Central de Saúde Pública do Distrito Federal no ano de 2002 / Resistance of the human immunodeficincy virus type 1 to protease inhibitors in samples from Laboratório Central de Saúde Pública do Distrito Federal from 2002

A pandemia da AIDS é um dos maiores problemas de saúdepública no mundo e a resistência aos anti-retrovirais, um dos principais obstáculos para o tratamento efetivo da infecção pelo vírus da imunodeficiência humana tipo 1 (HIV-1). Os estudos sobre a análise da resistência a esses medicamentos são particularmente importantes parao manejo clínico de indivíduos infectados pelo HIV-1. O HIV codifica uma protease que é essencial para a maturação das partículas virais e, por isso, essa proteína é alvo de abordagens terapêuticas utilizandoseos inibidores de protease. Entretanto, muitas mutações no gene da protease do HIV-1 têm sido associadas à resistência aos anti-retrovirais,conduzindo à falhas do tratamento. Objetivo: Descrever as mutações no gene da protease e os perfis de resistência genotípica em indivíduos infectados pelo HIV-1 provenientes do Distrito Federal e Entorno. Método: O gene da protease de 28 isolados de indivíduos infectados por HIV-1 foi amplificado por nested PCR e seqüenciado. As seqüênciasforam analisadas utilizando-se o programa HIVdb para determinação da susceptibilidade às drogas. Resultados: A mutação primária I50V foi a mais prevalente, ocorrendoem 28.57 por cento das amostras. Esta mutação está associada ao medicamento Amprenavir, que apresentou um alto nível de resistência.Conclusão: Esses resultados estão de acordo com uma descrição previamente realizada sobre a resistência aos inibidores de protease no Distrito Federal, e devem ser aprofundados para auxiliar no tratamento de indivíduos infectados pelo HIV-1. Palavras-chave: AIDS, HIV-1, inibidores de proteases.

HIV-1 subtypes and mutations associated to antiretroviral drug resistance in human isolates from Central Brazil

A detecção de polimorfismos do HIV-1 que estejam associados à resistência às drogas anti-retrovirais e aos subtipos genéticos é importante para o controle e tratamento da infecção pelo HIV-1. A pressão exercida pela terapia anti-retroviral seleciona variantes resistentes com mutações nos genes virais da transcriptase reversa (RT) e da protease (PR). Assim, visando contribuir com as autoridades de saúde pública na perspectiva de planejar a disponibilidade de um tratamento terapêutico, nós descrevemos a variabilidade genética e a prevalência de mutações associadas à resistência aos anti-retrovirais em isolados do HIV-1 de indivíduos infectados no Distrito Federal. Dezenove amostras de RNA do HIV-1 provenientes de um laboratório de Saúde Pública do Distrito Federal foram transcritas reversamente e os cDNAs obtidos foram amplificados por nested PCR. Um fragmento de 297 pb correspondente ao gene completo da protease e outro de 647 pb, correspondente à parte do gene da transcriptase reversa (códons 19 a 234), foram obtidos. O seqüenciamento automático e análise de homologia revelaram a presença de 17 subtipos B e 2 subtipos F1 do HIV-1. As seqüências de aminoácidos foram analisadas com relação à presença de mutações associadas à resistência. Um total de 6 mutações na PR, 2 primárias e 4 secundárias e 8 mutações relacionadas à resistência na RT foram encontradas. Nossos dados sugerem uma elevada prevalência do subtipo B do HIV-1 na população estudada do Distrito Federal, assim como a presença de variantes virais geneticamente resistentes em indivíduos que não respondem ao tratamento.