Molecular evolution and phylogenetic analysis of SARS-CoV-2 and hosts ACE2 protein suggest Malayan pangolin as intermediary host.

An emergence of a novel coronavirus, causative agent of COVID19, named as severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), occurred due to cross-species transmission. Coronaviruses are a large family of viruses able to infect a great number of hosts. Entrance of SARS-CoV-2 depends on the surface (S) protein interaction with host ACE2 protein and cleavage by TMPRSS2. ACE2 could be a species-specific barrier that interferes with bat-to-human coronavirus cross-species transmission. Molecular analysis supported bats as natural hosts for SARS-CoV and involved them in MERS-CoV origin. The genomic similarity between bat RaTG13 CoV strain and SARS-CoV-2 implicates bats in the origin of the new outbreak. Additionally, there is a hypothesis for the zoonotic transmission based on contact with Malayan pangolins by humans in Huanan seafood market in Wuhan, China. To investigate bats and pangolin as hosts in SARS-CoV-2 cross-species transmission, we perform an evolutionary analysis combining viral and host phylogenies and divergence of ACE2 and TMPRSS2 amino acid sequences between CoV hosts. Phylogeny showed SARS-like-CoV-2 strains that infected pangolin and bats are close to SARS-CoV-2. In contrast to TMPRSS2, pangolin ACE2 amino acid sequence has low evolutionary divergence compared with humans and is more divergent from bats. Comparing SARS-CoV with SARS-CoV-2 origins, pangolin has yet lower ACE2 evolutionary divergence with humans than civet-the main intermediary host of SARS-CoV. Thus, pangolin has become an opportune host to intermediates bat-to-human SARS-CoV-2 jump and entry.

A bioinformática na pesquisa odontológica brasileira / The bioinformatics in the Brazilian oral research / La bioinformática en la investigación odontológica brasileña

Objetivo: Avaliar o papel da bioinformática na pesquisa odontológica brasileira. Métodos: Foram analisados os resumos das reuniões da Sociedade Brasileira de Pesquisa Odontológica (SBPqO), de 2005 a 2011. As palavras-chave bioinformática, genbank, seqüenciamento/seqüenciada(o), PCR em tempo real, microarranjo e projeto genoma foram pesquisadas em português e inglês. Os dados foram tabulados de acordo com a instituição pesquisadora (publica ou privada e sua localização no país) e com a categoria de apresentação (estudante de graduação ou profissional graduado). Resultado: Verificou-se que o número de resumos com as palavras-chave aumentou de 2005 para 2011; entretanto, a maioria foi realizada por instituições públicas, no sudeste do Brasil e por graduados. Conclusão: A quantidade de pesquisas odontológicas usando bioinformática está crescendo, porém, ainda será necessário que esta tecnologia alcance todas as regiões do país e todos os níveis de estudantes, integrando também os graduandos com as ferramentas de bioinformática.

Objective: To verify the role of bioinformatics in the Brazilian oral research. Methods: The abstracts of Brazilian Oral Research Society (SBPqO) meetings were investigated, from 2005 to 2011. The key-words:bioinformatics, genbank, sequencing/sequence, real time PCR, microarray and genome project were searched in English and Portuguese languages. The data were tabulated according to the research institution(private or public and country location) and to the category of the speaker (graduating student or professional). Results: It could be seen that the number of abstracts with the key-words increased from 2005 to 2011; however, the majority was performed in public institutions, in Brazilian southeast and by graduated speakers. Conclusion: The amount of Brazilian oral researches using bioinformatics is increasing; however, it is necessary that this technology reach all the regions of the country and also all the degrees of students, integrating the graduate learners to bioinformatics tools.

Objetivo: Evaluar el papel de la bioinformática en la investigación odontológica brasileña. Métodos: Analizaron los resúmenes de las reuniones de la Sociedad Brasileña para la Investigación Odontológica (SBPqO), de 2005 a 2011. Los descriptores: bioinformática, GenBank, secuencia / secuenciada (o), PCR en tiempo real, microarray y proyecto genoma fueron buscados en Inglés y Portugués. Los datos fueron tabulados de acuerdo con la institución de investigación (públicos o privados y su ubicación en el país) y la categoría de presentación (estudiante graduado o título profesional). Resultados: Se encontró que el número de resúmenes con palabras clave se incrementó de 2005 a 2011, sin embargo, la mayoría estaba en manos de las instituciones públicas, en el sureste de Brasil y graduados. Conclusión: La cantidad de investigación odontológica utilizando la bioinformática está creciendo, todavía necesitan esta tecnología llegue a todos las regiones del país y todos los niveles de estudiantes, graduados también la integración con las herramientas de la bioinformática.

Canine distemper virus: detection of viral RNA by Nested RT-PCR in dogs with clinical diagnosis / Vírus da cinomose canina: detecção do RNA viral pelo Nested RT-PCR em cães com diagnóstico clínico

Canine distemper virus (CDV) is a pathogen which affects dogs and causes severe disease leading to death. Dogs infected with CDV can be diagnosed by RNA detection by Nested PCR technique. The following study proposed to evaluate CDV RNA in blood, urine and saliva samples. The Nested-PCR technique was able to detect CDV RNA in different types of biologic samples. The higher number of positive results was obtained in urine samples.

vírus da cinomose canina (CDV) é um patógeno que afeta cães, causando doença grave e que pode levar a morte. Os cães infectados pelo CDV podem ser diagnosticados pela detecção do RNA utilizando-se a técnica de Nested-PCR. O presente estudo teve como objetivo avaliar o RNA do CDV no sangue, urina e saliva em cães com diagnóstico clínico de cinomose. A técnica de Nested-PCR foi capaz de detectar o RNA em diferentes tipos de amostras biológicas. Obteve-se um maior número de resultados positivos em amostras de urina.

Canine distemper virus: detection of viral RNA by Nested RT-PCR in dogs with clinical diagnosis / Vírus da cinomose canina: detecção do RNA viral pelo Nested RT-PCR em cães com diagnóstico clínico

Canine distemper virus (CDV) is a pathogen which affects dogs and causes severe disease leading to death. Dogs infected with CDV can be diagnosed by RNA detection by Nested PCR technique. The following study proposed to evaluate CDV RNA in blood, urine and saliva samples. The Nested-PCR technique was able to detect CDV RNA in different types of biologic samples. The higher number of positive results was obtained in urine samples.(AU)

vírus da cinomose canina (CDV) é um patógeno que afeta cães, causando doença grave e que pode levar a morte. Os cães infectados pelo CDV podem ser diagnosticados pela detecção do RNA utilizando-se a técnica de Nested-PCR. O presente estudo teve como objetivo avaliar o RNA do CDV no sangue, urina e saliva em cães com diagnóstico clínico de cinomose. A técnica de Nested-PCR foi capaz de detectar o RNA em diferentes tipos de amostras biológicas. Obteve-se um maior número de resultados positivos em amostras de urina.(AU)

Sistemas de Informação para Gestão Hospitalar / Management Information Systems for Hospital / Sistemas de Gestión de la Información para Hospitalaria

A Tecnologia da Informação e seus sistemas informatizados são essenciais na área da saúde. Esses sistemas auxiliam não só nos diagnósticos médicos, mas na competitividade empresarial em saúde e na melhoria do atendimento em um serviço de necessidade básica. Porém, eles precisam garantir a integridade das informações mantidas e fornecidas por eles, a fim de evitar consequências graves, como processos judiciais ou indução ao erro médico. O objetivo deste artigo é apresentar uma visão que incentive a busca pela excelência em sistemas de gestão hospitalar em todos os níveis, do operacional ao estratégico. A metodologia utilizada foi composta por diversas pesquisas bibliográficas referentes ao tema, constituídas de livros, revistas técnicas, artigos de periódicos e materiais disponibilizados na Internet.

Information Technology and its information systems are essential for health. These systems help not only in medical diagnosis, but on business competitiveness and improving health care service in a basic necessity. However, they need to ensure the integrity of information maintained and provided by them, in order to avoid serious consequences such as lawsuits or inducement to medical error. The aim of this paper is to present a vision that encourages the pursuit of excellence in management systems in hospital at all levels, from operational to strategic. The methodology consists of several literature searches on the subject, consisting of books, journals, papers and materials available on the Internet.

Tecnología de la información y sus sistemas de información son esenciales para la salud. Estos sistemas ayudan no sólo en el diagnóstico médico, sino en la competitividad empresarial y mejorar el servicio de salud en una necesidad básica. Sin embargo, es necesario para asegurar la integridad de la información mantenida y siempre por ellos, con el fin de evitar consecuencias graves, tales como demandas o inducción a error médico. El objetivo de este trabajo es presentar una visión que alienta la búsqueda de la excelencia en los sistemas de gestión en el hospital en todos los niveles, desde el operativo a estratégico. La metodología consta de varias búsquedas en la literatura sobre el tema, que consisten en libros, artículos de revistas y materiales disponibles en Internet.

A importância da engenharia da usabilidade para a segurança de sistemas informatizados em saúde / The importance of usability engineering for the security of information systems in health / La importancia de la Ingeniería de la Usabilidad para la Seguridad de los Sistemas de Información en Salud

Objetivos: É salientar a contribuição da engenharia da usabilidade para a segurança de um sistema informatizado em saúde. Métodos: Pesquisa constituída de livros, artigos e materiais disponibilizados na Internet. São poucas as pesquisas em desenvolvimento de sistemas seguros e menos ainda, focados à engenharia da usabilidade, a qual é comumente vista como aliada apenas à engenharia de software. É preciso mudar esta visão. Resultados: São apresentados exemplos de falhas de segurança por falta de usabilidade, assim como tópicos da usabilidade relacionados à segurança da informação. Conclusão: Esse artigo contribui para o desenvolvimento e a operação de um sistema de informação em saúde funcional e seguro.

Objectives: Of this paper is to highlight the contribution of usability engineering for the security of a system computerized in health. Methods: Was used, consisting of books, articles and materials available on the Internet. There is little research in developing secure systems and even less focused on usability engineering, which is commonly seen as an ally only to software engineering. It is necessary to change this view. Results: This paper provides examples of security flaws due to lack of usability, as well as topics of usability related to information security. Conclusion: Thus, this paper contributes to the development and operation of a system computerized in health functional and secure.

Objetivos: Trabajo es poner de relieve la contribución de la ingeniería de usabilidad para la seguridad de la salud informatizados. Métodos: Utilizó de la investigación basada en libros, artículos y materiales disponibles en Internet. No hay mucha investigación en el desarrollo de sistemas seguros y menos centrada en la ingeniería de usabilidad, que es comúnmente vista como una aliada único para la ingeniería de software. Es necesario cambiar este punto de vista. Resultados: Son ejemplos de fallos de seguridad debido a la falta de usabilidad, así como temas relacionados con la usabilidad de seguridad de la información. Conclusión: Por lo tanto, este trabajo contribuye al desarrollo y operación de un sistema de información de salud funcional y seguro.

Comparação filogenética de seqüências de genes e espécies aplicada à análise de receptores acoplados à proteína-G / Phylogenetic comparison of gene amd species sequences applied to the analisys of G-protein coupled receptors

A maioria dos métodos utilizados para a predição de função de proteínas a partir de sua estrutura primária são baseados na similaridade com seqüências com função conhecida. No entanto, esta abordagem não considera a ocorrência de duplicação gênica (paralogia) ou evolução convergente de genes. Nesta tese, foi desenvolvido um programa para a análise de proteínas correlacionadas que compartilham um domínio comum. Este programa leva em consideração a história evolucionária dos genes sendo analisados, resultando numa anotação mais confiável de proteínas com funções desconhecidas. 0 Phylogenetic Genome Annotator (PGA) é um programa de computador que permite a comparação em tempo real entre árvores filogenéticas de genes e de espécies. Utilizando proteínas preditas a partir de regiões codificadoras em genomas completos e proteínas conhecidas que contenham um domínio protéico comum ao das seqüências preditas, é inferida a árvore dos genes. A filogenia das espécies é predita a partir de dados de RNA ribossômico. Seqüências com domínios protéicos correlacionados, definidos pela PFAM, são apresentados lado a lado com a filogenia das espécies correspondentes. 0 suporte estatístico para o agrupamento de genes é dado através do método dos quartetos. Esta análise permite identificar prontamente as proteínas originadas através de duplicação de genes e a predição de possíveis divergências funcionais em grupos de seqüências similares. A ferramenta foi testada em três diferentes classes da super-família de receptores acoplados à proteína-G