Era of TB elimination: Growing need to understand diversities of Mycobacterium tuberculosis lineages!

INTRODUCTION: The mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) has highly clonal population structure which made the organism spread globally mirroring human migration out of Africa and resulted in the formation of seven lineages. We conducted this study to determine the proportion of spoligotype lineages and drug susceptibility profile of Mycobacterium tuberculosis isolates among smear positive TB patients attending a tertiary care hospital in Mysore, Karnataka, India. METHODS: It is a descriptive study conducted at JSS Hospital a tertiary care centre at Mysore, India during 2018-19. The sputum smear positive samples were subjected to solid culture and drug susceptibility testing and spoligotyping for identification of lineages. RESULTS: Of the 100 samples which were culture positive, 94 isolates were clustered into five spoligotype international types with SIT-126 (EAI-5) being the largest cluster of 46 (46%) isolates, followed by SIT-62 (H1) with 24 (24%), SIT -26 (CAS 1-DELHI) with 20 (20%), SIT-53 (T1) with 03 (3%) and SIT-482 (BOV-1) with 01 (1%). Among the remaining six isolates, two had unique Cameroon spoligotypes and four were orphans CONCLUSION: The study finding reveals that a diverse pattern of genotypes is circulating in the region of which EAI-5, Harleem (H1) and CAS-DELHI pattern forms the majority (88%). It is evident that there is a wide range of MTB genetic lineages in circulation and further research is needed to understand the diversity across the country.

Non-response to first-line anti-tuberculosis treatment in Sikkim, India: a risk-factor analysis study.

Setting: Sikkim, India, has the highest proportion of tuberculosis (TB) patients on first-line anti-tuberculosis regimens with the outcome 'failure' or 'shifted to regimen for multidrug-resistant TB (MDR-TB)'. Objective: To assess the factors associated with non-response to treatment, i.e., 'failure' or 'shifted to MDR-TB regimen'. Methods: We conducted a retrospective cohort study using Revised National Tuberculosis Control Programme data of all TB patients registered in 2015 for first-line TB treatment. In addition, we interviewed 42 patients who had not responded to treatment to ascertain their current status. Results: Of 1508 patients enrolled for treatment, about 9% were classified as non-response to treatment. Patient factors associated with non-response were urban setting (adjusted odds ratio [aOR] 2.39, 95%CI 1.22-4.67), ethnicity (being an Indian tribal, aOR 1.73, 95%CI 1.17-2.57, Indian [other] aOR 1.83, 95%CI 1.29-2.60 compared to patients of Nepali origin) and those on retreatment (aOR 2.40, 95%CI 1.99-2.91). Of the patients interviewed, 28 (67%) had received treatment for drug-resistant TB. Conclusion: In Sikkim, one in 11 patients had not responded to first-line anti-tuberculosis treatment. Host-pathogen genetics and socio-behavioural studies may be required to understand the reasons for the differences in non-response, particularly among ethnic groups.

Contexte : L'état de Sikkim, en Inde, a la proportion la plus élevée du pays de patients atteints de tuberculose (TB) sous protocole antituberculeux de première ligne avec pour résultats « échec ¼ ou « passé à un protocole de TB multirésistante (TB-MDR) ¼.Objectif : Evaluer les facteurs associés à une non réponse au traitement (« échec ¼ ou « passé à un protocole de TB-MDR¼).Méthode : Nous avons réalisé une étude rétrospective de cohorte grâce aux données du programme national révisé pour la lutte contre la tuberculose de tous les patients TB enregistrés en 2015 pour un traitement de TB de première ligne. Nous avons également interviewé 42 patients ayant une non réponse au traitement pour vérifier leur statut actuel.Résultats : Sur les 1508 patients enrôlés en traitement, environ 9% ont été classés comme non réponse au traitement. Les facteurs liés au patient associés à l'absence de réponse ont été un contexte urbain (odds ratio ajusté [ORa] 2,39 ; IC95% 1,22­4,67), l'ethnicité (appartenance à une tribu Indienne, ORa 1,73 ; IC95% 1,17­2,57, autres populations Indiennes, ORa 1,83 ; IC95% 1,29­2,60, par comparaison aux patients d'origine Népalaise) et aux patients en retraitement de TB (ORa 2,40 ; IC95% 1,99­2,91). Parmi les patients interrogés, 28 (67%) ont reçu un traitement pour TB pharmacorésistante.Conclusion : Au Sikkim, un patient sur 11 avait une non réponse au traitement antituberculeux de première ligne. Des études de génétique hôte-pathogène et des études sociocomportementales pourraient être requises afin de comprendre les raisons des différences dans la non réponse, surtout entre les groupes ethniques.

Marco de Referencia: El estado de Sikkim en la India presenta la proporción más alta de pacientes cuyo desenlace del tratamiento antituberculoso de primera línea se clasifica como 'fracaso' o 'cambiado a un esquema contra la tuberculosis multirresistente (TB-MDR)'.Objetivo: Evaluar los factores que se asocian con la falta de respuesta al tratamiento ('fracaso' o 'cambiado a un esquema contra la TB-MDR').Métodos: Se llevó a cabo un estudio de cohortes, a partir de los datos del Programa Revisado Nacional contra la Tuberculosis, de todos los pacientes registrados en el 2015 en tratamiento antituberculoso de primera línea. Además, se entrevistaron 42 pacientes (que no respondieron al tratamiento), con el fin de verificar su situación actual.Resultados: De los 1508 pacientes inscritos para tratamiento, cerca del 9% se clasificaron sin respuesta al tratamiento. Los factores del paciente que se asociaron con la falta de respuesta fueron los siguientes: un entorno urbano (OR ajustado [ORa] 2,39; IC95% 1,22­4,67), la etnia (pertenencia a grupos tribales, ORa 1,73; IC95% 1,17­2,57 u otras poblaciones indias ORa 1,83; IC95% 1,29­2,60 cuando se compararon con los pacientes de origen nepalés) y el retratamiento antituberculoso (ORa 2,40; IC95% 1,99­2,91). De los pacientes entrevistados, 28 habían recibido tratamiento por TB farmacorresistente (67%).Conclusión: En Sikkim, uno de cada 11 pacientes no respondió al tratamiento de primera línea contra la TB. Se precisarían estudios genéticos de la interacción entre el hospedero y el patógeno y estudios sociales conductuales que permitan comprender las razones de las diferencias en la falta de respuesta, sobre todo entre los diferentes grupos étnicos.

Engaging private providers and Ayurvedic practitioners in Bilaspur, India: did it increase TB case detection?

To find 'missing' tuberculosis (TB) cases, in November 2014 we trained private practitioners (PPs) and Ayurvedic practitioners (APs; Indian system of medicine) in Bilaspur district, India, to identify patients with presumptive TB and refer them to sputum microscopy centres. To reinforce this training, we sent weekly text message reminders during January-March 2015. All 50 APs and 23 of 29 PPs participated. The number of patients with presumptive TB referred by the PPs and APs increased from 38 (January-March 2014) to 104 (January-March 2015), and the number of smear-positive TB patients diagnosed increased from 5 to 16, a 220% increase. While the intervention increased the number of referrals, it did not impact case detection at district level, due to the short duration of the intervention and the non-dominant private sector.

Dans le but de trouver des cas de tuberculose (TB) « manquants ¼, nous avons formé des praticiens privés (PP) et des praticiens ayurvédiques (AP ; médecine indienne) du district de Bilaspur, Inde, en novembre 2014 afin d'identifier des patients avec une TB présumée et de les référer dans des centres de microscopie de crachats. Pour renforcer cette formation, nous avons envoyé des messages sous forme de texto chaque semaine comme aide-mémoire de janvier à mars 2015. Tous les 50 AP et 23 des 29 PP ont participé. Le nombre de patients présumés TB référés par les PP et AP a augmenté de 38 (janvier­mars 2014) à 104 (janvier­mars 2015) et le nombre de patients à frottis de TB positifs diagnostiqués a augmenté de 5 à 16 (augmentation de 220%). Si l'intervention a augmenté la référence de patients au laboratoire, elle n'a pas eu d'impact sur la détection des cas au niveau du district à cause de sa durée brève et du fait que le secteur privé n'est pas dominant dans la région.

Con el propósito de detectar los casos de tuberculosis (TB) que 'se pasan por alto', se llevó a cabo una capacitación de los médicos del sector privado (PP) y los médicos del sistema Ayurveda (AP) de medicina tradicional de la India; la formación, realizada en el distrito de Bilaspur en noviembre del 2014, buscó mejorar el reconocimiento de los pacientes con presunción clínica de TB y su remisión a los centros de examen microscópico del esputo. Con el objeto de reforzar la capacitación, se enviaron mensajes recordatorios por SMS de enero a marzo del 2015. Participaron en el estudio todos los 50 AP y 23 de los 29 PP del distrito. El cociente del número de pacientes con presunción de TB remitidos por los PP y los AP de 38 (entre enero y marzo del 2014) a 104 (entre enero y marzo del 2015) y el número de casos diagnosticados de TB con baciloscopia positiva aumentó de cinco a 16 (incremento del 220%). Si bien la intervención aumentó el número de remisiones, la detección de casos a escala del distrito no se modificó, debido a la corta duración de la intervención y a que el sector privado no es predominante en este distrito.