Genetic characteristics of Tambaqui broodstocks in the state of Rondônia, Brazil: implications on production and conservation / Caracterização genética de estoques de Tambaqui do Estado de Rondônia (Brasil): implicações na produção e na conservação

In recent years, the genetic monitoring of broodstocks in fish farming has been greatly highlighted due to its importance in the management and improvement of their production and conservation. Current study evaluates the genetic diversity of four Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum) in the state of Rondônia (Brazil) and discusses activities towards the species´s correct production management and conservation. Nine primers were employed to analyze 94 specimens from four fish farms in the municipalities of Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Médici (PM) and Rolim de Moura (RM). Differences in the frequency of 38 fragments, with an exclusive fragment in JP and OP, were reported. High polymorphism (52.40 to 64.60%) and Shannon Index (0.313 to 0.382) rates were observed. The analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variation is within each stock. The identity and genetic distance between the groups ranged between 0.927 and 0.954 and between 0.047 and 0.076 respectively, with shortest distance between the OPxPM and JPxRM groups. Genetic differentiation ranged from moderate to high (Fst = 0.081 to 0.179) and the number of migrants per generation was moderate (Nm = 3.83 to 6.24). As a rule, stocks showed high genetic variability and moderate / high differentiation and genetic distance between them. The results allowed direct conservation...(AU)

Nos últimos anos, o monitoramento genético de estoques na piscicultura tem recebido grande destaque devido a sua importância no gerenciamento e melhora da sua produção e conservação. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de quatro estoques de reprodutores Tambaqui (Colossoma macropomum) do estado de Rondônia (Brasil) e através dela, discutir ações que contribuam com o correto manejo produtivo e conservação dessa espécie. Utilizaram-se nove iniciadores para analisar 94 indivíduos de quatro pisciculturas dos municípios Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Medici (PM) e Rolim de Moura (RM). Foram encontradas diferenças nas frequências de 38 fragmentos, com um fragmento exclusivo em JP e OP. Altos valores de polimorfismo (52,40 a 64,60%) e índice de Shannon (0,313 a 0,382) foram observados. A análise de variância molecular (AMOVA) demostrou que a maior parte da variação está dentro de cada estoque. A identidade e distância genética entre os agrupamentos variou de 0,927 a 0,954 e 0,047 a 0,076, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos OPxPM e JPxRM. A diferenciação genética variou de moderada a alta (Fst = 0,081 a 0,179) e o número de migrantes por geração foi moderado (Nm = 3,83 a 6,24). De forma geral, os estoques apresentaram alta variabilidade genética e moderada/alta diferenciação e distancia...(AU)

Genetic characteristics of Tambaqui broodstocks in the state of Rondônia, Brazil: implications on production and conservation / Caracterização genética de estoques de Tambaqui do Estado de Rondônia (Brasil): implicações na produção e na conservação

In recent years, the genetic monitoring of broodstocks in fish farming has been greatly highlighted due to its importance in the management and improvement of their production and conservation. Current study evaluates the genetic diversity of four Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum) in the state of Rondônia (Brazil) and discusses activities towards the species´s correct production management and conservation. Nine primers were employed to analyze 94 specimens from four fish farms in the municipalities of Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Médici (PM) and Rolim de Moura (RM). Differences in the frequency of 38 fragments, with an exclusive fragment in JP and OP, were reported. High polymorphism (52.40 to 64.60%) and Shannon Index (0.313 to 0.382) rates were observed. The analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variation is within each stock. The identity and genetic distance between the groups ranged between 0.927 and 0.954 and between 0.047 and 0.076 respectively, with shortest distance between the OPxPM and JPxRM groups. Genetic differentiation ranged from moderate to high (Fst = 0.081 to 0.179) and the number of migrants per generation was moderate (Nm = 3.83 to 6.24). As a rule, stocks showed high genetic variability and moderate / high differentiation and genetic distance between them. The results allowed direct conservation...

Nos últimos anos, o monitoramento genético de estoques na piscicultura tem recebido grande destaque devido a sua importância no gerenciamento e melhora da sua produção e conservação. Dessa forma, o objetivo deste estudo foi avaliar de forma inédita a diversidade genética de quatro estoques de reprodutores Tambaqui (Colossoma macropomum) do estado de Rondônia (Brasil) e através dela, discutir ações que contribuam com o correto manejo produtivo e conservação dessa espécie. Utilizaram-se nove iniciadores para analisar 94 indivíduos de quatro pisciculturas dos municípios Ji-Paraná (JP), Ouro Preto do Oeste (OP), Presidente Medici (PM) e Rolim de Moura (RM). Foram encontradas diferenças nas frequências de 38 fragmentos, com um fragmento exclusivo em JP e OP. Altos valores de polimorfismo (52,40 a 64,60%) e índice de Shannon (0,313 a 0,382) foram observados. A análise de variância molecular (AMOVA) demostrou que a maior parte da variação está dentro de cada estoque. A identidade e distância genética entre os agrupamentos variou de 0,927 a 0,954 e 0,047 a 0,076, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos OPxPM e JPxRM. A diferenciação genética variou de moderada a alta (Fst = 0,081 a 0,179) e o número de migrantes por geração foi moderado (Nm = 3,83 a 6,24). De forma geral, os estoques apresentaram alta variabilidade genética e moderada/alta diferenciação e distancia...

Genetic variability of broodstocks of Tambaqui (Teleostei Characidae) from the northeast region of Brazil / Variabilidade genética de Tambaqui (Teleostei Characidae) da região nordeste do Brasil

The objective of this experiment was to evaluate the genetic diversity within three Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum). Eight primers were used to analyze 67 individuals collected from three fish farming in the municipalities: Porto Real do Colégio Alagoas (PRC), Araujo 1 Sergipe (AR1) and Araujo 2 Sergipe (AR2), in Brazil. Differences in the frequencies of 88 fragments and four exclusive fragments in PRC were found. High polymorphism values (from 54.38% to 64.38%) and Shannon´s index (from 0.33 to 0.37) were observed. The AMOVA showed that high variation is within each broodstock. The identity and the genetic distance among the groups ranged from 0.845 to 0.975 and from 0.025 to 0.156 respectively, and the shortest distance was found in the groups PRC x AR1 and PRC x AR2. The genetic differentiation ranged from lower to higher (Fst = 0.03 and 0.178) as well as the migratory number per generation (Nm = 5.07 to 12.8). In general, the broodstocks had high intra-population variability, and high differentiation and genetic distance within themselves.(AU)

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de três estoques de tambaqui (Colossoma macropomum). Foram utilizados oito iniciadores para analisar 67 indivíduos, coletados de três pisciculturas nos municípios: Porto Real do Colégio Alagoas (PRC), Araujo 1 Sergipe (AR1) e Araujo 2 Sergipe (AR2), Brasil. Foram encontradas diferenças nas frequências de 88 fragmentos, com quatro fragmentos exclusivos em PRC. Observaram-se altos valores de polimorfismo (54,38 a 64,38%) e índice de Shannon (0,33 a 0,37). A AMOVA mostrou que a maior variação está dentro de cada estoque. A identidade e a distância genética entre os agrupamentos variou de 0,845 a 0,975 e 0,025 a 0,156, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos PRC x AR1 e PRC x AR2. A diferenciação genética variou de baixa a alta (Fst = 0,03 a 0,178) e o número de migrantes por geração foi baixo a alto (Nm = 5,07 a 12,8). De forma geral, os estoques apresentam alta variabilidade intrapopulacional e alta diferenciação e distância genética entre si.(AU)

Genetic variability of broodstocks of Tambaqui (Teleostei Characidae) from the northeast region of Brazil / Variabilidade genética de Tambaqui (Teleostei Characidae) da região nordeste do Brasil

The objective of this experiment was to evaluate the genetic diversity within three Tambaqui broodstocks (Colossoma macropomum). Eight primers were used to analyze 67 individuals collected from three fish farming in the municipalities: Porto Real do Colégio Alagoas (PRC), Araujo 1 Sergipe (AR1) and Araujo 2 Sergipe (AR2), in Brazil. Differences in the frequencies of 88 fragments and four exclusive fragments in PRC were found. High polymorphism values (from 54.38% to 64.38%) and Shannon´s index (from 0.33 to 0.37) were observed. The AMOVA showed that high variation is within each broodstock. The identity and the genetic distance among the groups ranged from 0.845 to 0.975 and from 0.025 to 0.156 respectively, and the shortest distance was found in the groups PRC x AR1 and PRC x AR2. The genetic differentiation ranged from lower to higher (Fst = 0.03 and 0.178) as well as the migratory number per generation (Nm = 5.07 to 12.8). In general, the broodstocks had high intra-population variability, and high differentiation and genetic distance within themselves.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de três estoques de tambaqui (Colossoma macropomum). Foram utilizados oito iniciadores para analisar 67 indivíduos, coletados de três pisciculturas nos municípios: Porto Real do Colégio Alagoas (PRC), Araujo 1 Sergipe (AR1) e Araujo 2 Sergipe (AR2), Brasil. Foram encontradas diferenças nas frequências de 88 fragmentos, com quatro fragmentos exclusivos em PRC. Observaram-se altos valores de polimorfismo (54,38 a 64,38%) e índice de Shannon (0,33 a 0,37). A AMOVA mostrou que a maior variação está dentro de cada estoque. A identidade e a distância genética entre os agrupamentos variou de 0,845 a 0,975 e 0,025 a 0,156, respectivamente, com menor distância entre os agrupamentos PRC x AR1 e PRC x AR2. A diferenciação genética variou de baixa a alta (Fst = 0,03 a 0,178) e o número de migrantes por geração foi baixo a alto (Nm = 5,07 a 12,8). De forma geral, os estoques apresentam alta variabilidade intrapopulacional e alta diferenciação e distância genética entre si.

Genetic parameters and morphometric characteristics of two generations from the GIFT strain of the Nile Tilapia / Parâmetros genéticos e características morfométricas de duas gerações de Tilápia do Nilo linhagem GIFT

The objective of this work was to estimate the (co)variance and the genetic parameters for weight andaverage daily gain from two national generations of the GIFT strain of the Nile tilapia (Oreochromis niloticus). We evaluated 3918 fish from two generations of the breeding program from the Universidade Estadual de Maringá, Northwestern Paraná. Univariate and bivariate analysis were carried out using Bayesian inference. The estimates of heritability using one-trait models for weight was 0.15, average daily gain was 0.19, fish length was 0.23, fish width was 0.19, standard length was 0.17, fish heightwas 0.15, and the head length was 0.17. The genetic and phenotypic correlations were above 0.68and 0.95, respectively. The values of Spearman and Pearson correlations for breeding values of the morphometric traits in relation to average daily gain ranged from 0.58 to 0.98 and from 0.63 to 0.99, respectively. In the second generation (G2), the genetic gain was 2.6%, the effective size of thepopulation was 94, and the inbreeding coefficient was 0.005. In the next generation (G3), these valueswere 8.1%, 124 and 0.004, respectively. The genetic gains over the generations gradually increasedfrom one generation to another, indicating that the criterion, average daily gain, chosen for featureselection was efficient.(AU)

O objetivo deste trabalho foi estimar a (co) variância e os parâmetros genéticos para peso e ganho de peso médio diário de duas gerações de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) linhagem GIFT. Foram avaliados 3.918 peixes por análise univariada e bivariada, utilizando inferência Bayesiana. As estimativas de herdabilidade usando modelos de análise unicaracteristica para o peso foi de 0,15 e para o ganho em peso médio diário foi de 0,19. Nas características morfométricas: comprimento total, comprimento padrão, largura, altura, tamanho da cabeça, os valores para herdabilidade foram de 0,23; 0,17; 0,19; 0,15 e 0,17 respectivamente. A correlação de Spearman e Pearson para os valores genéticos das características morfométricas em relação ao ganho de peso médio diário variaram de 0,58 a 0,98 e 0,63 a 0,99. Na segunda geração (G2), o ganho genético foi de 2,6%, o tamanho efetivo da população foi de 94, e coeficiente de endogamia foi de 0,005. Na geração (G3) estes valores foramde 8,1%, 124 e 0,004. As estimativas de (co) variância e parâmetros genéticos para peso e ganho de peso médio diário demonstraram que o ganho genético ao longo de gerações é gradual e crescente de uma geração para a outra indicando que o critério de seleção escolhido foi eficiente.(AU)

Genetic parameters and morphometric characteristics of two generations from the GIFT strain of the Nile Tilapia / Parâmetros genéticos e características morfométricas de duas gerações de Tilápia do Nilo linhagem GIFT

The objective of this work was to estimate the (co)variance and the genetic parameters for weight andaverage daily gain from two national generations of the GIFT strain of the Nile tilapia (Oreochromis niloticus). We evaluated 3918 fish from two generations of the breeding program from the Universidade Estadual de Maringá, Northwestern Paraná. Univariate and bivariate analysis were carried out using Bayesian inference. The estimates of heritability using one-trait models for weight was 0.15, average daily gain was 0.19, fish length was 0.23, fish width was 0.19, standard length was 0.17, fish heightwas 0.15, and the head length was 0.17. The genetic and phenotypic correlations were above 0.68and 0.95, respectively. The values of Spearman and Pearson correlations for breeding values of the morphometric traits in relation to average daily gain ranged from 0.58 to 0.98 and from 0.63 to 0.99, respectively. In the second generation (G2), the genetic gain was 2.6%, the effective size of thepopulation was 94, and the inbreeding coefficient was 0.005. In the next generation (G3), these valueswere 8.1%, 124 and 0.004, respectively. The genetic gains over the generations gradually increasedfrom one generation to another, indicating that the criterion, average daily gain, chosen for featureselection was efficient.

O objetivo deste trabalho foi estimar a (co) variância e os parâmetros genéticos para peso e ganho de peso médio diário de duas gerações de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) linhagem GIFT. Foram avaliados 3.918 peixes por análise univariada e bivariada, utilizando inferência Bayesiana. As estimativas de herdabilidade usando modelos de análise unicaracteristica para o peso foi de 0,15 e para o ganho em peso médio diário foi de 0,19. Nas características morfométricas: comprimento total, comprimento padrão, largura, altura, tamanho da cabeça, os valores para herdabilidade foram de 0,23; 0,17; 0,19; 0,15 e 0,17 respectivamente. A correlação de Spearman e Pearson para os valores genéticos das características morfométricas em relação ao ganho de peso médio diário variaram de 0,58 a 0,98 e 0,63 a 0,99. Na segunda geração (G2), o ganho genético foi de 2,6%, o tamanho efetivo da população foi de 94, e coeficiente de endogamia foi de 0,005. Na geração (G3) estes valores foramde 8,1%, 124 e 0,004. As estimativas de (co) variância e parâmetros genéticos para peso e ganho de peso médio diário demonstraram que o ganho genético ao longo de gerações é gradual e crescente de uma geração para a outra indicando que o critério de seleção escolhido foi eficiente.

Análise genética de três gerações de tilápia do Nilo (linhagem GIFT) utilizando o marcador RAPD / Genetic characterization of three Nile tilapia (GIFT strain) generations using the RAPD marker

O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética de três gerações da tilápia GIFT do Programa de Melhoramento Genético da Universidade Estadual de Maringá, utilizando o marcador RAPD. Foram utilizadas 180 amostras de nadadeira. Os sete primers utilizados produziram 91 fragmentos, dos quais 98,9% foram polimórficos. Observaram-se diferenças (p < 0,05) na frequência de 64 fragmentos, dos quais dez foram excluídos na G2. Os resultados de variabilidade genética estimados pelo índice de Shannon (G0: 0,430; G1: 0,469 e G2: 0,420) e pela porcentagem de fragmentos polimórficos (G0: 90,1%; G1: 94,5% e G2: 86,8%) indicaram alta variabilidade genética intrapopulacional. Resultados esses que corroborando com os preceitos de diversidade genética de Nei mostraram a G1 com os maiores valores (G0: 0,281; G1: 0,307 e G2: 0,277). Também foi constatada maior distância genética entre as gerações G0 e G1 (0,108) e maior identidade genética entre G0 e G2 (0,909). Há alta diversidade genética intrapopulacional nas três gerações, com valores maiores na G1, como observado nas analises.

The aim of this work was to analyze the genetic diversity in three GIFT tilapia generations from the Genetic Improvement Program of State University of Maringá, using the RAPD marker. One hundred eighty fin samples were used. The seven primers used produced 91 fragments, of which 98.9% were polymorphic. Differences (p < 0.05) were observed in the frequency of 64 fragments, of which ten were excluded in G2. The results of genetic variability estimated by the Shannon index (G0: 0.430, G1: 0.469 and G2: 0.420) and by the percentage of polymorphic fragments (G0: 90.1%, G1: 94.5% and G2: 86.8%) indicated a high intrapopulation genetic variability, corroborated by the Nei genetic diversity results that showed G1 with the highest values (G0: 0.281, G1: 0.307 and G2: 0.277). A greater genetic distance between the G0 and G1 generations (0.108) and a greater genetic identity between G0 and G2 (0.909) were verified. Intrapopulation genetic diversity was high in the three generations, with highest values in G1.