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Planta ; 230(1): 107-18, 2009 Jun.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-19360436

RESUMO

Dehydrin genes encode proteins with demonstrated cryoprotective and antifreeze activity, and they respond to a variety of abiotic stress conditions that have dehydration as a common component. Two dehydrins from peach (Prunus persica L. [Batsch.]) have been previously characterized; here, we describe the characterization of a third dehydrin from peach bark, PpDhn3, isolated by its response to low temperature. The expression of all three dehydrin genes was profiled by semi-quantitative reverse transcription PCR, and transcript initiation was mapped for all three genes using the RNA ligase-mediated 5' rapid amplification of cDNA ends technique. PpDhn3 transcripts from bark collected in December or July, as well as transcripts from developing fruit, initiated at a single site. Although most of the PpDhn1 transcripts initiated at a similar position, those from young fruit initiated much further upstream of the consensus TATA box. Bark and fruit transcripts encoding PpDhn2 initiated ca. 30 bases downstream of a consensus TATA box; however, transcripts from ripe fruit initiated further upstream. Ripe fruit transcripts of PpDhn2 contain a 5' leader intron which is predicted to add some 34 amino acids to the N-terminal methionine of the cognate protein when properly processed. Secondary structure prediction of sequences surrounding the TATA box suggests that conformational transitions associated with decreasing temperature contribute to the regulation of expression of the cold-responsive dehydrin genes. Taken together these results reveal new, unexpected levels of gene regulation contributing to the overall expression pattern of peach dehydrins.


Assuntos
Frutas/genética , Perfilação da Expressão Gênica , Proteínas de Plantas/genética , Prunus/genética , Análise por Conglomerados , Temperatura Baixa , DNA de Plantas/química , DNA de Plantas/genética , Frutas/crescimento & desenvolvimento , Regulação da Expressão Gênica no Desenvolvimento , Regulação da Expressão Gênica de Plantas , Dados de Sequência Molecular , Conformação de Ácido Nucleico , Filogenia , Casca de Planta/genética , Proteínas de Plantas/classificação , Regiões Promotoras Genéticas/genética , Isoformas de Proteínas/classificação , Isoformas de Proteínas/genética , Prunus/crescimento & desenvolvimento , Sequências Reguladoras de Ácido Nucleico/genética , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Estações do Ano , Análise de Sequência de DNA , TATA Box/genética , Temperatura , Sítio de Iniciação de Transcrição
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