Camera trap surveys of Atlantic Forest mammals: A data set for analyses considering imperfect detection (2004-2020).

Camera traps became the main observational method of a myriad of species over large areas. Data sets from camera traps can be used to describe the patterns and monitor the occupancy, abundance, and richness of wildlife, essential information for conservation in times of rapid climate and land-cover changes. Habitat loss and poaching are responsible for historical population losses of mammals in the Atlantic Forest biodiversity hotspot, especially for medium to large-sized species. Here we present a data set from camera trap surveys of medium to large-sized native mammals (>1 kg) across the Atlantic Forest. We compiled data from 5380 ground-level camera trap deployments in 3046 locations, from 2004 to 2020, resulting in 43,068 records of 58 species. These data add to existing data sets of mammals in the Atlantic Forest by including dates of camera operation needed for analyses dealing with imperfect detection. We also included, when available, information on important predictors of detection, namely the camera brand and model, use of bait, and obstruction of camera viewshed that can be measured from example pictures at each camera location. Besides its application in studies on the patterns and mechanisms behind occupancy, relative abundance, richness, and detection, the data set presented here can be used to study species' daily activity patterns, activity levels, and spatiotemporal interactions between species. Moreover, data can be used combined with other data sources in the multiple and expanding uses of integrated population modeling. An R script is available to view summaries of the data set. We expect that this data set will be used to advance the knowledge of mammal assemblages and to inform evidence-based solutions for the conservation of the Atlantic Forest. The data are not copyright restricted; please cite this paper when using the data.

As armadilhas fotográficas tornaram­se o principal método de observação de muitas espécies em grandes áreas. Os dados obtidos com armadilhas fotográficas podem ser usados para descrever os padrões e monitorar a ocupação, abundância e riqueza da vida selvagem, informação essencial para a conservação em tempos de rápidas mudanças climáticas e de cobertura do solo. A perda de habitat e a caça furtiva são responsáveis pelas perdas populacionais históricas de mamíferos no hotspot de biodiversidade da Mata Atlântica, especialmente para espécies de médio e grande porte. Aqui apresentamos um conjunto de dados de levantamentos com armadilhas fotográficas de mamíferos de médio e grande porte (>1 kg) em toda a Mata Atlântica. Compilamos dados de 5.380 armadilhas fotográficas instaladas no nível do chão em 3.046 locais, de 2004 a 2020, resultando em 43.068 registros de 58 espécies. Esses dados acrescentam aos conjuntos de dados existentes de mamíferos na Mata Atlântica por incluir as datas de operação das câmeras, que são necessárias para análises que lidam com detecção imperfeita. Também incluímos, quando disponíveis, informações sobre importantes preditores de detecção, como marca e modelo da câmera, uso de isca e obstrução do visor da câmera que pode ser medido a partir de imagens de exemplo em cada local da câmera. Além de estudos sobre os padrões e mecanismos por trás da ocupação, abundância relativa, riqueza e detecção, o conjunto de dados aqui apresentado pode ser usado para estudar os padrões de atividade diária das espécies, nível de atividade e interações espaço­temporais entre as espécies. Além disso, os dados podem ser usados em combinação com outras fontes de dados em diversas análises com modelagem populacional integrada. Um script R está disponível para visualizar um resumo do conjunto de dados. Esperamos que este conjunto de dados seja usado para aumentar o conhecimento sobre as assembleias de mamíferos e usado para informar soluções baseadas em evidências para a conservação da Mata Atlântica. Os dados não são restritos por direitos autorais e, por favor, cite este documento ao usar os dados.

NEOTROPICAL ALIEN MAMMALS: a data set of occurrence and abundance of alien mammals in the Neotropics.

Biological invasion is one of the main threats to native biodiversity. For a species to become invasive, it must be voluntarily or involuntarily introduced by humans into a nonnative habitat. Mammals were among first taxa to be introduced worldwide for game, meat, and labor, yet the number of species introduced in the Neotropics remains unknown. In this data set, we make available occurrence and abundance data on mammal species that (1) transposed a geographical barrier and (2) were voluntarily or involuntarily introduced by humans into the Neotropics. Our data set is composed of 73,738 historical and current georeferenced records on alien mammal species of which around 96% correspond to occurrence data on 77 species belonging to eight orders and 26 families. Data cover 26 continental countries in the Neotropics, ranging from Mexico and its frontier regions (southern Florida and coastal-central Florida in the southeast United States) to Argentina, Paraguay, Chile, and Uruguay, and the 13 countries of Caribbean islands. Our data set also includes neotropical species (e.g., Callithrix sp., Myocastor coypus, Nasua nasua) considered alien in particular areas of Neotropics. The most numerous species in terms of records are from Bos sp. (n = 37,782), Sus scrofa (n = 6,730), and Canis familiaris (n = 10,084); 17 species were represented by only one record (e.g., Syncerus caffer, Cervus timorensis, Cervus unicolor, Canis latrans). Primates have the highest number of species in the data set (n = 20 species), partly because of uncertainties regarding taxonomic identification of the genera Callithrix, which includes the species Callithrix aurita, Callithrix flaviceps, Callithrix geoffroyi, Callithrix jacchus, Callithrix kuhlii, Callithrix penicillata, and their hybrids. This unique data set will be a valuable source of information on invasion risk assessments, biodiversity redistribution and conservation-related research. There are no copyright restrictions. Please cite this data paper when using the data in publications. We also request that researchers and teachers inform us on how they are using the data.

Extension of the geographic distribution of Plecturocebus baptista (Pitheciidae, Primates) and a possible hybrid zone with Plecturocebus hoffmannsi: evolutionary and conservation implications / Extensão da distribuição geográfica de Plecturocebus baptista (Pitheciidae, Primates) e uma possível zona híbrida com Plecturocebus hoffmannsi: implicações evolutivas e de conservação

Titi monkeys (family Pitheciidae) are Neotropical primates highly diversified in morphology, ecology and genetics, with a wide geographic distribution, including the Amazon, Atlantic Forest, Cerrado, Pantanal and Caatinga. This diversity, together with knowledge gaps, generates uncertainties in titi monkey taxonomy and distribution. An example is Plecturocebus baptista, with only 14 occurrence records and an ill-defined distribution based on untested geographical barriers. Here, we report the occurrence of this species at a new locality outside its known range, across the Paraná-Urariá River, which was considered a distributional limit for the species. The new record implies an overlap of P. baptista with the range of P. hoffmannsi. We document the sighting of an apparent hybrid animal. Our observations suggest that i) the distribution of P. baptista needs to be reviewed, and ii) the evolutionary relationships between P. baptista and P. hoffmannsi may be more complex than previously assumed. Since both species share contiguous areas of potential hybridization, we question whether the two species arose via allopatric speciation.(AU)

Macacos zogue-zogue (família Pitheciidae) são primatas neotropicais altamente diversificados em morfologia, ecologia e genética, com distribuição geográfica abrangente, incluindo a Floresta Amazônica, Mata Atlântica, Cerrado, Pantanal e a Caatinga. Essa diversificação, juntamente com lacunas de conhecimento, gera incertezas na taxonomia e distribuição das espécies. Um exemplo é Plecturocebus baptista, com apenas 14 registros de ocorrência e distribuição indefinida, baseada em barreiras geográficas não testadas. Aqui nós relatamos a ocorrência da espécie em uma nova localidade, fora de sua área conhecida de distribuição, que transpõe uma suposta barreira geográfica, o Rio Paraná-Urariá. O novo registro de P. baptista se sobrepõe à distribuição de P. hoffmannsi e, neste contexto, observamos um indivíduo aparentemente híbrido entre as duas espécies. Nossas observações sugerem que i) a distribuição de P. baptista necessita ser revisada, e ii) a relação evolutiva entre P. baptista e P. hoffmannsi pode ser mais complexa do que se pensava. Como ambas espécies compartilham áreas contínuas de potencial hibridização, questionamos se as duas espécies resultaram de especiação alopátrica.(AU)

Extension of the geographic distribution of Plecturocebus baptista (Pitheciidae, Primates) and a possible hybrid zone with Plecturocebus hoffmannsi: evolutionary and conservation implications

Titi monkeys (family Pitheciidae) are Neotropical primates highly diversified in morphology, ecology and genetics, with a wide geographic distribution, including the Amazon, Atlantic Forest, Cerrado, Pantanal and Caatinga. This diversity, together with knowledge gaps, generates uncertainties in titi monkey taxonomy and distribution. An example is Plecturocebus baptista, with only 14 occurrence records and an ill-defined distribution based on untested geographical barriers. Here, we report the occurrence of this species at a new locality outside its known range, across the Paraná-Urariá River, which was considered a distributional limit for the species. The new record implies an overlap of P. baptista with the range of P. hoffmannsi. We document the sighting of an apparent hybrid animal. Our observations suggest that i) the distribution of P. baptista needs to be reviewed, and ii) the evolutionary relationships between P. baptista and P. hoffmannsi may be more complex than previously assumed. Since both species share contiguous areas of potential hybridization, we question whether the two species arose via allopatric speciation. (AU)