A study of transfer of information in animal collectives using deep learning tools.

We studied how the interactions among animals in a collective allow for the transfer of information. We performed laboratory experiments to study how zebrafish in a collective follow a subset of trained animals that move towards a light when it turns on because they expect food at that location. We built some deep learning tools to distinguish from video which are the trained and the naïve animals and to detect when each animal reacts to the light turning on. These tools gave us the data to build a model of interactions that we designed to have a balance between transparency and accuracy. The model finds a low-dimensional function that describes how a naïve animal weights neighbours depending on focal and neighbour variables. According to this low-dimensional function, neighbour speed plays an important role in the interactions. Specifically, a naïve animal weights more a neighbour in front than to the sides or behind, and more so the faster the neighbour is moving; and if the neighbour moves fast enough, the differences coming from the neighbour's relative position largely disappear. From the lens of decision-making, neighbour speed acts as confidence measure about where to go. This article is part of a discussion meeting issue 'Collective behaviour through time'.

Deep attention networks reveal the rules of collective motion in zebrafish.

A variety of simple models has been proposed to understand the collective motion of animals. These models can be insightful but may lack important elements necessary to predict the motion of each individual in the collective. Adding more detail increases predictability but can make models too complex to be insightful. Here we report that deep attention networks can obtain a model of collective behavior that is simultaneously predictive and insightful thanks to an organization in modules. When using simulated trajectories, the model recovers the ground-truth interaction rule used to generate them, as well as the number of interacting neighbours. For experimental trajectories of large groups of 60-100 zebrafish, Danio rerio, the model obtains that interactions between pairs can approximately be described as repulsive, attractive or as alignment, but only when moving slowly. At high velocities, interactions correspond only to alignment or alignment mixed with repulsion at close distances. The model also shows that each zebrafish decides where to move by aggregating information from the group as a weighted average over neighbours. Weights are higher for neighbours that are close, in a collision path or moving faster in frontal and lateral locations. The network also extracts that the number of interacting individuals is dynamical and typically in the range 8-22, with 1-10 more important ones. Our results suggest that each animal decides by dynamically selecting information from the collective.

idtracker.ai: tracking all individuals in small or large collectives of unmarked animals.

Understanding of animal collectives is limited by the ability to track each individual. We describe an algorithm and software that extract all trajectories from video, with high identification accuracy for collectives of up to 100 individuals. idtracker.ai uses two convolutional networks: one that detects when animals touch or cross and another for animal identification. The tool is trained with a protocol that adapts to video conditions and tracking difficulty.

Historia de la medicina del estado táchira (compendio) / History of medicine in the táchira state (compendium)

En el IV Congreso Venezolano de la Historia de la Medicina celebrado en 1984, se presentó la ponencia titulada "Historia de la Medicina en las Entidades Federales", el correlato correspondiente al Estado Táchira fue recopilado y publicado en 1993. Ese material me sirvió de sustento para la presentación en la Sociedad Venezolana de Historia de la Medicina, a manera de compendio de la Historia Médica del Táchira desde el descubrimiento hasta nuestros días. A pesar de la objetividad que debe poseer todo relato histórico, la narración siempre es más rica y precisa al referirse a los hechos reciente, porque existe la documentación determinada al respecto y la vivencia de los personajes. Los acontecimientos referidos en la época de la conquista y la colonia tienen la subjetividad de lo narrativo y la dificultad de investigar los documentos que pudieron preservarse en el tiempo. Espero que este relato logre satisfacer las expectativas de este grupo de médicos historiadores que se han ocupado de custodiar la memoria de la historia médica de Venezuela y que haya podido en este breve espacio presentar una semblanza de la evolución de la Medicina en el Estado Táchira(AU)

Cáncer avanzado que simula cáncer gástrico precoz: presentación de tres casos / Advanced gastric cancer simulating early gastric cancer: report of cases

El Cáncer Gástrico avanzado presenta características macroscópicas tradicionalmente definidas según la clasificación de Borrman establecida en 1926, no obstante algunos cánceres gástricos avanzados presentan aspectos macroscópicos similares al Cáncer Gástrico Precoz. Este tipo de lesiones han sido diagnósticadas como canceres precoces tanto por gastroenterólogos como por patológos. Presentamos tres casos de Cáncer Gástrico Avanzado que simulan Cáncer Gástrico Precoz. Los tres fueron lesiones ulceradas, dos de ellos se clasificaron como Cáncer Gástrico como Cáncer Gástrico Precoz Tipo III y el otro como Cáncer Gástrico Precoz Tipo III+IIc. En todos los casos se sospechó invasión hasta la submucosa. Estudios histológicos de los especímenes quirúrgicos revelaron el caracter avanzado de las lesiones

Leiomioblastoma gástrico: análisis histomorfológico e inmunológico de tres casos / Gastric leiomioblastoma: presentation of three cases

Se presentan tres casos de Leiomioblastoma gástrico diagnósticados en la Unidad de Patología del Centro de Control de Cáncer Gástrico "Dr. Luis E. Anderson" - San Cristóbal Estado Táchira Venezuela. Las lesiones se analizaron desde el punto de vista clínico patológico e inmunohistoquímico utilizando técnicas de Vimentina y Queratina. Esta neoplasia no es frecuente, pero interesante debido a que su comportamiento biológico no siempre se corresponde con la histología

Cáncer gastrico avanzado: centro de control de cáncer gastriintestinal San Cristobal, Estado Tachira / Gastric cancer advanced

El número de muertes debido a Cáncer Gástrico es alto en el Estado Táchira. En el Programa de Detección del Cáncer Gástrico en el Edo. Táchira, además de 80 Cánceres Precoces de estómago, se han diagnósticado 368 Cánceres Avanzados. De estos últimos fueron intervenidos 131 casos, siendo posible la recección en 123 (93.84%). La sobrevida de los pacientes que tienen más de 5 años de operados es de 16.12%. Se hace un análisis de la incidencia por sexo, edad, procedencia, síntomas digestivos, etc; como los tipos de intervenciones realizados y la histopatología de los tumores. Nuestro estudio nos permite concluir que han mejorado obstensiblemente la operabilidad, resecabilidad y sobrevida de los pacientes tratados por Cáncer Avanzado incluidos en nuestro Programa de Pesquisa. Se hace comparación de los resultados con un Informe de los casos tratados en nuestro Hospital Central antes de comenzar la pesquisa masiva

Cáncer gástrico precoz / Early gastric cancer

Se reporta la experiencia del tratamiento quirúrgico del cáncer gástrico precoz en el Estado Táchira, diagnosticados en el Programa de Pesquisa del Cáncer Gástrico de dicho Estado, desde su inicio en 1980. Se hacen las consideraciones generales sobre las pautas establecidas por la Sociedad Japonesa para la Investigación del Cáncer Gástrico. Entre diciembre 1980 y noviembre de 1986 han sido intervenidos 44 cánceres precoses de estómago, los resultados han sido óptimos, pues solo 1 paciente ha fallecido por tumor en el remanente gástrico. Y aunque solo muy pocos pacientes han sobrepasado el 5§ año de sobrevida, consideramos que, un elevado porcentaje de los casos tratados, están curados de su cáncer gástrico. Se hace comparación de este estudio con uno previo al establecimiento del Programa de Pesquisa