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J Microbiol Methods ; 84(2): 307-11, 2011 Feb.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-21182874

RESUMO

In the present study, a Taqman allelic discrimination assay based on three SNPs of the TPI gene is described. It was used as a differential diagnostic tool to detect blackleg and malignant edema. Sudden deaths of grazing ruminants, such as cattle, sheep and goats, which show clinical signs related to hyperacute infective processes, encouraged the development of a rapid and precise diagnostic molecular method. Specific primers and probes for Clostridium septicum and Clostridium chauvoei were designed on the basis of the TPI gene sequence. The multiplex PCR was tested on the DNA of a total of 57 strains, including 24 Clostridium chauvoei, 20 Clostridium septicum, 1 Bacillus anthracis and 12 other Clostridium spp. The DNA samples from Clostridium chauvoei and Clostridium septicum strains were amplified. Amplification of other DNA samples was not observed, with the exception of Clostridium tertium, which showed a weak positive signal. To avoid misdiagnosis, a confirmatory assay based on a Sybr green real time PCR was proposed. The authors confirmed the efficacy and the specificity of the test used in this study, which proved to be a useful tool for the diagnosis of clostridiosis that are often diagnosed using only traditional tools.


Assuntos
Técnicas Bacteriológicas/métodos , Infecções por Clostridium/veterinária , Clostridium chauvoei/isolamento & purificação , Clostridium septicum/isolamento & purificação , Reação em Cadeia da Polimerase/métodos , Triose-Fosfato Isomerase/genética , Animais , Bovinos , Doenças dos Bovinos/diagnóstico , Doenças dos Bovinos/microbiologia , Infecções por Clostridium/diagnóstico , Clostridium chauvoei/classificação , Clostridium chauvoei/genética , Clostridium septicum/classificação , Clostridium septicum/genética , Primers do DNA/genética , DNA Bacteriano/química , DNA Bacteriano/genética , Doenças das Cabras/diagnóstico , Doenças das Cabras/microbiologia , Cabras , Dados de Sequência Molecular , Sondas de Oligonucleotídeos/genética , Sensibilidade e Especificidade , Análise de Sequência de DNA , Ovinos , Doenças dos Ovinos/diagnóstico , Doenças dos Ovinos/microbiologia
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