Near-complete genome sequence and seed transmission evaluation of Physalis rugose mosaic virus from southern Brazil / Sequência do genoma completo e avaliação da transmissão por sementes do Physalis rugose mosaic virus no sul do Brasil

ABSTRACT: Physalis rugose mosaic virus (PhyRMV) causes severe damage to Physalis peruviana L., affecting vegetative parameters, fruit quantity and quality. The aim of this study was to perform a molecular characterization of PhyRMV associated with P. peruviana from commercial fields in the municipality of Lages, Santa Catarina State, Southern Brazil, and to evaluate its transmission by seeds. Plants displaying mosaic, dwarfism, and leaf malformation symptoms were collected from P. peruviana. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and high-throughput sequencing (HTS). For the virus transmission assay, seeds from PhyRMV-infected plants were used, and viral infection in seedlings was verified using symptomatic and molecular diagnosis. PhyRMV RNA has 4162 nucleotides (nts) and a genomic organization similar to that of other sobemoviruses and shares 97% nt identity with the previously characterized PhyRMV Piracicaba isolate. Results indicated the unlikely transmission of PhyRMV by physalis seeds.

RESUMO: Physalis rugose mosaic virus (PhyRMV) causa danos severos em Physalis peruviana L., afetando características vegetativas, a quantidade e qualidade de frutos. Os objetivos desse estudo consistem na caracterização molecular do PhyRMV associado a P. peruviana coletada em campos de produção em Lages, Santa Catarina, Brasil; e avaliar a transmissão do vírus por sementes. Plantas apresentando sintomas de mosaico, deformação e nanismo foram coletadas de P. peruviana. Amostras foliares dessas plantas foram utilizadas para extração de RNA de fita dupla, síntese de biblioteca de cDNA e sequenciamento de alto rendimento. No experimento de transmissão, sementes obtidas de plantas infectadas por PhyRMV foram utilizadas, e a infecção viral nas plântulas foi avaliada por inspeção visual de sintomas e diagnóstico molecular. O RNA viral apresentou 4162 nucleotideos (nts), a organização genômica foi similar à de outros sobemovírus e apresentou 97% de identidade de nucleotídeos com o isolado de Piracicaba de PhyRMV previamente caracterizado. Os resultados obtidos sugerem que é improvável a transmissão de PhyRMV por sementes de physalis.

Grain quality of maize hybrids submitted to different sowing times and nitrogen rates / Qualidade de grãos de híbridos de milho submetidos em diferentes épocas de semeadura e doses de nitrogênio

Grain quality is essential in the food industry, and it shows variations depending on crop management conditions in the field. The objective of this study was to quantify the effect of hybrids, sowing seasons, and topdressing nitrogen rates on the incidence of damaged grains and their correlation with pathogenic fungi. The experiment was conducted under field conditions in Atalanta, Santa Catarina, Brazil, in a split split-plot randomized block design consisting of the AG9025 PRO3 (super-early) and 30F53 VYH (early) hybrids, preferential (September 20) and late (December 5) sowing season, and nitrogen rates (0, 150, 300, and 450 kg ha-1). The percentage of normal, fermented, and burned grains, as well as the incidence of fungi in grains, were quantified. The hybrid 30F53 VYH had shown the lowest percentage of fermented grains (8.4%) when compared to the hybrid AG9025 PRO3 (43.2%). No significant difference was observed between the sowing season for fermented grains. The hybrid AG9025 PRO3 had shown an increase in fermented grains with nitrogen addition, while the hybrid 30F53 VYH presented a stable behavior. The hybrid AG9025 PRO3 (35.5%) showed the lowest incidence of Fusarium verticillioides in the grains when compared to the hybrid 30F53 VYH (49.9%). The fungus incidence was also lower in the preferential sowing season (35.7%) than in the late one (49.7%). The hybrid AG9025...(AU)

A qualidade dos grãos é essencial na indústria alimentícia e mostra variações dependendo das condições de manejo da cultura no campo. O objetivo deste estudo foi quantificar o efeito de híbridos, épocas de semeadura e doses de nitrogênio em cobertura sobre a incidência de grãos avariados e sua correlação com fungos patogênicos. O experimento foi conduzido em condições de campo, em Atalanta, Santa Catarina, Brasil, em delineamento de blocos ao acaso, em parcelas sub-subdivididas, constituído pelos híbridos AG9025 PRO3 (super-precoce) e 30F53 VYH (precoce), semeadura preferencial (20 de setembro) e tardia (5 de dezembro) e doses de nitrogênio em cobertura (0, 150, 300 e 450 kg ha-1). O percentual de grãos normais, fermentados e avariados, bem como a incidência de fungos em grãos, foram quantificados. O híbrido 30F53 VYH apresentou o menor percentual de grãos fermentados (8,4%) quando comparado ao híbrido AG9025 PRO3 (43,2%). Nenhuma diferença significativa foi observada entre as épocas de semeadura nos grãos fermentados. O híbrido AG9025 PRO3 apresentou um aumento nos grãos fermentados com adição de nitrogênio, enquanto o híbrido 30F53 VYH apresentou comportamento estável. O híbrido AG9025 PRO3 (35,5%) apresentou a menor incidência de Fusarium verticillioides nos grãos quando comparado ao híbrido 30F53 VYH (49,9%). A incidência do fungo foi menor também na época de semeadura...(AU)

Sensibilidade de isolados de Septoria lycopersici e eficácia de fungicidas no controle de septoriose em tomateiro / Sensitivity of Septoria lycopersici isolates and effectiveness of fungicides for the control of Septoria leaf spot in tomato

A septoriose é uma das principais doenças do tomateiro e os prejuízos causados variam em função da área cultivada com cultivar suscetível, raças fisiológicas do patógeno e condições climáticas. O objetivo do estudo foi determinar a dose efetiva na inibição de 50% da germinação de esporos (DE50), avaliar o fator de redução de sensibilidade (FRS) de isolados de Septoria lycopersici e a eficiência de fungicidas tradicionalmente utilizados no controle da septoriose do tomateiro em Santa Catarina, durante as safras 2016 e 2017.  Nos experimentos in vitro, 13 isolados de S. lycopersici obtidos de folhas com sintomas de septoriose do tomateiro de diferentes cultivares e os fungicidas tiofanato metílico e mancozeb nas concentrações de 0,1; 1,0; 10; 100 e 1000 mg L-1 do ingrediente ativo (i.a), foram avaliados para determinar a  dose efetiva na inibição de 50% da germinação de esporos (DE50) e o fator de redução de sensibilidade (FRS). Os isolados provenientes de lavouras que receberam aplicações de fungicidas foram comparados com os isolados 475-1, 475-3, 475-4 e 475-7 proveniente de lavouras que não receberam aplicações de fungicidas. Nos experimentos in vivo, os fungicidas preventivos azoxistrobina, clorotalonil, captana e mancozeb e os curativos tiofanato metílico, mancozeb, difenoconazol e metconazol nas doses comerciais foram pulverizados 12, 24, 36, 48, 72 e 96 h antes...(AU)

Septoria leaf spot is one of the main diseases affecting tomato. Its damages vary according to susceptible cultivar, pathogen physiological races, and environmental conditions. The objectives of this study were to assess the inhibitory concentration of 50% of spores (IC50), the sensitivity reduction factor (SRF) of Septoria lycopersici isolates, and the effectiveness of fungicides traditionally used to control Septoria Leaf Spot (SLS) in tomato in the state of Santa Catarina, Brazil, during the 2016 and 2017 crop seasons. For the in vitro experiment, 13 S. lycopersici isolates were obtained from leaves displaying SLS symptoms from different tomato cultivars. The fungicides thiophanate methyl and mancozeb were evaluated at concentrations of 0.1; 1.0; 10; 100 and 1000 mg L-1 of active ingredient to determine the effective dose for inhibiting 50% of spore germination (DE50) and the sensitivity reduction factor (FRS). The S. lycopersici isolates derived from tomato crops that were sprayed with these fungicides were compared with the isolates 475-1, 475-3, 475-4, and 475-7 obtained from tomato crops that remained unsprayed. For the in vivo experiments, the preventive fungicides azoxystrobin, chlorothalonil, captan, and mancozeb and the curative fungicides thiophanate methyl, mancozeb, difenoconazole, and methconazole were sprayed at the commercial dose at 12, 24, 36, 48, 72...(AU)

Grain quality of maize hybrids submitted to different sowing times and nitrogen rates / Qualidade de grãos de híbridos de milho submetidos em diferentes épocas de semeadura e doses de nitrogênio

Grain quality is essential in the food industry, and it shows variations depending on crop management conditions in the field. The objective of this study was to quantify the effect of hybrids, sowing seasons, and topdressing nitrogen rates on the incidence of damaged grains and their correlation with pathogenic fungi. The experiment was conducted under field conditions in Atalanta, Santa Catarina, Brazil, in a split split-plot randomized block design consisting of the AG9025 PRO3 (super-early) and 30F53 VYH (early) hybrids, preferential (September 20) and late (December 5) sowing season, and nitrogen rates (0, 150, 300, and 450 kg ha-1). The percentage of normal, fermented, and burned grains, as well as the incidence of fungi in grains, were quantified. The hybrid 30F53 VYH had shown the lowest percentage of fermented grains (8.4%) when compared to the hybrid AG9025 PRO3 (43.2%). No significant difference was observed between the sowing season for fermented grains. The hybrid AG9025 PRO3 had shown an increase in fermented grains with nitrogen addition, while the hybrid 30F53 VYH presented a stable behavior. The hybrid AG9025 PRO3 (35.5%) showed the lowest incidence of Fusarium verticillioides in the grains when compared to the hybrid 30F53 VYH (49.9%). The fungus incidence was also lower in the preferential sowing season (35.7%) than in the late one (49.7%). The hybrid AG9025...

A qualidade dos grãos é essencial na indústria alimentícia e mostra variações dependendo das condições de manejo da cultura no campo. O objetivo deste estudo foi quantificar o efeito de híbridos, épocas de semeadura e doses de nitrogênio em cobertura sobre a incidência de grãos avariados e sua correlação com fungos patogênicos. O experimento foi conduzido em condições de campo, em Atalanta, Santa Catarina, Brasil, em delineamento de blocos ao acaso, em parcelas sub-subdivididas, constituído pelos híbridos AG9025 PRO3 (super-precoce) e 30F53 VYH (precoce), semeadura preferencial (20 de setembro) e tardia (5 de dezembro) e doses de nitrogênio em cobertura (0, 150, 300 e 450 kg ha-1). O percentual de grãos normais, fermentados e avariados, bem como a incidência de fungos em grãos, foram quantificados. O híbrido 30F53 VYH apresentou o menor percentual de grãos fermentados (8,4%) quando comparado ao híbrido AG9025 PRO3 (43,2%). Nenhuma diferença significativa foi observada entre as épocas de semeadura nos grãos fermentados. O híbrido AG9025 PRO3 apresentou um aumento nos grãos fermentados com adição de nitrogênio, enquanto o híbrido 30F53 VYH apresentou comportamento estável. O híbrido AG9025 PRO3 (35,5%) apresentou a menor incidência de Fusarium verticillioides nos grãos quando comparado ao híbrido 30F53 VYH (49,9%). A incidência do fungo foi menor também na época de semeadura...

Sensibilidade de isolados de Septoria lycopersici e eficácia de fungicidas no controle de septoriose em tomateiro / Sensitivity of Septoria lycopersici isolates and effectiveness of fungicides for the control of Septoria leaf spot in tomato

A septoriose é uma das principais doenças do tomateiro e os prejuízos causados variam em função da área cultivada com cultivar suscetível, raças fisiológicas do patógeno e condições climáticas. O objetivo do estudo foi determinar a dose efetiva na inibição de 50% da germinação de esporos (DE50), avaliar o fator de redução de sensibilidade (FRS) de isolados de Septoria lycopersici e a eficiência de fungicidas tradicionalmente utilizados no controle da septoriose do tomateiro em Santa Catarina, durante as safras 2016 e 2017.  Nos experimentos in vitro, 13 isolados de S. lycopersici obtidos de folhas com sintomas de septoriose do tomateiro de diferentes cultivares e os fungicidas tiofanato metílico e mancozeb nas concentrações de 0,1; 1,0; 10; 100 e 1000 mg L-1 do ingrediente ativo (i.a), foram avaliados para determinar a  dose efetiva na inibição de 50% da germinação de esporos (DE50) e o fator de redução de sensibilidade (FRS). Os isolados provenientes de lavouras que receberam aplicações de fungicidas foram comparados com os isolados 475-1, 475-3, 475-4 e 475-7 proveniente de lavouras que não receberam aplicações de fungicidas. Nos experimentos in vivo, os fungicidas preventivos azoxistrobina, clorotalonil, captana e mancozeb e os curativos tiofanato metílico, mancozeb, difenoconazol e metconazol nas doses comerciais foram pulverizados 12, 24, 36, 48, 72 e 96 h antes...

Septoria leaf spot is one of the main diseases affecting tomato. Its damages vary according to susceptible cultivar, pathogen physiological races, and environmental conditions. The objectives of this study were to assess the inhibitory concentration of 50% of spores (IC50), the sensitivity reduction factor (SRF) of Septoria lycopersici isolates, and the effectiveness of fungicides traditionally used to control Septoria Leaf Spot (SLS) in tomato in the state of Santa Catarina, Brazil, during the 2016 and 2017 crop seasons. For the in vitro experiment, 13 S. lycopersici isolates were obtained from leaves displaying SLS symptoms from different tomato cultivars. The fungicides thiophanate methyl and mancozeb were evaluated at concentrations of 0.1; 1.0; 10; 100 and 1000 mg L-1 of active ingredient to determine the effective dose for inhibiting 50% of spore germination (DE50) and the sensitivity reduction factor (FRS). The S. lycopersici isolates derived from tomato crops that were sprayed with these fungicides were compared with the isolates 475-1, 475-3, 475-4, and 475-7 obtained from tomato crops that remained unsprayed. For the in vivo experiments, the preventive fungicides azoxystrobin, chlorothalonil, captan, and mancozeb and the curative fungicides thiophanate methyl, mancozeb, difenoconazole, and methconazole were sprayed at the commercial dose at 12, 24, 36, 48, 72...

Tratamento de sementes sobre a germinação, o vigor e o desenvolvimento do trigo / Seed treatment on germination, vigor and development of wheat

O tratamento de sementes (TS) é uma importante ferramenta no manejo de doenças na cultura do trigo, embora poucos produtos sejam indicados para esse fim. Por isso, a pesquisa deve realizar trabalhos relacionados à efetividade de diferentes produtos no TS e também o possível efeito fitotóxico. Os objetivos deste trabalho foram realizar testes fisiológicos em sementes e avaliar o desenvolvimento de duas cultivares de trigo (BRS Guamirim e TBIO Toruk), submetidas a 13 diferentes tratamentos de sementes. Para cada tratamento foram analisados a germinação e o vigor. As sementes tratadas também foram semeadas a campo, onde se determinou a emergência a campo e massa fresca de raiz e parte aérea. As sementes tratadas com azoxistrobina e Bacillus amyloliquefaciens resultaram em decréscimo na germinação da cultivar TBIO Toruk. Na análise do vigor houve diferença entre os tratamentos testados para as duas cultivares, sendo que houve redução do vigor em sementes tratadas com dimetomorfe para TBIO Toruk e azoxistrobina para a cultivar BRS Guamirim. As sementes submetidas ao tratamento Carboxamida A resultaram em plântulas com maiores valores de massa fresca de raiz e parte aérea. Os resultados apresentados permitem a seleção de produtos com baixa ou ausência de fitotoxidade para incorporação no manejo de doenças no trigo.(AU)

Seed treatment (ST) is an important tool in the management of diseases in the wheat crop, although few products are indicated for this purpose. The research must carry out studies related to the ST effectiveness using different products and the possible phytotoxic effect. The aim of this study was to perform physiological tests on seeds and evaluate the development of two wheat cultivars (BRS Guamirim and TBIO Toruk), submitted to 13 different ST. Germination and vigor were analyzed for each treatment. The treated seeds were also sown to the field, where the field emergence and fresh root and shoot mass were determined. In the germination test, the seeds treated azoxystrobin and Bacillus amyloliquefaciens presented a decrease in the cultivar TBIO Toruk. Vigor analyzes indicated differences between treatments in the two cultivars, and the dimethomorph treatment presented the lowest vigor for TBIO Toruk and azoxystrobin for the BRS Guamirim. The seeds submitted to the Carboxamide A treatment showed seedlings the highest values of fresh root and shoot mass. The results presented allow the selection of products with low or no phytotoxicity for incorporating in wheat disease management.(AU)

Tratamento de sementes sobre a germinação, o vigor e o desenvolvimento do trigo / Seed treatment on germination, vigor and development of wheat

O tratamento de sementes (TS) é uma importante ferramenta no manejo de doenças na cultura do trigo, embora poucos produtos sejam indicados para esse fim. Por isso, a pesquisa deve realizar trabalhos relacionados à efetividade de diferentes produtos no TS e também o possível efeito fitotóxico. Os objetivos deste trabalho foram realizar testes fisiológicos em sementes e avaliar o desenvolvimento de duas cultivares de trigo (BRS Guamirim e TBIO Toruk), submetidas a 13 diferentes tratamentos de sementes. Para cada tratamento foram analisados a germinação e o vigor. As sementes tratadas também foram semeadas a campo, onde se determinou a emergência a campo e massa fresca de raiz e parte aérea. As sementes tratadas com azoxistrobina e Bacillus amyloliquefaciens resultaram em decréscimo na germinação da cultivar TBIO Toruk. Na análise do vigor houve diferença entre os tratamentos testados para as duas cultivares, sendo que houve redução do vigor em sementes tratadas com dimetomorfe para TBIO Toruk e azoxistrobina para a cultivar BRS Guamirim. As sementes submetidas ao tratamento Carboxamida A resultaram em plântulas com maiores valores de massa fresca de raiz e parte aérea. Os resultados apresentados permitem a seleção de produtos com baixa ou ausência de fitotoxidade para incorporação no manejo de doenças no trigo.

Seed treatment (ST) is an important tool in the management of diseases in the wheat crop, although few products are indicated for this purpose. The research must carry out studies related to the ST effectiveness using different products and the possible phytotoxic effect. The aim of this study was to perform physiological tests on seeds and evaluate the development of two wheat cultivars (BRS Guamirim and TBIO Toruk), submitted to 13 different ST. Germination and vigor were analyzed for each treatment. The treated seeds were also sown to the field, where the field emergence and fresh root and shoot mass were determined. In the germination test, the seeds treated azoxystrobin and Bacillus amyloliquefaciens presented a decrease in the cultivar TBIO Toruk. Vigor analyzes indicated differences between treatments in the two cultivars, and the dimethomorph treatment presented the lowest vigor for TBIO Toruk and azoxystrobin for the BRS Guamirim. The seeds submitted to the Carboxamide A treatment showed seedlings the highest values of fresh root and shoot mass. The results presented allow the selection of products with low or no phytotoxicity for incorporating in wheat disease management.

Molecular characterization of GSyV-1 and GLRaV-3 and prevalence of grapevine viruses in a grape-growing area

The aims of this study were to determine the prevalence of viruses in 119 samples from 32 grapevine cultivars, collected from nine vineyards in a specific grape-growing area in southeastern Brazil, perform a partial molecular characterization of 14 isolates of Grapevine Syrah virus 1 (GSyV-1) and Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) and assess the coat protein genetic variability of these viruses. The detection of viruses was implemented by real-time RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) aiming to detect seven viruses and one viroid. With the exception of the Grapevine Cabernet Sauvignon reovirus (GCSV), the viruses and viroid that were evaluated were widespread in the sampled areas, often in high prevalence and multiple infections, ranging from 15 % up to 76 %. Eight isolates of GSyV-1 and six of GLRaV-3, partially characterized by complete coat protein gene nucleotide sequencing and a variability study showed nucleotide identities ranging from 91 % to 99 % (GSyV-1) and from 98 % to 100 % (GLRaV-3) among themselves, respectively. Comparisons between conventional and real-time RT-PCR detections were implemented for GSyV-1 and GLRaV-3 infections. Analysis of genetic variability indicated molecular differences between GSyV-1 and GLRaV-3 isolates and negative selection acting on the coat protein gene of both viruses. This is the first report of GSyV-1 in commercial vineyards in Brazil. The survey revealed widespread infections of seven important pathogens in one prominent Brazilian grape-producing region implying contaminated grapevine cuttings in the spread of disease.(AU)

Molecular characterization of GSyV-1 and GLRaV-3 and prevalence of grapevine viruses in a grape-growing area

The aims of this study were to determine the prevalence of viruses in 119 samples from 32 grapevine cultivars, collected from nine vineyards in a specific grape-growing area in southeastern Brazil, perform a partial molecular characterization of 14 isolates of Grapevine Syrah virus 1 (GSyV-1) and Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) and assess the coat protein genetic variability of these viruses. The detection of viruses was implemented by real-time RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) aiming to detect seven viruses and one viroid. With the exception of the Grapevine Cabernet Sauvignon reovirus (GCSV), the viruses and viroid that were evaluated were widespread in the sampled areas, often in high prevalence and multiple infections, ranging from 15 % up to 76 %. Eight isolates of GSyV-1 and six of GLRaV-3, partially characterized by complete coat protein gene nucleotide sequencing and a variability study showed nucleotide identities ranging from 91 % to 99 % (GSyV-1) and from 98 % to 100 % (GLRaV-3) among themselves, respectively. Comparisons between conventional and real-time RT-PCR detections were implemented for GSyV-1 and GLRaV-3 infections. Analysis of genetic variability indicated molecular differences between GSyV-1 and GLRaV-3 isolates and negative selection acting on the coat protein gene of both viruses. This is the first report of GSyV-1 in commercial vineyards in Brazil. The survey revealed widespread infections of seven important pathogens in one prominent Brazilian grape-producing region implying contaminated grapevine cuttings in the spread of disease.

European apple canker: morphophysiological variability and pathogenicity in isolates of Neonectria ditissima in southern Brazil / Cancro europeu da macieira: variabilidade morfofisiológicas e patogenicidade de isolados de Neonectria ditissima no sul do Brasil

European apple canker (EC) is caused by Neonectria ditissima, a pathogen officially registered as a quarantine pest in 2012. Thirty-five isolates of N. ditissima of different geographical regions of southern Brazil from apple branches showing symptoms of EC were identified by the specific pair primers Ch1 and Ch2 and analyzed concerning the virulence on Gala apple cultivar and morphophysiological characteristics. The disease symptoms were characterized and the isolates compared based on average mycelium growth (AMG), mycelium growth index (MGI), colony color, conidia type, dimensions and growth on potato dextrose agar (PDA), malt agar (AM), and synthetic SNAY (SN) culture media. Nineteen isolates showed the greatest AMG on PDA, forming three growth groups of 35.56 (GI), 52.71 (GII), and 62.67mm (GIII). Seven isolates showed MGI greater than 4.0mm diameter on PDA compared with that on AM and SN. The highest conidia production was on SN, and the predominant colony color in all media was white to beige with central pigmentation of brown and borders colored in shades of beige. There were significant differences among the average dimensions of micro- and macroconidia on PDA, AM, and SN. The pathogenicity was confirmed for all isolates despite of different morphophysiological characteristics. There was no correlation among isolates morphophysiological variability, virulence, and geographical origin.(AU)

O cancro europeu (CE) da macieira é causado pelo fungo Neonectria ditissima e foi oficialmente registrado como praga quarentenária em 2012. Foram avaliados 35 isolados de N. ditissima provenientes de ramos de macieira com sintomas típicos de CE de diferentes regiões do sul do Brasil. Os isolados foram identificados pelos primers específicos Ch1 e Ch2 e analisados quanto as características morfofisiológicas e virulência na cultivar de macieira Gala. Os sintomas foram caracterizados e os isolados comparados com base no crescimento micelial médio (CMM), índice de crescimento micelial (ICM), coloração das colônias e tipos, dimensões e produção de conídios em meios de cultura batata-dextrose-ágar (BDA), malte-ágar (MA) e meio sintético SNAY (SS). Dezenove isolados tiveram os maiores CMM sobre BDA, formando três grupos de crescimento de 35.56 (GI), 52.71 (GII) e 62.67mm (GIII). Sete isolados tiveram ICM maior de 4mm de diâmetro sobre BDA quando comparados com os meios MA e SS. A maior produção de conídios ocorreu sobre o meio SS e a coloração predominante foi de branco-à-bege com pigmentação central marrom e bordas de colônia em tons de bege. Foram observadas diferenças significativas nas dimensões médias dos micro- e macroconídios sobre os meios de culturas BDA, MA e SS. Todos os isolados foram patogênicos na cultivar de macieira gala, independentemente das diferenças morfofisiológicas. Não foram observadas correlações entre a variabilidade morfofisiológicas, virulência e origem geográfica dos isolados.(AU)

European apple canker: morphophysiological variability and pathogenicity in isolates of Neonectria ditissima in southern Brazil / Cancro europeu da macieira: variabilidade morfofisiológicas e patogenicidade de isolados de Neonectria ditissima no sul do Brasil

European apple canker (EC) is caused by Neonectria ditissima, a pathogen officially registered as a quarantine pest in 2012. Thirty-five isolates of N. ditissima of different geographical regions of southern Brazil from apple branches showing symptoms of EC were identified by the specific pair primers Ch1 and Ch2 and analyzed concerning the virulence on Gala apple cultivar and morphophysiological characteristics. The disease symptoms were characterized and the isolates compared based on average mycelium growth (AMG), mycelium growth index (MGI), colony color, conidia type, dimensions and growth on potato dextrose agar (PDA), malt agar (AM), and synthetic SNAY (SN) culture media. Nineteen isolates showed the greatest AMG on PDA, forming three growth groups of 35.56 (GI), 52.71 (GII), and 62.67mm (GIII). Seven isolates showed MGI greater than 4.0mm diameter on PDA compared with that on AM and SN. The highest conidia production was on SN, and the predominant colony color in all media was white to beige with central pigmentation of brown and borders colored in shades of beige. There were significant differences among the average dimensions of micro- and macroconidia on PDA, AM, and SN. The pathogenicity was confirmed for all isolates despite of different morphophysiological characteristics. There was no correlation among isolates morphophysiological variability, virulence, and geographical origin.

O cancro europeu (CE) da macieira é causado pelo fungo Neonectria ditissima e foi oficialmente registrado como praga quarentenária em 2012. Foram avaliados 35 isolados de N. ditissima provenientes de ramos de macieira com sintomas típicos de CE de diferentes regiões do sul do Brasil. Os isolados foram identificados pelos primers específicos Ch1 e Ch2 e analisados quanto as características morfofisiológicas e virulência na cultivar de macieira Gala. Os sintomas foram caracterizados e os isolados comparados com base no crescimento micelial médio (CMM), índice de crescimento micelial (ICM), coloração das colônias e tipos, dimensões e produção de conídios em meios de cultura batata-dextrose-ágar (BDA), malte-ágar (MA) e meio sintético SNAY (SS). Dezenove isolados tiveram os maiores CMM sobre BDA, formando três grupos de crescimento de 35.56 (GI), 52.71 (GII) e 62.67mm (GIII). Sete isolados tiveram ICM maior de 4mm de diâmetro sobre BDA quando comparados com os meios MA e SS. A maior produção de conídios ocorreu sobre o meio SS e a coloração predominante foi de branco-à-bege com pigmentação central marrom e bordas de colônia em tons de bege. Foram observadas diferenças significativas nas dimensões médias dos micro- e macroconídios sobre os meios de culturas BDA, MA e SS. Todos os isolados foram patogênicos na cultivar de macieira gala, independentemente das diferenças morfofisiológicas. Não foram observadas correlações entre a variabilidade morfofisiológicas, virulência e origem geográfica dos isolados.

European apple canker: morphophysiological variability and pathogenicity in isolates of Neonectria ditissima in southern Brazil / Cancro europeu da macieira: variabilidade morfofisiológicas e patogenicidade de isolados de Neonectria ditissima no sul do Brasil

ABSTRACT: European apple canker (EC) is caused by Neonectria ditissima, a pathogen officially registered as a quarantine pest in 2012. Thirty-five isolates of N. ditissima of different geographical regions of southern Brazil from apple branches showing symptoms of EC were identified by the specific pair primers Ch1 and Ch2 and analyzed concerning the virulence on Gala apple cultivar and morphophysiological characteristics. The disease symptoms were characterized and the isolates compared based on average mycelium growth (AMG), mycelium growth index (MGI), colony color, conidia type, dimensions and growth on potato dextrose agar (PDA), malt agar (AM), and synthetic SNAY (SN) culture media. Nineteen isolates showed the greatest AMG on PDA, forming three growth groups of 35.56 (GI), 52.71 (GII), and 62.67mm (GIII). Seven isolates showed MGI greater than 4.0mm diameter on PDA compared with that on AM and SN. The highest conidia production was on SN, and the predominant colony color in all media was white to beige with central pigmentation of brown and borders colored in shades of beige. There were significant differences among the average dimensions of micro- and macroconidia on PDA, AM, and SN. The pathogenicity was confirmed for all isolates despite of different morphophysiological characteristics. There was no correlation among isolates morphophysiological variability, virulence, and geographical origin.

RESUMO: O cancro europeu (CE) da macieira é causado pelo fungo Neonectria ditissima e foi oficialmente registrado como praga quarentenária em 2012. Foram avaliados 35 isolados de N. ditissima provenientes de ramos de macieira com sintomas típicos de CE de diferentes regiões do sul do Brasil. Os isolados foram identificados pelos primers específicos Ch1 e Ch2 e analisados quanto as características morfofisiológicas e virulência na cultivar de macieira Gala. Os sintomas foram caracterizados e os isolados comparados com base no crescimento micelial médio (CMM), índice de crescimento micelial (ICM), coloração das colônias e tipos, dimensões e produção de conídios em meios de cultura batata-dextrose-ágar (BDA), malte-ágar (MA) e meio sintético SNAY (SS). Dezenove isolados tiveram os maiores CMM sobre BDA, formando três grupos de crescimento de 35.56 (GI), 52.71 (GII) e 62.67mm (GIII). Sete isolados tiveram ICM maior de 4mm de diâmetro sobre BDA quando comparados com os meios MA e SS. A maior produção de conídios ocorreu sobre o meio SS e a coloração predominante foi de branco-à-bege com pigmentação central marrom e bordas de colônia em tons de bege. Foram observadas diferenças significativas nas dimensões médias dos micro- e macroconídios sobre os meios de culturas BDA, MA e SS. Todos os isolados foram patogênicos na cultivar de macieira gala, independentemente das diferenças morfofisiológicas. Não foram observadas correlações entre a variabilidade morfofisiológicas, virulência e origem geográfica dos isolados.