RESUMO
Human respiratory syncytial virus (HRSV) strains were isolated from nasopharyngeal aspirates collected from 965 children between 2004 and 2005, yielding 424 positive samples. We sequenced the small hydrophobic protein (SH) gene of 117 strains and compared them with other viruses identified worldwide. Phylogenetic analysis showed a low genetic variability among the isolates but allowed us to classify the viruses into different genotypes for both groups, HRSVA and HRSVB. It is also shown that the novel BA-like genotype was well segregated from the others, indicating that the mutations are not limited to the G gene.
Assuntos
Polimorfismo Genético , Infecções por Vírus Respiratório Sincicial/epidemiologia , Infecções por Vírus Respiratório Sincicial/virologia , Vírus Sincicial Respiratório Humano/classificação , Vírus Sincicial Respiratório Humano/genética , Proteínas Oncogênicas de Retroviridae/genética , Pré-Escolar , Análise por Conglomerados , Genótipo , Humanos , Lactente , Epidemiologia Molecular , Dados de Sequência Molecular , Nasofaringe/virologia , Filogenia , RNA Viral/genética , Vírus Sincicial Respiratório Humano/isolamento & purificação , Análise de Sequência de DNA , Homologia de Sequência de AminoácidosRESUMO
The Human Respiratory Syncytial Virus (HRSV), isolated in 1955, is the main cause of hospitalization of babies and infants with respiratory illness. Several studies have been conducted worldwide aiming the development of a safe and effective vaccine against HRSV. The G2 region of glycoprotein G is used as genotyping default. In the present study, we performed a phylogenetic analysis of G protein and a comparative study between G2 region and ectodomain of attachment glycoprotein. Fifty-three nasal swab samples from children less than 5 years old and presenting symptoms of acute respiratory illness, assisted at the University Hospital (UH) of University of Sao Paulo (USP) in 2004, were submitted to sequencing by PCR and compared with GenBank sequences. We concluded that the G2 region is adequate for HRSV genotyping.
O vírus respiratório sincicial humano (HRSV), isolado em 1955, é a principal causa da hospitalização de bebês e crianças pequenas com sintomas de doença respiratória. No mundo inteiro, vários estudos para o desenvolvimento de uma vacina segura e eficiente contra o HRSV têm tido alta prioridade. A região G2 da glicoproteína G é usada como padrão para genotipagem do HRSV. Neste estudo, foi realizada a análise filogenética da glicoproteína G e o estudo comparativo entre a região G2 e o ectodomínio dessa glicoproteína. Cinquenta e três amostras de swab nasal de crianças com menos de cinco anos de idade, apresentando doença respiratória aguda, atendidas no Hospital Universitário (HU) da Universidade de São Paulo durante o ano de 2004, foram submetidas a sequenciamento por PCR e comparadas com seqüências do GenBank. A região G2 mostrou ser adequada para a genotipagem do HRSV.
