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Methods Mol Biol ; 2324: 255-262, 2021.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-34165720

RESUMO

NANOG is an embryonic transcription factor, which gets reexpressed in cancer stem or tumor initiating cells. NANOGP8, a retrogene belonging to the NANOG family, is predominantly expressed in cancer cells and shows very high similarity with NANOG both at the nucleotide and at the protein level. The high similarity makes it extremely challenging to distinguish between these two transcription factors. Here we describe a highly efficient restriction endonuclease-based assay, which is performed on cDNA and allows to distinguish NANOGP8 from NANOG. This assay is critical to understand the specific role of NANOGP8 in cancer stemness, which in turn helps to unravel the therapeutic potential of targeting this undruggable transcription factor through gene therapy, for treatment of various cancers.


Assuntos
Desoxirribonucleases de Sítio Específico do Tipo II , Proteína Homeobox Nanog/genética , Mapeamento por Restrição/métodos , Biomarcadores Tumorais/genética , Linhagem Celular Tumoral , DNA Complementar/genética , Eletroforese em Gel de Ágar , Humanos , Neoplasias/genética , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa/métodos , Alinhamento de Sequência , Homologia de Sequência do Ácido Nucleico , Especificidade por Substrato
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