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Nat Genet ; 40(6): 730-40, 2008 Jun.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-18488030

RESUMO

Gastric cancer is classified into intestinal and diffuse types, the latter including a highly malignant form, linitis plastica. A two-stage genome-wide association study (stage 1: 85,576 SNPs on 188 cases and 752 references; stage 2: 2,753 SNPs on 749 cases and 750 controls) in Japan identified a significant association between an intronic SNP (rs2976392) in PSCA (prostate stem cell antigen) and diffuse-type gastric cancer (allele-specific odds ratio (OR) = 1.62, 95% CI = 1.38-1.89, P = 1.11 x 10(-9)). The association was far less significant in intestinal-type gastric cancer. We found that PSCA is expressed in differentiating gastric epithelial cells, has a cell-proliferation inhibition activity in vitro and is frequently silenced in gastric cancer. Substitution of the C allele with the risk allele T at a SNP in the first exon (rs2294008, which has r(2) = 0.995, D' = 0.999 with rs2976392) reduces transcriptional activity of an upstream fragment of the gene. The same risk allele was also significantly associated with diffuse-type gastric cancer in 457 cases and 390 controls in Korea (allele-specific OR = 1.90, 95% CI = 1.56-2.33, P = 8.01 x 10(-11)). The polymorphism of the PSCA gene, which is possibly involved in regulating gastric epithelial-cell proliferation, influences susceptibility to diffuse-type gastric cancer.


Assuntos
Predisposição Genética para Doença , Variação Genética , Genoma Humano/genética , Glicoproteínas de Membrana/genética , Proteínas de Neoplasias/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Neoplasias Gástricas/genética , Adenocarcinoma/genética , Adenocarcinoma/patologia , Adenocarcinoma Mucinoso/genética , Adenocarcinoma Mucinoso/patologia , Animais , Antígenos de Neoplasias , Células CHO , Carcinoma Papilar/genética , Carcinoma Papilar/patologia , Carcinoma de Células em Anel de Sinete/genética , Carcinoma de Células em Anel de Sinete/patologia , Estudos de Casos e Controles , Proliferação de Células , Cricetinae , Cricetulus , Epitélio , Éxons/genética , Proteínas Ligadas por GPI , Frequência do Gene , Haplótipos/genética , Humanos , Técnicas Imunoenzimáticas , Neoplasias Intestinais , Japão , Coreia (Geográfico) , Desequilíbrio de Ligação , Glicoproteínas de Membrana/metabolismo , Camundongos , Proteínas de Neoplasias/metabolismo , Razão de Chances , Regiões Promotoras Genéticas , RNA Mensageiro/genética , RNA Mensageiro/metabolismo , Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa , Neoplasias Gástricas/patologia , Transcrição Gênica
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