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Oncol Rep ; 15(4): 749-55, 2006 Apr.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-16525654

RESUMO

We analyzed hTERT splicing patterns with respect to telomerase activity in breast cancer. Using a cDNA microarray in 22 cell lines, we observed the difference in expression profiling based on the different levels of full-length variant expression with 71 selected genes. Using 33 known genes that act with the telomerase complex, we performed unsupervised clustering with all cell lines, and found a clustering tendency related to the full-length variant expression level. Using array-based CGH, highly altered genomic copy number changes were found more often in MCF-7 (159 genes) than in MDA-MB-231 (109 genes) and MDA-MB-435 (49 genes), suggesting more genomic changes in MCF-7 cells. On comparing MCF-7 with MDA-MB231 and MDA-MB-435 cell lines, we identified 8 genes with different copy numbers, including dystroglycan, which is located in the p12-21.2 area of chromosome 3. In conclusion, alterations in the level of the full-length variant of hTERT showed different gene expression profiles and genomic copy number changes in breast cancer, which require further study into their cause-and-effect relationship.


Assuntos
Proteínas de Ligação a DNA/genética , Perfilação da Expressão Gênica , Telomerase/genética , Processamento Alternativo/genética , Neoplasias da Mama/enzimologia , Neoplasias da Mama/genética , Neoplasias da Mama/patologia , Linhagem Celular , Linhagem Celular Tumoral , Mapeamento Cromossômico , Análise por Conglomerados , Proteínas de Ligação a DNA/metabolismo , Dosagem de Genes , Regulação Neoplásica da Expressão Gênica/genética , Células HCT116 , Células HL-60 , Células HeLa , Humanos , Isoenzimas/genética , Isoenzimas/metabolismo , Análise de Sequência com Séries de Oligonucleotídeos/métodos , Telomerase/metabolismo
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