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Front Biosci (Landmark Ed) ; 24(4): 700-711, 2019 03 01.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-30844706

RESUMO

A new method of coding of genetic information using laser speckles has been developed. Specific technique of transforming the nucleotide of gene into a speckle pattern (gene-based speckles or GB-speckles) is suggested. Reference speckle patterns of omp1 gene of typical wild strains of Chlamydia trachomatis of genovars D, E, F, G, and J are generated. This is the first report in which perspectives of the proposed technique in the bacterial gene identification and detection of natural genetic mutations in bacteria as a single nucleotide polymorphism (SNP) are demonstrated. The usage of GB-speckles can be viewed as the next step on the way to the era of digital biology.


Assuntos
Armazenamento e Recuperação da Informação/métodos , Interferometria/métodos , Lasers , Nucleotídeos/química , Algoritmos , Bactérias/genética , Chlamydia trachomatis/genética , Biologia Computacional , Bases de Dados Genéticas , Genótipo , Mutação , Óptica e Fotônica , Reação em Cadeia da Polimerase , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Porinas/genética , Análise de Sequência de DNA , Processamento de Sinais Assistido por Computador
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