A genome-wide analysis of cardiac lesions of pigs that die during transport: Is heart failure of in-transit-loss pigs associated with a heritable cardiomyopathy?

While heart failure is a primary cause of death for many in-transit-loss (ITL) pigs, the underlying cause of these deaths is not known. Cardiomyopathies are considered a common cause of heart failure in humans and often have a genetic component. The objective of this study was to determine if genes associated with cardiomyopathies could be identified in ITL pigs. Samples from the hearts of pigs that died during transport to an abattoir in Ontario, Canada were collected and genotyped along with samples from pigs that did not die during transport (ILT hearts: n = 149; non-ITL/control hearts: n = 387). Genome-wide analyses were carried out on each of the determined phenotypes (gross cardiac lesions) using a medium density single nucleotide polymorphism (SNP) chip and 500 kb windows/regions for analysis, with 250 kb regions of overlap. The distribution derived by a multidimensional scaling (MDS) analysis of all phenotypes demonstrated a lack of complete separation between phenotypes of affected and unaffected animals, which made diagnosis difficult. Although genetic differences were small, a few genes associated with dilated cardiomyopathy (DCM) and arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVM) were identified. In addition, multiple genes associated with cardiac arrhythmias and ventricular hypertrophy were identified that can possibly result in heart failure. The results of this preliminary study did not provide convincing evidence that a single, heritable cardiomyopathy is the cause of heart failure in ITL pigs.

Bien que l'insuffisance cardiaque soit la principale cause de décès chez de nombreux porcs perdus en transit (ITL), la cause sous-jacente de ces décès n'est pas connue. Les cardiomyopathies sont considérées comme une cause fréquente d'insuffisance cardiaque chez l'homme et ont souvent une composante génétique. L'objectif de cette étude était de déterminer si des gènes associés aux cardiomyopathies pouvaient être identifiés chez les porcs ITL. Des échantillons de coeurs de porcs morts pendant le transport vers un abattoir en Ontario, au Canada, ont été prélevés et génotypés avec des échantillons de porcs qui ne sont pas morts pendant le transport (coeurs ILT: n = 149; coeurs non ITL/témoins: n = 387). Des analyses à l'échelle du génome ont été effectuées sur chacun des phénotypes déterminés (lésions cardiaques macroscopiques) en utilisant une puce de polymorphisme nucléotidique unique (SNP) de densité moyenne et des fenêtres/régions de 500 kb pour l'analyse, avec des régions de chevauchement de 250 kb. La distribution dérivée par une analyse de mise à l'échelle multidimensionnelle (MDS) de tous les phénotypes a démontré un manque de séparation complète entre les phénotypes des animaux affectés et non affectés, ce qui a rendu le diagnostic difficile. Bien que les différences génétiques soient minimes, quelques gènes associés à la cardiomyopathie dilatée (DCM) et à la cardiomyopathie arythmogène ventriculaire droite (ARVM) ont été identifiés. De plus, plusieurs gènes associés aux arythmies cardiaques et à l'hypertrophie ventriculaire ont été identifiés, pouvant éventuellement entraîner une insuffisance cardiaque. Les résultats de cette étude préliminaire n'ont pas fourni de preuves convaincantes qu'une seule cardiomyopathie héréditaire est la cause de l'insuffisance cardiaque chez les porcs ITL.(Traduit par Docteur Serge Messier).

Factors associated with good compliance and long-term sustainability in a practitioner-based livestock disease surveillance system.

The Ontario Farm call Surveillance Project (OFSP) was a practitioner-based, syndromic surveillance system for livestock disease. Three data-recording methods (paper, web-based, and handheld electronic) used by participating veterinarians were compared for timeliness (when the report arrived at the OFSP office), completeness of the report, and the usage and costs of incentives offered to veterinarians as compensation for their time to record data. There were no statistically significant differences in these parameters among the 3 data-recording methods. This indicates that different data-recording methods can be used within a single veterinary surveillance program while maintaining data integrity and timely reporting. Factors such as ease of data collection and providing incentives valued by veterinarians ensured high compliance and long-term participation in the project. It also increased the diversity of the participant group, reducing the likelihood of biased data submissions.

Facteurs associés à une bonne observance et à la durabilité à long terme dans un système de surveillance des maladies du bétail mis en œuvre par les praticiens. L'Ontario Farm call Surveillance Project (OFSP) a été un système de surveillance syndromique mis en œuvre par le praticien pour les maladies du bétail. Trois méthodes d'enregistrement des données (sur papier, sur Internet et par appareil portatif) utilisées par les vétérinaires participants ont été comparées pour la rapidité (lorsque le rapport arrivait au bureau de l'OFSP), l'intégralité du rapport ainsi que l'utilisation et les coûts des incitatifs offerts aux vétérinaires, comme la rémunération horaire, afin d'enregistrer les données. Il n'y a pas eu de différence significative sur le plan statistique de ces paramètres parmi les 3 méthodes d'enregistrement des données. Cela indique que les différentes méthodes d'enregistrement des données peuvent être utilisées dans le cadre d'un seul programme de surveillance vétérinaire tout en préservant l'intégrité des données et en assurant des rapports rapides. Des facteurs comme la facilité de la collecte des données et l'offre d'incitatifs appréciés par les vétérinaires ont garanti une observance élevée et une participation à long terme au projet. Ils ont aussi augmenté la diversité du groupe de participants, réduisant la probabilité de la soumission de données partiales.(Traduit par Isabelle Vallières).