Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.(AU)

Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.(AU)

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

Abstract The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Resumo Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria

Abstract The -lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p 0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Resumo Os medicamentos combinados de -lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Distinct carbapenems susceptibility profiles in isogenic isolates of Klebsiella pneumoniae presenting Ompk36 disruption and expression of down-regulated blaKPC-2 / Perfis distintos de suscetibilidade a carbapenêmicos em isolados isogênicos de Klebsiella pneumoniae apresentando interrupção de Ompk36 e expressão de blaKPC-2 negativamente regulada

The isolation of multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae in hospitals is a major public health threat, increasing patient hospitalization costs, morbidity and mortality. Therefore, this work investigated the resistance mechanisms that produced different carbapenems susceptibility profiles in two isogenic strains of K. pneumoniae isolated from the same patient in a public hospital in Recife, Pernambuco. The genes that encode the main porins in K. pneumoniae, ompK35 and ompK36, and several beta-lactamase genes were analyzed. The expression of these genes was evaluated by quantitative real time PCR (polymerase chain reaction) with reverse transcriptase (RT-qPCR). SDS-PAGE (sodium dodecyl sulphate­polyacrylamide gel electrophoresis) was performed to analyze the outer membrane proteins. The analysis of the ompK36 genetic environment disclosed an IS903 insertion sequence disrupting this gene in the ertapenem resistant isolate (KPN133). The blaKPC-2 gene showed down-regulated expression in both isolates. Our findings show that changes in porins, especially OmpK36, are more determinant to carbapenems susceptibility profile of bacterial isolates than variations in blaKPC gene expression.

O isolamento de Klebsiella pneumoniae multirresistente em hospitais é uma grande ameaça à saúde pública, aumentando os custos de internação, morbidade e mortalidade dos pacientes. Portanto, este trabalho investigou os mecanismos de resistência que produziram diferentes perfis de suscetibilidade aos carbapenêmicos em duas cepas isogênicas de K. pneumoniae isoladas do mesmo paciente em um hospital público em Recife, Pernambuco. Foram analisados ​​os genes que codificam as principais porinas em K. pneumoniae, ompK35 e ompK36, e diversos genes de beta-lactamases. A expressão desses genes foi avaliada por PCR (reação em cadeia da polimerase quantitativa em tempo real) com transcriptase reversa (RT-qPCR). SDS-PAGE (dodecil sulfato de sódio-poliacrilamida gel eletroforese) foi realizada para analisar as proteínas da membrana externa. A análise do ambiente genético ompK36 revelou uma sequência de inserção IS903 interrompendo este gene no isolado resistente ao ertapenem (KPN133). O gene blaKPC-2 apresentou expressão negativamente regulada em ambos os isolados. Nossos achados mostram que alterações nas porinas, especialmente OmpK36, são mais determinantes no perfil de suscetibilidade aos carbapenêmicos de isolados bacterianos do que variações na expressão do gene blaKPC.

Detection of antimicrobial residues in informal raw milk in the central-west of Minas Gerais / Detecção de resíduos de antimicrobianos em leite cru informal no centro-oeste de Minas Gerais

The presence of antimicrobial residues in informal milk, sold in inland cities, a situation commonly found in Brazilian cities, since the inspection of this type of product is incipient. As a case study, the municipalities of Arcos, Lagoa da Prata and Santo Antônio do Monte, in the center-west of Minas Gerais, were considered. Two collections were carried out in 22 informal sales points in 2020. To detect antimicrobial residues, the Trisensor® test was used, in which the presence of three groups of antimicrobials can be observed: beta-lactams, tetracyclines and sulfonamides. After performing the analyses, negative results were observed for the groups of tetracyclines and sulfonamides. However, when evaluating the beta-lactam group, positive results were observed: in a total of 44 samples, 54.5% were positive for the presence of beta-lactams (24 samples). The high incidence of antimicrobial residues in the analyzed samples (54.5%) confirms the need for surveillance of the product that is commercialized, and it is extremely important to adopt strict measures by inspection bodies since the presence of residues of antimicrobials in raw milk can, directly and indirectly, affect health.(AU)

O objetivo do presente estudo consiste em avaliar a presença de resíduos de antimicrobianos em leite informal, comercializados em cidades interioranas, situação comumente encontrada nas cidades brasileiras, visto que a fiscalização sobre este tipo de produto é incipiente. Como estudo de caso, foram considerados os municípios de Arcos, Lagoa da Prata e Santo Antônio do Monte, no centro-oeste de Minas Gerais. Foram realizadas duas coletas em 22 pontos de venda informal em 2020. Para detecção dos resíduos de antimicrobianos foi utilizado o teste Trisensor®, onde pode ser observada a presença de três grupos de antimicrobianos: beta-lactâmicos, tetraciclinas e sulfonamidas. Após a realização das análises, observou-se resultados negativos para os grupos das tetraciclinas e sulfonamidas. Entretanto, ao se avaliar o grupo dos beta-lactâmicos, observou-se resultados positivos significativos, onde em um total de 44 amostras, 54,5% foram positivas para a presença de beta-lactâmicos (24 amostras). A alta incidência de resíduos de antimicrobianos nas amostras analisadas (54,5%), confirma a necessidade da vigilância acerca do produto que é comercializado, sendo de extrema importância a adoção de medidas rigorosas por parte dos órgãos fiscalizadores, pois a presença de resíduos de antimicrobianos no leite cru pode afetar direta e indiretamente a saúde.(AU)

Beta-lactam antibiotics and viridans group streptococci / Antibióticos beta-lactámicos y estreptococos grupo viridans

Abstract The aim of this review is to present an update on the susceptibility of viridans groupstreptococci (VGS) to -lactam antimicrobials, with emphasis on the Argentinean scenario. VGSare a heterogeneous group including five groups of species, each one exhibiting peculiar sus-ceptibility patterns to penicillin (PEN). Species of the Streptococcus mitis group are frequentlynonsusceptible to PEN. PEN resistance is associated with changes in PEN-binding proteins. InArgentina, one to two thirds of VGS are nonsusceptible to PEN. Third generation cephalosporinsand carbapenems are currently more effective in vitro than PEN against VGS. Mortality was asso-ciated to nonsusceptibility to PEN in at least two studies involving patients with bacteremiacaused by VGS. Treatment of endocarditis due to VGS should be adjusted/to the PEN suscepti-bility of the isolates. Vancomycin may be an alternative choice for treating endocarditis causedby PEN-resistant isolates (MIC 4 g/ml).

Resumen El objetivo de esta revisión es presentar una actualización sobre la sensibilidad de los estreptococos del grupo viridans (EGV) a los antimicrobianos p-lactámicos, con énfasis en el escenario argentino. Los EGV son un grupo heterogéneo que incluye cinco grupos de especies, y cada una presenta su patrón especial de sensibilidad a la penicilina (PEN). Las especies del grupo Streptococcus mitis, con mayor frecuencia, no son sensibles a la PEN. La resistencia a la PEN se asocia con cambios de las proteínas ligadoras de PEN. En la Argentina, de uno a dos tercios de los EGV no son sensibles a la PEN. Las cefalosporinas de tercera generación y los carbapenemes son actualmente más eficaces in vitro que la PEN contra los EGV. La mortalidad se asoció con la no sensibilidad a la PEN en al menos dos estudios de pacientes con bacteriemia por EGV. El tratamiento de las endocarditis por EGV debe ajustarse según la sensibilidad a la PEN de los aislados. La vancomicina podría ser una elección alternativa para el tratamiento de las endocarditis por cepas resistentes a PEN (CIM >4 ^g/ml).

Beta-lactam antibiotics and viridans group streptococci.

The aim of this review is to present an update on the susceptibility of viridans group streptococci (VGS) to ß-lactam antimicrobials, with emphasis on the Argentinean scenario. VGS are a heterogeneous group including five groups of species, each one exhibiting peculiar susceptibility patterns to penicillin (PEN). Species of the Streptococcus mitis group are frequently nonsusceptible to PEN. PEN resistance is associated with changes in PEN-binding proteins. In Argentina, one to two thirds of VGS are nonsusceptible to PEN. Third generation cephalosporins and carbapenems are currently more effective in vitro than PEN against VGS. Mortality was associated to nonsusceptibility to PEN in at least two studies involving patients with bacteremia caused by VGS. Treatment of endocarditis due to VGS should be adjusted/to the PEN susceptibility of the isolates. Vancomycin may be an alternative choice for treating endocarditis caused by PEN-resistant isolates (MIC≥4µg/ml).

Mecanismos de resistencia en aislados clínicos de Klebsiella pneumoniae

Resumen La bacteria Klebsiella pneumoniae es la causante de infecciones intrahospitalarias multirresistentes, posee diversos mecanismos de resistencia como la producción de enzimas betalactamasas cuya acción afecta a los antibióticos betalactámicos. Objetivo: Caracterizar los mecanismos de resistencia presentes en aislados clínicos con Klebsiella pneumoniae identificados mediante métodos fenotípicos en el Hospital Monte Sinai desde enero de 2018 hasta agosto de 2020. Materiales y métodos: Estudio positivista con un enfoque cuantitativo de corte transversal descriptivo de diseño documental. La población estuvo conformada por 274 datos de aislados clínicos identificados con Klebsiella pneumoniae. Los cuales conformaron la totalidad de la muestra con un muestreo por cobertura total. Mismos que fueron recopilados de fuentes secundarias ingresados en la base de datos del departamento de Microbiología. Para el análisis se utilizó estadística descriptiva. Resultados: Klebsiella pneumoniae mostró mayor frecuencia en el año 2020 con el 35%. Se identificó al mecanismo de resistencia BLEE con el 27,7% y carbapenemasas tipo KPC con el 7.7 %, con mayor presencia en el sexo masculino. Presentó una mayor resistencia a Penicilinas, una sensibilidad moderada a Cefalosporinas, Aminoglucósidos, Quinolonas y una alta sensibilidad a los Carbapenémicos, Tigeciclina y Colistina. Los aislados se clasificaron como multidrogorresistentes, con mayor frecuencia en Urocultivo, Aspirado bronquial, Líquido corporal, Punta de Catéter y Hemocultivo en áreas de Hospitalización, UCI y Neonatología. Conclusiones: Los mecanismos de resistencia de K. pneumoniae a los antibióticos son un hallazgo común en ambientes hospitalarios independientemente de sexo, servicio hospitalario o tipo de muestra, convirtiéndose en un problema de salud pública.

Abstract The bacterium Klebsiella pneumoniae is the cause of multiresistant intrahospital infections, it has various resistance mechanisms such as the production of beta-lactamase enzymes whose action affects beta-lactam antibiotics. Objective: To characterize the resistance mechanisms present in clinical isolates with Klebsiella pneumoniae identified by phenotypic methods at Monte Sinai Hospital from January 2018 to August 2020. Materials and methods: Positivist study with a descriptive cross-sectional quantitative approach to documentary design. The population consisted of 274 data from clinical isolates identified with Klebsiella pneumoniae. Which made up the entire sample with a total coverage sampling. The same ones that were collected from secondary sources entered in the database of the Microbiology department. Descriptive statistics were used for the analysis. Results: Klebsiella pneumoniae showed a higher frequency in 2020 with 35%. The ESBL resistance mechanism was identified with 27.7% and KPC-type carbapenemases with 7.7%, with a higher presence in males. It presented a greater resistance to Penicillins, a moderate sensitivity to Cephalosporins, Aminoglycosides, Quinolones and a high sensitivity to Carbapenems, Tigecycline and Colistin. The isolates were classified as multidrug resistant, more frequently in Urine culture, Bronchial aspirate, Body fluid, Catheter Tip and Blood culture in Hospitalization, ICU and Neonatology areas. Conclusions: The resistance mechanisms of K. pneumoniae to antibiotics are a common finding in hospital settings regardless of sex, hospital service or type of sample, becoming a public health problem.

Resumo A bactéria Klebsiella pneumoniae é causa de infecções intra-hospitalares multirresistentes, possui diversos mecanismos de resistência como a produção de enzimas beta-lactamase cuja ação afeta os antibióticos beta-lactâmicos. Objetivo: Caracterizar os mecanismos de resistência presentes em isolados clínicos de Klebsiella pneumoniae identificados por métodos fenotípicos no Hospital Monte Sinai de janeiro de 2018 a agosto de 2020. Materiais e métodos: Estudo positivista com abordagem quantitativa transversal descritiva do design documental. A população consistia em 274 dados de isolados clínicos identificados com Klebsiella pneumoniae. O que constituiu toda a amostra com uma amostra de cobertura total. Os mesmos que foram coletados em fontes secundárias e cadastrados no banco de dados do departamento de Microbiologia. Estatísticas descritivas foram utilizadas para a análise. Resultados: Klebsiella pneumoniae apresentou maior frequência em 2020 com 35%. O mecanismo de resistência a ESBL foi identificado com 27,7% e carbapenemases do tipo KPC com 7,7%, com maior presença no sexo masculino. Apresentou maior resistência às Penicilinas, sensibilidade moderada às Cefalosporinas, Aminoglicosídeos, Quinolonas e alta sensibilidade aos Carbapenêmicos, Tigeciclina e Colistina. Os isolados foram classificados como multirresistentes, com maior frequência em Urocultura, Aspirado Brônquico, Fluido Corporal, Ponta de Cateter e Hemocultura em Hospitalização, UTI e Neonatologia. Conclusões: Os mecanismos de resistência de K. pneumoniae aos antibióticos são um achado comum em ambientes hospitalares independentemente do sexo, serviço hospitalar ou tipo de amostra, tornando-se um problema de saúde pública.

Detection of beta-lactamase, blaZ and mecA in penicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis in Garanhuns, Brazil / Detecção de beta-lactamase, blaZ e mecA em amostras de Staphylococcus aureus resistentes à penicilina isoladas de mastite bovina em Garanhuns, Brasil

There are few reports in the literature about genetic determinants of resistance to β-lactams in Staphylococcus aureusisolated from dairy cattle located in the municipality of Garanhuns, state of Pernambuco, Brazil. Thus, this study aimed to investigate the production of β-lactamase and the presence of the blaZ and mecA genes in penicillin-resistant S. aureus isolated from cases of subclinical bovine mastitis in the city of Garanhuns. Forty-six strains of penicillin-resistant S. aureus were evalu-ated using the nitrocefin disc test and duplex PCR. The results revealed that 45 strains (97.8%) were positive for β-lactamase production and 44 (95.7%) carried the blaZ gene. Among the latter, 43 (97.7%) were β-lactamase producers and only one (2.3%) was not. The mecA gene was not detected in any of the isolates investigated. The results suggest that enzymatic inacti-vation is the main β-lactam resistance mechanism expressed by S. aureus in the herds analyzed.(AU)

Existem poucos relatos na literatura sobre determinantes genéticos da resistência aos β-lactâmicos em Staphylococcus aureus isolados em rebanhos de bovinos leiteiros localizados no município de Garanhuns, estado de Pernambuco, Brasil. Dessa forma, este estudo teve como objetivo investigar a produção de β-lactamase e a presença dos genes blaZ e mecA em S. aureusresistentes à penicilina isolados de casos de mastite bovina subclínica na cidade de Garanhuns. Quarenta e seis amostras de S. aureus resistentes à penicilina foram avaliadas usando o teste do disco de nitrocefina e PCR duplex. Os resultados demonstra-ram que 45 amostras (97,8%) foram positivas para a produção de β-lactamase e 44 (95,7%) portavam o gene blaZ. Destes últimos, 43 (97,7%) eram produtores de β-lactamase e apenas um (2,3%) não produziu essa enzima. O gene mecA não foi detectado em nenhum dos isolados investigados. Os resultados sugerem que nos rebanhos avaliados a inativação enzimática é o principal mecanismo de resistência aos β-lactâmicos expresso por S. aureus.(AU)

Detection of beta-lactamase, blaZ and mecA in penicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from bovine mastitis in Garanhuns, Brazil / Detecção de beta-lactamase, blaZ e mecA em amostras de Staphylococcus aureus resistentes à penicilina isoladas de mastite bovina em Garanhuns, Brasil

There are few reports in the literature about genetic determinants of resistance to β-lactams in Staphylococcus aureusisolated from dairy cattle located in the municipality of Garanhuns, state of Pernambuco, Brazil. Thus, this study aimed to investigate the production of β-lactamase and the presence of the blaZ and mecA genes in penicillin-resistant S. aureus isolated from cases of subclinical bovine mastitis in the city of Garanhuns. Forty-six strains of penicillin-resistant S. aureus were evalu-ated using the nitrocefin disc test and duplex PCR. The results revealed that 45 strains (97.8%) were positive for β-lactamase production and 44 (95.7%) carried the blaZ gene. Among the latter, 43 (97.7%) were β-lactamase producers and only one (2.3%) was not. The mecA gene was not detected in any of the isolates investigated. The results suggest that enzymatic inacti-vation is the main β-lactam resistance mechanism expressed by S. aureus in the herds analyzed.

Existem poucos relatos na literatura sobre determinantes genéticos da resistência aos β-lactâmicos em Staphylococcus aureus isolados em rebanhos de bovinos leiteiros localizados no município de Garanhuns, estado de Pernambuco, Brasil. Dessa forma, este estudo teve como objetivo investigar a produção de β-lactamase e a presença dos genes blaZ e mecA em S. aureusresistentes à penicilina isolados de casos de mastite bovina subclínica na cidade de Garanhuns. Quarenta e seis amostras de S. aureus resistentes à penicilina foram avaliadas usando o teste do disco de nitrocefina e PCR duplex. Os resultados demonstra-ram que 45 amostras (97,8%) foram positivas para a produção de β-lactamase e 44 (95,7%) portavam o gene blaZ. Destes últimos, 43 (97,7%) eram produtores de β-lactamase e apenas um (2,3%) não produziu essa enzima. O gene mecA não foi detectado em nenhum dos isolados investigados. Os resultados sugerem que nos rebanhos avaliados a inativação enzimática é o principal mecanismo de resistência aos β-lactâmicos expresso por S. aureus.

Resistance to ß-lactams in Streptococcus pneumoniae.

Streptococcus pneumoniae is an important causal agent of pneumonia, meningitis, sepsis, bacteremia, and otitis media. Penicillin resistance rates in S. pneumoniae have remained stable in Argentina in the last years. In the late '90s more isolates with MIC of penicillin ≥2µg/ml were observed; however, their frequency has decreased in recent years. The phenotypic expression of penicillin resistance is due to a modification in penicillin-binding proteins associated with a mosaic structure in the coding genes. The expansion of successful resistant clones varies among the different regions and is influenced by the use of antibiotics, vaccines, particularly conjugated ones, as well as population density. Parenteral treatment with high doses of penicillin G continues to be effective for the treatment of pneumonia and bacteremia, oral aminopenicillins for otitis media and sinusitis and third generation cephalosporins for meningitis.

Caracterización de bacilos gramnegativos multi-resistentes, aislados en pacientes hospitalizados en instituciones de salud de Barranquilla (Colombia) / Characterization of multiresistant gram-negative bacilli, isolated in patients hospitalized in health institutions in Barranquilla (Colombia)

Resumen Introducción: La resistencia a carbapenémicos en bacilos gramnegativos es un problema de salud pública mundial, debido a que se asocia con altas tasas de mortalidad, aumento en los niveles de resistencia a otros antimicrobianos, elevación en el potencial de diseminación e incremento en los costos de atención en salud. Objetivo: Caracterizar bacilos gramnegativos multirresistentes, aislados en pacientes hospitalizados en instituciones de salud de Barranquilla (Colombia). Material y Métodos: Estudio descriptivo acerca de la caracterización fenotípica y genotípica de la resistencia bacteriana en las infecciones asociadas a la atención en salud, mediada por carbapenemasas en aislados bacterianos enviados por los laboratorios pertenecientes a la red de laboratorios del Departamento del Atlántico. Resultados: La KPC fue la carbapenemasa más frecuente en las Enterobacterales (27,6%), predominando en Klebsiella pneumoniae (13,1%) sola y asociada a otras carbapenemasas. En Pseudomonas aeruginosa predominó la carbapenemasa VIM (32,8%) y la OXA en Acinetobacter baumannii (17,1%). Conclusión: Se encontró una amplia distribución de cepas multi-resistentes productoras de carbapenemasas en instituciones de salud de Barranquilla, las cuales expresaron los siguientes mecanismos de resistencia: KPC, VIM, NDM, OXA.

Abstract Background: The emergence of carbapenem resistant gramnegative bacilli has become a problem of public health worldwide, because it is associated with high mortality rates, increased levels of resistance to other antimicrobials, increased potential for dissemination transition and increase in health care costs. Aim: To characterize multiresistant gram-negative bacilli, isolated in patients hospitalized in health institutions of Barranquilla (Colombia). Methods: A descriptive study was conducted on the phenotypic and genotypic characterization of bacterial resistance in infections associated with health care, mediated by carbapenemases in bacterial isolates sent by laboratories belonging to the laboratory network of the Department of Atlántico. Results: KPC was the most frequent carbapenemase in Enterobacterales (27.6%), predominantly in Klebsiella pneumoniae (13.1%) alone and associated with other carbapenemases. In Pseudomonas aeruginosa, VIM carbapenemase (32.8%) predominated and OXA in Acinetobacter baumannii (17.1%). Conclusion: A wide distribution of multi-resistant strains producing carbapenemases in Atlantic health institutions was found, which expressed the following resistance mechanisms: KPC, VIM, NDM, OXA.

Sensibilidad disminuida a los antibóticos Beta-Lactamicos en estreptococos Beta-Hemolíticos / Decreased sensitivity to beta-lactam antibiotics in beta-hemolytic streptococci

Últimamente, se están detectando mutaciones en las proteínas ligadoras de penicilina (PBP) de los estreptococos beta-hemolíticos que corresponden a sitios que en Streptococcus pneumoniae han determinado sensibilidad disminuida a los antibióticos beta-lactámicos. Primero, se describieron cepas con sensibilidad intermedia a penicilina en Streptococcus agalactiae (estreptococos del grupo B), luego en Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis (mayormente grupos C y G) y, más recientemente, cepas con sensibilidad disminuida a aminopenicilinas y cefalosporinas de tercera generación en Streptococcus pyogenes (grupo A). El costo biológico de estas modificaciones nos permite pensar que los niveles de resistencia no han de ser tan elevados como para comprometer por ahora la efectividad clínica de los beta-lactámicos (AU)

Recently, mutations in penicillin-binding proteins (PBPs) of beta-hemolytic streptococci have been detected corresponding to sites that in Streptococcus pneumoniae have been determined to have decreased sensitivity to beta-lactam antibiotics. First, strains with intermediate sensitivity to penicillin were described in Streptococcus agalactiae (group B streptococci), subsequently in Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis (mainly groups C and G) and, more recently, strains with decreased sensitivity to third-generation aminopenicillins and cephalosporins were found in Streptococcus pyogenes (group A). The biological cost of these modifications suggests that, for now, resistance levels are not high enough to compromise the clinical effectiveness of beta-lactams (AU)

Reacciones adversas a betalactámicos: una revisión de tema / Adverse reactions to beta-lactams: a topic review / Reações adversas a beta-lactâmicos: uma revisão de tópico

Las reacciones adversas a medicamentos son una de las principales causas de muerte en el mundo, producen muchos ingresos hospitalarios y aumentan los costos de atención. Dentro de los medicamentos que más se asocian con estas reacciones están los antibióticos y de estos los más comunes son los betalactámicos, ampliamente utilizados en las instituciones de salud. Las manifestaciones más frecuentes de las reacciones adversas a betalactámicos son alérgicas, dermatológicas, gastrointestinales, renales, hepáticas y neurológicas. Se realiza una revisión general de las reacciones adversas de estos medicamentos, se mencionan los distintos antibióticos betalactámicos con su clasificación y espectro de acción y más precisamente se explican las distintas reacciones adversas por uso de betalactámicos según el sistema comprometido.

Adverse drug reactions are one of the leading causes of death in the world. They are also responsible for an increase in hospital admissions and higher care costs. Among the most associated drugs with these reactions are antibiotics and of these the most common are beta-lactams, which are widely used in health institutions. The most fre-quent manifestations of adverse reactions to beta-lactams are allergic, dermatological, gastrointestinal, renal, hepatic and neurological reactions. A general review of the adverse reactions to these drugs is carried out. Also, the different beta-lactam antibiotics are described along with their classification and spectrum of action, and an accurate explanation of the different adverse reactions due to the use of beta-lactams according to the compromised system is made.

As reações adversas a medicamentos são uma das principais causas de morte no mundo, resultam em muitas admissões hospitalares e aumentam os custos do atendimento. Entre os medicamentos que mais se associam a essas reações estão os antibióticos e, destes, os mais comuns são os beta-lactâmicos, amplamente utilizados em instituições de saúde. As manifestações mais frequentes de reações adversas aos beta-lactâmicos são alérgicas, dermatológicas, gastrointestinais, renais, hepáticas e neurológicas. Faz-se uma revisão geral das reações adversas desses medicamentos, são mencionados os diferentes antibióticos beta-lactâmicos com sua classificação e espectro de ação, e mais precisamente explicam as diferentes reações adversas devidas ao uso de beta-lactâmicos de acordo com o sistema comprometido

Resistencia enzimática en Pseudomonas aeruginosa, aspectos clínicos y de laboratorio / Enzymatic resistance in Pseudomonas aeruginosa, clinical and laboratory aspects

Resumen Pseudomonas aeruginosa es uno de los principales patógenos que causa infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS). Su capacidad de adaptación, diseminación, resistencia intrínseca a los antimicrobianos y de adquirir nuevos mecanismos a través de elementos genéticos móviles, hacen que el tratamiento de las infecciones por este microorganismo sea un desafío para el médico clínico. Intrínsecamente, P. aeruginosa, presenta una reducida permeabilidad en la membrana externa, debido a la expresión de bombas de expulsión, y una cefalosporinasa tipo AmpC inducible. Además, P. aeruginosa es capaz de adquirir nuevos determinantes de resistencia por transferencia horizontal en forma de casetes situados en integrones, y a su vez, localizados en transposones o plásmidos. Dentro de la resistencia enzimática que presenta P. aeruginosa destacan las β-lactamasas, incluyendo aquellas de espectro extendido (BLEE) y las carbapenemasas. Pero también enzimas modificadoras de los aminoglucósidos, haciendo que este microorganismo pueda presentar fenotipos de multi-resistencia (MDR), resistencia extrema (XDR) y panresistencia (PDR) a los antimicrobianos denominados antipseudomonas, incluyendo a las nuevas cefalosporinas con inhibidores de beta-lactamasas.

Abstract Pseudomonas aeruginosa is one of the major pathogens causing healthcare-associated infections (HAI). Its capacity of adaptation, dissemination, intrinsic resistance to antimicrobials and of acquiring new mechanisms through mobile genetic elements, make the treatment of infections by this microorganism a challenge for the clinician. Intrinsically, P. aeruginosa, presents a reduced permeability in the external membrane, due to the expression of efflux pumps, and an inducible AmpC-type cephalosporinase. In addition, P. aeruginosa is able to acquire new resistance determinants by horizontal transfer in the form of cassettes located in integrons, and in turn located in transposons or plasmids. Within the enzymatic resistance that P. aeruginosa presents, betalactamases, including extended spectrum (ESBL) and carbapenemases. But also aminoglycoside modifying enzymes, stand out, causing this microorganism to present multi-resistance phenotypes (MDR), extreme resistance (XDR) and pan-resistance (PDR) to the called antipseudomonal antibiotics, including the new cephalosporins with betalactamase inhibitors.

Proteomics characterization of Staphylococcus spp. from goat mastitis and phenogeno-typical assessment of resistance to beta-lactamics / Caracterização proteômica de Staphylococcus spp. oriundos de mastite caprina e avaliação fenogenotípica da resistência aos beta-lactâmicos

Mastitis occupies a prominent place among the diseases that affect dairy herds due to economic problems and public health. Staphylococcus spp. are infectious agents more involved in the etiology of caprine mastites, especially coagulase-negative Staphylococcus. Nineteen isolates of Staphylococcus spp. were obtained from subclinical caprine mastitis. All isolates were characterized by MALDI-TOF MS, being 47.36% (9/19) identified for S. epidermidis, 15.78% (3/19) for S. warneri, 10.52% (2/19) for S. aureus and S. caprae and 5.26% (1/19) for S. lugdunensis, S. simulans, and S. cohnii. All isolates characterized by MALDI-TOF were subjected a to polymerase chain reaction (PCR) for the 16S rRNA gene of Staphylococcus spp. to confirm the gender. After determining the species, tests for phenotypic detection of resistance to beta-lactams were carried out simple disk diffusion oxacillin, cefoxitin, penicillin G and amoxicillin + clavulanic acid, agar "screen" oxacillin and microdilution (MIC) cefoxitin. The disk diffusion test showed a strength of 58% (11/19) for penicillin G, 26.31% (5/19) for cefoxitin and 26.31% (5/19) for oxacillin. All strains were susceptible to amoxicillin + clavulanic acid and agar "screen" oxacillin. In the MIC, 63.15% (12/19) of the samples were cefoxitin resistant (MIC >4.0μg/ml). Then isolates were subjected to detection of the mecA resistance genes and regulators (mecl and mecRI), mecC and blaZ. Two samples of Staphylococcus epidermidis had the mecA gene. All isolates were negative for the mecA gene variant, mecl, mecRI, mecC and blaZ. These findings reinforce the importance of this group of microorganisms in the etiology of subclinical mastitis in goats and open perspectives for future research to investigate the epidemiology of the disease.(AU)

A mastite ocupa lugar de destaque entre as doenças que acometem o rebanho leiteiro, em virtude de problemas econômicos e de saúde pública. Staphylococcus spp. são os agentes infecciosos mais envolvidos na etiologia das mastites caprinas, principalmente Staphylococcus coagulase negativo. Dezenove isolados de Staphylococcus spp. foram obtidos a partir de mastite caprina subclínica. Todos os isolados foram caracterizados por MALDI-TOF MS, sendo 47,36% (9/19) identificadas como S. epidermidis, 15,78%(3/19) como S. warneri, 10,52% (2/19) como S. caprae e S. aureus e 5,26% (1/19) tanto para S. lugdunensis, como para S. simulans e S. cohnii. Todos os isolados caracterizados pelo MALDI-TOF foram submetidos a reação em cadeia da polimerase (PCR) para o gene 16rRNA de Staphylococcus spp. para a confirmação do gênero. Após a determinação da espécie, foram realizadas as provas para a detecção fenotípica de resistência aos beta-lactâmicos: difusão em disco simples de oxacilina, cefoxitina, penicilina G e amoxacilina +ácido clavulânico, ágar "screen" de oxacilina e microdiluição em caldo (MIC) de cefoxitina. O teste de difusão em disco demonstrou resistência de 58% (11/19) para penicilina G, 26,31% (5/19) para cefoxitina e 26,31% (5/19) para oxacilina. Todas as amostras foram sensíveis a amoxicilina + ácido clavulânico e ao ágar "screen" de oxacilina. Pelo MIC, 63,15% (12/19) das amostras foram resistentes a cefoxitina (MIC >4,0μg/ml). Em seguida os isolados foram submetidos a detecção dos genes de resistência mecA e seus reguladores (mecl e mecRI), mecC e blaZ. Duas amostras de S. epidermidis apresentaram o gene mecA. Todos os isolados foram negativos para a variante do gene mecA, mecl, mecRI, mecC e blaZ. Tais achados reforçam a importância deste grupo de microrganismos na etiologia da mastite subclínica em caprinos e abre perspectivas para futuras pesquisas para a investigação da epidemiologia da doença.(AU)

Proteomics characterization of Staphylococcus spp. from goat mastitis and phenogeno-typical assessment of resistance to beta-lactamics

ABSTRACT: Mastitis occupies a prominent place among the diseases that affect dairy herds due to economic problems and public health. Staphylococcus spp. are infectious agents more involved in the etiology of caprine mastites, especially coagulase-negative Staphylococcus. Nineteen isolates of Staphylococcus spp. were obtained from subclinical caprine mastitis. All isolates were characterized by MALDI-TOF MS, being 47.36% (9/19) identified for S. epidermidis, 15.78% (3/19) for S. warneri, 10.52% (2/19) for S. aureus and S. caprae and 5.26% (1/19) for S. lugdunensis, S. simulans, and S. cohnii. All isolates characterized by MALDI-TOF were subjected a to polymerase chain reaction (PCR) for the 16S rRNA gene of Staphylococcus spp. to confirm the gender. After determining the species, tests for phenotypic detection of resistance to beta-lactams were carried out simple disk diffusion oxacillin, cefoxitin, penicillin G and amoxicillin + clavulanic acid, agar screen oxacillin and microdilution (MIC) cefoxitin. The disk diffusion test showed a strength of 58% (11/19) for penicillin G, 26.31% (5/19) for cefoxitin and 26.31% (5/19) for oxacillin. All strains were susceptible to amoxicillin + clavulanic acid and agar screen oxacillin. In the MIC, 63.15% (12/19) of the samples were cefoxitin resistant (MIC >4.0g/ml). Then isolates were subjected to detection of the mecA resistance genes and regulators (mecl and mecRI), mecC and blaZ. Two samples of Staphylococcus epidermidis had the mecA gene. All isolates were negative for the mecA gene variant, mecl, mecRI, mecC and blaZ. These findings reinforce the importance of this group of microorganisms in the etiology of subclinical mastitis in goats and open perspectives for future research to investigate the epidemiology of the disease.

RESUMO: A mastite ocupa lugar de destaque entre as doenças que acometem o rebanho leiteiro, em virtude de problemas econômicos e de saúde pública. Staphylococcus spp. são os agentes infecciosos mais envolvidos na etiologia das mastites caprinas, principalmente Staphylococcus coagulase negativo. Dezenove isolados de Staphylococcus spp. foram obtidos a partir de mastite caprina subclínica. Todos os isolados foram caracterizados por MALDI-TOF MS, sendo 47,36% (9/19) identificadas como S. epidermidis, 15,78%(3/19) como S. warneri, 10,52% (2/19) como S. caprae e S. aureus e 5,26% (1/19) tanto para S. lugdunensis, como para S. simulans e S. cohnii. Todos os isolados caracterizados pelo MALDI-TOF foram submetidos a reação em cadeia da polimerase (PCR) para o gene 16rRNA de Staphylococcus spp. para a confirmação do gênero. Após a determinação da espécie, foram realizadas as provas para a detecção fenotípica de resistência aos beta-lactâmicos: difusão em disco simples de oxacilina, cefoxitina, penicilina G e amoxacilina +ácido clavulânico, ágar screen de oxacilina e microdiluição em caldo (MIC) de cefoxitina. O teste de difusão em disco demonstrou resistência de 58% (11/19) para penicilina G, 26,31% (5/19) para cefoxitina e 26,31% (5/19) para oxacilina. Todas as amostras foram sensíveis a amoxicilina + ácido clavulânico e ao ágar screen de oxacilina. Pelo MIC, 63,15% (12/19) das amostras foram resistentes a cefoxitina (MIC >4,0g/ml). Em seguida os isolados foram submetidos a detecção dos genes de resistência mecA e seus reguladores (mecl e mecRI), mecC e blaZ. Duas amostras de S. epidermidis apresentaram o gene mecA. Todos os isolados foram negativos para a variante do gene mecA, mecl, mecRI, mecC e blaZ. Tais achados reforçam a importância deste grupo de microrganismos na etiologia da mastite subclínica em caprinos e abre perspectivas para futuras pesquisas para a investigação da epidemiologia da doença.

Proteomics characterization of Staphylococcus spp. from goat mastitis and phenogeno-typical assessment of resistance to beta-lactamics / Caracterização proteômica de Staphylococcus spp. oriundos de mastite caprina e avaliação fenogenotípica da resistência aos beta-lactâmicos

Mastitis occupies a prominent place among the diseases that affect dairy herds due to economic problems and public health. Staphylococcus spp. are infectious agents more involved in the etiology of caprine mastites, especially coagulase-negative Staphylococcus. Nineteen isolates of Staphylococcus spp. were obtained from subclinical caprine mastitis. All isolates were characterized by MALDI-TOF MS, being 47.36% (9/19) identified for S. epidermidis, 15.78% (3/19) for S. warneri, 10.52% (2/19) for S. aureus and S. caprae and 5.26% (1/19) for S. lugdunensis, S. simulans, and S. cohnii. All isolates characterized by MALDI-TOF were subjected a to polymerase chain reaction (PCR) for the 16S rRNA gene of Staphylococcus spp. to confirm the gender. After determining the species, tests for phenotypic detection of resistance to beta-lactams were carried out simple disk diffusion oxacillin, cefoxitin, penicillin G and amoxicillin + clavulanic acid, agar "screen" oxacillin and microdilution (MIC) cefoxitin. The disk diffusion test showed a strength of 58% (11/19) for penicillin G, 26.31% (5/19) for cefoxitin and 26.31% (5/19) for oxacillin. All strains were susceptible to amoxicillin + clavulanic acid and agar "screen" oxacillin. In the MIC, 63.15% (12/19) of the samples were cefoxitin resistant (MIC >4.0μg/ml). Then isolates were subjected to detection of the mecA resistance genes and regulators (mecl and mecRI), mecC and blaZ. Two samples of Staphylococcus epidermidis had the mecA gene. All isolates were negative for the mecA gene variant, mecl, mecRI, mecC and blaZ. These findings reinforce the importance of this group of microorganisms in the etiology of subclinical mastitis in goats and open perspectives for future research to investigate the epidemiology of the disease.(AU)

A mastite ocupa lugar de destaque entre as doenças que acometem o rebanho leiteiro, em virtude de problemas econômicos e de saúde pública. Staphylococcus spp. são os agentes infecciosos mais envolvidos na etiologia das mastites caprinas, principalmente Staphylococcus coagulase negativo. Dezenove isolados de Staphylococcus spp. foram obtidos a partir de mastite caprina subclínica. Todos os isolados foram caracterizados por MALDI-TOF MS, sendo 47,36% (9/19) identificadas como S. epidermidis, 15,78%(3/19) como S. warneri, 10,52% (2/19) como S. caprae e S. aureus e 5,26% (1/19) tanto para S. lugdunensis, como para S. simulans e S. cohnii. Todos os isolados caracterizados pelo MALDI-TOF foram submetidos a reação em cadeia da polimerase (PCR) para o gene 16rRNA de Staphylococcus spp. para a confirmação do gênero. Após a determinação da espécie, foram realizadas as provas para a detecção fenotípica de resistência aos beta-lactâmicos: difusão em disco simples de oxacilina, cefoxitina, penicilina G e amoxacilina +ácido clavulânico, ágar "screen" de oxacilina e microdiluição em caldo (MIC) de cefoxitina. O teste de difusão em disco demonstrou resistência de 58% (11/19) para penicilina G, 26,31% (5/19) para cefoxitina e 26,31% (5/19) para oxacilina. Todas as amostras foram sensíveis a amoxicilina + ácido clavulânico e ao ágar "screen" de oxacilina. Pelo MIC, 63,15% (12/19) das amostras foram resistentes a cefoxitina (MIC >4,0μg/ml). Em seguida os isolados foram submetidos a detecção dos genes de resistência mecA e seus reguladores (mecl e mecRI), mecC e blaZ. Duas amostras de S. epidermidis apresentaram o gene mecA. Todos os isolados foram negativos para a variante do gene mecA, mecl, mecRI, mecC e blaZ. Tais achados reforçam a importância deste grupo de microrganismos na etiologia da mastite subclínica em caprinos e abre perspectivas para futuras pesquisas para a investigação da epidemiologia da doença.(AU)

Desarrollo y validación de un modelo diagnóstico de resistencia antimicrobiana por beta-lactamasas de espectro extendido en infecciones urinarias adquiridas en la comunidad. ¿Cómo ajustar la predicción en prevalencias variables del desenlace? La utilidad de la contracción de predictores con regresión LASSO / Development and validation of a diagnostic model of antimicrobial resistance by extended-spectrum beta-lactamases in community-acquired urinary tract infections. How to adjust the prediction in variable outcome prevalences? The usefulness of contracting predictors with LASSO regression

INTRODUCCIÓN: Para el caso de infección urinaria adquirida en la comunidad la identificación de enterobacterias con beta-lactamasas de espectro extendido (BLEE) puede optimizar las estrategias de tratamiento, control y seguimiento; sin embargo, el efecto de prevalencias variables de este patrón de resistencia ha afectado la validez externa de este tipo de modelos. OBJETIVO: Desarrollar un modelo predictor diagnóstico que ajuste el error de predicción en prevalencias variables utilizando la regresión LASSO. MÉTODOS: Se diseñó un modelo predictor diagnóstico de infección urinaria adquirida en la comunidad por enterobacterias productoras de BLEE. Se empleó un estudio de corte transversal, tanto para la construcción como para la validación. Para evaluar el efecto de la prevalencia variable del desenlace, la validación se realizó con población en la que la proporción de aislados con este mecanismo de resistencia fue menor, los participantes fueron pacientes adultos que consultaron a servicios de urgencias de dos instituciones hospitalarias de mediano nivel de complejidad de la ciudad de Medellín. Para ajustar el efecto de un medio ambiente con menor proporción de resistencia antimicrobiana, utilizamos la contracción de predictores por regresión LASSO. RESULTADOS: Se incluyeron 303 pacientes para la construcción del modelo, se evaluaron seis predictores y la validación se realizó en 220 pacientes. CONCLUSIÓN: El modelo ajustado con regresión LASSO favoreció la validez externa del modelo en poblaciones con proporción de aislados productores de BLEE en urocultivo de pacientes ambulatorio entre 11 y 16%. Este estudio brinda criterios para un aislamiento temprano cuando los predictores están presentes en poblaciones con proporciones de resistencia en urocultivos ambulatorios cercanas a 15% y propone una metodología para ajuste de error en el diseño de modelos de predicción en resistencia antimicrobiana

BACKGROUND: In the case of community-acquired urinary tract infection, the identification of Enterobacteriaceae with extended spectrum beta-lactamases (ESBL) can optimize treatment, control and follow-up strategies, however the effect of variable prevalences of this resistance pattern has affected the external validity of this type of models. AIM: To develop a diagnostic predictive model that adjusts the prediction error in variable prevalences using the LASSO regression. METHODS: A diagnostic predictive model of community-acquired urinary tract infection by infection by ESBL producing Enterobacteriaceae was designed. A cross-sectional study was used for both construction and validation. To assess the effect of the variable prevalence of the outcome, the validation was performed with a population in which the proportion of isolates with this resistance mechanism was lower, the participants were adult patients who consulted the emergency services of two medium-level hospital institutions. complexity of the city of Medellin. To adjust for the effect of an environment with a lower proportion of antimicrobial resistance, we used the contraction of predictors by LASSO regression. RESULTS: 303 patients were included for the construction of the model, six predictors were evaluated and validation was carried out in 220 patients. CONCLUSION: The adjusted model with LASSO regression favored the external validity of the model in populations with a proportion of ESBL producing isolates in urine culture of outpatients between 11 and 16%. This study provides criteria for early isolation when predictors are present in populations with proportions of resistance in ambulatory urine cultures close to 15% and proposes a methodology for the adjustment of errors in the design of prediction models for antimicrobial resistance.