Draft genome sequence data of Cercospora kikuchii, a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeans.

Cercospora kikuchii (Tak. Matsumoto & Tomoy.) M.W. Gardner 1927 is an ascomycete fungal pathogen that causes Cercospora leaf blight and purple seed stain on soybean. Here, we report the first draft genome sequence and assembly of this pathogen. The C. kikuchii strain ARG_18_001 was isolated from soybean purple seed collected from San Pedro, Buenos Aires, Argentina, during the 2018 harvest. The genome was sequenced using a 2 × 150 bp paired-end method by Illumina NovaSeq 6000. The C. kikuchii protein-coding genes were predicted using FunGAP (Fungal Genome Annotation Pipeline). The draft genome assembly was 33.1 Mb in size with a GC-content of 53%. The gene prediction resulted in 14,856 gene models/14,721 protein coding genes. Genomic data of C. kikuchii presented here will be a useful resource for future studies of this pathosystem. The data can be accessed at GenBank under the accession number VTAY00000000 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/VTAY00000000.

Aerobiologia de Cercospora kikuchii / Aerobiology of Cercospora kikuchii

Neste estudo, foram quantificados os conídios de Cercospora kikuchii [crestamento foliar em soja (Glycine max)] presentes no ar, sua relação com a intensidade da doença e com os fatores ambientais [temperatura, umidade relativa do ar (UR), precipitação e molhamento foliar] no período de novembro a março de 2006/07 e 2007/08 em Brasília, DF. Para tanto, foi instalada uma armadilha volumétrica capta-esporos 'Burkard' de sete dias em campo experimental com soja. Houve maior captura de conídios no período diurno, com mais de 60 por cento dos esporos coletados entre 8h e 15h. Os dados climáticos variaram de acordo com a safra, mas, de modo geral, em ambos os experimentos, o período de maior captura de esporos ocorreu quando houve redução da precipitação e do molhamento foliar. A UR acima de 80 por cento e temperatura entre 20 e 24°C foram mais favoráveis para a captura de conídios e a intensidade do crestamento foliar. Nos dois anos de avaliação, a maior quantidade de esporo capturado ocorreu quando a soja se apresentava no estádio R6-R7, assim como a intensidade da doença foi maior após o início do estágio reprodutivo da cultura. Apesar da quantidade de conídio capturado em 2006/07 ter sido maior que em 2007/08, o padrão da flutuação aérea de conídios foi semelhante.

The objective of this study was to evaluate the relation of airborne released conidia of Cercospora kikuchii [cercospora leaf blight of soybean (Glycine max)] with the disease intensity and some environmental factors [temperature, relative humidity (RH), precipitation and leaf wetness period) under experimental field conditions in Brasília, DF, Brazil. The evaluation was from November to March of 2006/07 and 2007/08. Data for the amount of airborne conidia were collected using a Burkard's seven-day volumetric spore trap set in a field with soybean. Most of the conidia were collected during the day, with over 60 percent of the spores collected between 8h and 15h. Climatic data varied according to the crop period, but for both periods the highest amount of spores occurred with reduction of precipitation and leaf wetness period. RH above 80 percent and temperature from 20 to 24°C were more favorable to capture of conidia and disease intensity. For both crop period of evaluation the major amount of spores were collected when plant stage was R6-R7, as well as, disease intensity increased after beginning of reproductive stage of soybean. Although the number of captured conidia in the 2006/07 crop period was higher than in 2007/08, the variation of fluctuation of airborne spores occurred similarly.

Aerobiologia de Cercospora kikuchii

The objective of this study was to evaluate the relation of airborne released conidia of Cercospora kikuchii [cercospora leaf blight of soybean (Glycine max)] with the disease intensity and some environmental factors [temperature, relative humidity (RH), precipitation and leaf wetness period) under experimental field conditions in Brasília, DF, Brazil. The evaluation was from November to March of 2006/07 and 2007/08. Data for the amount of airborne conidia were collected using a Burkard's seven-day volumetric spore trap set in a field with soybean. Most of the conidia were collected during the day, with over 60% of the spores collected between 8h and 15h. Climatic data varied according to the crop period, but for both periods the highest amount of spores occurred with reduction of precipitation and leaf wetness period. RH above 80% and temperature from 20 to 24°C were more favorable to capture of conidia and disease intensity. For both crop period of evaluation the major amount of spores were collected when plant stage was R6-R7, as well as, disease intensity increased after beginning of reproductive stage of soybean. Although the number of captured conidia in the 2006/07 crop period was higher than in 2007/08, the variation of fluctuation of airborne spores occurred similarly.

Neste estudo, foram quantificados os conídios de Cercospora kikuchii [crestamento foliar em soja (Glycine max)] presentes no ar, sua relação com a intensidade da doença e com os fatores ambientais [temperatura, umidade relativa do ar (UR), precipitação e molhamento foliar] no período de novembro a março de 2006/07 e 2007/08 em Brasília, DF. Para tanto, foi instalada uma armadilha volumétrica capta-esporos 'Burkard' de sete dias em campo experimental com soja. Houve maior captura de conídios no período diurno, com mais de 60% dos esporos coletados entre 8h e 15h. Os dados climáticos variaram de acordo com a safra, mas, de modo geral, em ambos os experimentos, o período de maior captura de esporos ocorreu quando houve redução da precipitação e do molhamento foliar. A UR acima de 80% e temperatura entre 20 e 24°C foram mais favoráveis para a captura de conídios e a intensidade do crestamento foliar. Nos dois anos de avaliação, a maior quantidade de esporo capturado ocorreu quando a soja se apresentava no estádio R6-R7, assim como a intensidade da doença foi maior após o início do estágio reprodutivo da cultura. Apesar da quantidade de conídio capturado em 2006/07 ter sido maior que em 2007/08, o padrão da flutuação aérea de conídios foi semelhante.

Aerobiologia de Cercospora kikuchii

The objective of this study was to evaluate the relation of airborne released conidia of Cercospora kikuchii [cercospora leaf blight of soybean (Glycine max)] with the disease intensity and some environmental factors [temperature, relative humidity (RH), precipitation and leaf wetness period) under experimental field conditions in Brasília, DF, Brazil. The evaluation was from November to March of 2006/07 and 2007/08. Data for the amount of airborne conidia were collected using a Burkard's seven-day volumetric spore trap set in a field with soybean. Most of the conidia were collected during the day, with over 60% of the spores collected between 8h and 15h. Climatic data varied according to the crop period, but for both periods the highest amount of spores occurred with reduction of precipitation and leaf wetness period. RH above 80% and temperature from 20 to 24°C were more favorable to capture of conidia and disease intensity. For both crop period of evaluation the major amount of spores were collected when plant stage was R6-R7, as well as, disease intensity increased after beginning of reproductive stage of soybean. Although the number of captured conidia in the 2006/07 crop period was higher than in 2007/08, the variation of fluctuation of airborne spores occurred similarly.

Neste estudo, foram quantificados os conídios de Cercospora kikuchii [crestamento foliar em soja (Glycine max)] presentes no ar, sua relação com a intensidade da doença e com os fatores ambientais [temperatura, umidade relativa do ar (UR), precipitação e molhamento foliar] no período de novembro a março de 2006/07 e 2007/08 em Brasília, DF. Para tanto, foi instalada uma armadilha volumétrica capta-esporos 'Burkard' de sete dias em campo experimental com soja. Houve maior captura de conídios no período diurno, com mais de 60% dos esporos coletados entre 8h e 15h. Os dados climáticos variaram de acordo com a safra, mas, de modo geral, em ambos os experimentos, o período de maior captura de esporos ocorreu quando houve redução da precipitação e do molhamento foliar. A UR acima de 80% e temperatura entre 20 e 24°C foram mais favoráveis para a captura de conídios e a intensidade do crestamento foliar. Nos dois anos de avaliação, a maior quantidade de esporo capturado ocorreu quando a soja se apresentava no estádio R6-R7, assim como a intensidade da doença foi maior após o início do estágio reprodutivo da cultura. Apesar da quantidade de conídio capturado em 2006/07 ter sido maior que em 2007/08, o padrão da flutuação aérea de conídios foi semelhante.

Aerobiologia de Cercospora kikuchii

The objective of this study was to evaluate the relation of airborne released conidia of Cercospora kikuchii [cercospora leaf blight of soybean (Glycine max)] with the disease intensity and some environmental factors [temperature, relative humidity (RH), precipitation and leaf wetness period) under experimental field conditions in Brasília, DF, Brazil. The evaluation was from November to March of 2006/07 and 2007/08. Data for the amount of airborne conidia were collected using a Burkard's seven-day volumetric spore trap set in a field with soybean. Most of the conidia were collected during the day, with over 60% of the spores collected between 8h and 15h. Climatic data varied according to the crop period, but for both periods the highest amount of spores occurred with reduction of precipitation and leaf wetness period. RH above 80% and temperature from 20 to 24°C were more favorable to capture of conidia and disease intensity. For both crop period of evaluation the major amount of spores were collected when plant stage was R6-R7, as well as, disease intensity increased after beginning of reproductive stage of soybean. Although the number of captured conidia in the 2006/07 crop period was higher than in 2007/08, the variation of fluctuation of airborne spores occurred similarly.

Neste estudo, foram quantificados os conídios de Cercospora kikuchii [crestamento foliar em soja (Glycine max)] presentes no ar, sua relação com a intensidade da doença e com os fatores ambientais [temperatura, umidade relativa do ar (UR), precipitação e molhamento foliar] no período de novembro a março de 2006/07 e 2007/08 em Brasília, DF. Para tanto, foi instalada uma armadilha volumétrica capta-esporos 'Burkard' de sete dias em campo experimental com soja. Houve maior captura de conídios no período diurno, com mais de 60% dos esporos coletados entre 8h e 15h. Os dados climáticos variaram de acordo com a safra, mas, de modo geral, em ambos os experimentos, o período de maior captura de esporos ocorreu quando houve redução da precipitação e do molhamento foliar. A UR acima de 80% e temperatura entre 20 e 24°C foram mais favoráveis para a captura de conídios e a intensidade do crestamento foliar. Nos dois anos de avaliação, a maior quantidade de esporo capturado ocorreu quando a soja se apresentava no estádio R6-R7, assim como a intensidade da doença foi maior após o início do estágio reprodutivo da cultura. Apesar da quantidade de conídio capturado em 2006/07 ter sido maior que em 2007/08, o padrão da flutuação aérea de conídios foi semelhante.