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1.
Eur J Psychotraumatol ; : 2360814, 2024 Jun 27.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-38934047

RESUMO

The existing theories of post-traumatic stress disorder (PTSD) have inspired large volumes of research and have contributed substantially to our current knowledge base. However, most of the theories are of a qualitative and verbal nature, and may be difficult to evaluate and compare with each other. In this paper, we propose that one way forward is to use computational modelling to formulate more precise theories of PTSD that can be evaluated by (1) assessing whether the model can explain fundamental phenomena related to PTSD, and (2) comparing simulated outcomes with real data. Computational modelling can force us to describe processes more precisely and achieve stronger theories that are viable for testing. Establishing the theoretical groundwork before undertaking empirical studies can help us to avoid doing research with low probability of valid results, and counteract the replicability crisis in psychology. In conclusion, computational modelling is a promising avenue for advancing the understanding and treatment of PTSD.


Computational modelling can help us to specify the psychological processes involved in PTSD, which may increase our understanding of how best to help people to recover after traumatic events.With computational models of PTSD, we can simulate the consequences of the theoretical principles and make sure to design research studies that are theoretically well grounded.To validate the computational models, high-quality empirical data are still needed.

2.
Arq. bras. cardiol ; 121(2): e20230462, 2024. tab, graf
Artigo em Português | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1556998

RESUMO

Resumo Fundamento O infarto do miocárdio com elevação do segmento ST (IAMCSST) é uma das principais causas de doenças cardiovasculares fatais, que têm sido a principal causa de mortalidade em todo o mundo. O diagnóstico na fase inicial beneficiaria a intervenção clínica e o prognóstico, mas ainda falta a exploração dos biomarcadores do IAMCSST. Objetivos Neste estudo, conduzimos uma análise bioinformática para identificar potenciais biomarcadores cruciais no progresso do IAMCSST. Métodos Obtivemos GSE59867 para pacientes com IAMCSST e doença arterial coronariana estável (DACE). Genes diferencialmente expressos (GDEs) foram selecionados com o limiar de -log2fold change- > 0,5 e p < 0,05. Com base nesses genes, conduzimos análises de enriquecimento para explorar a relevância potencial entre genes e para rastrear genes centrais. Posteriormente, os genes centrais foram analisados para detectar miRNAs relacionados e DAVID para detectar fatores de transcrição para análise posterior. Finalmente, o GSE62646 foi utilizado para avaliar a especificidade dos GDEs, com genes demonstrando resultados de AUC superiores a 75%, indicando seu potencial como candidatos a biomarcadores. Posteriormente, os genes centrais foram analisados para detectar miRNAs relacionados e DAVID para detectar fatores de transcrição para análise posterior. Finalmente, o GSE62646 foi utilizado para avaliar a especificidade dos GDEs, com genes demonstrando resultados de AUC superiores a 75%, indicando seu potencial como candidatos a biomarcadores. Resultados 133 GDEs entre DACE e IAMCSST foram obtidos. Em seguida, a rede PPI de GDEs foi construída usando String e Cytoscape, e análises posteriores determinaram genes centrais e 6 complexos moleculares. A análise de enriquecimento funcional dos GDEs sugere que as vias relacionadas à inflamação, metabolismo e imunidade desempenham um papel fundamental na progressão de DACE para IAMCSST. Além disso, foram previstos miRNAs relacionados, has-miR-124, has-miR-130a/b e has-miR-301a/b regularam a expressão do maior número de genes. Enquanto isso, a análise dos fatores de transcrição indica que EVI1, AML1, GATA1 e PPARG são os genes mais enriquecidos. Finalmente, as curvas ROC demonstram que MS4A3, KLRC4, KLRD1, AQP9 e CD14 exibem alta sensibilidade e especificidade na previsão de IAMCSST. Conclusões Este estudo revelou que imunidade, metabolismo e inflamação estão envolvidos no desenvolvimento de IAMCSST derivado de DACE, e 6 genes, incluindo MS4A3, KLRC4, KLRD1, AQP9, CD14 e CCR1, poderiam ser empregados como candidatos a biomarcadores para IAMCSST.


Abstract Background ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) is one of the leading causes of fatal cardiovascular diseases, which have been the prime cause of mortality worldwide. Diagnosis in the early phase would benefit clinical intervention and prognosis, but the exploration of the biomarkers of STEMI is still lacking. Objectives In this study, we conducted a bioinformatics analysis to identify potential crucial biomarkers in the progress of STEMI. Methods We obtained GSE59867 for STEMI and stable coronary artery disease (SCAD) patients. Differentially expressed genes (DEGs) were screened with the threshold of -log2fold change- > 0.5 and p <0.05. Based on these genes, we conducted enrichment analysis to explore the potential relevance between genes and to screen hub genes. Subsequently, hub genes were analyzed to detect related miRNAs and DAVID to detect transcription factors for further analysis. Finally, GSE62646 was utilized to assess DEGs specificity, with genes demonstrating AUC results exceeding 75%, indicating their potential as candidate biomarkers. Results 133 DEGs between SCAD and STEMI were obtained. Then, the PPI network of DEGs was constructed using String and Cytoscape, and further analysis determined hub genes and 6 molecular complexes. Functional enrichment analysis of the DEGs suggests that pathways related to inflammation, metabolism, and immunity play a pivotal role in the progression from SCAD to STEMI. Besides, related-miRNAs were predicted, has-miR-124, has-miR-130a/b, and has-miR-301a/b regulated the expression of the largest number of genes. Meanwhile, Transcription factors analysis indicate that EVI1, AML1, GATA1, and PPARG are the most enriched gene. Finally, ROC curves demonstrate that MS4A3, KLRC4, KLRD1, AQP9, and CD14 exhibit both high sensitivity and specificity in predicting STEMI. Conclusions This study revealed that immunity, metabolism, and inflammation are involved in the development of STEMI derived from SCAD, and 6 genes, including MS4A3, KLRC4, KLRD1, AQP9, CD14, and CCR1, could be employed as candidate biomarkers to STEMI.

3.
Rev. bioét. derecho ; (59): 181-203, Nov. 2023. ilus, tab
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-226621

RESUMO

En este artículo reflexionamos sobre la potencialidad terapéutica de los nuevos desarrollos de la Inteligencia Artificial en el ámbito de la salud mental, en particular en la prevención de conductas suicidas. En primer lugar, analizamos los aspectos tecno-científicos más relevantes del Machine Learning en el entorno de las Redes Sociales, las aplicaciones móviles y los chatbots, así como las ventajas e inconvenientes de esta nueva Psiquiatría Computacional. A continuación, consideramos los límites y dificultades en el uso de estas tecnologías desde una perspectiva ética, además del marco legal para que estas aplicaciones preventivas sean garantistas en lo que a eficacia, seguridad, privacidad, transparencia, responsabilidad y equidad se refiere. Si bien las amenazas son considerables, concluimos que con una correcta identificación y gestión de las mismas el alcance terapéutico de estas herramientas se antoja alentador.(AU)


En aquest article reflexionem sobre la potencialitat terapèutica dels nous desenvolupaments de la Intel·ligència Artificial en l'àmbit de la salut mental, especialment en la prevenció de conductes suïcides. En primer lloc, analitzem els aspectes tecno-científics més rellevants de l'Aprenentatge Automàtic en l'entorn de les Xarxes Socials, les aplicacions mòbils i els chatbots, així com els avantatges i inconvenients d'aquesta nova Psiquiatria Computacional. A continuació, considerem els límits i les dificultats en l'ús d'aquestes tecnologies des d'una perspectiva ètica, a més del marc legal perquè aquestes aplicacions preventives siguin garantistes en qüestions d'eficàcia, seguretat, privadesa, transparència, responsabilitat i equitat. Toti que les amenaces són considerables, concloem que amb una correcta identificació i gestió d'aquestes, el potencial terapèutic d'aquestes eines sembla prometedor.(AU)


In this article we reflect on the therapeutic potential of the new developments of Artificial Intelligence in the field of mental health, particularly in the prevention of suicidal behavior. First, we analyze the most relevant techno-scientific aspects of Machine Learning in the environment of Social Networks, mobile applications and chatbots, as well as the advantages and disadvantages of this new computational psychiatry. Next, we consider the limits and difficulties in the use of these technologies from an ethical perspective, in addition to the legal framework so that these preventive applications are guarantees in terms of efficacy, security, privacy, transparency, responsibility and fairness. Although the threats are considerable, we conclude that with proper identification and management of them, the therapeutic scope of these tools seems encouraging.(AU)


Assuntos
Humanos , Inteligência Artificial , Ideação Suicida , Suicídio , Suicídio/legislação & jurisprudência , Rede Social , Direitos do Paciente , Bioética , Ética Médica , Saúde Mental , Prevenção de Doenças , Psiquiatria , Aplicativos Móveis/tendências
4.
Rev. esp. cardiol. (Ed. impr.) ; 76(9): 700-707, Sept. 2023. tab, graf
Artigo em Espanhol | IBECS | ID: ibc-224454

RESUMO

Introducción y objetivos: La escala UKPDS (acrónimo inglés de «Estudio Prospectivo de Diabetes del Reino Unido») tiene un valor limitado para la predicción de eventos de enfermedad arterial coronaria (EAC). El estudio pretende investigar el valor añadido de la angiografía coronaria por tomografía computarizada (ACTC) sobre la escala de riesgo UKPDS para la predicción a 10 años de eventos cardiacos adversos en pacientes asintomáticos con diabetes tipo 2. Métodos: Se evaluó a 589 pacientes diabéticos asintomáticos sin historia de EAC a quienes se les realizó una ACTC. El objetivo principal estaba compuesto por muerte cardiaca, infarto de miocardio no mortal, angina inestable que requiere hospitalización y revascularización. Se estimó la habilidad de discriminación y reclasificación para modelos de predicción que incluían combinaciones de la categoría UKPDS, gravedad de estenosis y puntuación de calcio arterial coronario por ACTC. Resultados: La incidencia del objetivo primario fue del 12,4%. A lo largo de 10 años de seguimiento, los pacientes sin placa ateroesclerótica por ACTC tendieron a tener un bajo ratio de eventos coronarios en tanto que aquellos con EAC obstructiva tuvieron una mayor ratio de eventos, independientemente de la categoría de riesgo de la escala UKPDS. EL modelo que solo incluyó la categoría UKPDS tuvo un índice C de Harrell de 0,658; añadiendo el grado de estenosis coronaria al modelo se incrementó significativamente el índice C en 0,066 (p=0,004), en tanto que la adición del CSC incrementó el índice C en solo 0,039 (p=0,056). Globalmente, la información de la ACTC añadida a la categoría de riesgo UKPDS mejoró el ratio de reclasificación para la predicción del objetivo primario. Conclusiones: En pacientes asintomáticos con diabetes tipo 2, la información de la ACTC para EAC...(AU)


Introduction and objectives: The United Kingdom Prospective Diabetes Study (UKPDS) risk score has limited value for predicting coronary artery disease (CAD) events. We investigated the additive value of coronary computed tomography angiography (CCTA) on top of the UKPDS risk score in predicting 10-year adverse cardiac events in asymptomatic patients with type 2 diabetes. Methods: We evaluated 589 asymptomatic diabetic patients without a history of CAD who underwent CCTA. The primary outcome was a composite of cardiac death, nonfatal myocardial infarction, unstable angina requiring hospitalization, and revascularization. We estimated the discrimination and reclassification ability for the prediction models, which included combinations of the UKPDS category, severity of stenosis, and coronary artery calcium score by CCTA. Results: The incidence of the primary outcome was 12.4%. During 10 years of follow-up, patients without plaque by CCTA tended to have a low CAD event rate, while those with obstructive CAD tended to have a high event rate, irrespective of the baseline UKPDS risk category. The model that included only the UKPDS category had a Harrell's c-index of 0.658; adding the degree of stenosis to the model significantly increased the c-index by 0.066 (P=.004), while adding coronary artery calcium score increased the c-index by only 0.039 (P=.056). Overall, CCTA information in addition to the UKPDS risk category improved the reclassification rate for predicting the primary outcome. Conclusions: In asymptomatic patients with type 2 diabetes, CCTA information for CAD provided significant incremental discriminatory power beyond the UKPDS risk score category for predicting 10-year adverse coronary events.(AU)


Assuntos
Humanos , Infecções Assintomáticas , Angiografia Coronária , Diabetes Mellitus Tipo 2/complicações , Angiografia por Tomografia Computadorizada , Doença da Artéria Coronariana , Cardiologia , Cardiopatias , Doença das Coronárias/diagnóstico por imagem , Estudos Retrospectivos
5.
Vive (El Alto) ; 6(17): 410-423, ago. 2023.
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1515618

RESUMO

El SVI como problema de salud, también puede tener un impacto económico significativo y sus consecuencias perjudiciales pueden continuar incluso cuando la pandemia haya terminado. Objetivo. Determinar la prevalencia y causas relacionadas del síndrome visual informático (SVI) entre los estudiantes de 12 a 17 años, durante la COVID-19. Materiales y Métodos. Se realizó una investigación de tipo transversal, observacional, analítica y cuantitativa, la población estuvo constituida por 345 estudiantes de educación secundaria, se aplicó una encuesta a través de GoogleForms usando como instrumento, el cuestionario de Computer Vision Sympton Scale (CVSS17). Resultados. Se evidenció que los participantes padecen del síndrome visual informático (SVI) entre un nivel leve a muy severo (67%), la mayoría de los participantes presentan mayor uso de dispositivos digitales por día de 4-6 horas. Sintomatología de fotofobia a pantalla 73,3%, dolor de ojos 69,9% y ardor de ojos 66,4%. No evidencia enfermedades visuales 77.7%; algunos casos eventuales de miopía, astigmatismo, hipermetropía y anisometropía, por lo cual, se concluye que los participantes padecen del síndrome visual informático entre un nivel leve a muy severo (67%). Conclusiones. Se sugiere solicitar un diagnóstico completo que permita tener una información real del daño ocasionado por el SVI.


As a health problem, SVI can also have a significant economic impact and its detrimental consequences may continue even when the pandemic is over. Objective. To determine the prevalence and related causes of computer vision syndrome (CVI) among students aged 12 to 17 years during COVID-19. Materials and Methods. A cross-sectional, observational, analytical and quantitative research was conducted, the population consisted of 345 high school students, a survey was applied through GoogleForms using as instrument, the Computer Vision Sympton Scale (CVSS17) questionnaire. Results. It was evidenced that the participants suffer from computer vision syndrome (CVSS) between a mild to very severe level (67%), most of the participants present greater use of digital devices per day of 4-6 hours. Symptomatology of photophobia to screen 73.3%, eye pain 69.9% and burning eyes 66.4%. No evidence of visual diseases 77.7%; some eventual cases of myopia, astigmatism, hyperopia and anisometropia, therefore, it is concluded that participants suffer from computer visual syndrome between a mild to very severe level (67%). Conclusions. It is suggested to request a complete diagnosis that allows us to have real information about the damage caused by CVI.


Como um problema de saúde, a SVI também pode ter um impacto econômico significativo e suas consequências prejudiciais podem continuar mesmo após o fim da pandemia. Objetivo. Determinar a prevalência e as causas relacionadas à síndrome da visão computacional (SVI) entre estudantes de 12 a 17 anos durante a COVID-19. Materiais e métodos. Foi realizada uma pesquisa transversal, observacional, analítica e quantitativa, a população consistiu em 345 alunos do ensino médio, uma pesquisa foi aplicada por meio do GoogleForms usando o questionário Computer Vision Sympton Scale (CVSS17) como instrumento. Resultados. Verificou-se que os participantes sofrem de síndrome da visão computacional (CVSS) entre um nível leve a muito grave (67%), a maioria dos participantes tem um uso maior de dispositivos digitais por dia de 4-6 horas. Sintomatologia de fotofobia de tela 73,3%, dor ocular 69,9% e ardência ocular 66,4%. Nenhuma evidência de doenças visuais 77,7%; alguns casos eventuais de miopia, astigmatismo, hipermetropia e anisometropia, portanto, conclui-se que os participantes sofrem de síndrome visual do computador entre um nível leve e muito grave (67%). Conclusões. Sugere-se que seja solicitado um diagnóstico completo para obter informações reais sobre os danos causados pela IVC.


Assuntos
Humanos , Criança , Adolescente
6.
Psicopedagogia ; 40(121): 38-45, jan.-abr. 2023.
Artigo em Português | LILACS-Express | LILACS, Index Psicologia - Periódicos | ID: biblio-1449000

RESUMO

De acordo com a Organização Mundial da Saúde, estima-se que 5% da população tenha Altas Habilidades, podendo esse número ser ainda maior. O presente trabalho tem como objetivo realizar uma pesquisa na área das Altas Habilidades com foco na inteligência lógico-matemática e a criatividade no Pensamento Computacional. O atendimento desse público ainda é incipiente na medida em que as políticas públicas destinadas à Educação Especial não são implementadas como deveriam ser. Dessa maneira, trata-se de uma pesquisa bibliográfica acerca dessa temática, referente ao período de 2015 a 2021. Utilizamos como metodologia a revisão da literatura, através de pesquisa realizada nas bases de dados Nuevas Ideas en Informática Educativa, Biblioteca Digital de Tese e Dissertação da Universidade Estadual do Oeste do Paraná (UNIOESTE), Research Society, na Revista de Informática da Educação, Revista Computação Aplicada e na Revista Internacional Educon. Os resultados mostraram a necessidade de pesquisa no campo das Altas Habilidades com tendência ao Pensamento Computacional, a fim de difundir o conhecimento a respeito dessa temática para que mais pessoas com esse perfil possam ser identificadas e assistidas para que suas potencialidades possam ser desenvolvidas.


According to the World Health Organization, it is estimated that 5% of the population has high skills, and this number may be even higher. The present work aims to conduct a research in the area of high skills focusing on logical-mathematical intelligence and creativity in computational thinking. The attendance of this public is still incipient to the extent that the public policies aimed at Special Education are not implemented as they should be. Thus, this is a bibliographical research on this theme, referring to the period from 2015 to 2021. We used as methodology the literature review, through research conducted in the databases Nuevas Ideas en Informática Educativa, Biblioteca Digital de Tese e Dissertação da Universidade Estadual do Oeste do Paraná (UNIOESTE) (in English - Digital Library of Thesis and Dissertation of the State University of Western Paraná - UNIOESTE), Research Society, in the Revista de Informática da Educação, Revista Computação Aplicada, and in Revista Internacional Educon. The results showed the need for research in the field of high skills with a tendency to computational thinking, in order to disseminate knowledge about this theme so that more people with this profile can be identified and assisted so that their potentialities can be developed.

7.
Rev Esp Cardiol (Engl Ed) ; 76(9): 700-707, 2023 Sep.
Artigo em Inglês, Espanhol | MEDLINE | ID: mdl-36716990

RESUMO

INTRODUCTION AND OBJECTIVES: The United Kingdom Prospective Diabetes Study (UKPDS) risk score has limited value for predicting coronary artery disease (CAD) events. We investigated the additive value of coronary computed tomography angiography (CCTA) on top of the UKPDS risk score in predicting 10-year adverse cardiac events in asymptomatic patients with type 2 diabetes. METHODS: We evaluated 589 asymptomatic diabetic patients without a history of CAD who underwent CCTA. The primary outcome was a composite of cardiac death, nonfatal myocardial infarction, unstable angina requiring hospitalization, and revascularization. We estimated the discrimination and reclassification ability for the prediction models, which included combinations of the UKPDS category, severity of stenosis, and coronary artery calcium score by CCTA. RESULTS: The incidence of the primary outcome was 12.4%. During 10 years of follow-up, patients without plaque by CCTA tended to have a low CAD event rate, while those with obstructive CAD tended to have a high event rate, irrespective of the baseline UKPDS risk category. The model that included only the UKPDS category had a Harrell's c-index of 0.658; adding the degree of stenosis to the model significantly increased the c-index by 0.066 (P=.004), while adding coronary artery calcium score increased the c-index by only 0.039 (P=.056). Overall, CCTA information in addition to the UKPDS risk category improved the reclassification rate for predicting the primary outcome. CONCLUSIONS: In asymptomatic patients with type 2 diabetes, CCTA information for CAD provided significant incremental discriminatory power beyond the UKPDS risk score category for predicting 10-year adverse coronary events.


Assuntos
Doença da Artéria Coronariana , Estenose Coronária , Diabetes Mellitus Tipo 2 , Humanos , Angiografia por Tomografia Computadorizada/métodos , Diabetes Mellitus Tipo 2/complicações , Diabetes Mellitus Tipo 2/diagnóstico , Diabetes Mellitus Tipo 2/epidemiologia , Prognóstico , Estudos Prospectivos , Constrição Patológica , Cálcio , Doença da Artéria Coronariana/diagnóstico , Angiografia Coronária/métodos , Valor Preditivo dos Testes , Estenose Coronária/diagnóstico por imagem
8.
Rev. bras. enferm ; 76(supl.3): e20230126, 2023. graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS, BDENF - Enfermagem | ID: biblio-1529812

RESUMO

ABSTRACT Objectives: to reflect on the impacts of the General Personal Data Protection Law on Nursing practice. Methods: reflection article, through the intentional collection of materials relating to the topic. Results: legislation regulates confidentiality, processing and data sharing, requiring institutional protection measures. The nursing team is responsible for acting preventively, both in care and in the management role, in order to avoid the misuse of the patient's personal data. The law allows academic research to be carried out as long as the purpose is clear, data collection occurs with an explicit purpose and data is anonymized. Final Considerations: although the General Personal Data Protection Law requires greater care in relation to data processing, it is established on precepts of good faith and respect for the rights of the individual, concepts aligned with the nursing code of ethics.


RESUMEN Objetivos: reflexionar sobre los impactos de la Ley General de Protección de Datos Personales en la práctica de enfermería. Métodos: se trata de un artículo reflexivo llevado a cabo mediante una recolección intencional de materiales referentes al tema. Resultados: la legislación regula la confidencialidad, el tratamiento y la puesta en común de los datos, exigiendo medidas institucionales de protección. Corresponde al equipo de enfermería actuar de forma preventiva, tanto en la atención como en la gestión, para evitar el uso indebido de los datos personales de los pacientes. La ley permite la investigación académica siempre que el propósito sea claro, los datos se recojan con un fin explícito y se anonimicen. Consideraciones Finales: aunque la Ley General de Protección de Datos de Carácter Personal exige un cuidado mayor con relación al tratamiento de los datos, se basa en preceptos de buena fe y respeto de los derechos del individuo, conceptos que están en consonancia con el código deontológico de la enfermería.


RESUMO Objetivos: refletir sobre os impactos da Lei Geral de Proteção de Dados Pessoais na prática da enfermagem. Métodos: artigo de reflexão, por meio da coleta intencional de materiais referentes ao tema. Resultados: a legislação regulamenta o sigilo, o tratamento e o compartilhamento dos dados, exigindo medidas de proteção institucionais. À equipe de enfermagem cabe agir preventivamente, tanto na assistência quanto no papel gerencial, a fim de evitar o mau uso dos dados pessoais do paciente. A lei permite a realização de pesquisas acadêmicas desde que a finalidade esteja clara, que a coleta de dados ocorra com um propósito explícito e que seja realizada a anonimização dos dados. Considerações Finais: apesar da Lei Geral de Proteção de Dados Pessoais exigir maiores cuidados em relação ao tratamento dos dados, ela é estabelecida em preceitos de boa-fé e em respeito aos direitos do indivíduo, conceitos alinhados ao código de ética da enfermagem.

9.
Arq. bras. cardiol ; 120(10): e20220874, 2023. graf
Artigo em Português | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1520122

RESUMO

Resumo Fundamento Apesar das evidências crescentes de que pacientes com insuficiência cardíaca (IC) são suscetíveis à sarcopenia, o motivo da associação não é bem compreendido. Objetivo O objetivo deste estudo é explorar ainda mais o mecanismo molecular de ocorrência desta complicação. Métodos Conjuntos de dados de expressão gênica para HF (GSE57345) e Sarcopenia (GSE1428) foram obtidos do banco de dados Gene Expression Omnibus (GEO). Genes diferencialmente expressos (DEGs) foram identificados usando pacotes 'edgeR' e "limma" de R, e suas funções foram analisadas usando Gene Ontology (GO) e a Enciclopédia de Genes e Genomas de Kyoto (KEGG). Redes de interação proteína-proteína (PPI) foram construídas e visualizadas usando Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes (STRING) e Cytoscape. Os genes hub foram selecionados usando o plugin cytoHubba e validados com GSE76701 para IC e GSE136344 para Sarcopenia. As vias relacionadas e os mecanismos moleculares dos genes hub foram realizados pela análise de enriquecimento de genes (GSEA). As análises estatísticas foram realizadas no software R. P < 0,05 foi considerado estatisticamente significativo. Resultados Foram encontrados 114 DEGs comuns. As vias relacionadas ao fator de crescimento, secreção de insulina e cGMP-PKG estavam enriquecidas tanto na IC quanto na sarcopenia. Descobriu-se que CYP27A1, KCNJ8, PIK3R5, TIMP2, CXCL12, KIT e VCAM1 são genes hub significativos após validação com GSEA enfatizando a importância dos genes hub na regulação da resposta inflamatória. Conclusão Nosso estudo revela que a IC e a Sarcopenia compartilham vias e mecanismos patogênicos comuns. Estes achados podem sugerir novas direções para pesquisas futuras sobre a patogênese subjacente.


Abstract Background Despite increasing evidence that patients with heart failure (HF) are susceptible to sarcopenia, the reason for the association is not well understood. Objective The purpose of this study is to explore further the molecular mechanism of the occurrence of this complication. Methods Gene expression datasets for HF (GSE57345) and Sarcopenia (GSE1428) were obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using 'edgeR' and "limma" packages of R, and their functions were analyzed using Gene Ontology (GO) and the Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Protein-protein interaction (PPI) networks were constructed and visualized using Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes (STRING) and Cytoscape. Hub genes were selected using the plugin cytoHubba and validation with GSE76701 for HF and GSE136344 for Sarcopenia. The related pathways and molecular mechanisms of the hub genes were performed by Gene set enrichment analysis (GSEA). The statistical analyses were performed using R software. P < 0.05 was considered statistically significant. Results A total of 114 common DEGs were found. Pathways related to growth factor, Insulin secretion and cGMP-PKG were enriched in both HF and Sarcopenia. CYP27A1, KCNJ8, PIK3R5, TIMP2, CXCL12, KIT, and VCAM1 were found to be significant hub genes after validation, with GSEA emphasizing the importance of the hub genes in the regulation of the inflammatory response. Conclusion Our study reveals that HF and Sarcopenia share common pathways and pathogenic mechanisms. These findings may suggest new directions for future research into the underlying pathogenesis.

10.
Aval. psicol ; 21(4): 437-445, out.-dez. 2022.
Artigo em Português | LILACS, Index Psicologia - Periódicos | ID: biblio-1447492

RESUMO

O objetivo geral da presente pesquisa é discutir as principais inovações em avaliação psicológica possibilitadas pela existência das redes sociais. Mais especificamente, iremos caracterizar as práticas (e fragilidades) da avaliação psicológica convencionais, os métodos mais modernos de psicometria computacional e exemplos de aplicações de psicometria computacional a partir de dados provenientes de redes sociais. De forma geral, as práticas convencionais da avaliação psicológica da psicometria foram criadas no século XIX e muitas de suas práticas, desenvolvidas próximo à metade do século XX, continuam sendo utilizadas de forma pouco crítica. Como alternativa, a psicometria computacional, uma abordagem da psicometria que combina métodos da ciência da computação orientados a dados e teoria psicométrica, tem sido utilizada para gerar inovações na área de avaliação. Por fim, discutimos algumas aplicações da psicometria computacional e como essas inovações irão, provavelmente, gerar mudanças profundas no contexto de avaliação.(AU)


The overall aim of this study was to discuss the main innovations in psychological assessment made possible by the existence of social networks. More specifically, we characterize the practices (and weaknesses) of conventional psychological assessment, the most modern methods of computational psychometry and examples of applications of computational psychometry using data from social networks. In general, the conventional practices of psychological assessment of psychometrics were created in the 19th century and many of its practices, developed around the middle of the 20th century, continue to be used in a non-critical way. As an alternative, computational psychometrics, an approach to psychometrics that combines data-driven methods of computer science and psychometric theory, has been used to generate innovations in the area of assessment. Finally, we discuss some applications of computational psychometrics and how these innovations are likely to generate profound changes in the assessment context.(AU)


El objetivo general de esta investigación es discutir las principales innovaciones, en materia de evaluación psicológica, posibilitadas por la existencia de las redes sociales. Más específicamente, caracterizaremos las prácticas convencionales (y debilidades) de la evaluación psicológica, los métodos más modernos de psicometría computacional y ejemplos de aplicaciones de psicometría computacional a partir de los datos de redes sociales. En general, las prácticas convencionales de evaluación psicológica de la psicometría se crearon en el siglo XIX y muchas de sus prácticas, desarrolladas a mediados del siglo XX, continúan utilizándose de forma acrítica. Como alternativa, la psicometría computacional, un enfoque de la psicometría que combina métodos informáticos basados en datos y teoría psicométrica, se ha empleado para generar innovaciones en el área de la evaluación. Por último, discutimos algunas aplicaciones de la psicometría computacional y cómo es probable que estas innovaciones generen cambios profundos en el contexto de la evaluación.(AU)


Assuntos
Testes Psicológicos , Psicometria/tendências , Redes Sociais Online , Aprendizado de Máquina , Análise de Dados
11.
Rev. bras. med. esporte ; 28(5): 436-439, Set.-Oct. 2022. tab, graf
Artigo em Inglês | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1376663

RESUMO

ABSTRACT Objective: Use the deep learning network model to identify key content in videos. Methodology: After reviewing the literature on computer vision, the feature extraction of the target video from the network using deep learning with the time-series data enhancement method was performed. The preprocessing method for data augmentation and Spatio-temporal feature extraction on the video based on LI3D network was explained. Accuracy rate, precision, and recall were used as indices. Results: The three indicators increased from 0.85, 0.88, and 0.84 to 0.89, 0.90, and 0.88, respectively. This shows that the LI3D network model maintains a high recall rate accompanied by high accuracy after data augmentation. The accuracy and loss function curves of the training phase show that the accuracy of the network is greatly improved compared to I3D. Conclusion: The experiment proves that the LI3D model is more stable and has faster convergence. By comparing the accuracy curve and loss function curve during LI3D, LI3D-LSTM, and LI3D-BiLSTM training, it is found that the LI3D-BiLSTM model converges faster. Level of evidence II; Therapeutic studies - investigation of treatment results.


RESUMO Objetivo: Usar o modelo de rede de aprendizagem profunda para identificar o conteúdo-chave em vídeos. Metodologia: Após revisão da literatura sobre a visão computadorizada, efetuou-se a extração da característica do vídeo alvo da rede utilizando o aprendizado profundo com o método de melhoramento de dados em séries temporais. Foi explanado o método de pré-processamento para aumento de dados e extração da característica espaço-temporal no vídeo baseado na rede LI3D. Foram utilizados como índices a taxa de precisão, precisão e recall. Resultados: Os três indicadores aumentaram de 0,85, 0,88, e 0,84 para 0,89, 0,90, e 0,88, respectivamente. Isso mostra que após o aumento dos dados, o modelo de rede LI3D mantém uma alta taxa de recuperação acompanhada de uma alta precisão. As curvas de precisão e função de perda da fase de treinamento demonstram que a precisão da rede é muito melhorada em comparação com a I3D. Conclusão: O experimento prova que o modelo LI3D é mais estável e que a convergência é mais rápida. Ao comparar a curva de precisão e a curva de função de perda durante o treinamento LI3D, LI3D-LSTM e LI3D-BiLSTM, verifica-se que o modelo LI3D-BiLSTM converge mais rapidamente. Nível de evidência II; Estudos terapêuticos - investigação de resultados de tratamento.


RESUMEN Objetivo: Utilizar el modelo de red de aprendizaje profundo para identificar el contenido clave en los vídeos. Metodología: Después de revisar la literatura sobre visión por ordenador, se realizó la extracción de características del vídeo objetivo de la red utilizando el aprendizaje profundo con el método de aumento de datos de series temporales. Se explicó el método de preprocesamiento para el aumento de datos y la extracción de características espacio-temporales en el vídeo basado en la red LI3D. Se utilizaron como índices la tasa de exactitud, la precisión y recall. Resultados: Los tres indicadores aumentaron de 0,85, 0,88 y 0,84 a 0,89, 0,90 y 0,88, respectivamente. Esto demuestra que el modelo de red LI3D mantiene un alto índice de recuperación acompañado de una alta precisión tras el aumento de datos. Las curvas de precisión y de función de pérdida de la fase de entrenamiento muestran que la precisión de la red mejora mucho en comparación con la I3D. Conclusión: El experimento demuestra que el modelo LI3D es más estable y tiene una convergencia más rápida. Al comparar la curva de precisión y la curva de función de pérdida durante el entrenamiento de LI3D, LI3D-LSTM y LI3D-BiLSTM, se observa que el modelo LI3D-BiLSTM converge más rápidamente. Nivel de evidencia II; Estudios terapéuticos - investigación de resultados de tratamiento.

12.
Rev. colomb. ciencias quim. farm ; 51(2)mayo-ago. 2022.
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1535835

RESUMO

Introducción: La termoquímica computacional es un campo de gran interés por sus diversas aplicaciones en diferentes campos de la química. En la actualidad, con el avance en el desarrollo de los supercomputadores se pueden emplear diversas metodologías que emplean cálculos de estructura electrónica para estimar valores termodinámicos con errores ~ 1,0 kcal/mol en comparación con los datos experimentales. Metodología: En este artículo se describen brevemente los principales métodos compuestos empleados en la termoquímica computacional como la serie de Petersson, los métodos Weizmann, el modelo HEAT y con especial énfasis en las teorías Gaussian-n. Aplicaciones: Diversas aplicaciones de la termoquímica computacional se presentan en este trabajo tales como el estudio de la reactividad y las estabilidades de nuevos derivados de compuestos químicos con potencialidades como fármacos, estudios de contaminantes en la química de la atmosfera donde se estiman valores importantes de entalpias de formación sobre compuestos derivados del gas de efecto invernadero SF6, estudios de compuestos derivados del petróleo de potencial importancia como nuevos combustibles y el desarrollo de explosivos con estimaciones energéticas de las entalpias de disociación de enlace y de combustión de nuevos compuestos orgánicos. Conclusiones: La termoquímica computacional es una herramienta actual para resolver problemas de la química donde la experimentación es difícil y con un alto costo económico. Se espera en un futuro que esta área desarrolle nuevos métodos y códigos computacionales que permitan estudiar sistemas moleculares de gran tamaño importantes en otras áreas de las ciencias como la física, la biología, ciencias de los materiales, entre otros.


Introdução: A termoquímica computacional é uma área de grande interesse devido às suas diversas aplicações em diferentes campos da química. Hoje em dia, com o avanço no desenvolvimento de supercomputadores, várias metodologias podem ser utilizadas que utilizam cálculos de estrutura eletrônica para estimar valores termodinâmicos com erros de ~ 1,0 kcal/mol em comparação com os dados experimentais. Metodologia: Este artigo descreve resumidamente os principais métodos compostos usados em termoquímica computacional, como a série Petersson, os métodos de Weizmann, o modelo HEAT e com especial ênfase nas teorias Gaussianas-n. Aplicações: Várias aplicações da termoquímica computacional são apresentadas neste trabalho tais como o estudo da reatividade e estabilidades de novos derivados de compostos químicos com potencial como drogas, estudos de poluentes em química atmosférica onde valores importantes de entalpias são estimados de treinamento em compostos derivados do gás de efeito estufa SF6, estudos de compostos derivados do petróleo com potencial importância como novos combustíveis e o desenvolvimento de explosivos com estimativas energéticas das entalpias de dissociação de ligações e combustão de novos compostos orgânicos. Conclusões: A termoquímica computacional é uma ferramenta atual para resolver problemas de química onde a experimentação é difícil e com alto custo econômico. Espera-se que no futuro esta área desenvolva novos métodos e códigos computacionais que permitam estudar grandes sistemas moleculares importantes em outras áreas da ciência como física, biologia, ciência dos materiais, entre outras.


SUMMARY Introductión: Computational thermochemistry is an area of great interest for its various applications in many different fields of chemistry. With the increase of the computational power readily available, it is currently possible to use various calculation based on the electronic structure methods for estimate thermodynamic properties with an error on the order of ~1.0 kcal/mol, which is comparable to experimental values. Methodology: In this work we briefly describe the main composite methods such as Petersson series, the Weizmann methods the HEAT model and with special focus on the Gaussian-n theories. Applications: Various applications of computational thermochemistry are presented in this work such as the study of reactivity and stabilities of new derivatives of chemical compounds with potential use as drugs, studies of pollutants in atmospheric chemistry where important values of enthalpies are estimated of training on compounds derived from the greenhouse gas SF6, studies of compounds derived from petroleum of potential importance as new fuels and the development of explosives with energy estimates of the enthalpies of bond dissociation and combustion of new organic compounds. Conclusions: Computational thermochemistry is a current tool to solve chemistry problems where experimentation is difficult and with a high economic cost. It is expected in the future that this area will develop new methods and computational codes that allow studying large molecular systems important in other areas of science such as physics, biology, materials science, among others.

13.
Medisan ; 26(4)jul.-ago. 2022. ilus
Artigo em Espanhol | LILACS, CUMED | ID: biblio-1405823

RESUMO

Introducción: La gestión de información agiliza los procesos en diferentes ambientes laborales, para lo cual se emplean sistemas capaces de reunir, organizar y vincular la información almacenada. La nube se basa en tecnologías existentes, tales como virtualización y servicios web; constituye un hito informático y se adapta a diversos escenarios y contextos. Objetivo: Contribuir a la gestión de información relacionada con las bases de datos de la reacción en cadena de la polimerasa y los procesos de acreditación en la Universidad de Ciencias Médicas de Santiago de Cuba a través de la nube Infomed Santiago. Métodos: Se realizó una investigación aplicada de desarrollo tecnológico en el Centro Provincial de Información de Ciencias Médicas, la Universidad de Ciencias Médicas y el Centro Provincial de Higiene, Epidemiología y Microbiología de Santiago de Cuba, desde junio hasta diciembre del 2021. Se aplicaron encuestas a 19 profesionales del sector, quienes laboraban directamente en la gestión de información relacionada con las bases de datos antes citadas. Resultados: Los 19 encuestados (100,0 %) afirmaron que utilizaban el correo electrónico, el chat integrado, la nube y otras facilidades que esta herramienta ofrece para almacenar y compartir información. Conclusiones: La nube permitió la gestión de información relacionada con los procesos asistenciales y académicos durante el periodo más crítico de la COVID-19.


Introduction: The information management speeds up the processes in different labor atmospheres, for which systems able to gather, organize and link the stored information are used. The cloud is based on existent technologies, such as virtualization and web services; it constitutes a computer landmark and it is adapted to diverse scenarios and contexts. Objective: To contribute the information management related to the databases of the polymerase chain reaction and the accreditation processes in the University of Medical Sciences from Santiago de Cuba through the cloud Infomed Santiago. Methods: An applied investigation of technological development was carried out in the Provincial Information Center of Medical Sciences, the University of Medical Sciences and the Provincial Center of Hygiene, Epidemiology and Microbiology in Santiago de Cuba, from June to December, 2021. Surveys were applied to 19 professionals of the sector who worked directly in the administration of information related to the databases mentioned. Results: The 19 professionals interviewed (100.0 %) affirmed that they used the electronic mail, the integrated chat, the cloud and other facilities that this tool offers to store and share information. Conclusions: The cloud allowed the information management related to the assistance and academic processes during the most critical period of COVID-19.


Assuntos
Gestão da Informação , Computação em Nuvem , COVID-19
14.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 39(1): 15-23, ene.-mar. 2022. graf
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1389924

RESUMO

RESUMEN Objetivo. Evaluar in silico y a nivel serológico el potencial antigénico del dominio extracelular recombinante de la proteína de ensamblaje de lipopolisacáridos - D (LptD) de Bartonella bacilliformis (dexr_LptD). Materiales y métodos. Mediante el análisis in silico se realizó la selección de una proteína de B. bacilliformis con potencial antigénico e inmunogénico. El gen de la proteína seleccionada se clonó en Escherichia coli TOP10 y se expresó en Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. La proteína recombinante fue expresada usando isopropil-β-D-1-tiogalactopiranósido (IPTG) y se optimizaron las condiciones de inducción. Por último, se purificó con resina Ni-IDA (His60 Ni Superflow) y se realizó un ensayo de Western Blot. Resultados. In silico, la proteína seleccionada fue LptD por estar localizada en la membrana externa y ser antigénica e inmunogénica. Las condiciones optimizadas para la inducción del dexr_LptD fueron 0,5 mM IPTG, 16 h, medio TB (Terrific Broth), etanol al 3% (v/v), 28 ºC, OD600: 1-1,5 y 200 r.p.m. La purificación se realizó en condiciones denaturantes a pequeña escala y se obtuvo 2,6 µg/mL de dexr_LptD parcialmente purificada. El ensayo de Western Blot mostró una reacción positiva entre los sueros provenientes de pacientes con la enfermedad de Carrión y dexr_LptD, ello evidencia la antigenicidad del dexr_LptD. Conclusiones. El dexr_LptD muestra antigenicidad in silico y a nivel serológico, estos resultados son base para posteriores estudios sobre candidatos vacunales contra la enfermedad de Carrión.


ABSTRACT Objective. To evaluate in silico and at the serological level the antigenic potential of the recombinant extracellular domain of the lipopolysaccharide assembly protein - D (LptD) of Bartonella bacilliformis (dexr_LptD). Materials and Methods. Through in silico analysis, we selected a B. bacilliformis protein with antigenic and immunogenic potential. The selected protein gene was cloned into Escherichia coli TOP10 and expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) pLysS. Recombinant protein was expressed using isopropyl-β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) and induction conditions were optimized. Finally, it was purified with Ni-IDA resin (His60 Ni Superflow) and a Western Blot assay was conducted. Results. In silico, the selected protein was LptD because it is located in the outer membrane and is antigenic and immunogenic. Optimized conditions for dexr_LptD induction were 0.5 mM IPTG, 16 hours, TB (Terrific Broth) medium, 3% (v/v) ethanol, 28 ºC, OD600: 1-1.5 and 200 rpm. Purification was carried out under denaturating conditions on a small scale and we obtained 2.6 μg/mL of partially purified dexr_LptD. The Western Blot assay showed a positive reaction between the sera from patients with Carrión's Disease and dexr_LptD, which shows the antigenicity of dexr_LptD. Conclusions. The dexr_LptD shows antigenicity both in silico and at the serological level, these results are the basis for further studies on vaccine candidates against Carrion's Disease.


Assuntos
Proteínas Recombinantes , Clonagem de Organismos , Bartonella bacilliformis , Infecções por Bartonella , Biologia Computacional , Imunogenicidade da Vacina
15.
Braz. dent. sci ; 25(4): 1-6, 2022. tab, ilus
Artigo em Inglês | LILACS, BBO - Odontologia | ID: biblio-1400990

RESUMO

Objective: The current study aimed at assessing the induced apical pressure at various simulated irrigant flow rates. Materials and Methods: Forty eight freshly extracted single-rooted premolars were decoronated and prepared to size 30 0.04 taper using HY-Flex CM rotary file system and were scanned using cone-beam computed tomography (CBCT). The scanned images were reconstructed to three-dimensional Computer-aided design models (CAD) and the 3D needle was also reconstructed. Finally, simulations were done by placing the 30 gauge open-ended needle 3 mm short of the working length. Results: There was a statistically significant difference (p<0.05) among the different groups compared. 1 ml/min flow rate induced the least apical pressures (p<0.05) as compared to the other types. Conclusion: 1 ml/min flow rates induced the least apical pressures when open-ended needles are used for irrigation.(AU)


Objetivo: O presente estudo teve como objetivo avaliar a indução de pressão apical em várias taxas de fluxo irrigante simuladas. Material e Métodos: Quarenta e oito raízes de pré-molares unirradiculares recém extraídos tiveram suas coroas removidas, foram preparados para uma conicidade de tamanho 30 0.04 através de um sistema rotatório de limas HYFlex CM e foram escaneados via tomografia computadorizada cone-beam (CBCT). As imagens escaneadas e as agulhas para irrigação foram reconstruídas em modelos tridimensionais de design assistido por computador (CAD). Ao final, foram feitas simulações através de agulhas de calibre 30 e 3 mm a menos que o comprimento de trabalho. Resultados: Houve diferença estatisticamente significativa (p<0.05) entre os diferentes grupos. A taxa de fluxo de 1 ml/min induziu as menores pressões apicais (p<0.05) quando comparada às demais taxas. Conclusão: Taxas de fluxo de 1 ml/min induziram as menores pressões apicais quando agulhas de ponta aberta foram utilizadas para irrigação (AU)


Assuntos
Pressão , Dente Pré-Molar , Tomografia Computadorizada por Raios X , Cavidade Pulpar
16.
Rev. Asoc. Colomb. Cien. Biol. (En línea) ; 1(34): 10-17, 2022. tab, ilus
Artigo em Espanhol | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1372379

RESUMO

Introducción: La enfermedad por almacenamiento del glucógeno tipo III (GSDIII, Glycogen storage disease type III) o Enfermedad de Cori Forbes es un trastorno del proceso de glucogenólisis ocasionado por variantes del gen AGL que codifica la enzima desramificante del glucógeno; se encuentra ubicado en el cromosoma 1p21.2 y su alteración genera una degradación incompleta del glucógeno, llevando a una acumulación de dextrina límite en órganos blanco, ocasionando organomegalia y disfunción. Objetivo: Caracterizar molecularmente un paciente lactante mayor con diagnóstico clínico y bioquímico sospechoso de GSDIII. Materiales y Métodos: Paciente lactante mayor masculino con antecedente de displasia broncopulmonar, infección respiratoria aguda, reflujo gastroesofágico, hepatomegalia e intolerancia a la lactosa. Se realizó estudio molecular mediante secuenciación de exoma completo; las variantes reportadas fueron evaluadas por Software de predicción como: Mutation Tas-ter, PROVEAN, UMD-Predictor, POLYPHEN, SIFT, Human Splicing Finder. Finalmente, se realizó una red de interacción génica mediante el programa GeneMania para determinar asociaciones génicas cercanas. Resultados: Se identifi caron 3 variantes heterocigotas ubicadas en el gen AGL: p.Arg910* que ocasiona pérdida del dominio amilo-1,6 glucosidasa y el dominio de unión al glucógeno, y las variantes p.Trp373Cys, p.Asn565Ser que generan cambios missense en la proteína. El análisis de significancia clínica por medio de métodos in-sílico determinó una clasificación patogénica para todas las variantes. La red de interacción permitió observar asociaciones entre el gen AGL y los genes FOXA2, PPP1R3B, NHLRC1 y GCK, que tienen relación con procesos metabólicos. Conclusión: una sospecha clínica inicial, a través de una buena historia clínica y la pertinencia de estudios bioquímicos-metabólicos-genómicos dirigidos, permite brindar un correcto diagnóstico, tratamiento y seguimiento, acercándonos a la medicina de precisión.


Introduction: Glycogen storage disease type III (GSDIII) or Cori Forbes disease is a disorder of the glycogeno-lysis process caused by variants of the AGL gene that encodes the glycogen debranching enzyme; It is located on chromosome 1p21.2 and its alteration generate an incomplete degradation of glycogen, leading to an accumu-lation of borderline dextrin in target organs, causing organomegaly and dysfunction. Objective: To characterize at the molecular level an elderly male lactating patient from southwestern Colombia with a clinical, biochemical diagnosis suspected of GSDIII. Materials and methods: An elderly male infant with a history of bronchopul-monary dysplasia, acute respiratory infection, gastroesophageal refl ux, hepatomegaly, and lactose intolerance. A molecular study was performed by whole exome sequencing; the reported variants were evaluated by prediction software such as Mutation Taster, PROVEAN, UMD-Predictor, POLYPHEN, SIFT, Human Splicing Finder. Fi-nally, a gene interaction network was performed using the GeneMania program to determine close gene associa-tions. Results: 3 heterozygous variants located in the AGL gene were identifi ed: p.Arg910 * that causes loss of the amyl-1,6 glucosidase domain and the glycogen-binding domain, and the variants p.Trp373Cys, p.Asn565 in the protein. The analysis of clinical signifi cance by means of in-silico methods determined a pathogenic classifi cation for all the variants. The interaction network will observe associations between the AGL gene and the FOXA2, PPP1R3B, NHLRC1 and GCK genes, which are related to metabolic processes. Conclusion: an initial clinical suspicion, through a good clinical history and the relevance of directed biochemical-metabolic-genomic studies, allows us to provide a correct diagnosis, treatment, and follow-up, bringing us closer to precision medicine


Assuntos
Humanos , Masculino , Lactente , Biologia Computacional , Doença de Depósito de Glicogênio Tipo III , Colômbia
17.
Arq. bras. cardiol ; 118(2): 448-460, 2022. tab, graf
Artigo em Inglês, Português | LILACS | ID: biblio-1364325

RESUMO

Resumo Fundamentos Uma metodologia para identificação de pacientes portadores de aneurisma de aorta ascendente (AAAs) sob alto risco de remodelamento aórtico não está completamente definida. Objetivo Esta pesquisa objetiva caracterizar numericamente o fluxo sanguíneo aórtico, relacionando a distribuição do estresse mecânico resultante com o crescimento de AAAs. Métodos Estudo analítico, observacional, unicêntrico, em que um protocolo de fluidodinâmica computacional (CFD - Computacional Fluid Dynamics) foi aplicado a imagens de angiotomografia computadorizada (ATC) de aorta de pacientes portadores de AAAs. Duas ATC de aorta com pelo menos um ano de intervalo foram obtidas. Dados clínicos dos pacientes foram registrados e, a partir das imagens de ATC, foram gerados modelos tridimensionais. Foram realizados estudos do campo de velocidade e estruturas coerentes (vórtices) com o objetivo de relacioná-los ao crescimento ou não do aneurisma e, posteriormente, compará-los com os dados clínicos dos pacientes. O teste de Kolmogorov-Smirnov foi utilizado para avaliar a normalidade da amostra e o teste não-paramétrico Wilcoxon signed-rank foi aplicado para comparações de dados pareados entre os ângulos aórticos. A significância estatística foi fixada em 5%. Resultados Para o grupo que apresentou crescimento do aneurisma, a incidência do jato na parede aórtica gerou áreas de recirculação posterior ao jato, induzindo à formação de vórtices complexos, ocasionando um incremento na pressão média no endotélio aórtico. O grupo sem crescimento do aneurisma apresentou diminuição na pressão média. Conclusão Este estudo piloto mostrou que a CFD baseada em ATC pode, em um futuro próximo, ser uma ferramenta auxiliar na identificação dos padrões de fluxo associados ao processo de remodelamento de AAAs.


Abstract Background A methodology to identify patients with ascending aortic aneurysm (AsAA) under high risk for aortic growth is not completely defined Objetive This research seeks to numerically characterize the aortic blood flow by relating the resulting mechanical stress distribution with AsAA growth. Methods Analytical, observational, single-center study in which a computational fluid dynamics (CFD) protocol was applied to aortic computed tomography angiogram (CTA) images of patients with AsAA. Two CTA exams taken at a minimum interval of one year were obtained. From the CTA-gathered images, three-dimensional models were built, and clinical data were registered. Study of velocity field and coherent structures (vortices) was performed aiming to relate them to the presence or absence of aneurysm growth, as well as comparing them to the patients' clinical data. The Kolmogorov-Smirnov test was used to evaluate the normality of the distribution, and the non-parametric Wilcoxon signed-rank test, for non-normal distribution, was used to compare the paired data of the aortic angles. Statistical significance was set at 5%. Results The incident jet in the aortic wall generated recirculation areas in the posterior region of the jet, inducing complex vortices formation in the group with aneurysm growth, leading to an average pressure increase in the ascending aortic wall between exams. In the group without aneurysm growth, the average pressure decreased. Conclusion This pilot study showed that CFD based on CTA may in the near future be a tool to help identify flow patterns associated with AsAA remodeling process.


Assuntos
Humanos , Aneurisma Aórtico/diagnóstico por imagem , Hidrodinâmica , Aorta/diagnóstico por imagem , Projetos Piloto , Hemodinâmica/fisiologia
18.
Int. j. morphol ; 39(5): 1296-1301, oct. 2021. ilus, tab
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1385514

RESUMO

RESUMEN: En la práctica clínica odontológica, reconocer estructuras anatómicas es determinante en la planificación de distintos tratamientos que involucren algún riesgo. Uno de los exámenes complementarios recomendados para la planificación de diferentes tratamientos en odontología es la Tomografía Computarizada de Haz Cónico (CBCT). Con este examen, se pueden pesquisar variantes anatómicas como el Foramen Mental Accesorio (FMA), el cual es importante identificar para prevenir complicaciones. El objetivo de este trabajo fue determinar la frecuencia y caracterización de FMA en una población chilena adulta, de la ciudad de Valdivia, Chile. Este estudio es de tipo observacional descriptivo. Se revisaron 247 exploraciones de diferentes centros radiológicos de la ciudad de Valdivia, cumpliendo 143 con los criterios de selección. Este estudio fue aprobado por el Comité ético científico del Servicio de Salud de Valdivia. Se encontró presencia de FMA en el 17,48 % que corresponde a 25 pacientes de un total de 143, correspondiendo un 80 % al sexo femenino. El rango etario en que se encontró con mayor frecuencia correspondió a 18-39 años. La distancia promedio entre FMA y FM (Foramen Mental) fue de 5,76 mm, correspondiendo a 2 mm la distancia mínima y 11,5 mm la distancia máxima. La distancia promedio entre FMA y ápice dentario más cercano fue de 5,36 mm. La distancia mínima y máxima fueron de 0,8 mm y 10,2 mm respectivamente. El ápice radicular mayormente asociado al FMA correspondió al segundo premolar con una frecuencia de 60 % (n=15). Este estudio confirma la importancia de la correcta evaluación de la región mental ante procedimientos en la zona, la cual es vital para prevenir lesiones en relación a esta variante anatómica.


SUMMARY: The recognition of key anatomical structures is decisive to avoid complications in the dental clinical practice. Cone Beam Computed Tomography (CBCT) is a complementary exam recommended for the planning of different procedures in dentistry. With this exam, anatomical variants can be identified, such as the Accessory Mental Foramen (AMF). The objective of this work was to determine the frequency and characteristics of AMF in an adult Chilean population from the city of Valdivia, Chile. This is an observational study that included 247 CBCT exams from different radiological centers in Valdivia. According to the selection criteria, 143 CBCT exams were included. This study was approved by the Scientific Ethics Committee of the Valdivia Health Services. AMF was identified in 25 patients representing 17.48 %. From this result, 80 % were found in females. AMF was most frequently identified in patients from 18 to 39 years old. The average distance between AMF and Mental Foramen (MF) was 5.76 mm, which corresponds to 2 mm the minimum distance and 11.5 mm the maximum distance. The average distance between AMF and the nearest dental apex was 5.36 mm, and the minimum and maximum distance were 0.8 mm and 10.2 mm, respectively. The root apex of the second premolar was most frequently associated with the AMF, representing 60 % (n=15). This study confirms the importance of the correct evaluation of the mental region before initiating procedures in the area, which is vital to prevent injuries associated with this anatomical variant.


Assuntos
Humanos , Masculino , Feminino , Adolescente , Adulto , Pessoa de Meia-Idade , Idoso , Adulto Jovem , Tomografia Computadorizada de Feixe Cônico , Mandíbula/diagnóstico por imagem , Chile , Variação Anatômica , Mandíbula/anatomia & histologia
19.
Int. j interdiscip. dent. (Print) ; 14(2): 187-190, ago. 2021. ilus
Artigo em Espanhol | LILACS | ID: biblio-1385213

RESUMO

RESUMEN: El objetivo: de este reporte es presentar el tratamiento endodóntico de un diente ante-rior con obliteración del canal radicular, con la ayuda de la endodoncia guiada. Paciente masculino sin antecedentes médicos relevante, y en tratamiento ortodóntico. Diente 2.1 con historia de traumatismo dento-alveaolar y presencia de dolor a la percusión. En la TCHC se observa obliteración total del canal radicular en el tercio cervical y medio y un área de radiolucidez apical. Diagnóstico: Periodontitis apical Sintomática. Tratamiento: Terapia de canal No vital, con planificación virtual y guía endodóntica. Se utilizó el programa de acceso gratuito, Bluesky Plan®, para la planifica-ción digital de la guía endodóntica. El tratamiento se realizó en dos citas. Conclusión: el uso de tecnología para la resolución de casos de alta complejidad en endodoncia, podría ayudar a mejorar el pronóstico de estos dientes y ser una alternativa más segura para reducir la posibilidad de perforación y preservar estructura dental.


ABSTRACT: The aim: of this case report is to present the endodontic treatment of an anterior tooth with an obliterated pulp canal, with the help of guided endodontics. Male patient with no relevant medical history, currently with orthodontic treatment. Tooth 2.1 had a history of dental trauma and presented tenderness to percussion. The CBCT exam showed a completely obliterated root canal in the cervical and middle third, and apical radiolucency. Diagnosis: Symptomatic Apical Periodontitis. Treatment: Root canal treatment with virtual planning and endodontic guide. Bluesky Plan® free access program was used for the digital planning of the endodontic guide. The treatment: was made in two sessions. Conclusion: the use of technology for the resolution of high complexity cases in endodontics could help improve the prognosis of these teeth and be a safer alternative to reduce the possibility of perforation and preserve more tooth structure.


Assuntos
Humanos , Masculino , Adulto , Periodontite Periapical/cirurgia , Tratamento do Canal Radicular/métodos , Cavidade Pulpar/cirurgia , Cavidade Pulpar/diagnóstico por imagem , Periodontite Periapical/diagnóstico por imagem , Calcificações da Polpa Dentária/cirurgia , Tomografia Computadorizada de Feixe Cônico , Impressão Tridimensional
20.
Acta biol. colomb ; 26(2): 170-177, mayo-ago. 2021. tab, graf
Artigo em Espanhol | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1355528

RESUMO

RESUMEN El filtrado de secuencias es un paso esencial sin importar el tipo de tecnología aplicada para la secuenciación de un genoma, en el cual las lecturas de baja calidad o una parte son eliminadas. En un ensamblado la construcción de un genoma se realiza a partir de la unión de lecturas cortas en cóntigos. Algunos ensambladores miden la relación que existe entre secuencias de una longitud fija (k-mer) que puede verse afectada por la presencia de secuencias de baja calidad. Un enfoque común para evaluar los ensamblados se basa en el análisis del número de cóntigos, la longitud del cóntigo más largo y el valor del N50, definido como la longitud del cóntigo que representa el 50 % de la longitud del conjunto. En este contexto, el presente estudio tuvo como objetivo evaluar el efecto del uso de lecturas crudas y filtradas en los valores de los parámetros de calidad obtenidos en el ensamblado del genoma de Bacillus altitudinis 19RS3 aislada de Ilex paraguariensis. Se realizó el análisis de calidad de ambos archivos de partida con el software FastqC y se filtraron las lecturas con el softwareTrimmomatic. Para el ensamblado se utilizó el software SPAdes y para su evaluación la herramienta QUAST. El mejor ensamblado para B. altitudinis 19RS3 se obtuvo a partir de las lecturas filtradas con el valor de k-mer 79, que generó 16 cóntigos mayores a 500 pb con un N50 de 931 914 pb y el cóntigo más largo de 966 271 pb.


ABSTRACT Sequence filtering is an essential step regardless of the type of technology applied for sequencing a genome, in which low-quality readings or a portion are eliminated. In an assembly, the construction of a genome is carried out from the union of short reads in contigs. Some assemblers measure the relationship between sequences of a fixed length (k-mer) that can be affected by the presence of low-quality sequences. A common approach to evaluating assemblies is based on the analysis of the number of contigs, the length of the longest contig, and the value of N50 defined as the length of the contig representing 50 % of the length of the assembly. In this context, the objective of this study was to evaluate the effect of the use of crude and filtered reads on the values of the quality parameters obtained from the genome assembly of Bacillus altituidinis 19RS3 isolated from Ilex paraguariensis. The quality analysis of both starting files was performed with the FastqC software and the readings were filtered with the Trimmomatic software. The SPAdes software was used for the assembly and the QUAST tool for its evaluation. The best assembly for B. altitudinis 19RS3 was obtained from the filtered readings with the value of k-mer 79, which generated 16 contigs greater than 500 bp with a N50 of 931 914 bp and the longest contig of 966 271 bp.

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