Specialized terminology for nursing practice with older adults in situations of violence / Terminología especializada para la práctica de enfermería a adultos mayores en situación de violencia / Terminologia especializada para a prática de enfermagem a pessoas idosas em situação de violência

ABSTRACT Objective: to develop a term bank for nursing clinical practice addressing violence against older adults, based on scientific literature. Method: this is a methodological, documentary study conducted in the following steps: identification of relevant terms for the target population and/or health priority, extracted from a scoping review using the PorOnto tool; and cross-mapping of the identified terms with those from the 2019/2020 version of the International Classification for Nursing Practice. The Content Validity Index was used for term validation. Variables related to participants were analyzed using descriptive statistics. Results: a total of 1,236 terms were identified, which were reduced to 704 after validation by seven judges. Subsequently, through cross-mapping, 293 terms were found to be present and 411 absent in the International Classification for Nursing Practice version 2019/2020. Conclusion: the study's contributions emphasize the importance of strengthening specialized terminologies that address the needs of older adults in situations of violence. This term bank will support the development of new nursing diagnoses, outcomes, and intervention statements to enhance the care plan provided by the nursing team across all levels of complexity.

RESUMEN Objetivo: desarrollar una base terminológica para la práctica clínica de enfermería frente a la violencia contra adultos mayores, fundada en la literatura científica. Método: estudio metodológico, documental, desarrollado a través de las etapas de identificación de términos relevantes para la clientela y/o prioridad de salud, extraídos de una revisión de alcance utilizando la herramienta PorOnto; y mapeo cruzado de términos identificados con términos de la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería versión 2019/2020. Para validar los términos se utilizó el Índice de Validez de Contenido. Las variables relacionadas con los participantes se analizaron mediante estadística descriptiva. Resultados: se identificaron 1.236 términos, que resultaron en 704 después de la validación por siete jueces. Luego, con mapeo cruzado, se identificaron 293 términos constantes y 411 términos no constantes en la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería versión 2019/2020. Conclusión: se destacan las contribuciones del estudio para el fortalecimiento de terminologías especializadas y adecuadas a las necesidades de las personas mayores en situación de violencia. Esta base terminológica contribuirá a la construcción de nuevos enunciados de diagnósticos, resultados e intervenciones de enfermería para calificar el plan de cuidados realizado por el equipo de enfermería en todos los niveles de complejidad.

RESUMO Objetivo: desenvolver um banco de termos para a prática clínica de enfermagem frente à violência contra a pessoa idosa, a partir da literatura científica. Método: estudo metodológico, documental, desenvolvido mediante as etapas de identificação dos termos relevantes para a clientela e/ou prioridade de saúde, extraídos de uma scoping review pela ferramenta PorOnto; e mapeamento cruzado dos termos identificados com termos da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem versão 2019/2020. Para validação dos termos, foi utilizado o Índice de Validade de Conteúdo. As variáveis relativas aos participantes foram analisadas por meio de estatística descritiva. Resultados: foram identificados 1.236 termos, que resultaram em 704 após validação por sete juízes. Em seguida, com o mapeamento cruzado, foram identificados 293 termos constantes e 411 não constantes na Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem versão 2019/2020. Conclusão: sublinha-se as contribuições do estudo para o fortalecimento de terminologias especializadas e adequadas às necessidades da pessoa idosa em situação de violência. O referido banco subsidiará a construção de novos enunciados de diagnósticos, resultados e intervenções de enfermagem para qualificar o plano de cuidados conduzido pela equipe de enfermagem em todos os níveis de complexidade.

Modelo ontológico para sistematização da assistência de enfermagem na perspectiva da teoria da complexidade / Ontological model for the systematization of nursing care from the perspective of complexity theory

Resumo: Introdução: A Sistematização da Assistência de Enfermagem corresponde à organização do trabalho quanto ao método, pessoal e instrumentos, vislumbrando operacionalizar o processo de enfermagem. Porém, há limitação da compreensão semântica do seu significado, conhecimento, operacionalização dos seus componentes e da contribuição para prática profissional e Ciência da Enfermagem. Objetivo: analisar, sob a ótica da Teoria da Complexidade, a construção de um modelo ontológico sobre Sistematização da Assistência de Enfermagem como tecnologia de apoio à organização da prática profissional do enfermeiro. Método: estudo qualitativo e exploratório, em três etapas. Primeiramente, construiu-se um mapa conceitual baseado nas sete etapas apresentadas por Cañas, Novak, Reiska (2015), almejando identificar conceitos, estrutura, processos e operação da Sistematização da Assistência de Enfermagem, à luz da Teoria da Complexidade. Organizou-se e representou-se o conhecimento com apoio do software CMap Tools. A segunda etapa compôs-se de entrevistas semiestruturadas, entre maio e dezembro de 2020, com 17 enfermeiros, dos quais nove eram do Grupo de Trabalho da Sistematização da Prática de Enfermagem da Comissão Mista da Associação Brasileira de Enfermagem e Conselho Regional de Enfermagem-PR e oito da Comissão Permanente de Sistematização da Prática de Enfermagem, nomeada pela Associação Brasileira de Enfermagem. Empregou-se a Análise de Conteúdo Temática, apoiada no software MAXQDA. Na terceira etapa, modelou-se a representação de uma ontologia sobre a Sistematização da Assistência de Enfermagem, baseada no guia interativo Ontology Development 101 apoiada pelo software Protégé (versão 5.5.0), a partir do mapa conceitual e das entrevistas. Resultados: identificou-se inconsistência semântica e de correlações, retratando a complexidade dos componentes da Sistematização da Assistência de Enfermagem, com fragmentos mecanicistas. No mapa conceitual, elaboraram-se três camadas conceituais. Organizaram-se os conceitos de acordo com a proposta conceitual da Sistematização da Assistência de Enfermagem prevista em sua principal legislação e posteriormente foram ampliados. Desta análise, procedeu-se ao agrupamento por temáticas: Sistematização da Assistência de Enfermagem; Ações de Enfermagem; Ações da Gestão do Cuidado; Ações de Gestão do Serviço de Enfermagem; Ações para Aplicação dos Cuidados; Ações para Aplicação no Serviço de Enfermagem; Fundamentos; Competências; Instrumentos; Normativas e Pessoal. Das entrevistas, emergiram 863 unidades de registro e seis categorias: Significado de Sistematização da Assistência de Enfermagem, com três subcategorias primárias; Construção Histórica do Conceito de Sistematização da Assistência de Enfermagem, com quatro subcategorias primárias; Ensino e Aprendizagem; Pesquisa da Enfermagem; Implicações Prática e Concretização da Sistematização da Assistência de Enfermagem. Identificaram-se 156 conceitos relevantes para modelagem da ontologia, utilizando-se da "metodologia 101", objetivando representar o conhecimento do domínio Sistematização da Assistência de Enfermagem. Considerações finais: a ontologia sobre Sistematização da Assistência de Enfermagem ancorada na Teoria da Complexidade permitiu um novo olhar sobre os fenômenos, os quais devem ser desenvolvidos, revistos e ressignificados. Acredita-se que esta ontologia facilite a representação formal do conhecimento sobre Sistematização da Assistência de Enfermagem, afirmando-a enquanto área de conhecimento representativo, fortalecendo sua identidade, significado unívoco, organização, compartilhamento de saberes e de informação. Ademais, pode favorecer difusão de vocabulário comum, contribuindo com a prática profissional de enfermeiros.

Abstract: Introduction: the Systematization of Nursing Care is the work organization according to the method, personnel and instruments, which glimpses to operationalize the nursing process. However, there is a limitation in the semantic understanding of its meaning, knowledge, and operationalization of its components and the contribution to the practice and science of nursing. Objective: to analyze, from the perspective of Complexity Theory, the process of building an ontological model on Systematization of Nursing Care as a technology to support the organization of professional nursing practice. Method: qualitative and exploratory study, in three stages. Firstly, a conceptual map was built based on the seven stages presented by Cañas, Novak, Reiska (2015), aiming to identify concepts, structure, processes and operation of the Systematization of Nursing Care, in light of the complexity, anchored in the related literature. Knowledge was organized and represented with the support of CMap Tools software. The second stage consisted of semi-structured interviews, between May and December 2020, done with 17 professionals, of whom nine from the Working Group on the Systematization of Nursing Practice of the Mixed Commission of the Brazilian Nursing Association and Regional Nursing Council-PR and eight from the Permanent Commission for the Systematization of Nursing Practice, appointed by the Association. Thematic Content Analysis was used, supported by the MAXQDA software. In the third stage, the representation of ontology on the Systematization of Nursing Care was modeled, based on the interactive guide Ontology Development 101 supported by the software Protégé (version 5.5.0), from the conceptual map and the interviews. Results: semantic inconsistency and correlations were identified, portraying the complexity of the components of the Systematization of Nursing Care, with mechanistic fragments. In the conceptual map, three conceptual layers were elaborated. The concepts were organized according to the conceptual proposal of the Systematization of Nursing Care provided for in its main legislation and were later expanded. From this analysis, we proceeded to group by themes: Systematization of Nursing Care; Nursing Actions; Management Care Actions; Nursing Service Management Actions, Care Management Actions; Nursing Service Management Actions; Actions for Application of Care, and Actions for Application in the Nursing Service; Fundamentals, Competencies; Instruments; Regulations and Personnel. From the interviews, 863 record units and six categories emerged: Meaning of Systematization of Nursing Care, with three primary subcategories; Historical Construction of the Concept of Systematization of Nursing Care, with four primary subcategories; Teaching and Learning; Nursing Research; Practical Implications and Implementation of the Systematization of Nursing Care. 156 relevant concepts for ontology modeling were identified using the "101 methodology", aiming to represent the knowledge of the Systematization of Nursing Care domain. Final considerations: the ontology on Systematization of Nursing Care anchored in Complexity Theory allowed a new look at the phenomena, which must be developed, reviewed and re-signified. It is believed that this ontology facilitates the formal representation of knowledge about Systematization of Nursing Care, affirming it as a representative area of knowledge, strengthening its identity, univocal meaning, organization, sharing of knowledge and information. Furthermore, it can favor the diffusion of common vocabulary, contributing to the professional practice of nurses.

Resumen: Introducción: la sistematización de la asistencia de Enfermeríaes la organización del trabajo en cuanto a método, personal e instrumentos, con el objetivo de operacionalizar el proceso de enfermería. Sin embargo, existe una limitación en la comprensión semántica de su significado, conocimiento, operacionalización de sus componentes y el aporte a la práctica y ciencia de enfermería. Objetivo: analizar, en la perspectiva de la Teoría de la Complejidad, el proceso de construcción de un modelo ontológico sobre la sistematización de la asistencia de Enfermería como tecnología de apoyo a la organización de la práctica profesional de enfermería. Método: estudio cualitativo y exploratorio, en tres etapas. En primer lugar, se construyó un mapa conceptual a partir de las siete etapas proclamadas presentadas por Cañas, Novak, Reiska (2015), con el objetivo de identificar conceptos, estructura, procesos y funcionamiento de la sistematización de la asistencia de Enfermería, a la luz de la complejidad, anclada en la literatura relacionada. El conocimiento fue organizado y representado con el apoyo del software CMap Tools. La segunda etapa consistió en entrevistas semiestructuradas, entre mayo y diciembre de 2020, con 17 profesionales, de los cuales nueve del Grupo de Trabajo sobre Sistematización de la Práctica de Enfermería de la Comisión Mixta de la Asociación Brasileña de Enfermería y Consejo Regional de Enfermería-PR y ocho del Comisión Permanente para la Sistematización de la Práctica de Enfermería, designada por el Colegio. Se utilizó el Análisis de Contenido Temático, apoyado en el software MAXQDA. En la tercera etapa, se modeló la representación de una ontología sobre la sistematización de la asistencia de Enfermería, a partir de la guía interactiva Ontology Development 101 con el apoyo del software Protégé (versión 5.5.0), del mapa conceptual y de las entrevistas. Resultados: fueron identificadas inconsistencias semánticas y correlaciones, retratando la complejidad de los componentes de lasistematización de la asistencia de Enfermería, con fragmentos mecanicistas. En el mapa conceptual se elaboraron tres capas conceptuales. Los conceptos fueron organizados de acuerdo con la propuesta conceptual de la sistematización de la asistencia de Enfermeríaprevista en su legislación principal y posteriormente fueron ampliados. A partir de ese análisis, se procedió a agrupar por temas: Sistematización de la Asistencia de Enfermería; Acciones de Enfermería; Acciones de Gestión del Cuidado; Acciones de Gestión del Servicio de Enfermería; Acciones de Gestión del Cuidado; Acciones de Gestión del Servicio de Enfermería; Acciones de Aplicación de Cuidados; Acciones de Aplicación en el Servicio de Enfermería; Fundamentos; Competencias; Instrumentos; Reglamentos y Personal. De las entrevistas surgieron 863 unidades de registro y seis categorías: Significado de sistematización de la asistencia de Enfermería, con tres subcategorías primarias; Construcción Histórica del Concepto de Sistematización de la Atención de Enfermería, con cuatro subcategorías primarias; Enseñanza y Aprendizaje; Investigación en Enfermería; Implicaciones Prácticas e Implementación de la sistematización de la asistencia de Enfermería. Fueron identificados 156 conceptos relevantes para el modelado ontológico utilizando la "metodología 101", con el objetivo de representar el conocimiento del dominio sistematización de la asistencia de Enfermería. Consideraciones finales: la ontología sobre sistematización de la asistencia de Enfermería anclado en la Teoría de la Complejidad permitió una nueva mirada sobre los fenómenos, que deben ser desarrollados, revisados y redefinidos. Se cree que esta ontología facilita la representación formal del conocimiento sobre sistematización de la asistencia de Enfermería, afirmándola como área representativa del saber, fortaleciendo su identidad, sentido unívoco, organización, intercambio de saberes e informaciones. Además, puede favorecer la difusión del vocabulario común, contribuyendo a la práctica profesional de los enfermeros.

Equivalence between ICNP® and SNOMED CT concepts: theoretical reflection / Equivalencia entre conceptos ICNP® y SNOMED CT: reflexión teórica / Equivalência entre conceitos da CIPE® e da SNOMED CT: reflexão teórica

ABSTRACT Objective: to reflect on the equivalence between the concepts of the International Classification for Nursing Practice and the Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms. Method: theoretical reflection based on the analysis of equivalence between the concepts of diagnoses, results and nursing interventions of the International Classification for Nursing Practice and the hierarchy of the Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms. The researchers' experience and articles on the subject provided support for analysis. Results: nursing diagnoses and results of the International Classification for Nursing Practice are present in the hierarchies "clinical finding", "disorder" and "problem situation", while the interventions are included in the hierarchies "procedure" and "regime/therapy". The main causes of non-equivalence are linked to the problems of the specificity of the concept. Cross-mapping will require analysis by nursing specialists to improve the representativeness of the concepts. The equivalence table must be translated into Brazilian Portuguese, but the entire Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms lacks interdisciplinary work. Conclusion: the representation of the International Classification for Nursing Practice in systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms will bring benefits related to the clarity of concepts. The concepts of nursing classification that are not equivalent will require conceptual analysis. The lack of translation of the Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms for the Portuguese language will reflect the development of terminological subsets of the International Classification for Nursing Practice.

RESUMEN Objetivo: reflexionar sobre la equivalencia entre los conceptos de la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería y la Nomenclatura Sistematizada de Medicina Internacional - Términos Clínicos. Método: reflexión teórica basada en el análisis de la equivalencia entre los conceptos de diagnósticos, resultados e intervenciones de enfermería de la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería y la jerarquía de la Nomenclatura Sistematizada de Medicina Internacional - Términos Clínicos. La experiencia de los investigadores y los artículos sobre el tema sirvieron de apoyo para el análisis. Resultados: los diagnósticos y resultados de enfermería de la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería están presentes en las jerarquías "hallazgo clínico", "trastorno" y "situación-problema", mientras que las intervenciones están incluidas en las jerarquías "procedimiento" y "régimen/terapia". Las principales causas de la no equivalencia están vinculadas a los problemas de especificidad del concepto. El mapeo cruzado requerirá el análisis de expertos en enfermería para mejorar la representatividad de los conceptos. La tabla de equivalencia debe ser traducida al portugués brasileño, pero la totalidad de la Nomenclatura Sistematizada de Medicina Internacional - Términos Clínicos carece de trabajo interdisciplinario. Conclusión: la representación de la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería en la Nomenclatura Sistematizada de Medicina Internacional - Términos Clínicos traerá beneficios relacionados con la claridad de conceptos. Los conceptos de clasificación de enfermería que no sean equivalentes requerirán un análisis conceptual. La falta de traducción de la Nomenclatura Sistematizada de Medicina Internacional - Términos Clínicos para el portugués se reflejará en el desarrollo de subconjuntos terminológicos de la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería.

RESUMO Objetivo: refletir sobre a equivalência entre os conceitos da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem e da Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms. Método: reflexão teórica baseada na análise da equivalência entre os conceitos de diagnósticos, resultados e intervenções de enfermagem da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem e a hierarquia da Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms. A experiência das pesquisadoras e artigos sobre o tema ofereceram suporte para análise. Resultados: diagnósticos e resultados de enfermagem da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem estão presentes nas hierarquias "achado clínico", "transtorno" e "situação-problema", enquanto as intervenções constam nas hierarquias "procedimento" e "regime/terapia". As principais causas de não equivalência são ligadas aos problemas da especificidade do conceito. O mapeamento cruzado exigirá análise por especialistas na enfermagem para melhorar a representatividade dos conceitos. A tabela de equivalência deverá ser traduzida para o português brasileiro, porém a totalidade da Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms carece de trabalho interdisciplinar. Conclusão: a representação da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem na Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms trará benefícios relacionados à clareza dos conceitos. Os conceitos da classificação de enfermagem que não foram equivalentes necessitarão de análise conceitual. A ausência de tradução da Systematized Nomenclature of Medicine International - Clinical Terms para o português refletirá no desenvolvimento de subconjuntos terminológicos da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem.

Mapeamento dos domínios da ANVISA para o padrão ISO IDMP / Mapping of ANVISA domains to the ISO IDMP standard / Mapeo de dominios de ANVISA al estándar ISO IDMP

Objetivo: Apresentar o mapeamento entre vocabulários controlados da Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA) para listas do European Directorate for the Quality of Medicines and Healthcare (EDQM). Método: O mapeamento obedeceu aos princípios da ABNT NBR ISO 12300. Resultados: Foram mapeadas as listas: Via de Administração, Forma Farmacêutica e Embalagem. 47% dos mapeamentos foram classificados com grau de equivalência 4, onde o conceito fonte foi mais restrito com mais significado específico que o conceito/termo alvo. Conclusão: Entende-se que este estudo fornece subsídios para a ANVISA prosseguir no trabalho de harmonização das listas locais com o padrão IDMP.

Objective: To present the mapping between controlled Brazilian Health Regulatory Agency (ANVISA) vocabularies for European Directorate for the Quality of Medicines and Healthcare (EDQM) lists. Method: The mapping followed the principles described in the ABNT NBR ISO 12300. Results: Terms of three lists were mapped: Routes of Administration, Pharmaceutical Dose Forms and Packaging. Almost half of the mappings were classified with equivalence grade 4 meaning that the source concept was more restricted with more specific meaning than the target concept / term. Conclusion: This work provides the necessary subsidies for ANVISA to proceed with the work of harmonizing local lists with the IDMP standard.

Objetivo: Presentar el mapeo entre vocabularios controlados de Agencia Nacional de Vigilancia Sanitaria (ANVISA) para listas European Directorate for the Quality of Medicines and Healthcare (EDQM). Método: El mapeo siguió los principios descritos en lo estándar ABNT NBR ISO 12300. Resultados: Se mapearon los términos de las listas: Vía de administración, Forma farmacéutica y Embalajes. La mayoría se clasificaron como grado de equivalencia 4, donde el concepto fuente era más restringido con un significado más específico que el concepto/término objetivo. Conclusión: Se entiende que este estudio proporciona subsidios para ANVISA continúe el trabajo de armonizar las listas locales con el estándar IDMP.

The evidence-based medicine PICO strategy applied to dentistry using MeSH, Emtree and DeCS / Estrategia PICO de la medicina basada en la evidencia aplicada a odontología con uso de los tesauros MeSH, Emtree y DeCS

Abstract Introduction: the PICO mnemonic is an evidence-based medicine tool that helps formulate the research questions needed to conduct the right search for scientific information. To properly classify this information, controlled languages or thesauruses are used for information retrieval. The aim was to identify whether the PICO search strategy in evidence-based medicine using the MeSH, Emtree and DeCS thesauruses answers a research question in the field of dentistry. Methods: to carry out the PICO strategy, a research question was formulated, identifying the natural language terms for each component of the PICO acronym, which were normalized into the three thesauruses to create the search equations. Results: 43 results were found on Medline through PubMed, 5 on Embase, and 0 on LILACS. There were 4 original articles that answer the research question, proving to be an effective strategy for finding clinical evidence. Conclusion: this study shows that the strategy helps obtain results to answer the question posed. It should be noted that, in order to successfully search and retrieve information, researchers should use the PICO strategy and get familiar with the thesauruses that help structure search equations in the various bibliographic databases.

Resumen Introducción: la mnemotecnia PICO es una herramienta de la medicina basada en la evidencia que facilita la formulación de preguntas de investigación necesarias para realizar una correcta búsqueda de información científica. Para clasificar adecuadamente esta información se utilizan lenguajes controlados o tesauros que permiten ubicar dicha información. El objetivo del presente estudio consistió en identificar si la estrategia de búsqueda PICO de la medicina basada en la evidencia, utilizando los tesauros MeSH, Emtree y DeCS, responde a una pregunta de investigación en el campo de la odontología. Métodos: para llevar a cabo la estrategia PICO, se elaboró una pregunta de investigación, se identificaron los términos en lenguaje natural para cada componente del acrónimo PICO, posteriormente se normalizaron en los tres tesauros y se construyeron las ecuaciones de búsqueda. Resultados: se encontraron 43 resultados en Medline a través de la plataforma PubMed, 5 en Embase y 0 en LILACS. Se identificaron 4 artículos originales que responden la pregunta de investigación, demostrando ser una estrategia eficaz para la búsqueda de evidencia clínica. Conclusión: el ejercicio realizado en el presente trabajo logró demostrar que la estrategia permite obtener resultados que responden a la pregunta planteada. Cabe resaltar que, para tener éxito en la búsqueda y obtención de información, los investigadores deberían utilizar la estrategia PICO y conocer los diferentes tesauros que facilitan la construcción de las ecuaciones de búsqueda en las diferentes bases de datos bibliográficas.

Use of computational tools as support to the cross-mapping method between clinical terminologies / Uso de herramientas computacionales como ayuda al método de mapeo cruzado entre terminologías clínicas / Uso de ferramentas computacionais como auxílio ao método de mapeamento cruzado entre terminologias clínicas

ABSTRACT Objective: to reflect on the use of computational tools in the cross-mapping method between clinical terminologies. Method: reflection study. Results: the cross-mapping method consists of obtaining a list of terms through extraction and normalization; the connection between the terms of the list and those of the reference base, by means of predefined rules; and grouping of the terms into categories: exact or partial combination or, in more detail, similar term, more comprehensive term, more restricted term and non-agreeing term. Performed manually in many studies, it can be automated with the use of the Unified Medical Language System (UMLS). Obtaining the terms list can occur automatically by natural language processing algorithms, being that the use of rules to identify information in texts allows the expert's knowledge to be coupled to the algorithm, and it can be performed by techniques based on Machine Learning. When it comes to mapping terms using the 7-Axis model of the International Classification for Nursing Practice (ICNP®), the process can also be automated through natural language processing algorithms such as POS-tagger and the syntactic parser. Conclusion: the cross-mapping method can be intensified by the use of natural language processing algorithms. However, even in cases of automatic mapping, the validation of the results by specialists should not be discarded.

RESUMEN Objetivo: reflexionar sobre el uso de herramientas computacionales en el método de mapeo cruzado entre terminologías clínicas. Método: estudio de reflexión. Resultados: el método de mapeo cruzado consiste en la obtención de listado de términos, por medio de extracción y normalización; conexión entre los términos del listado y los de la base de referencia, mediante reglas previamente definidas; y agrupación de los términos en categorías: combinación exacta o parcial o, de manera más detallada, término similar, término más amplio, término más restringido y término no concordante. Realizado manualmente en muchos estudios, puede ser automatizado con el uso del Unified Medical Language System (UMLS). La obtención del listado de términos puede ocurrir de forma automática por algoritmos de procesamiento de lenguaje natural, siendo que la utilización de reglas para identificación de información en textos permite que el conocimiento del especialista sea acoplado al algoritmo, pudiendo ser realizado por técnicas basadas en Machine Learning. Cuando se trata de mapeo de términos utilizando el modelo de siete Ejes de la Clasificación Internacional para la Práctica de Enfermería (CIPE®), el proceso también puede ser automatizado a través de algoritmos de procesamiento de lenguaje natural, como el POS-tagger y el parser sintático. Conclusión: el método de mapeo cruzado puede ser intensificado por el uso de algoritmos de procesamiento de lenguaje natural. Sin embargo, incluso en casos de asignación automática, la validación de los resultados por expertos no debe descartarse.

RESUMO Objetivo: refletir sobre o uso de ferramentas computacionais no método de mapeamento cruzado entre terminologias clínicas. Método: estudo de reflexão. Resultados: o método de mapeamento cruzado consiste na obtenção de listagem de termos, por meio de extração e normalização; ligação entre os termos da listagem e os da base de referência, mediante regras previamente definidas; e agrupamento dos termos em categorias: combinação exata ou parcial ou, de maneira mais detalhada, termo similar, termo mais abrangente, termo mais restrito e termo não concordante. Realizado manualmente em muitos estudos, pode ser automatizado com a utilização do Unified Medical Language System (UMLS). A obtenção da listagem de termos pode ocorrer de forma automática por algoritmos de processamento de linguagem natural, sendo que a utilização de regras para identificação de informação em textos permite que o conhecimento do especialista seja acoplado ao algoritmo, podendo ser realizada por técnicas baseadas em Machine Learning. Quando se trata de mapeamento de termos utilizando o modelo de sete Eixos da Classificação Internacional para a Prática de Enfermagem (CIPE®), o processo também pode ser automatizado por meio de algoritmos de processamento de linguagem natural, como o POS-tagger e o parser sintático. Conclusão: o método de mapeamento cruzado pode ser intensificado pelo uso de algoritmos de processamento de linguagem natural. No entanto, mesmo em casos de mapeamento automático, a validação dos resultados por especialistas não deve ser descartada.

Estratégia para a recuperação de informação científica sobre as doenças tropicais negligenciadas: análise comparativa da Scopus, Pubmed e Web of Science / Estrategia para la recuperación de la información científica sobre enfermedades tropicales desatendidas: análisis comparativo de Scopus, PubMed y Web of Science / Strategy for information retrieval of scientific on neglected tropical diseases: comparative analysis of Scopus, PubMed and Web of Science

Objetiva desenvolver um percurso metodológico para recuperar informações científicas sobre as Doenças Tropicais Negligenciadas (DTN) em bases de dados internacionais (Scopus, Web of Science e PubMed). Os procedimentos metodológicos desta pesquisa foram: a) identificação das principais doenças tropicais segundo a Organização Mundial da Saúde; b) padronização dos nomes das doenças a partir dos Descritores em Ciências da Saúde da Biblioteca Virtual de Saúde (DeCS/BVS); c) construção de duas listas: uma com os termos controlados associados a operadores booleanos, e outra com os termos não controlados, também estruturada com operadores booleanos; d) busca de informações nas principais bases de dados anteriormente citadas de maneira controlada e não controlada; e) comparação dos resultados obtidos entre a busca controlada e não controlada; f) construção de fluxo metodológico para fins de replicação. Percebeu-se que o uso da busca controlada aumentou a revocação do processo de recuperação da informação, especificamente, a Base Scopus apresentou um aumento mais significativo na recuperação de resultados (11,28 %). A PubMed teve um incremento na revocação de 8,92 % e a Web of Science de 2,64 %. Ademais, propõe-se neste trabalho um fluxo para a recuperação da informação nas referidas bases, que sirva para os pesquisadores neste tema, pois entende-se que o alto grau de variabilidade das palavras e a dispersão na representação do tema nas bases constitui-se no importante impeditivo para a recuperação de informações(AU)

El objetivo de esta investigación fue desarrollar una metodología para recuperar informaciones científicas sobre las enfermedades tropicales desatendidas, en bases de datos internacionales (Scopus, Web of Science y PubMed). Los procedimientos metodológicos de esta investigación fueron: a) identificación de las principales enfermedades tropicales según la Organización Mundial de la Salud; b) estandarización de los nombres de las enfermedades a partir de los Descriptores en Ciencias de la Salud de la Biblioteca Virtual de Salud (DeCS/BVS); c) construcción de dos listas: una con los términos controlados asociados a operadores booleanos, y otra con los términos no controlados, también estructurada con operadores booleanos; d) búsqueda de informaciones en las principales bases de datos anteriormente citadas de manera controlada y no controlada; e) comparación de los resultados obtenidos entre la búsqueda controlada y no controlada; f) construcción de flujo metodológico para fines de replicación. Se percibió que el uso de la búsqueda controlada aumentó la revocación del proceso de recuperación de la información. Específicamente la Base Scopus presentó un aumento más significativo en los resultados (11,28 %). PubMed tuvo un incremento en la revocación del 8,92 % y la Web of Science del 2,64 %. Además, se propone en este trabajo un flujo para la recuperación de la información en las referidas bases, que sirva para los investigadores en este tema, pues se entiende que el alto grado de variabilidad de las palabras y la dispersión en la representación del tema en las bases se constituyen en importante impedimento para la recuperación de informaciones(AU)

It aims to develop a methodological pathway for the retrieval of scientific information on neglected tropical diseases in international databases (Scopus, Web of Science and PubMed). The methodological procedures performed in this work were: a) identification of the main tropical diseases according to the World Health Organization; b) conversion of the names of the diseases in standardized terms from the Descriptors in Health Sciences of the Virtual Health Library (DeCS), c) the construction of two lists: one with the standard terms associated with Boolean operators, and the other with the nonstandard terms; d) search for information in the main databases previously mentioned in a standardized and non-standardized way; e) comparison of the results obtained between standardized and non-standardized search; f) methodological flow construction for replication purposes. As a main result it was observed that the use of the standardized search increased the recall of the information retrieval process, and Scopus was the basis that presented a more significant increase in the retrieval of results (11.28 %). PubMed had an increase in recall of 8.92 % and Web of Science of 2.64 %. In addition, it is proposed in this work a flow for the retrieval of the information in the mentioned bases, that can be useful to all the researchers who wish to obtain scientific information on this subject, since it is understood that the high degree of variability of the words and the dispersion in the representation of the theme in the bases constitutes the important impediment for the information retrieval(AU)

Estratégia para a recuperação de informação científica sobre as doenças tropicais negligenciadas: análise comparativa da Scopus, Pubmed e Web of Science / Estrategia para la recuperación de la información científica sobre enfermedades tropicales desatendidas: análisis comparativo de Scopus, PubMed y Web of Science / Strategy for information retrieval of scientific on neglected tropical diseases: comparative analysis of Scopus, PubMed and Web of Science

Objetiva desenvolver um percurso metodológico para recuperar informações científicas sobre as Doenças Tropicais Negligenciadas (DTN) em bases de dados internacionais (Scopus, Web of Science e PubMed). Os procedimentos metodológicos desta pesquisa foram: a) identificação das principais doenças tropicais segundo a Organização Mundial da Saúde; b) padronização dos nomes das doenças a partir dos Descritores em Ciências da Saúde da Biblioteca Virtual de Saúde (DeCS/BVS); c) construção de duas listas: uma com os termos controlados associados a operadores booleanos, e outra com os termos não controlados, também estruturada com operadores booleanos; d) busca de informações nas principais bases de dados anteriormente citadas de maneira controlada e não controlada; e) comparação dos resultados obtidos entre a busca controlada e não controlada; f) construção de fluxo metodológico para fins de replicação. Percebeu-se que o uso da busca controlada aumentou a revocação do processo de recuperação da informação, especificamente, a Base Scopus apresentou um aumento mais significativo na recuperação de resultados (11,28 %). A PubMed teve um incremento na revocação de 8,92 % e a Web of Science de 2,64 %. Ademais, propõe-se neste trabalho um fluxo para a recuperação da informação nas referidas bases, que sirva para os pesquisadores neste tema, pois entende-se que o alto grau de variabilidade das palavras e a dispersão na representação do tema nas bases constitui-se no importante impeditivo para a recuperação de informações(AU)

El objetivo de esta investigación fue desarrollar una metodología para recuperar informaciones científicas sobre las enfermedades tropicales desatendidas, en bases de datos internacionales (Scopus, Web of Science y PubMed). Los procedimientos metodológicos de esta investigación fueron: a) identificación de las principales enfermedades tropicales según la Organización Mundial de la Salud; b) estandarización de los nombres de las enfermedades a partir de los Descriptores en Ciencias de la Salud de la Biblioteca Virtual de Salud (DeCS/BVS); c) construcción de dos listas: una con los términos controlados asociados a operadores booleanos, y otra con los términos no controlados, también estructurada con operadores booleanos; d) búsqueda de informaciones en las principales bases de datos anteriormente citadas de manera controlada y no controlada; e) comparación de los resultados obtenidos entre la búsqueda controlada y no controlada; f) construcción de flujo metodológico para fines de replicación. Se percibió que el uso de la búsqueda controlada aumentó la revocación del proceso de recuperación de la información. Específicamente la Base Scopus presentó un aumento más significativo en los resultados (11,28 %). PubMed tuvo un incremento en la revocación del 8,92 % y la Web of Science del 2,64 %. Además, se propone en este trabajo un flujo para la recuperación de la información en las referidas bases, que sirva para los investigadores en este tema, pues se entiende que el alto grado de variabilidad de las palabras y la dispersión en la representación del tema en las bases se constituyen en importante impedimento para la recuperación de informaciones(AU)

It aims to develop a methodological pathway for the retrieval of scientific information on neglected tropical diseases in international databases (Scopus, Web of Science and PubMed). The methodological procedures performed in this work were: a) identification of the main tropical diseases according to the World Health Organization; b) conversion of the names of the diseases in standardized terms from the Descriptors in Health Sciences of the Virtual Health Library (DeCS), c) the construction of two lists: one with the standard terms associated with Boolean operators, and the other with the nonstandard terms; d) search for information in the main databases previously mentioned in a standardized and non-standardized way; e) comparison of the results obtained between standardized and non-standardized search; f) methodological flow construction for replication purposes. As a main result it was observed that the use of the standardized search increased the recall of the information retrieval process, and Scopus was the basis that presented a more significant increase in the retrieval of results (11.28 %). PubMed had an increase in recall of 8.92 % and Web of Science of 2.64 %. In addition, it is proposed in this work a flow for the retrieval of the information in the mentioned bases, that can be useful to all the researchers who wish to obtain scientific information on this subject, since it is understood that the high degree of variability of the words and the dispersion in the representation of the theme in the bases constitutes the important impediment for the information retrieval(AU)

Mapeamento terminológico no domínio da radiologia obstétrica: estudo estatístico a partir de ontologias / Terminological mapping in the domain of the obstetric radiology: a statistical study based on ontologies / Mapeamiento terminológico en el dominio de la radiología obstétrica: estudio estadístico a partir de ontologías

Este artigo tem como base um estudo em que foram levantados e organizados termos do domínio da radiologia obstétrica e, então, foi identificado se os mesmos estão compreendidos em quatro distintos vocabulários controlados: OntoNeo, RadLex, LOINC e SNOMED. É apresentado o Sistema Integrado Catarinense de Telemedicina e Telessaúde (STT/SC) e o projeto de estruturação de laudos de exames de radiologia obstétrica, bem como o contexto teórico da ciência da informação sobre vocabulários controlados.Foram realizadas uma pesquisa de campo para o levantamento dos termos junto a um especialista da área e uma pesquisa documental para o levantamento estatístico dos termos em vocabulários controlados.Constituiu-se uma hierarquia dos termos levantados e verificou-se a cobertura de cada um dos vocabulários controlados em relação aos termos. O SNOMED é o vocabulário controlado com maior potencial de uso para a indexação de laudos no domínio da radiologia obstétrica.(AU)

This article bases on a study in which terms of the obstetric radiology domain were collected and arranged, and then we identified whether they are comprised in four distinct controlled vocabularies: OntoNeo, RadLex, LOINC and SNOMED. We present the STT/SC ­ Sistema Integrado Catarinense de Telemedicina e Telessaúde (Santa Catarina's integrated system of telemedicine and tele health) and theproject of structuring diagnostic reports of tests in obstetric radiology, as well as the theoretical contextof information science about controlled vocabulary. We carried out a survey of the terms jointly an expertand a documentary research to the statistical survey of the terms from controlled vocabularies. A hierarchy of the terms collected was established and the coverage of each of the controlled vocabularies in relation to the terms was verified. The SNOMED is the controlled vocabulary with greater potential of use for theindexation of diagnostic reports in the field of obstetric radiology.

Este artículo se basa en un estudio en el cual fueron levantados y arreglados términos del dominio de la radiología obstétrica, y entonces fue identificado si los mismos están comprendidos en cuatro distintos vocabularios controlados: el OntoNeo, el RadLex, el LOINC y el SNOMED. Presentamos el STT/SC ­ Sistema Integrado Catarinense de Telemedicina e Telessaúde (sistema integrado catarinense de telemedicina y telesalud) y el proyecto de estructuración de resultados de exámenes de radiología obstétrica, así como el contexto teórico de la ciencia de la información sobre vocabularios controlados. Una investigación de campo fue realizada para el levantamiento de los términos junto a un especialista y una investigación documental para el levantamiento estadístico de los términos en vocabularios controlados. Se ha constituido una jerarquía de los términos levantados y se ha verificado la cobertura de cada uno de los vocabularios controlados en relación a los términos. El SNOMED es el vocabulario controlado con mayor potencial deuso para la indexación de los resultados de exámenes en el dominio de la radiología obstétrica.

Open source libraries and frameworks for mass spectrometry based proteomics: a developer's perspective.

Data processing, management and visualization are central and critical components of a state of the art high-throughput mass spectrometry (MS)-based proteomics experiment, and are often some of the most time-consuming steps, especially for labs without much bioinformatics support. The growing interest in the field of proteomics has triggered an increase in the development of new software libraries, including freely available and open-source software. From database search analysis to post-processing of the identification results, even though the objectives of these libraries and packages can vary significantly, they usually share a number of features. Common use cases include the handling of protein and peptide sequences, the parsing of results from various proteomics search engines output files, and the visualization of MS-related information (including mass spectra and chromatograms). In this review, we provide an overview of the existing software libraries, open-source frameworks and also, we give information on some of the freely available applications which make use of them. This article is part of a Special Issue entitled: Computational Proteomics in the Post-Identification Era. Guest Editors: Martin Eisenacher and Christian Stephan.

Mapeamento dos termos dos eixos tempo, localização, meio e cliente entre versões da CIPE® e CIPESC® / Cross-mapping of terms of the axes time, location, means and client between different versions of ICNP® and CIPESC® / Mapeamento de términos de los ejes tiempo, localización, medio y cliente entre versiones de la CIPE® y CIPESC®

O modelo de sete eixos da CIPE® resultou em transferências de termos entre os eixos, modificações conceituais, inclusões e exclusões de termos. Este estudo, de caráter descritivo bibliográfico, mapeou os termos dos eixos "Tempo", "Localização", "Meios" e "Cliente", entre as versões: Beta-2, 1.0 e 1.1 da CIPE® e a CIPESC®. O mapeamento consistiu em localizar os termos dos referidos eixos nas diferentes versões da CIPE® e da CIPESC®. Foi realizada equivalência semântica para classificação dos termos e de seus conceitos. O resultado aponta que algumas modificações respondem ao objetivo de redução de ambiguidades e redundâncias, outras não permitem a verificação do critério para retirada, inclusão e migração de termos. É imperativo o estabelecimento de conceitos consensados pelo grupo responsável pela construção da terminologia, de forma a minimizar o uso incorreto ou inadequado dos termos e constata-se a necessidade de revisão da lista de ações do inventário vocabular da CIPESC®.

The ICNP® model of seven axes resulted in the transfer of terms between the axes, conceptual modifications, inclusion and exclusion of terms. This descriptive, bibliographic study, mapped out the terms of the axes "Time", "Location", "Means" and "Client" among Beta-2, 1.0 and 1.1 versions of the ICNP® and CIPESC®. The mapping located the terms of these axes in the different versions of the ICNP® and CIPESC®. It was performed to classify the semantic equivalence of terms and concepts. The result shows that some changes have the objective of reducing ambiguities and redundancies; others do not allow the verification of the criterion for exclusion, inclusion and migration of terms. It is imperative to establish concepts of consensus by the group responsible for building the terminology in order to minimize the misuse or improper use of terms. It is necessary to revise the list of actions in the vocabulary inventory of CIPESC®.

El modelo de siete ejes de la CIPE® resulto en transferencias de términos, modificaciones conceptuáis, inclusiones y exclusiones de términos. Este estudio, descriptivo bibliográfico, mapeo términos de los ejes "Tiempo", "Localización", "Medios" y "Cliente", entre las versiones: Beta-2, 1.0 y 1.1 de la CIPE® y CIPESC®. El mapeo fue localizar los términos en los ejes de las diferentes versiones de la CIPE® y CIPESC®. Se realizó para clasificar a la equivalencia semántica de los términos y conceptos. El resultado apunta que algunas modificaciones contestan el objetivo de reducción de ambigüedades y redundancias, otras no permiten la verificación del criterio para sacada, inclusión y migración de términos. Es imperativo el establecimiento de conceptos acuerdados por el grupo responsable por la construcción de la terminología, de forma a minimizar el uso incorrecto o inadecuado de los términos. Hay necesidad de revisión de la lista de acciones del inventario de la CIPESC®.

Mapeamento dos termos do eixo ação entre diferentes classificações de enfermagem / Cross-mapping of terms from the action axis between different nursing classifications / Mapeamento entre los términos del eje acción entre diferentes clasificiaciones de enfermería

Estudo descritivo documental, que apresenta o mapeamento de termos do Eixo "Ação", entre as versões: Beta-2, 1.0 e 1.1 da CIPE® e os verbos da CIPESC®. Resultou em: 22 por cento termos novos na Versão 1.0; 12,61 por cento idênticos, com conceito diferente; poucos migraram para outros eixos; 51 por cento dos termos da CIPE® 1.0 não estão na CIPESC®; 65 por cento da CIPESC® não estão na CIPE®, destes, 15 por cento representam ações relacionadas a construção de vínculo ou ao empoderamento. O resultado carece de validação por especialistas. Discute-se a complexidade da língua portuguesa e a necessidade de estabelecer consenso entre conceitos. Considera-se a falta de verbos da CIPESC® uma lacuna a ser preenchida, que poderá refletir no uso da CIPE® por enfermeiros da saúde coletiva.

Documental descriptive research, presents the mapping of the terms from the "Action" Axis among the versions: Beta-2, 1.0 and 1.1 of the ICNP® and the verbs of CIPESC®. Results are: 22 percent of terms from Version 1.0 are new; 12.61 percent are identical, with different concept; 51 percent are not in CIPESC®; 65 percent of terms from CIPESC® are not in ICNP®, in relation to them, 15 percent represent actions related to link building or empowerment. The results require validation by experts. This paper discusses the complexity of the Portuguese language and the need to establish consensus among concepts. The lack of verbs from CIPESC® is considered a gap to be filled, which may reflect the use of ICNP® by nurses in public health.

Estudio descriptivo documental, presenta el mapeo de los términos del Eje "Acción", versiones: Beta-2, 1.0 y 1.1 de la CIPE® y verbos de la CIPESC®. Resultó: 22 por ciento de los términos de la Versión 1.0 son nuevos; 12,61 por ciento son idénticos, con concepto diferente; pocos migraran; 51 por ciento de la 1.0 no están en la CIPESC®; 65 por ciento de la CIPESC® no están en la CIPE®, de estos, 15 por ciento representan acciones de construcción del vínculo o al empoderamiento. El resultado carece de validación. Discútase la complexidad de la lengua portuguesa y la necesidad de consentimiento entre conceptos. La falta de verbos de la CIPESC® es laguna a ser llenada, y podrá reflejar el uso de la CIPE® por enfermeros de la salud colectiva.