RESUMO
In dairy farm animals, one the most important goal of the selection is the improvement of milk yield and composition. Several studies have demonstrated that the candidate genes of the kappa-casein (CSN3) and β - lactoglobulin (β-LG) are associated with milk yield, milk quality and health traits in dairy animals. Therefore the aim of this study was to detect polymorphisms in CSN3 and β-LG genes and its association with milk yield in up to 305 days (305MY) and predicted transmission capacity (PTA) for 305MY in Girolando cattle. Totally, 138 bulls and 729 cows (n=867) were sampled. The genotypes of both genes were obtained by the PCR-RFLP method using HinfI and HaeIII enzymes for CSN3 and β-LG genes, respectively. Statistical results revealed two alleles A and B for both genes. The genotypes and alleles more frequents for CSN3 and β-LG genes were respectively: AA (0.7324) and A (0.8558), and AB (0.4827) and A (0.5017). The x2 test revealed that the two loci were at Hardy-Weinberg equilibrium (p<0.001). The allele substitution effects for the variants were not significant on 305MY and PTA for 305MY (p>0.05). The allele variants of β-LG and CSN3 might be more investigated before include them into future breeding schemes designed for Girolando dairy cattle with objective of improving milk traits as milk yield in up to 305 days (305MY) and predicted transmission capacity (PTA) for 305MY.(AU)
Em rebanhos leiteiros, um dos objetivos mais importantes da seleção é a melhoria da produção e composição do leite. Vários estudos demonstraram que os genes candidatos da kappa-caseína (CSN3) e da β-lactoglobulina (β-LG) estão associados a produção de leite, qualidade do leite e características de saúde em animais leiteiros. Portanto, o objetivo deste estudo foi detectar polimorfismos nos genes CSN3 e β-LG e avaliar possíveis associaçoes desses polimorfismos com a produção de leite em até 305 dias (305MY) e a capacidade de transmissão prevista (PTA) de leite em bovinos da raça Girolando. No total, 138 touros e 729 vacas (n = 867) foram amostrados. A genotipagem foi realizada pelo método PCR-RFLP utilizando as enzimas HinfI e HaeIII para os genes CSN3 e β-LG, respectivamente. Os resultados estatísticos revelaram dois alelos A e B para ambos os genes. Os genotipos e alelos mais frequentes para os genes CSN3 e β-LG foram respectivamente: AA (0,7324) e A (0,8558) e AB (0,4827) e A (0,5017). O teste x2 revelou que os dois loci estavam em equilibrio de Hardy-Weinberg (p <0,001). Os efeitos de substituiçao alélica para as variantes nao foram significativos para as características 305 MY e PTA para 305MY (p> 0,05). Portanto, as variantes alélicas identificadas nos genes β-LG e CSN3 devem ser mais investigadas antes de serem incluidas nos programas de melhoramento desenhados para bovinos leiteiros Girolando objetivando melhorar as características do leite analisadas no presente estudo.(AU)
Assuntos
Caseínas/genética , Lactoglobulinas/genética , Leite/química , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Proteínas do Leite/análise , Técnicas de Genotipagem , Reação em Cadeia da PolimeraseRESUMO
In dairy farm animals, one the most important goal of the selection is the improvement of milk yield and composition. Several studies have demonstrated that the candidate genes of the kappa-casein (CSN3) and β - lactoglobulin (β-LG) are associated with milk yield, milk quality and health traits in dairy animals. Therefore the aim of this study was to detect polymorphisms in CSN3 and β-LG genes and its association with milk yield in up to 305 days (305MY) and predicted transmission capacity (PTA) for 305MY in Girolando cattle. Totally, 138 bulls and 729 cows (n=867) were sampled. The genotypes of both genes were obtained by the PCR-RFLP method using HinfI and HaeIII enzymes for CSN3 and β-LG genes, respectively. Statistical results revealed two alleles A and B for both genes. The genotypes and alleles more frequents for CSN3 and β-LG genes were respectively: AA (0.7324) and A (0.8558), and AB (0.4827) and A (0.5017). The x2 test revealed that the two loci were at Hardy-Weinberg equilibrium (p0.05). The allele variants of β-LG and CSN3 might be more investigated before include them into future breeding schemes designed for Girolando dairy cattle with objective of improving milk traits as milk yield in up to 305 days (305MY) and predicted transmission capacity (PTA) for 305MY.
Em rebanhos leiteiros, um dos objetivos mais importantes da seleção é a melhoria da produção e composição do leite. Vários estudos demonstraram que os genes candidatos da kappa-caseína (CSN3) e da β-lactoglobulina (β-LG) estão associados a produção de leite, qualidade do leite e características de saúde em animais leiteiros. Portanto, o objetivo deste estudo foi detectar polimorfismos nos genes CSN3 e β-LG e avaliar possíveis associaçoes desses polimorfismos com a produção de leite em até 305 dias (305MY) e a capacidade de transmissão prevista (PTA) de leite em bovinos da raça Girolando. No total, 138 touros e 729 vacas (n = 867) foram amostrados. A genotipagem foi realizada pelo método PCR-RFLP utilizando as enzimas HinfI e HaeIII para os genes CSN3 e β-LG, respectivamente. Os resultados estatísticos revelaram dois alelos A e B para ambos os genes. Os genotipos e alelos mais frequentes para os genes CSN3 e β-LG foram respectivamente: AA (0,7324) e A (0,8558) e AB (0,4827) e A (0,5017). O teste x2 revelou que os dois loci estavam em equilibrio de Hardy-Weinberg (p 0,05). Portanto, as variantes alélicas identificadas nos genes β-LG e CSN3 devem ser mais investigadas antes de serem incluidas nos programas de melhoramento desenhados para bovinos leiteiros Girolando objetivando melhorar as características do leite analisadas no presente estudo.
Assuntos
Caseínas/genética , Lactoglobulinas/genética , Leite/química , Polimorfismo de Nucleotídeo Único , Proteínas do Leite/análise , Reação em Cadeia da Polimerase , Técnicas de GenotipagemRESUMO
ABSTRACT: The increasing development of DNA sequencing and genotyping technologies has made possible to analyze the genomes of several species. Genomic studies of production animals have greatly increased the understanding of mechanisms that control the interactions of genetic and environmental factors involved in the expression of traits of economic importance. Several technologies have been presented by different companies for the genotyping of low-density SNP panels, which may be used in different applications with different goals, such as paternity testing, diagnosis of genetic diseases, and identification of genetically superior animals based on polymorphisms characterized in candidate genes. The present review critically analyzes the GoldenGate Beadxpress technology and puts its use in these applications into perspective.
RESUMO: A crescente evolução das tecnologias de sequenciamento e genotipagem de DNA tornaram possível analisar o genoma de várias espécies, compreender suas funções dentro dos sistemas biológicos e, sobretudo, começar a entender os mecanismos que controlam as interações entre os genótipos e os efeitos ambientais que estão envolvidos com a expressão de características de interesse econômico. Várias tecnologias foram apresentadas por diferentes empresas para a genotipagem de painéis de SNP de baixa densidade, os quais podem ser utilizados em diferentes aplicações com objetivos variados, desde testes de paternidade e diagnósticos de doenças genéticas até a identificação de animais geneticamente superiores, com base em polimorfismos caracterizados em genes candidatos. Essa revisão analisa a tecnologia Goldengate Beadxpress e coloca em perspectiva seu uso nessas aplicações.
RESUMO
The increasing development of DNA sequencing and genotyping technologies has made possible to analyze the genomes of several species. Genomic studies of production animals have greatly increased the understanding of mechanisms that control the interactions of genetic and environmental factors involved in the expression of traits of economic importance. Several technologies have been presented by different companies for the genotyping of low-density SNP panels, which may be used in different applications with different goals, such as paternity testing, diagnosis of genetic diseases, and identification of genetically superior animals based on polymorphisms characterized in candidate genes. The present review critically analyzes the GoldenGate Beadxpress technology and puts its use in these applications into perspective.(AU)
A crescente evolução das tecnologias de sequenciamento e genotipagem de DNA tornaram possível analisar o genoma de várias espécies, compreender suas funções dentro dos sistemas biológicos e, sobretudo, começar a entender os mecanismos que controlam as interações entre os genótipos e os efeitos ambientais que estão envolvidos com a expressão de características de interesse econômico. Várias tecnologias foram apresentadas por diferentes empresas para a genotipagem de painéis de SNP de baixa densidade, os quais podem ser utilizados em diferentes aplicações com objetivos variados, desde testes de paternidade e diagnósticos de doenças genéticas até a identificação de animais geneticamente superiores, com base em polimorfismos caracterizados em genes candidatos. Essa revisão analisa a tecnologia Goldengate Beadxpress e coloca em perspectiva seu uso nessas aplicações.(AU)