Staphylococcus hominis: a rare cause of endophthalmitis / Staphylococcus hominis: uma causa rara de endoftalmite

ABSTRACT Staphylococcus hominis (S. hominis) is a coagulase-negative Staphylococci and an infrequent cause of endophthalmitis. Due to its ability to produce biofilm, especially in diabetic patients, strains may acquire antibiotic resistance. We present two cases of S. hominis endophthalmitis, one with acute endophthalmitis after intravitreal bevacizumab injection and one with chronic endophthalmitis following undiagnosed penetrating ocular trauma. Although there are only four published S. hominis endophthalmitis cases in the literature, to the best of our knowledge, there has been no previously published case after intravitreal bevacizumab.

RESUMO Staphylococcus hominis (S. hominis) é um estafilococo coagulase-negativo e uma causa pouco frequente de endoftalmite. Devido à sua capacidade de produzir biofilme, especialmente em pacientes diabéticos, cepas dessa bactéria podem adquirir resistência a antibióticos. Este relato apresenta dois casos de endoftalmite por S. hominis: um de endoftalmite aguda após injeção intravítrea de bevacizumabe e outro de endoftalmite crônica após trauma ocular penetrante não diagnosticado. Embora existam apenas quatro casos de endoftalmite por S. hominis publicados na literatura, até onde sabemos não houve nenhum caso publicado anteriormente após bevacizumabe intravítreo.

Use of Schirmer strips and conjunctival swabs for virus detection on the ocular surface of adults: a scoping review / Fitas de Schirmer e swab conjunctival para detecção de vírus na superfície ocular de adultos: scoping review

ABSTRACT Schirmer strips and conjunctival swabs are used in ophthalmology for the collection of tears and fluids. One of the biggest challenges during the COVID-19 pandemic has been accurate diagnosis and, in some cases, ocular manifestations are among the first symptoms. In this context, this study aimed to collect evidence to support the use of Schirmer strips and conjunctival swabs as a method of sample collection for viral analysis. A literature search was conducted following the Scoping Review protocol defined by The Joanna Briggs Institute. Studies were analyzed regarding virus research, collection methods, and sample analysis. The findings support that viruses can be detected on the ocular surface through analysis of Schirmer strips and conjunctival swabs. However, additional studies with larger samples and time data are necessary to confirm these conclusions.

RESUMO A fita de Schirmer e o swab conjunctival são utilizados na oftalmologia como métodos de coleta para lágrimas e fluidos. Durante a pandemia da COVID-19, um dos desafios foi o diagnóstico correto e se sabe que, em alguns casos, as manifestações oculares podem ser um dos primeiros sintomas. Nesse contexto, este estudo tem como objetivo levantar evidência que destaque o uso de fitas de Schirmer e de swabs conjuntivais como método de coleta para análise viral. Conduziu-se uma revisão de literatura seguindo o protocolo para Scoping Review definido pelo Joanna Briggs Institute. Os pesquisadores analisaram os estudos em busca do vírus pesquisado, os métodos de coleta e os métodos de análise. Vírus podem ser detectados na superfície ocular através da análise de fitas de Schirmer e de swabs conjuntivais, entretanto novos estudos com populações maiores e com definições claras de tempo são necessários para conclusões mais assertivas no tema.

The importance of considering the possibility of ocular sporotrichosis in areas with high incidence rates of sporotrichosis / Esporotricose ocular: a importância de ser considerada em áreas com grande incidência de esporotricose

ABSTRACT Ocular sporotrichosis involving adnexa can present in 4 types: granulomatous conjunctivitis, dacryocystitis, Parinaud oculoglandular syndrome, and bulbar conjunctivitis. The incidence of ocular sporotrichosis has increased in regions with high incidence rates of sporotrichosis. We present a series of three cases of ocular involvement by the fungus Sporothrix species, including its manifestations, approaches, and relevance in areas where sporotrichosis has considerable incidence rates.

RESUMO A esporotricose ocular envolvendo anexos pode se apresentar de quatro formas: conjuntivite granulomatosa, dacriocistite, Síndrome Oculoglandular de Parinaud e conjuntivite bulbar. A esporotricose ocular, apesar de incomum, tem aumentado em regiões com alta incidência de esporotricose. Apresentamos uma série de três casos de envolvimento ocular pelo fungo Sporothrix sp.: suas manifestações, abordagem e sua relevância em áreas com alta incidência de esporotricose.

Amplificación directa de ADN de Bordetella pertussis purificado de hisopados nasofaríngeos por un método de bajo costo, rápido (60-segundos) y libre de equipos / Direct amplification of Bordetella pertussis DNA purified from nasopharyngeal swabs by a low-cost, fast (60-second), and equipment-free method

RESUMEN Objetivo. Desarrollar y evaluar un método de bajo costo basado en celulosa para la purificación rápida y amplificación directa de ADN de Bordetella pertussis de hisopados nasofaríngeos. Materiales y métodos. Se prepararon discos de celulosa y se evaluaron diferentes parámetros (buffers de lisis/lavado, número de discos y elución de ADN). El método se acopló a una amplificación directa por PCR en tiempo real (qPCR) y se estimó el rendimiento utilizando hisopados nasofaríngeos que fueron positivos (n=100) y negativos (n=50) para ADN B. pertussis por qPCR, comparado con el método basado en columnas de sílice. Se calculó el grado de concordancia, sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo (VPP) y valor predictivo negativo (VPN). Se evaluó la factibilidad del método rápido para ser acoplado a un ensayo colorimétrico de amplificación isotérmica mediada por lazo (LAMP). Resultados. El método rápido con un disco de celulosa y buffer de lisis y lavado conteniendo PVP-40 y Tween 20, respectivamente, mostró una mayor capacidad para purificar ADN amplificable de B. pertussis. El método tuvo una sensibilidad de 89,0% (IC95%, 80,2%-94,9%) y una especificidad de 98,5% (IC95%, 92,1%-100,0%), con un buen grado de concordancia (Kappa=0,867; IC95% 0,788 - 0,946), respecto al método referencial. Los VPP y VPN fueron 98,6% (IC95%, 92,7,2%-100,0%) y 88,2% (IC95%, 78,7%-94,4%), respectivamente. Se evidenció una amplificación exitosa por LAMP, y se obtuvieron resultados comparables con el método por columnas de sílice. Conclusión. El método desarrollado es simple, de bajo costo y libre de equipos para la obtención rápida (60 segundos) de ADN en el punto de atención, y puede ser implementado en diversas técnicas moleculares orientados al diagnóstico oportuno y al estudio epidemiológico de tos ferina.

ABSTRACT Objective. To develop and evaluate a low-cost cellulose-based method for rapid purification and direct amplification of Bordetella pertussis DNA from nasopharyngeal swabs. Materials and methods. We prepared cellulose discs and evaluated different parameters (lysis/wash buffers, number of discs and DNA elution). The method was coupled to a direct real-time PCR (qPCR) amplification and the performance was estimated using nasopharyngeal swabs that were positive (n=100) and negative (n=50) for B. pertussis DNA by qPCR, compared to the silica column-based method. We calculated sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) and the degree of agreement. The feasibility of the rapid method to be coupled to a loop-mediated isothermal amplification colorimetric assay (LAMP) was evaluated. Results. The rapid method, with a cellulose disk and lysis and wash buffer containing PVP-40 and Tween 20, respectively, showed a greater capacity to purify amplifiable DNA from B. pertussis. The method had a sensitivity of 89.0% (95%CI: 80.2%-94.9%) and a specificity of 98.5% (95%CI: 92.1%-100.0%), with a good degree of agreement (Kappa=0.867; 95%CI: 0.788 - 0.946), compared to the reference method. The PPV and NPV were 98.6% (95%CI: 92.7.2%-100.0%) and 88.2% (95%CI: 78.7%-94.4%), respectively. Successful amplification by LAMP was evident, and comparable results were obtained with the silica column method. Conclusion. The developed method is simple, low-cost and equipment-free for rapid (60 seconds) DNA collection at the point of care, and can be implemented in various molecular techniques aimed at the timely diagnosis and epidemiological study of pertussis.

Evaluation of microbial contamination in multi-dose fluorescein eyedrops in a reference eye center / Avaliação da contaminação microbiana em colírios multi-dose de fluoresceína em um centro oftalmológico de referência

ABSTRACT Purpose: To analyze the presence of microorganisms in fluorescein eyedrops used in a reference eye center in Recife-PE. Methods: This real-life and masked study evaluated fluorescein eyedrops used at the Altino Ventura Foundation in May 2019. Cultures were performed according to exposure times; I) three eyedrop bottles were analyzed after one day of use, II) three eyedrop bottles after 4 d of use, III) three eyedrop bottles after 8 d of use, and IV) three unopened bottles used as control. Samples were collected from the bottle's tip, instilled drop, and residual fluid. After incubation, all colonies were analyzed and identified through biochemical tests. Results: The contamination rate of the fluorescein eyedrop bottles in this study was 55.5% (5/9 vials). There was no contamination in the control group. The highest contamination was seen in one day exposed eyedrops, in 100% of the bottles. The bottle's tip had a higher rate of contamination compared to the drop and residual fluid. Gram-positive bacteria were isolated in 7/27 (25.9%) samples. Growth of fungi or gram-negative bacteria was not observed. Conclusion: The identification of gram-positive bacteria predominantly on the tip of the fluorescein eyedrop bottles suggests inadequate handling as the main cause of contamination.

RESUMO Objetivo: Analisar a presença de microrganismos nos colírios de fluoresceína utilizados em um centro oftalmológico de referência em Recife-PE. Métodos: Este estudo de vida real e mascarado avaliou colírios de fluoresceína utilizados na Fundação Altino Ventura em maio/2019. As culturas foram realizadas de acordo com os diferentes tempos de exposição: I - três frascos de colírio foram analisados após 1 dia de uso; II - três frascos de colírio após 4 dias de uso; III - três frascos de colírio após 8 dias de uso; IV - três garrafas fechadas foram usadas como grupo controle. As amostras foram coletadas da ponta do frasco, da gota instilada e do líquido residual interior. Após incubação, todas as colônias foram analisadas e identificadas através de testes bioquímicos. Resultados: A taxa de contaminação dos frascos de colírio de fluoresceína neste estudo foi de 55,5% (5/9 frascos). Não houve contaminação no grupo controle. A maior contaminação foi observada os colírios expostos de um dia - 100% dos frascos. A ponta da garrafa teve uma maior taxa de contaminação em comparação com as culturas de gota e de fluido residual inferior. Bactérias gram-positivas foram isoladas em 7/27 amostras (25,9%). Não houve crescimento de fungos ou bactérias Gram-negativas. Conclusão: A identificação de bactérias Gram-positivas predominantemente na ponta dos frascos de colírio de fluoresceína sugere manuseio inadequado como a principal causa de contaminação de colírios multidose.

Characterization and distribution of viridans group streptococci isolated from infectious endophthalmitis and keratitis / Caracterização e distribuição de estreptococos do grupo viridans isolados de endoftalmite infecciosa e ceratite

ABSTRACT Purpose: The aims of this study were to characterize alpha-hemolytic streptococci among isolates from cases of infectious endophthalmitis and keratitis and to determine their distributions. Methods: The sample included 27 and 35 nonduplicated isolates of alpha-hemolytic streptococci recovered from patients with infectious endophthalmitis (2002-2013) and keratitis (2008-2013), respectively. Isolates were identified by the optochin susceptibility and bile solubility tests, using a biochemical identification system. The minimum inhibitory concentration was determined by the broth microdilution method. Molecular identification was performed by analyses of three constitutive genes and the complementary multilocus sequence. The molecular epidemiology of Streptococcus pneumoniae was investigated using multilocus sequence typing, and the presence of the capsular polysaccharide-encoding gene was assessed using conventional polymerase chain reaction. Outcomes were evaluated using the patients' medical records. Results: Phenotypic tests differentiated S. pneumoniae from other alpha-hemolytic streptococci, consistent with later molecular identifications. Streptococcus oralis was significantly prevalent among the endophthalmitis isolates, as was S. pneumoniae in the keratitis isolates. High levels of susceptibility to antibiotics were observed, including vancomycin, cephalosporins, and fluoroquinolones. High genetic variability was detected among the 19 S. pneumoniae strains, with 15 predicted to be encapsulated. The medical records of patients with infectious endophthalmitis were reviewed (n=15/27; 56%), and final visual acuity was assessed in 12 cases (44%). Many patients progressed to a final visual acuity state of "no light perception" (6/12; 50%), "light perception" (3/12; 25%), or "hand motion" (1/12; 8%). The medical records of patients with infectious keratitis were also reviewed (n=24/35; 69%), and final visual acuity was assessed in 18 cases (51%). Similarly, most patients progressed to a final visual acuity state of "no light perception" (6/18; 33%), "light perception" (1/18; 6%), or "hand motion" (6/18; 33%). Overall, the majority of patients progressed to a final visual acuity state of "no light perception" (12/30), "light perception" (4/30), or "hand motion" (7/30). Conclusions: The distribution of alpha-hemolytic streptococci in ocular infections suggested the presence of a species-specific tissue tropism. The prognoses of patients with ocular streptococcal infections were highly unfavorable, and antibiotic resistance did not contribute to the unfavorable clinical progressions and poor outcomes.

RESUMO Objetivo: O objetivo deste estudo foi caracterizar os estreptococos alfa-hemolíticos isolados de endoftalmite infecciosa e ceratite e determinar sua distribuição. Métodos: A amostra incluiu 27 e 35 isolados não-duplicados de estreptococos alfa-hemolíticos recuperados de pacientes com endoftalmite infecciosa (2002-2013) e ceratite (2008-2013), respectivamente. Os isolados foram identificados pelos testes de suscetibilidade à optoquina e bile solubilidade, utilizando um sistema de identificação bioquímica. A concentração inibitória mínima foi determinada pelo método de microdiluição em caldo. A identificação molecular foi realizada pela análise de três genes constitutivos e análise complementar de sequências multilocus. A epidemiologia molecular do Streptococcus pneumoniae foi investigada por tipagem de sequência multilocus, e a presença do gene codificador do polissacarídeo capsular foi avaliada por reação em cadeia da polymerase convencional. Os resultados foram avaliados utilizando os prontuários médicos dos pacientes. Resultados: Os testes fenotípicos diferenciaram S. pneumoniae dos outros estreptococos alpha-hemolíticos, consistentes com identificações moleculares posteriores. S. oralis foi significativamente prevalente entre os isolados de endoftalmite, assim como S. pneumoniae nos isolados de ceratite. Foram observados altos níveis de suscetibilidade a antibióticos, incluindo vancomicina, cefalosporinas e fluoroquinolonas. Alta variabilidade genética foi detectada entre as 19 cepas de S. pneumoniae, com 15 previstas para serem encapsuladas. Os prontuários médicos dos pacientes com endoftalmite infecciosa foram revisados (n=15/27; 56%), e a acuidade visual final foi avaliada em 12 casos (44%). Muitos pacientes evoluiram para um estado final de acuidade visual de "sem percepção luminosa" (6/12; 50%), "percepção luminosa" (3/12; 25%) ou "movimentos de mãos" (1/12; 8%). Também foram revisados os prontuários médicos dos pacientes com ceratite infecciosa (n=24/35; 69%), e a acuidade visual final foi avaliada em 18 casos (51%). Da mesma foram, a maioria dos pacientes evoluiu para um estado final de acuidade visual de "sem percepção luminosa" (6/18; 33%), "percepção luminosa" (1/18; 6%) ou "movimentos de mãos" (6/18; 33%). No geral, a maioria dos pacientes evoluiu para um estado final de acuidade visual de "sem percepção luminosa" (12/30), "percepção luminosa" (4/30) ou "movimentos de mãos" (7/30). Conclusões: A distribuição de estreptococos alfa-hemolíticos nas infecções oculares sugeriu a presença de um tropismo de tecido específico da espécie. Os prognósticos dos pacientes com infeções oculares por estreptococos foram altamente desfavoráveis e a resistência a antibióticos contribuiu não para as progressões clínicas des­favoráveis e os maus resultados.

Perfil microbiológico en servicio de Neonatología / Microbiological profile in the Neonatology service

RESUMEN Se realizó este estudio en el servicio de Neonatología del Hospital Universitario Pediátrico José Luis Miranda, de Santa Clara, en el período de junio 2015 - mayo 2016. Se analizaron los aislamientos de microorganismos en los cultivos realizados a los neonatos hospitalizados, con el objetivo de investigar la prevalencia y sensibilidad de estos gérmenes. Se confirmaron 69 aislamientos, en los cuales predominaron los gérmenes grampositivos; el estafilococo prevaleció de forma significativa y ofreció resistencia creciente a cefazolina. Dentro de los gramnegativos, la escherichia coli resultó el microorganismo con mayor aislamiento, mientras que el acinetobacter se comportó resistente a las cefalosporinas.

ABSTRACT A study was carried out in the Neonatology service at "José Luis Miranda" Pediatric University Hospital, in Santa Clara, from June, 2015 to May, 2016. The isolations of microorganisms in the cultures performed on hospitalized neonates were analyzed with the aim of investigating the prevalence and sensitivity of these germs. Sixty-nine isolates were confirmed, in which the gram-positive ones predominated; staphylococcus prevailed significantly and offered a high resistance to cefazolin. Escherichia coli was the microorganism with the highest isolation among the gram-negative bacteria, while acinetobacter exhibited resistant to cephalosporins.

Current use and acceptability of novel diagnostic tests for active tuberculosis: a worldwide survey / Uso atual e aceitabilidade de novos testes diagnósticos para tuberculose ativa: um inquérito mundial

ABSTRACT Objective: To determine the current use and potential acceptance (by tuberculosis experts worldwide) of novel rapid tests for the diagnosis of tuberculosis that are in line with World Health Organization target product profiles. Methods: A multilingual survey was disseminated online between July and November of 2016. Results: A total of 723 individuals from 114 countries responded to the survey. Smear microscopy was the most commonly used rapid tuberculosis test (available to 90.9% of the respondents), followed by molecular assays (available to 70.7%). Only a small proportion of the respondents in middle- and low-income countries had access to interferon-gamma-release assays. Serological and lateral flow immunoassays were used by more than a quarter (25.4%) of the respondents. Among the respondents who had access to molecular tests, 46.7% were using the Xpert assay overall, that proportion being higher in lower middle-income countries (55.6%) and low-income countries (76.6%). The data also suggest that there was some alignment of pricing for molecular assays. Respondents stated they would accept novel rapid tuberculosis tests if available, including molecular assays (acceptable to 86.0%) or biomarker-based serological assays (acceptable to 81.7%). Simple biomarker-based assays were more commonly deemed acceptable in middle- and low-income countries. Conclusions: Second-generation molecular assays have become more widely available in high- and low-resource settings. However, the development of novel rapid tuberculosis tests continues to be considered important by tuberculosis experts. Our data also underscore the need for additional training and education of end users.

RESUMO Objetivo: Determinar o uso atual e a aceitação potencial (por especialistas em tuberculose em todo o mundo) de novos testes rápidos para o diagnóstico de tuberculose que estão alinhados com os perfis de produtos alvo da Organização Mundial da Saúde. Métodos: Um inquérito multilingue foi divulgado on-line entre julho e novembro de 2016. Resultados: Um total de 723 indivíduos de 114 países respondeu ao inquérito. A baciloscopia foi o teste rápido para tuberculose mais utilizado (disponível para 90,9% dos entrevistados), seguida de ensaios moleculares (disponível para 70,7%). Apenas uma pequena proporção dos entrevistados de países de renda média e baixa tinha acesso a ensaios de liberação de IFN-γ. Imunoensaios de fluxo lateral e testes sorológicos eram utilizados por mais de um quarto dos entrevistados (25,4%). Entre os entrevistados que tinham acesso a testes moleculares, 46,7% utilizavam o teste Xpert de forma geral, sendo essa proporção maior em países de renda média baixa (55,6%) e renda baixa (76,6%). Os dados também sugerem que houve algum alinhamento de preços para testes moleculares. Os entrevistados afirmaram que aceitariam novos testes rápidos para tuberculose, se disponíveis, incluindo testes moleculares (aceitáveis para 86,0%) ou testes sorológicos baseados em biomarcadores (aceitáveis para 81,7%). Testes simples baseados em biomarcadores foram mais comumente considerados aceitáveis nos países de renda média e baixa. Conclusões: Os testes moleculares de segunda geração tornaram-se mais amplamente disponíveis em locais tanto com poucos quanto com muitos recursos. No entanto, o desenvolvimento de novos testes rápidos para tuberculose continua a ser considerado importante por especialistas em tuberculose. Nossos dados também ressaltam a necessidade de maior formação e educação dos usuários finais.

Aislamiento de Serratia marcescens en herida quirúrgica / Isolation of Serratia marcescens in a surgical wound

La Serratia marcescens es un bacilo Gram negativo, anaerobio facultativo, oxidasa negativo, perteneciente a la familia enterobacteriacea. Se presenta como un agente nosocomial y la transmisión de persona a persona es la más importante forma de diseminación. Su aislamiento es poco común, razón por la cual se decidió la presentación del caso de una paciente de 32 años, con antecedentes de buena salud, procedencia rural, con gravidez de 35 semanas, que evolucionó sin riesgo obstétrico aparente. Fue remitida al Hospital General Universitario Dr. Gustavo Aldereguía Lima por dolor recurrente abdominal desde hacía tres horas, vómitos con restos de alimentos y fiebre de 38 oC. Fue intervenida quirúrgicamente por apendicitis y al evolucionar satisfactoriamente fue dada de alta, pero al séptimo día sufrió la dehiscencia de la herida quirúrgica y se observó salida de secreción amarillenta. Fue nuevamente ingresada y se aisló de su herida la Serratia marcescens. Después de tratamiento evolucionó satisfactoriamente.

Serratia marcescens is a Gram possitive bacila, facultative anaerobic, negative oxidase, belonging to the enterobacteriaceae family. It is presented as a nosocomial agent and the person to person transmission is the most important way of dissemination. Its isolation is uncommon, reason for which it was decided to present the case of a 32 year old patient, with healthy antecedents, from a rural area and a 35 week pregnancy that developed without apparent obstetric risks. She was referred to the General University Hospital University Dr. Gustavo Aldereguía Lima with recurrent abdominal pain of three hours, vomiting with food remains and 38 degree fever. She was performed a surgery due to appendicitis and she was discharged in a good condition, but on the day seven she had a dehiscence in the surgical wound and it was observed a yellowish discharge from it. She was admitted again and Serratia marcensens was isolated. After treatment she had a satisfactory evolution.

[Partial purification of peptides present in the Tityus macrochirus (Buthidae) scorpion venom and preliminary assessment of their cytotoxicity].

INTRODUCTION: Scorpion venom contains peptides with neurotoxic action primarily active on ion channels in the nervous system of insects and mammals. They are also characterized as cytolytic and anticancer, biological characteristics that have not yet been reported for the Tityus macrochirus venom. OBJECTIVE: To assess if the total T. macrochirus venom and the fraction of partially purified peptides decrease the viability of various tumor-derived cell lines. MATERIALS AND METHODS: The scorpion venom was collected by electrical stimulation and, subsequently, subjected to chromatography, electrophoresis, and ultrafiltration with Amicon Ultra 0.5® membranes for the partial identification and purification of its peptides. The cytotoxic activity of the venom and the peptides fraction trials on tumor-derived cell lines were carried out by the MTT method. RESULTS: The T. macrochirus scorpion venom has peptides with molecular weights ranging between 3 and 10 kDa. They were partially purified using the ultrafiltration technique, and assessed by the RP-HPLC method. Cytotoxicity trials with the whole T. macrochirus venom showed a higher viability decrease on the PC3 cell line compared to the other cell lines assessed, while the partially purified peptides decreased the HeLa cell line viability. CONCLUSION: Peptides in the T. macrochirus scorpion venom showed cytotoxic activity on some tumorderived cell lines. We observed some degree of selectivity against other cell lines assessed.

A case of atypical nocardia asteroides sclerouveitis resistant to fourth-generation fluoroquinolones / Um caso atípico de esclero-uveíte por Nocardia Asteroides resistente a fluorquinolona de quarta-geração

ABSTRACT We describe an unusual case of Nocardia spp scleritis in a health girl resistant to topical fourth-generation fluoroquinolones. Clinically, there was only partial response of the scleritis to initial therapy. Treatment was changed to meropenem intravenously and topical amikacin. Following several weeks of antibiotic treatment, the patient's infection resolved but her vision was reduced to no light perception. Nocardia asteroides must be considered as a possible agent in cases of necrotizing scleritis in patients without a clear source. Antibiotic sensitivity testing has a definitive role in view of the resistance to these new medications.

RESUMO Nós descrevemos um raro caso de esclerite por Nocardia spp em uma criança sadia resistente a utilização tópica de fluorquinolona de quarta-geração. Clinicamente, a paciente apresentou apenas uma resposta parcial do quadro de esclerite a terapêutica inicial. O tratamento foi então modificado para meropenem intravenoso e amicacina tópica. Após várias semanas de tratamento com antibiótico, o quadro infeccioso regrediu porém a visao da pacientes evoluiu para perda da percepção luminosa. Em casos de esclerite necrotizante em pacientes sem fatores de risco aparente é necessário considerer a Nocardia Asteroides como possível agente causador. Os testes de sensibilidade medicamentosa apresentam importância significativa em virtude do aparecimento de resistência aos novos medicamentos.

Fonsecaea pedrosoi as a rare cause of acute conjunctival ulceration / Fonsecaea pedrosoi como agente raramente associado à úlcera conjuntival aguda

ABSTRACT Conjunctival ulceration accompanied with secretion and pain was observed in a 30-year-old male, 3 days after a perforating corneal trauma. Cultures of conjunctival ulcer samples grew Fonsecaea pedrosoi, a major causative agent of chromoblastomycosis that is typically transmitted during trauma. The conjunctival ulcer was successfully treated with amphotericin B, itraconazole, and fluconazole. This case report summarizes the diagnosis and treatment of a conjunctival ulcer due to F. pedrosoi, which is a rare complication of contaminated ocular trauma. To the best of our knowledge, this is the first reported case of F. pedrosoi causing acute conjunctival ulceration in the literature.

RESUMO O quadro clínico de uma úlcera conjuntival acompanhada de secreção e dor foi observado em homem de 30 anos de idade, 3 dias após um trauma perfurante da córnea. As culturas de uma amostra retirada da úlcera conjuntival foi positiva para Fonsecaea pedrosoi, uma cromoblastomicose, geralmente transmitido após traumatismos. O caso foi tratado com sucesso com a anfotericina B, itraconazol e fluconazol. Este relato de caso reporta o diagnóstico e tratamento de uma úlcera conjuntival causada por F. pedrosoi, que raramente é visto nos olhos expostos a traumatismos contaminados. Até onde sabemos, este é o primeiro caso relatado na literatura de F. pedrosoi causando úlcera conjuntival aguda.

Resistencia de Staphylococcus aureus a la meticilina en aislamientos nosocomiales en un hospital provincial / Resistance to methicillin of the Staphylococcus aureus in nosocomial isolations in a provincial hospital

Fundamento: La detección de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina es una herramienta para un adecuado proceder terapéutico. La alta incidencia de infecciones que produce el Staphylococcus aureus y la complejidad para su tratamiento constituye la causa fundamental de esta investigación. Objetivo: Identificar la presencia de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina en muestras de pacientes ingresados en el Hospital Camilo Cienfuegos desde el 1 de diciembre de 2011 al 30 de mayo de 2012. Metodología: Se realizó un estudio transversal que incluyó 79 cepas de Staphylococcus aureus, a las cuales se les realizó prueba de susceptibilidad por el método de Kirby-Bauer, se utilizó el disco de cefoxitina para detectar resistencia a la meticilina. Resultados: De los 79 aislamientos por Staphylococcus aureus un 75 % procedía de las muestras de los servicios quirúrgicos, y el 50.6 % fue resistente a meticilina. De estos últimos (40) el 37.5 % fue de las muestras de sangre, mientras un 25 % a las purulentas que drenan a piel. La tetraciclina (82.5 % vs 59 %) y la vancomicina (100 %) fueron los antimicrobianos que mayor sensibilidad mostraron tanto en las cepas resistentes o no a la meticilina respectivamente. Conclusiones: La mitad de las cepas de Staphylococcus aureus investigadas resultó resistente a meticilina. La susceptibilidad a los antimicrobianos mostró elevados porcentajes de resistencia, excepto para vancomicina y tetraciclina.

Background: The detection of Staphylococcus aureus resistant to the methicillin is a tool for an appropriate to therapeutic procedure. The high incidence of infections that produces the Staphylococcus aureus and the complexity for its treatment constitutes the fundamental cause of this investigation. Objective: To identify the presence of Staphylococcus aureus resistant to the methicillin in patients' samples entered in the Hospital Camilo Cienfuegos from December 1st, 2011 to May 30 th, 2012. Methodology: It was carried out a traverse study that included 79 stumps of Staphylococcus aureus, to which were carried out a test of susceptibility by the method of Kirby-Bauer; the cefoxitin disk was used to detect resistance to the methicillin. Results: Of the 79 isolations for Staphylococcus aureus 75% came from the samples of the surgical services, and 50.6 % were resistant to methicillin. Of these last ones (40) 37.5 % was of the samples of blood, while 25 % to the purulent that drain to skin. The tetracycline (82.5 % vs 59 %) and the vancomycin (100 %) were the antimicrobic that showed bigger sensibility, either in the resistant stumps or not to the methicillin respectively. Conclusions: Half of the stumps of Staphylococcus aureus investigated were resistant to methicillin. The susceptibility to the antimicrobic showed high resistance percentages, except for vancomycin and tetracycline.

Investigation of the association between glaucoma and Helicobacter pylori infection using the 14C-urea breath test / Investigação de associação entre glaucoma e infecção pelo Helicobacter pylori pelo teste respiratório da ureia 14C

ABSTRACTPurpose:To investigate the association between glaucoma and Helicobacter pylori infection by evaluating for the presence of H. pylori infection in patients with glaucoma using the 14C-urea breath test (14C-UBT).Methods:Using 14C-UBT, H. pylori infection positivity was compared between a group of patients with primary open-angle glaucoma and a control group with normal intraocular pressure and a normal optic disc or normal perimetry.Results:The 14C-UBT was positive in 18 (51.42%) out of 35 patients in the glaucoma group and in 15 (42.85%) out of 35 patients in the control group. H. pylori infection positivity rates were similar between the glaucoma and control groups (p>0.05).Conclusion:According to the 14C-UBT, there is no association between primary open-angle glaucoma and H. pylori infection.

RESUMOObjetivo:Investigar a associação entre glaucoma e infecção por H. pyloripor meio do teste para a presença de infecção por H. pylori em pacientes com glaucoma usando o teste de respiração da ureia 14C (14C-UBT).Métodos:Foi feita uma comparação em relação a positividade H. pyloriutilizando 14C-UBT entre um grupo de pacientes com glaucoma primário de ângulo aberto e um grupo controle com pressão intraocular normal e sem verificação de disco óptico glaucomatosa.Resultados:O 14C-UBT foi positivo em 18 (51,42%) dos 35 pacientes no grupo de glaucoma e em 15 (42,85%) dos 35 pacientes no grupo de controle. As taxas de positividade foram semelhantes entre os grupos de glaucoma e de controle e não houve diferença significativa entre os grupos (p>0,05).Conclusão:De acordo com o 14C-UBT, não há associação entre o glaucoma primário de ângulo aberto e H. pylori.

Comparação entre duas técnicas de genotipagem do HPV em mulheres com lesão intra-epitelial de alto grau / Comparison of two techniques for HPV genotyping in women with high-grade squamous intraepithelial lesion

OBJETIVO: Comparar o desempenho de duas técnicas de genotipagem de papilomavírus humano (HPV), Linear Array e PapilloCheck, em mulheres com lesão intra-epitelial de alto grau (LIAG). MÉTODOS: Foram selecionadas 88 mulheres com diagnóstico citopatológico de LIAG em 2 centros de referência em patologia cervical em Salvador, Bahia, no período de julho de 2006 a janeiro de 2009. Após o diagnóstico citopatológico de LIAG, foram realizadas a coleta de células do colo uterino para a genotipagem do HPV e a biópsia sob visão colposcópica para análise histopatológica do fragmento retirado. Posteriormente à confirmação de NIC2+ pelo exame histopatológico, foi realizada a genotipagem do HPV em 41 mulheres pelas técnicas Linear Array e PapilloCheck. RESULTADOS: Os dois testes apresentaram taxa de concordância geral para detecção do vírus HPV de 97,2% (35/36). Das 36 amostras válidas, 35 (97,2%) foram consideradas positivas em ambos os testes e apenas uma amostra (2,8%) foi considerada discordante. Os genótipos do HPV mais prevalentes detectados através da técnica do Linear Array foram: HPV 16, HPV 56, HPV 35, HPV 45 e HPV 70; e pela técnica PapilloCheck foram: HPV 16, HPV 56, HPV 11, HPV 35 e HPV 42. Foi observado índice semelhante de infecção por múltiplos tipos do HPV nos dois testes analisados (72,5% no Linear Array e 75,0% no PapilloCheck). CONCLUSÕES: Os testes de genotipagem Linear Array e PapilloCheck apresentaram um desempenho equivalente na detecção dos tipos de HPV oncogênicos em mulheres com LIAG, tendo o PapilloCheck a vantagem de ser um método que evita a subjetividade da leitura dos genótipos de HPV. .

PURPOSE: The aim of this study was to compare the performance of two human papillomavirus (HPV) genotyping techniques, Linear Array and PapilloCheck, in women with high-grade squamous intraepithelial lesion (HSIL). METHODS: A total of 88 women with cytological diagnosis of HSIL were recruited at 2 reference centers in cervical pathology in Salvador, Bahia, Brazil, from July 2006 to January 2009. After the cytological diagnosis of HSIL, cervix cells were collected to determine the HPV genotype and a biopsy was obtained under colposcopic vision for histopathological analysis. After the confirmation of CIN2+ by histopathology, HPV genotyping was performed on 41 women by the Linear Array and PapilloCheck methods. RESULTS: Both tests showed an overall concordance rate for HPV detection of 97.2% (35/36). Of the 36 valid samples, 35 (97.2%) were positive in both tests and 1 (2.8%) was discordant, with the Linear Array indicating the presence of multiple types. The most prevalent HPV genotypes detected by the Linear Array technique were HPV 16, HPV 56, HPV 35, HPV 45, and HPV 70; and those detected by the PapilloCheck technique were HPV 16, HPV 56, HPV 11, HPV 35, and HPV 42. A similar rate of infection with multiple HPV types was observed with the two tests (72.5% with the Linear Array and 75.0% with the PapilloCheck). CONCLUSIONS: Linear Array genotyping assay and PapilloCheck showed equivalent performance for the detection of oncogenic HPV types in women with HSIL, with PapilloCheck having the advantage of being a method that avoids subjectivity when reading the HPV genotypes. .

Nosocomial infections by Klebsiella pneumoniae carbapenemase producing enterobacteria in a teaching hospital / Infecções hospitalares por enterobactérias produtoras de Klebsiella pneumoniae carbapenemase em um hospital escola

Objective To analyze the profile of patients with microorganisms resistant to carbapenems, and the prevalence of the enzyme Klebsiella pneumoniae carbapenemase in interobacteriaceae. Methods Retrospective descriptive study. From the isolation in bacteriological tests ordered by clinicians, we described the clinical and epidemiological characteristics of patients with enterobacteria resistants to carbapenems at a university hospital, between March and October 2013. Results We included 47 isolated patients in this study, all exhibiting resistance to carbapenems, including 9 patients who were confirmed as infected/colonized with K. pneumoniae carbapenemase. Isolation in tracheal aspirates (12; 25.5%) predominated. The resistance to ertapenem, meropenem, and imipenem was 91.5%, 83.0% and 80.0%, respectively. Aminoglycosides was the class of antimicrobials that showed the highest sensitivity, 91.5% being sensitive to amikacin and 57.4% to gentamicin. Conclusion The K. pneumoniae carbapenemase was an important agent in graun isotaling in hospital intection. The limited therapeutic options emphasize the need for rapid laboratory detection, as well as the implementation of measures to prevent and control the spread of these pathogens. .

Objetivo Analisar o perfil dos pacientes que apresentaram microrganismos com resistência aos carbapenêmicos, e a prevalência da enzima Klebsiella pneumoniae carbapenemase em enterobactérias. Métodos Estudo retrospectivo descritivo. A partir do isolamento em exames bacteriológicos solicitados pelos clínicos, descrevemos as características clínicas e epidemiológicas dos pacientes que apresentaram enterobactérias resistentes aos carbapenêmicos entre março e outubro de 2013 em um hospital universitário. Resultados Foram incluídos 47 pacientes isolados, todos apresentando resistência aos carbapenêmicos, dos quais 9 tiveram confirmação de infecção/colonização por K. pneumoniae carbapenemase. Ocorreu predomínio de isolamento em aspirados traqueais (12; 25,5%). A resistência ao ertapenem, meropenem e imipenem foi de 91,5%, 83,0% e 80,0%, respectivamente. Os aminoglicosídeos foram a classe de antimicrobianos que apresentou maior sensibilidade, sendo 91,5% sensível a amicacina e 57,4% a gentamicina. Conclusão A K. pneumoniae carbapenemase constituiu um importante patógeno hospitalar em isolamento crescente nesse nosocômio. As limitadas opções terapêuticas reforçam a necessidade de uma rápida detecção laboratorial, assim como a implementação de medidas de prevenção e controle da disseminação desses patógenos. .

Comparación de métodos de extracción de ADN en tejidos parafinados y utilidad para amplificación por PCR / Comparison of DNA extraction methods from formalin-fixed paraffin sections for RCP amplification

Los tejidos fijados en formol e incluidos en parafina son una fuente de material para hallazgos moleculares en el ámbito clínico y científico, demostrándose que el ADN extraído de éstos, es adecuado para amplificación a través de la reacción en cadena de la polimerasa (RCP). En este estudio, se ensayaron tres métodos de extracción de ADN en tejidos incluidos en parafina, con el objetivo de comparar la eficiencia de estos para obtener ADN adecuado, además se analizó su utilidad en amplificación por RCP. Se emplearon tres muestras, correspondientes a una biopsia de pulmón, legrado endometrial y ganglio linfático, todas fijadas en formaldehido al 10% e incluidas en parafina. Utilizándose tres métodos diferentes de extracción de ADN (extracción por salting out, método modificado de Sambrook y kit comercial) El ADN obtenido se cuantificó por espectrofotometría, además se realizó electroforesis en gel de agarosa al 1%, para comprobar si el ADN era de buena calidad y se realizó RCP para el exón 3 del gen caveolina 1. Todos los métodos dieron como resultado una buen producto de ADN genómico, observándose mayor cantidad y pureza en los métodos de salting out y kit comercial, asimismo se obtuvo amplificación del producto esperado por estos dos métodos, no hubo buenos resultados con el ADN extraído por el método modificado "Preparation of Genomic DNA from Mouse Tails y Other Small samples, según Sambrook". El ADN obtenido a partir de tejidos FFIP puede ser amplificado por varios métodos, entre estos, la extracción por salting out es útil y con poca toxicidad, permite obtener ADN de buena calidad para amplificación por RCP.

Formalin-fixed and paraffin-embedded tissues are a source of important molecular findings in clinical and scientific, demonstrating that the DNA extracted from these is suitable for amplification by polymerase chain reaction (PCR). In this study, we tested three methods of DNA extraction, in order to compare the efficiency of these DNA for RCP amplification. Three samples were used, corresponding to a lung biopsy, endometrial curettage and lymph node, all fixed in 10% formaldehyde and embedded in paraffin. Three different methods were used for DNA extraction (extraction by salting out, modified Sambrook method and commercial kit) The DNA obtained was analyzed by spectrophotometry, and gel electrophoresis was performed in 1% agarose to check if the DNA was amplifiable. PCR was performed for exon 3 of caveolin-1 gene. All methods resulted in a good product of genomic DNA, obtaining more quality and purity in the salting out and commercial kit methods. Also, we obtained amplification of the product by these two methods, without favorable results with the DNA extracted by the modified "Preparation of Genomic DNA from Mouse Tails and Other Small samples, according to Sambrook et al." The DNA obtained from FFPE can be amplified by several methods, among them, salting out extraction is an easy, effective and low toxicity for obtaining good quality DNA for PCR amplification.

Diagnóstico molecular de candidemia mediante PCR semianidada en pacientes críticos / Molecular diagnosis of candidemia by seminested PCR in critically ill patients

Objetivos: estandarizar una prueba molecular basada en PCR semianidada para el diagnóstico de candidemia Metodología: se desarrolló un estudio piloto en que se optimizó el protocolo de extracción y utilización de ADN ribosomal, amplificando la región ITS-2 completa de Candida spp. Y mediante PCR semianidada, reamplificando segmentos específicos de nueve especies clínicamente relevantes de Candida. Se utilizaron muestras clínicas de plasma de pacientes críticamente enfermos con candidemia documentada microbiológicamente del Hospital de la Samaritana en Bogotá. Se utilizó una muestra de candidemia simulada utilizando una cepa de Candida obtenida de orina. Resultados: se logró protocolizar dicha técnica y tener a partir de muestras clínicas de plasma una sensibilidad probable de 90% y especificidad teórica cercana a 100%. La capacidad de detección de este ensayo es hasta de una célula por 200 μl de plasma. Conclusiones: se estandarizó una prueba molecular para detección de candidemia en pacientes críticamente enfermos (Acta Med Colomb 2011; 36: 135-140).

Objectives: to standardize a molecular test based on semi-nested PCR for diagnosis of candidemia. Methods: we developed a pilot study by means of optimizing the extraction protocol and use of ribosomal DNA, amplifying the complete ITS-2 region of Candida spp. And by semi-nested PCR reamplifying specific segments of nine clinically relevant Candida species. Clinical samples of plasma of critically ill patients with microbiologically proven candidemia from a third level hospital in Bogotá. Another sample of simulated candidemia was used with Candida strain form a urine sample. Results: we were able to standardize this technique and achieved from clinical samples of plasma a likely sensitivity of 90% and a theoretical specificity of 100%. The detection capability of this test is up to 1 cell per 200 μl of plasma. Conclusion: a molecular test for detection of candidemia among critically ill patients was standardized (Acta Med Colomb 2011; 36: 135-140).