Genetic parameters and genetic dissimilarity of Gower in black oat / Parâmetros genéticos e dissimilaridade genética de Gower em aveia preta

This research evaluated the agronomic performance through mixed models, and determined the genetic divergence between black oat genotypes. The experiment was carried out at Federal University of Santa Maria, Frederico Westphalen/RS. Fourteen black oat genotypes were evaluated, being 11 lines developed by Breeding Program of University, and three commercial cultivars (IAPAR 61, UPFA 21 - Moreninha and, IPR Cabocla). We evaluated quantitative traits associated to plant height, cycle, dry mass yield and seeds yield; and 19 qualitative traits, being these morphological descriptors. The results showed that lines UFSMFW 2-05 and UFSMFW 2-07 stand out with characteristics such as early cycle, higher dry mass and grain yield. Divergence analysis revealed the formation of three distinct groups, indicating the presence of variability. These results suggested the potential for the development of new cultivars of black oat, presenting early cycle and good grain yield.

O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho agronômico por meio de modelos mistos e determinar a divergência genética entre genótipos de aveia preta. O experimento foi conduzido na Universidade Federal de Santa Maria, campus de Frederico Westphalen/RS. Catorze genótipos de aveia preta foram avaliados, sendo 11 linhagens desenvolvidas pelo Programa de Melhoramento da Universidade e três cultivares comercias (IAPAR 61, UPFA 21 - Moreninha e IPR Cabocla). Foram avaliadas características agronômicas quantitativas relacionadas ao porte, ciclo e produtividade de massa seca e de sementes; e 19 características qualitativas, sendo estes descritores morfológicos. Os resultados mostraram que as linhagens UFSMFW 2-05 e UFSMFW 2-07 se destacam com características como ciclo precoce, elevada produtividade de massa seca e de sementes. A análise de divergência revelou a formação de três grupos distintos, indicando presença de variabilidade. Os resultados demonstram o potencial de desenvolvimento de novas cultivares de aveia preta, apresentando precocidade e boa produtividade de sementes.

Small numbers are an opportunity, not a problem / Números pequenos são uma oportunidade, não um problema

Aims: outcomes of research in education and training are partly a function of the context in which that study takes place, the questions we ask, and what is feasible. Many questions are about learning, which involves repeated measurements in a particular time window, and the practical context is usually such that offering an intervention to some but not to all learners does not make sense or is unethical. For quality assurance and other purposes, education and training centers may have very locally oriented questions that they seek to answer, such as whether an intervention can be considered effective in their context of small numbers of learners. While the rationale behind the design and outcomes of this kind of studies may be of interest to a much wider community, for example to study the transferability of findings to other contexts, people are often discouraged to report on the outcomes of such studies at conferences or in educational research journals. The aim of this paper is to counter that discouragement and instead encourage people to see small numbers as an opportunity instead of as a problem. Method: a worked example of a parametric and a non-parametric method for this type of situation, using simulated data in the zero-cost Open Source statistical program R version 4.0.5. Results: contrary to the non-parametric method, the parametric method can provide estimates of intervention effectiveness for the individual participant, account for trends in different phases of a study. However, the non-parametric method provides a solution in several situations where the parametric method should be used. Conclusion: Given the costs of research, the lessons to be learned from research, and statistical methods available, small numbers should be considered an opportunity, not a problem.

Objetivo: os resultados da pesquisa em educação e treinamento são, em parte, uma função do contexto em que esse estudo ocorre, das perguntas que fazemos e do que é viável. Muitas perguntas são sobre a aprendizagem, que envolve medições repetidas em uma janela de tempo específica, e o contexto prático, geralmente, é tal, que oferecer uma intervenção a alguns, mas não a todos os alunos, não faz sentido ou é antiético. Para garantia de qualidade e outros propósitos, os centros de educação e treinamento podem ter perguntas orientadas localmente que procuram responder, como, por exemplo, se uma intervenção pode ser considerada eficaz em seu contexto de pequeno número de alunos. Embora a justificativa por trás do projeto e dos resultados deste tipo de estudos possa ser do interesse de uma comunidade muito mais ampla, por exemplo, para estudar a possibilidade de transferência de resultados para outros contextos, as pessoas são frequentemente desencorajadas a relatar os resultados de tais estudos em conferências ou em revistas de pesquisa educacional. O objetivo deste artigo é combater esse desânimo e, em vez disso, incentivar as pessoas a verem os pequenos números como uma oportunidade em vez de um problema. Método: realizado um exemplo de método paramétrico e não paramétrico para este tipo de situação, utilizando dados simulados no programa estatístico Open Source R versão 4.0.5 de custo zero. Resultados: ao contrário do método não paramétrico, o método paramétrico pode fornecer estimativas da eficácia da intervenção para o participante individual, levando em conta as tendências em diferentes fases de um estudo. No entanto, o método não paramétrico fornece uma solução em várias situações, onde o método paramétrico deve ser usado. Conclusão: dados os custos da pesquisa, as lições a serem aprendidas com a pesquisa e os métodos estatísticos disponíveis, pequenos números devem ser considerados uma oportunidade, não um problema.

Assessment of individual competence: a sequential mixed model 1 / Avaliação da competência individual: um modelo sequencial misto

Aims: the assessment of individual competence in medical education is about finding a balance between having sufficient resources to make valid and reliable decisions and not using more resources than necessary. Sequential assessment, in which more resources are used for borderline performing candidates than for poorly or clearly satisfactorily performing candidates, can be used to achieve that balance. Although sequential assessment is commonly associated with larger groups of candidates to be assessed, in many practical settings numbers of candidates may be small. Objective: this article presents a single case design with a statistical model for the assessment of individual competence that can be used regardless of the number of candidates. Method: a worked example of a solution that can be used for an individual candidate, using simulated data in the zero-cost Open Source statistical program R version 4.0.5, is provided. Results: the aforementioned solution provides statistics that can be used to make pass/fail decisions at the level of the individual candidate as well as to make decisions regarding the length and timing of an exam (or parts thereof) for the individual candidate. Conclusion: the solution provided can help to reduce resources needed for assessment to a considerable extent while maximizing resources for borderline candidates. This facilitates both decision making and cost reduction in assessment.

Introdução: a avaliação da competência individual na educação médica consiste em encontrar um equilíbrio entre ter recursos suficientes para tomar decisões válidas e confiáveis e não usar mais recursos do que o necessário. A avaliação sequencial, na qual mais recursos são usados para candidatos limítrofes do que para candidatos com desempenho insatisfatório ou claramente satisfatório, pode ser usada para atingir esse equilíbrio. Embora a avaliação sequencial seja comumente associada a grupos maiores de candidatos a serem avaliados, em muitos ambientes práticos, o número de candidatos pode ser pequeno. Objetivo: este artigo apresenta um desenho de caso único com um modelo estatístico de avaliação de competência individual que pode ser utilizado independentemente do número de candidatos. Método: é fornecido um exemplo prático de uma solução que pode ser usada para um candidato individual, usando dados simulados no programa estatístico Open Source de custo zero R versão 4.0.5. Resultados: a solução mencionada fornece estatísticas que podem ser usadas para tomar decisões individuais de aprovação/reprovação para cada candidato, bem como para tomar decisões individualizadas sobre a duração e o tempo de um exame (ou partes dele) para um candidato. Conclusão: a solução fornecida pode ajudar a reduzir consideravelmente os recursos necessários para a avaliação, ao mesmo tempo que maximiza os recursos para os candidatos limítrofes. Isso facilita a tomada de decisões e a redução de custos na avaliação.

Factors associated with parasite dominance in fishes from Brazil / Fatores associados com a dominância parasitária em peixes do Brasil

The present study used regression models to evaluate the existence of factors that may influence the numerical parasite dominance with an epidemiological approximation. A database including 3,746 fish specimens and their respective parasites were used to evaluate the relationship between parasite dominance and biotic characteristics inherent to the studied hosts and the parasite taxa. Multivariate, classical, and mixed effects linear regression models were fitted. The calculations were performed using R software (95% CI). In the fitting of the classical multiple linear regression model, freshwater and planktivorous fish species and body length, as well as the species of the taxa Trematoda, Monogenea, and Hirudinea, were associated with parasite dominance. However, the fitting of the mixed effects model showed that the body length of the host and the species of the taxa Nematoda, Trematoda, Monogenea, Hirudinea, and Crustacea were significantly associated with parasite dominance. Studies that consider specific biological aspects of the hosts and parasites should expand the knowledge regarding factors that influence the numerical dominance of fish in Brazil. The use of a mixed model shows, once again, the importance of the appropriate use of a model correlated with the characteristics of the data to obtain consistent results.(AU)

Este estudo avaliou, por meio de modelos de regressão e sob o ponto de vista epidemiológico, a existência de fatores que podem influenciar a dominância numérica parasitária. Utilizou-se um banco de dados, contendo 3.746 espécimes de peixes e seus respectivos parasitos, para avaliar a relação da dominância parasitária com características bióticas inerentes aos hospedeiros e aos táxons parasitários estudados. Foram ajustados modelos de regressão linear multivariada, clássico e de efeitos mistos. Os cálculos foram realizados no software R (IC 95%). No ajuste do modelo de regressão linear múltipla clássico, as espécies de peixes dulcícolas, as planctívoras e o comprimento do corpo foram associadas à dominância parasitária, assim como os táxons Trematoda, Monogenea e Hirudínea. Entretanto, o ajuste do modelo de efeitos mistos demonstrou que apenas o comprimento do hospedeiro e os táxons Nematota, Trematoda, Monogenea, Hirudínea e Crustácea estão associados significativamente a dominância parasitária. Estudos que considerem os aspectos biológicos específicos dos hospedeiros e dos parasitos devem ampliar o entendimento sobre os fatores que interferem na dominância numérica em peixes do Brasil. A utilização do modelo misto demonstra, mais uma vez, a importância do uso adequado do modelo que respeite a natureza dos dados para a obtenção de resultados consistentes.(AU)

Parasite abundance and its determinants in fishes from Brazil: an eco-epidemiological approach / Abundância parasitária e seus determinantes em peixes do Brasil: uma abordagem ecoepidemiológica

The variability in parasite abundance has an ecological basis; however, from an epidemiological point of view, the contribution of factors inherent to the host to the variability in parasite abundance remains an open question. A database consisting of 3,746 specimens of 73 fish species was used to verify the relation between the distribution of parasite abundance in fishes and a set of biotic factors inherent to the hosts. Classical and mixed Poisson regression models were constructed. Prevalence ratios (PR) and their respective 95% confidence intervals were estimated. The parasite abundance was significantly higher in female hosts, nonschooling species, species from benthopelagic and pelagic habitats, and fishes with greater body length. Overall, these results suggest that the variability in the abundance of infection is an attribute of the parasite species. Although the results are biologically plausible, important gaps may still exist and should be explored to better understand the variations in parasite abundance, which has great relevance in epidemiological studies. We reinforce the importance of choosing the statistical model most appropriate for the nature of the data to avoid spurious results, especially when the autocorrelation in the data is not taken into account.(AU)

A variabilidade na abundância parasitária tem embasamento na perspectiva ecológica, entretanto, do ponto de vista epidemiológico, permanece em aberto a possibilidade da contribuição de fatores inerentes aos hospedeiros para essa variabilidade. Foram analisados 3.746 espécimes, pertencentes a 73 espécies de peixes, para verificar a relação entre a distribuição da abundância parasitária em peixes e um conjunto de fatores bióticos inerentes aos hospedeiros. Modelos de Regressão de Poisson clássico e misto foram ajustados. As razões de prevalência (RP) e seus respectivos intervalos, com 95% de confiança, foram estimados. A abundância parasitária foi significativamente maior em hospedeiros fêmeas, não formadoras de cardumes, de hábitats bentopelágico e pelágico e com maior comprimento do corporal. De um modo geral, esses resultados sugerem que a abundância de infecção é um atributo da espécie de parasitos que pode ser variável. Apesar dos resultados apresentarem plausibilidade biológica, ainda pode haver lacunas importantes a serem exploradas para o melhor entendimento das variações da abundância parasitária que, por sua vez, tem grande relevância nos estudos epidemiológicos. Reforça-se a importância da escolha de um modelo estatístico mais adequado à natureza dos dados, evitando-se resultados espúrios, principalmente quando não se leva em conta a autocorrelação entre os dados.(AU)

Parasite abundance and its determinants in fishes from Brazil: an eco-epidemiological approach / Abundância parasitária e seus determinantes em peixes do Brasil: uma abordagem ecoepidemiológica

Abstract The variability in parasite abundance has an ecological basis; however, from an epidemiological point of view, the contribution of factors inherent to the host to the variability in parasite abundance remains an open question. A database consisting of 3,746 specimens of 73 fish species was used to verify the relation between the distribution of parasite abundance in fishes and a set of biotic factors inherent to the hosts. Classical and mixed Poisson regression models were constructed. Prevalence ratios (PR) and their respective 95% confidence intervals were estimated. The parasite abundance was significantly higher in female hosts, nonschooling species, species from benthopelagic and pelagic habitats, and fishes with greater body length. Overall, these results suggest that the variability in the abundance of infection is an attribute of the parasite species. Although the results are biologically plausible, important gaps may still exist and should be explored to better understand the variations in parasite abundance, which has great relevance in epidemiological studies. We reinforce the importance of choosing the statistical model most appropriate for the nature of the data to avoid spurious results, especially when the autocorrelation in the data is not taken into account.

Resumo A variabilidade na abundância parasitária tem embasamento na perspectiva ecológica, entretanto, do ponto de vista epidemiológico, permanece em aberto a possibilidade da contribuição de fatores inerentes aos hospedeiros para essa variabilidade. Foram analisados 3.746 espécimes, pertencentes a 73 espécies de peixes, para verificar a relação entre a distribuição da abundância parasitária em peixes e um conjunto de fatores bióticos inerentes aos hospedeiros. Modelos de Regressão de Poisson clássico e misto foram ajustados. As razões de prevalência (RP) e seus respectivos intervalos, com 95% de confiança, foram estimados. A abundância parasitária foi significativamente maior em hospedeiros fêmeas, não formadoras de cardumes, de hábitats bentopelágico e pelágico e com maior comprimento do corporal. De um modo geral, esses resultados sugerem que a abundância de infecção é um atributo da espécie de parasitos que pode ser variável. Apesar dos resultados apresentarem plausibilidade biológica, ainda pode haver lacunas importantes a serem exploradas para o melhor entendimento das variações da abundância parasitária que, por sua vez, tem grande relevância nos estudos epidemiológicos. Reforça-se a importância da escolha de um modelo estatístico mais adequado à natureza dos dados, evitando-se resultados espúrios, principalmente quando não se leva em conta a autocorrelação entre os dados.

Factors associated with parasite dominance in fishes from Brazil / Fatores associados com a dominância parasitária em peixes do Brasil

Abstract The present study used regression models to evaluate the existence of factors that may influence the numerical parasite dominance with an epidemiological approximation. A database including 3,746 fish specimens and their respective parasites were used to evaluate the relationship between parasite dominance and biotic characteristics inherent to the studied hosts and the parasite taxa. Multivariate, classical, and mixed effects linear regression models were fitted. The calculations were performed using R software (95% CI). In the fitting of the classical multiple linear regression model, freshwater and planktivorous fish species and body length, as well as the species of the taxa Trematoda, Monogenea, and Hirudinea, were associated with parasite dominance. However, the fitting of the mixed effects model showed that the body length of the host and the species of the taxa Nematoda, Trematoda, Monogenea, Hirudinea, and Crustacea were significantly associated with parasite dominance. Studies that consider specific biological aspects of the hosts and parasites should expand the knowledge regarding factors that influence the numerical dominance of fish in Brazil. The use of a mixed model shows, once again, the importance of the appropriate use of a model correlated with the characteristics of the data to obtain consistent results.

Resumo Este estudo avaliou, por meio de modelos de regressão e sob o ponto de vista epidemiológico, a existência de fatores que podem influenciar a dominância numérica parasitária. Utilizou-se um banco de dados, contendo 3.746 espécimes de peixes e seus respectivos parasitos, para avaliar a relação da dominância parasitária com características bióticas inerentes aos hospedeiros e aos táxons parasitários estudados. Foram ajustados modelos de regressão linear multivariada, clássico e de efeitos mistos. Os cálculos foram realizados no software R (IC 95%). No ajuste do modelo de regressão linear múltipla clássico, as espécies de peixes dulcícolas, as planctívoras e o comprimento do corpo foram associadas à dominância parasitária, assim como os táxons Trematoda, Monogenea e Hirudínea. Entretanto, o ajuste do modelo de efeitos mistos demonstrou que apenas o comprimento do hospedeiro e os táxons Nematota, Trematoda, Monogenea, Hirudínea e Crustácea estão associados significativamente a dominância parasitária. Estudos que considerem os aspectos biológicos específicos dos hospedeiros e dos parasitos devem ampliar o entendimento sobre os fatores que interferem na dominância numérica em peixes do Brasil. A utilização do modelo misto demonstra, mais uma vez, a importância do uso adequado do modelo que respeite a natureza dos dados para a obtenção de resultados consistentes.

Avaliação da efetividade de programa governamental de distribuição de leite fortificado no crescimento de crianças de 6 a 24 meses de famílias de baixa renda, residentes no interior do Estado de São Paulo / Evaluation the effectiveness of a state-run food supplementation program for child growth according to childrens nutritional status at enrollment

Introdução: A avaliação dos resultados de políticas públicas de suplementação alimentar em condições reais de sua operacionalização (efetividade) é um instrumento imprescindível para área de saúde pública. Objetivos: Avaliar a efetividade de programa governamental de suplementação alimentar no crescimento de crianças, segundo o estado nutricional ao ingressar. Métodos: Estudo de coorte com dados secundários de 25.433 crianças de baixa renda com idade entre 6 a 24 meses que ingressaram em programa de distribuição de leite fortificado "Projeto Vivaleite" de 2003 a 2008, em 311 municípios do Estado de São Paulo. O crescimento foi medido por meio dos valores de escore z de peso para idade (PI), calculados pelo padrão OMS/2006, obtidos, na rotina do programa, ao ingressar e a cada 4 meses durante a permanência. Os critérios de inclusão foram ter idade ao ingressar entre 6 a 24 meses, ter pelo menos duas pesagens, incluindo a obtida na entrada, e não ter relatos de problemas de saúde. As crianças foram divididas em três grupos de escore z ao entrar: sem comprometimento de peso (z> -1); risco de baixo peso (-2 ≤z< -1) e baixo peso (z<-2). Utilizou-se regressão linear multinível (modelo misto), permitindo a comparação, em cada idade, das médias ajustadas do escore z de ingressantes e participantes há pelo menos quatro meses, ajustadas para correlação entre medidas repetidas. Resultados: Verificou-se efeito positivo do Programa no ganho de peso das crianças, variando em função do estado nutricional ao ingressar; para as que entraram sem comprometimento de peso o ganho médio ajustado foi 0,1827 escore z, entre as que entraram com risco de baixo peso foi 0,5659 e entre as ingressantes com baixo peso foi 1,0049 escore z. Conclusões: O programa é efetivo para o crescimento infantil, medido pelo escore z PI, com efeito mais pronunciado entre as crianças que entram no programa em condições menos favoráveis de peso.

OBJECTIVE: To assess the effectiveness of a state-run food supplementation program for child growth according to childrens nutritional status at enrollment. METHODS: Cohort study including secondary data of 25,433 low-income children aged between 6 and 24 months enrolled in a fortified milk program "Projeto Vivaleite" in 311 cities in the State of São Paulo, Brazil, between 2003 and 2008. Children's growth was assessed based on weight-for-age (WA) z-scores, estimated following WHO criteria (2006). Data was routinely collected at the program enrollment and every 4 months. Inclusion criteria were: being 6 to 24 months of age at enrollment; having at least two weight measures including the first measure at enrollment; and not having any ill health conditions. At enrollment, children were categorized into three groups based on their z-scores: no compromised weight gain (z> 1); at risk of low weight (-2 ≤z< -1), and low weight (z< -2). Multilevel linear regression analysis (mixed model) was performed for comparison, considering age, of adjusted average z-scores between new children enrolled and those in the program for at least four months, adjusted for correlation between repeat measures. RESULTS: The program had a positive effect on children's weight gain. Based on their nutritional status at enrollment, adjusted average weight gain z-score was 0,1827 in children with compromised weight gain, 0,5659 in those at risk of low weight, and 1,0049 in those with low weight. CONCLUSIONS: The milk program is effective for child growth, as measured by WA z-scores. The most pronounced effect was seen among children who showed less favorable levels of weight at enrollment.

As lideranças científicas / The scientific leaderships

O objetivo do trabalho é analisar a atuação das lideranças científicas na produção do conhecimento e na definição da política de ciência e tecnologia. Depois de verificados os líderes dos grupos de pesquisa no Diretório dos Grupos de Pesquisa do CNPq, nas áreas de Agronomia, Genética e Sociologia, recorreu-se à Plataforma Lattes, a fim de sistematizar em tabelas os dados referentes à formação, instituição, produção científica, participação em comitês assessores ou em sociedades científicas. Também foram constatadas as fontes de financiamento de suas pesquisas. A definição da amostra de pesquisadores a serem entrevistados levou em conta esses indicadores e ainda procurou contemplar diversidade regional, institucional e proporcionalidade de gêneros. Foram realizadas quarenta entrevistas sobre as principais práticas acadêmicas e políticas desses líderes. Os resultados levam à discussão de alguns conceitos como de campo científico em Bourdieu e de condições sóciocognitivas do modelo misto de produção do conhecimento.

Simulation of mixed models in augmented block design

The augmented block design is widely used in breeding programs, with non-replicated treatments generally being selection units, and replicated treatments being standard cultivars. Originally, an intrablock analysis (fixed model) was proposed. Although non-replicated treatments and/or blocks can be considered of random nature, mixed linear models could be used instead. This work evaluated such an approach, using computer simulation. Populations consisted of sets of randomly generated inbred lines. Molecular marker data were also simulated to allow the estimation of the genetic covariance matrix. Different conditions were considered, varying heritability and the coefficient b of Smith of soil heterogeneity. For each condition 100 simulations were performed, considering four linear models, varying respectively the nature of the effects of blocks and non-replicated treatments (fixed - F, or random - R): FF, FR, RF and RR. In relation to FF, the mixed models were more efficient under low to intermediate heritability and high b. Mixed models could improve inference in breeding programs using the augmented block design and the choice of the model should rely on the kind of selection. If this is truncated, the RF model should be preferred; if it is not, then the RR model would be more suitable.

O delineamento em blocos aumentados é amplamente utilizado em programas de melhoramento, geralmente com tratamentos não-repetidos correspondentes a unidades de seleção, e tratamentos repetidos sendo cultivares comerciais. Originalmente, uma análise intrablocos (modelo fixo) foi sugerida. No entanto, se os tratamentos não-repetidos e/ou blocos puderem ser considerados de natureza aleatória, modelos lineares mistos poderiam ser utilizados. Este estudo objetivou a avaliação de tal abordagem, utilizando simulação. Linhagens endogâmicas foram geradas aleatoriamente, bem como dados de marcação molecular, para estimar a matriz de covariâncias genéticas. Variaram-se a herdabilidade e o coeficiente b de heterogeneidade de solo de Smith; em cada condição, 100 simulações foram feitas, considerando 4 modelos lineares, variando respectivamente a natureza dos efeitos de bloco e de tratamentos não-repetidos (fixo -- F, ou aleatório -- A): FF, FA, AF e AA. Em relação ao modelo FF, os modelos mistos foram mais eficientes especialmente sob herdabilidade baixa a intermediária e alto b. Modelos mistos podem melhorar a inferência em programas de melhoramento utilizando o delineamento, e a escolha do modelo deve se basear no tipo de seleção. Se esta for truncada, o modelo AF deveria ser preferido; se não for, então o modelo AA é mais apropriado.

Simulation of mixed models in augmented block design

The augmented block design is widely used in breeding programs, with non-replicated treatments generally being selection units, and replicated treatments being standard cultivars. Originally, an intrablock analysis (fixed model) was proposed. Although non-replicated treatments and/or blocks can be considered of random nature, mixed linear models could be used instead. This work evaluated such an approach, using computer simulation. Populations consisted of sets of randomly generated inbred lines. Molecular marker data were also simulated to allow the estimation of the genetic covariance matrix. Different conditions were considered, varying heritability and the coefficient b of Smith of soil heterogeneity. For each condition 100 simulations were performed, considering four linear models, varying respectively the nature of the effects of blocks and non-replicated treatments (fixed - F, or random - R): FF, FR, RF and RR. In relation to FF, the mixed models were more efficient under low to intermediate heritability and high b. Mixed models could improve inference in breeding programs using the augmented block design and the choice of the model should rely on the kind of selection. If this is truncated, the RF model should be preferred; if it is not, then the RR model would be more suitable.

O delineamento em blocos aumentados é amplamente utilizado em programas de melhoramento, geralmente com tratamentos não-repetidos correspondentes a unidades de seleção, e tratamentos repetidos sendo cultivares comerciais. Originalmente, uma análise intrablocos (modelo fixo) foi sugerida. No entanto, se os tratamentos não-repetidos e/ou blocos puderem ser considerados de natureza aleatória, modelos lineares mistos poderiam ser utilizados. Este estudo objetivou a avaliação de tal abordagem, utilizando simulação. Linhagens endogâmicas foram geradas aleatoriamente, bem como dados de marcação molecular, para estimar a matriz de covariâncias genéticas. Variaram-se a herdabilidade e o coeficiente b de heterogeneidade de solo de Smith; em cada condição, 100 simulações foram feitas, considerando 4 modelos lineares, variando respectivamente a natureza dos efeitos de bloco e de tratamentos não-repetidos (fixo -- F, ou aleatório -- A): FF, FA, AF e AA. Em relação ao modelo FF, os modelos mistos foram mais eficientes especialmente sob herdabilidade baixa a intermediária e alto b. Modelos mistos podem melhorar a inferência em programas de melhoramento utilizando o delineamento, e a escolha do modelo deve se basear no tipo de seleção. Se esta for truncada, o modelo AF deveria ser preferido; se não for, então o modelo AA é mais apropriado.

Métodos de estimação de componentes de variância em modelos mistos desbalanceados

Scientists have been giving especial attention to the estimation of variance components in mixed models in the last decades. Consequently several estimation methods have been proposed, what makes the choice of one among them difficult. Aiming to subsidize users of estimation methods of variance components in unbalanced mixed models, aiming to make a better choice in obtaining these estimatives this paper presents, using numerical examples, the main methods of estimation. It also helps beginners with the introductory concepts they need to use the PROC MIXED programfrom the SAS Statistical system, to obtain the estimatives of variance components trough the available methods there presented, considering the occurence of different matrices of variance and covariance.

A estimação dos componentes de variância em modelos mistos tem merecido, nas últimas décadas, atenção especial dos pesquisadores. Sendo assim, vários métodos de estimação têm sido propostos, e diante de tal disponibilidade, escolher um deles pode não ser uma questão trivial. Nesse contexto, buscando fornecer aos usuários dos métodos de estimação de componentes de variância em modelos mistos desbalanceados, subsídios para uma opção tão confortável quanto possível do método mais adequado para a obtenção das estimativas, em suas pesquisas, o presente artigo apresenta, com ilustrações numéricas, os principais métodos de estimação. Ademais, apresenta, aos usuários não iniciados, conceitos introdutórios necessários para a utilização do PROC MIXED do Sistema Estatístico SAS, na obtenção das estimativas dos componentes de variância através dos métodos ali disponíveis, considerando a ocorrência de diferentes matrizes de variâncias e covariâncias.

Parâmetros genéticos para coelhos da raça Califórnia criados no Brasil

Genetic, phenotypic and environmental parameters of a population of Californian rabbits submitted to selection for three generations were studied. Traits analyzed were individual weaning weight (PD), weight at 10 weeks (P10) and average daily gain from weaning to 10 weeks of age (GPD10) using 3,249 records of weights of rabbits and pedigree information of 4,857 animals, born from 1980 to 1996, and selected based on an index of estimated breeding values for PD, P10 and GPD10. Permanent effects of litters were as important as additive genetic effects. Heritabilities for the three traits were .23 (PD), .44 (P10) and .39 (GPD10). Genetic correlations between PD and P10 and between PD and GPD10 were high (.66) and very low, respectively.

Registros de pesos de 3.249 coelhos, nascidos de 1980 a 1996 e, dados de pedigree de 4.857 coelhos da raça Califórnia, criados no Campus da USP de Pirassununga, São Paulo, submetidos à seleção por três gerações, com base em valores genéticos de pesos à desmama (PD) e à 10ª semana de idade (P10) e ganho de peso da desmama até 10 semanas de idade (GPD10), foram analisados pelo método de modelos mistos sob modelos animais para obter estimativas de parâmetros genéticos para as características consideradas como parte do critério de seleção. As estimativas do coeficiente de herdabilidade encontradas foram de 0,23 para PD, de 0,44 para P10 e 0,39 para GP10, mostrando ser possível haver ganhos genéticos se aplicados processos seletivos. A correlação genética entre PD e P10 foi de 0,66 e entre PD e GPD10 foi baixa, indicando que as variáveis são praticamente independentes. A proporção da variância fenotípica devida aos efeitos permanentes de ninhada foi importante para todas as características. Os resultados sugerem que a seleção para características ponderais pode ser eficiente.

Métodos de estimação de componentes de variância em modelos mistos desbalanceados

Scientists have been giving especial attention to the estimation of variance components in mixed models in the last decades. Consequently several estimation methods have been proposed, what makes the choice of one among them difficult. Aiming to subsidize users of estimation methods of variance components in unbalanced mixed models, aiming to make a better choice in obtaining these estimatives this paper presents, using numerical examples, the main methods of estimation. It also helps beginners with the introductory concepts they need to use the PROC MIXED programfrom the SAS Statistical system, to obtain the estimatives of variance components trough the available methods there presented, considering the occurence of different matrices of variance and covariance.

A estimação dos componentes de variância em modelos mistos tem merecido, nas últimas décadas, atenção especial dos pesquisadores. Sendo assim, vários métodos de estimação têm sido propostos, e diante de tal disponibilidade, escolher um deles pode não ser uma questão trivial. Nesse contexto, buscando fornecer aos usuários dos métodos de estimação de componentes de variância em modelos mistos desbalanceados, subsídios para uma opção tão confortável quanto possível do método mais adequado para a obtenção das estimativas, em suas pesquisas, o presente artigo apresenta, com ilustrações numéricas, os principais métodos de estimação. Ademais, apresenta, aos usuários não iniciados, conceitos introdutórios necessários para a utilização do PROC MIXED do Sistema Estatístico SAS, na obtenção das estimativas dos componentes de variância através dos métodos ali disponíveis, considerando a ocorrência de diferentes matrizes de variâncias e covariâncias.

Procedimento "MIXED" do SAS® para análise de modelos mistos

The mixed model is an important class of models that is traditionally analyzed by procedures of analysis of variance. Three aspects are fundamental in the mixed models: estimation and tests of the hypotheses of the fixed effects, prediction of the random effects and estimation of the components of variance. In the analysis of unbalanced mixed linear models, the estimation of variance components is of fundamental importance and it depends on the covariance structure and methods of estimation used. In such a context, this article intends to present the main methods of estimation and analysis used in the study of mixed linear models with general covariance structures in the random effects, available in the MIXED procedure, of the SAS (Statistical Analysis System).

O modelo misto consiste numa importante classe de modelos que tem sido tradicionalmente analisada por meio de procedimentos da análise de variância. Nos modelos mistos, três aspectos são fundamentais: estimação e testes de hipóteses dos efeitos fixos, predição dos efeitos aleatórios e estimação dos componentes de variância. Na análise de modelos lineares mistos desbalanceados, a estimação dos componentes de variância é de fundamental importância e depende da estrutura de covariâncias e dos métodos de estimação utilizados. Nesse contexto, este artigo pretende apresentar os principais métodos de estimação e de análise utilizados no estudo de modelos lineares mistos com estruturas gerais de covariâncias nos efeitos aleatórios, disponíveis no procedimento MIXED, do SAS (Statistical Analysis System).

Procedimento "MIXED" do SAS® para análise de modelos mistos

The mixed model is an important class of models that is traditionally analyzed by procedures of analysis of variance. Three aspects are fundamental in the mixed models: estimation and tests of the hypotheses of the fixed effects, prediction of the random effects and estimation of the components of variance. In the analysis of unbalanced mixed linear models, the estimation of variance components is of fundamental importance and it depends on the covariance structure and methods of estimation used. In such a context, this article intends to present the main methods of estimation and analysis used in the study of mixed linear models with general covariance structures in the random effects, available in the MIXED procedure, of the SAS (Statistical Analysis System).

O modelo misto consiste numa importante classe de modelos que tem sido tradicionalmente analisada por meio de procedimentos da análise de variância. Nos modelos mistos, três aspectos são fundamentais: estimação e testes de hipóteses dos efeitos fixos, predição dos efeitos aleatórios e estimação dos componentes de variância. Na análise de modelos lineares mistos desbalanceados, a estimação dos componentes de variância é de fundamental importância e depende da estrutura de covariâncias e dos métodos de estimação utilizados. Nesse contexto, este artigo pretende apresentar os principais métodos de estimação e de análise utilizados no estudo de modelos lineares mistos com estruturas gerais de covariâncias nos efeitos aleatórios, disponíveis no procedimento MIXED, do SAS (Statistical Analysis System).