RESUMO
BACKGROUND: The vitamin D receptor (VDR) is responsible for mediating the effects of vitamin D through regulation of other gene transcriptions. There are several polymorphisms that alter the gene expression or the function of this protein. We aimed to analyze the association between two SNPs of VDR gene and melanoma cancer in Colombian patients. METHODS: We included 120 healthy individual as controls and 120 melanoma cancer patients as cases . Patients in both groups were matched in terms of gender and age. The genotyping of rs731236 and rs2228570 polymorphisms was performed using PCR-RFLP. The SNPStats program was used to carry out the statistical analysis through a logistic regression model. RESULTS: Under dominant model, we found that rs2228570 polymorphism was associated with melanoma cancer risk (C/C vs C/T-T/T, OR: 5.10, 95% CI: 2.85-9.14), whereas rs731236 polymorphism was associated with a protective effect against this cancer (T/T vs T/C, OR: 0.27, 95% CI: 0.14-0.53). CONCLUSION: Our results suggested that both polymorphisms were involved in the development of melanoma cancer, increasing or decreasing this risk.
Assuntos
Etnicidade/genética , Predisposição Genética para Doença/genética , Melanoma/genética , Polimorfismo de Nucleotídeo Único/genética , Receptores de Calcitriol/genética , Estudos de Casos e Controles , Colômbia/etnologia , Feminino , Predisposição Genética para Doença/etnologia , Genótipo , Humanos , Masculino , Melanoma/etnologia , Pessoa de Meia-Idade , Polimorfismo de Fragmento de RestriçãoRESUMO
Abstract Background: Canine degenerative myelopathy (DM) is a late-onset disease that primarily affects large-breed dogs. The disease involves the spinal cord and produces progressive paresia and, eventually, complete loss of mobility. DM has been related to missense mutation c.118G>A in the SOD1 gene. Objective: To determine the genotypic and genic frequencies of DM in Mexico. Methods: In total, 330 samples from 22 different dog breeds were genotyped using the polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphisms (PCR-RFLP) technique. Results: The mutation was identified in 71 animals from 11 different breeds. Observed genic frequencies were 0.78 for the G allele and 0.14 for the A allele. Genotypic frequencies were 0.79 for the G/G wild-type, 0.14 for the G/A heterozygote, and 0.7 for the A/A homozygote. Conclusion: The genic frequency of this allele is high among the studied populations. A molecular marker program that identifies the DM mutation in breeding dogs should be implemented in order to reduce this frequency.
Resumen Antecedentes: La mielopatía degenerativa canina (MD) es una enfermedad progresiva de presentación tardía que afecta a la médula espinal, generalmente en caninos de razas grandes, y que produce paresis progresiva y eventual pérdida completa de la movilidad. Se ha relacionado con una mutación puntual por sustitución de bases en el gen SOD1 recientemente identificado como c.118G>A. Objetivo: Determinar las frecuencias genotípicas y génicas para la presentación de DM en México. Métodos: Se genotipificaron 330 muestras de perros de 22 razas mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa y polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (PCR- RFLPs). Resultados: Se identificó la mutación en 71 animales de 11 razas diferentes. Las frecuencias génicas encontradas fueron de 0,78 para el alelo G y de 0,14 para el alelo A. Las frecuencias genotípicas fueron de 0,79 para el tipo silvestre G/G, 0,14 para el heterocigoto G/A y 0,7 para el homocigoto A/A. Conclusión: La frecuencia encontrada para la mutación es alta en las poblaciones estudiadas. La aplicación de un programa de selección asistida por marcadores moleculares contra la mutación causante de MDC en perros reproductores resultaría útil para reducir su frecuencia.
Resumo Antecedentes: A mielopatía degenerativa canina (MD) é uma doença progressiva de apresentação tardia que afeta a medula espinal geralmente de caninos de raças grandes e que produz paresia progressiva e eventualmente a perda completa da mobilidade. Tem sido relacionada com uma mutação pontual por substituição de bases no gen SOD1, recentemente identificado como c.118G>A. Objetivo: Determinar as frequências genotípicas e genéticas para a apresentação de DM no México. Métodos: Genotipagem de 330 amostras de cães de 22 raças por meio da técnica de reação em cadeia da polimerase e polimorfismos no comprimento de fragmentos de restrição (PCR- RFLPs). Resultados: A mutação foi identificada em 71 animais de 11 raças diferentes. As frequências gênicas encontradas foram de 0,78 para o alelo G e de 0,14 para o alelo A. As frequências genotípicas foram de 0,79 para o tipo silvestre G/G, 0,14 para o heterozigoto G/A e 0,7 para o homozigoto A/A. Conclusão: A frequência encontrada para a mutação é alta nas populações estudadas. A implementação de um programa de seleção assistida por marcadores moleculares contra a mutação que causa MDC seria útil para reduzir a sua frequência.