Detección molecular de patotipos de Escherichia coli productores de enfermedad diarreica aguda en niños en un hospital de Rosario, Argentina: patotipos de Escherichia coli en niños / Molecular detection of Escherichia coli pathotypes associated to acute diarrheal disease in children in a hospital in Rosario, Argentina: Escherichia coli pathotypes in children

Objetivo: Detectar los patotipos de Escherichia coli en una población pediátrica con enfermedad diarreica aguda en la ciudad de Rosario para adoptar medidas de intervención oportunas y eficaces en Salud Pública. Materiales y métodos: Se estudiaron 360 muestras de heces de niños menores de 15 años que presentaron cuadro diarreico agudo y que concurrieron a un hospital pediátrico de la ciudad de Rosario, Argentina. La investigación se realizó desde enero de 2021 a abril del 2022. La detección de patotipos se realizó mediante reacción en cadena de la polimerasa. Resultados: Se identificaron el 21.11% de Escherichia coli diarrogénicas (DEC). Se detectaron los genes de virulencia correspondientes a: E. coli enteroagregativa (EAEC) (42,10%), E. coli enteroinvasiva (EIEC) (23.68%), E. coli enterotoxigénica ETEC) (14.47%), E. coli enteropatógena (EPEC) (15.79%) y E. coli enterohemorrágica (EHEC) (1.32%). Se detectaron infecciones mixtas por EAEC/EPEC (1.32%) y ETEC/EAEC (1.32%). Conclusiones: Los métodos de diagnóstico moleculares son una herramienta fundamental en el estudio de la epidemiologia de las enfermedades diarreicas aguda. Más aún, su implementación resulta primordial para identificar del agente etiológico de DEC, disminuir la diseminación de estos patógenos y reducir así la morbi-mortalidad asociada a las diarreas en la población pediátrica.

Objective: Detect Escherichia coli pathotypes in a pediatric population with acute diarrheal disease in the city of Rosario to adopt timely and effective intervention measures in Public Health. Material and methods: A total of 360 fecal samples from pediatric patient with ADD and who attended in a pediatric hospital in Rosario, Argentina, were studied. The research was carried out from January 2021 to April 2022. The identification of pathotypes was carried out by polymerase chain reaction. Results: 21.11% diarrheagenic Escherichia coli (DEC) strains were identified. The virulence genes corresponding to all the pathotypes studied were detected: enteroaggregative E. coli (EAEC) (42.10%), enteroinvasive E. coli (EIEC) (23.68%), enterotoxigenic E. coli (ETEC) (14.47%), enteropathogenic E. coli (EPEC) (15.79%) and enterohemorrhagic E. coli (EHEC) (1.32%). Mixed EAEC/EPEC (1.32%) and ETEC/EAEC (1.32%) infections were detected. Conclusions: Molecular diagnostic methods are a fundamental tool in the study of the epidemiology of acute diarrheal disease. The application of these techniques is essential to identify the etiological agent of DEC, reduce the spread of these pathogens and thus reduce morbidity and mortality associated with diarrhea in the pediatric population.

Escherichia coli diarrogénicos, identificación de patotipos y fenotipos de resistencia antimicrobiana en aislados cubanos / Diarrheagenic Escherichia coli: identification of pathotypes and antimicrobial resistance phenotypes in Cuban isolates

Introducción: En los países en vías de desarrollo las enfermedades diarreicas agudas son causa frecuente de morbilidad y mortalidad. Entre las primeras causas se encuentra Escherichia coli diarrogénicos, que afecta a pacientes en edades extremas de la vida y con inmunodeficiencias. Objetivo: Identificar los patotipos de Escherichia coli diarrogénicos que más inciden y los fenotipos de resistencia antimicrobiana expresados por el patotipo predominante. Métodos: Se estudiaron 184 aislamientos procedentes de 15 centros provinciales de Higiene, Epidemiología y Microbiología de Cuba e Isla de la Juventud. La investigación se realizó desde julio de 2012 hasta febrero de 2014. La identificación de género, especie y patotipos fue realizada por métodos de diagnóstico convencional y molecular. La determinación de la susceptibilidad antimicrobiana se realizó por el método de Bauer y Kirby, y las normas del Clinical and Laboratory Institute Standards de 2013. Resultados: Se identificaron 108 (58 por ciento) Escherichia coli diarrogénicos. Los patotipos confirmados fueron: en la PCR múltiple 1, 5 (6 por ciento) de Escherichia coli enteropatogénico, 4 (4 por ciento) de enterotoxigénico y 0 (0 por ciento) de enterohemorrágico. La PCR múltiple 2 reveló 72 (82 por ciento) Escherichia coli enteroagregativo, que resultó el predominante en el estudio. La PCR 3 (simple) detectó 7 (8 por ciento) de enteroinvasivo. El 100 por ciento del patotipo predominante mostró resistencia, al menos a un antimicrobiano de los probados, un solo patron de resistencia a dos antimicrobianos, y nueve patrones de multirresistencia. Conclusiones: El estudio demuestra la importancia del uso de pruebas moleculares rápidas para la confirmación de los patotipos de E. coli diarrogénicos, los que provocan deshidratación ligera, complicaciones graves y la muerte. Se logra identificar los cuatro patotipos más frecuentes y E. coli enteroagregativo, el de mayor incidencia en la población estudiada. El patotipo predominante mostró altos porcentaje de resistencia antimicrobiana a betalactámicos y buena sensibilidad antimicrobiana a los aminoglucósidos y cefalosporinas de tercera generación. La investigación aporta conocimientos, no revelados en estudios anteriores con aislados cubanos, lo que es considerado de alto valor para los clínicos, pediatras y epidemiólogos del país(AU)

Introduction: Acute diarrheal disease is a frequent cause of morbidity and mortality in developing countries. One of the leading causes is diarrheagenic Escherichia coli, which affects patients at extreme ages and with immunodeficiencies. Objective: Identify the most active pathotypes of diarrheagenic Escherichia coli and the antimicrobial resistance phenotypes expressed by the prevailing pathotype. Methods: A study was conducted from July 2012 to February 2014 of 184 isolates obtained from 15 provincial Hygiene, Epidemiology and Microbiology Centers in Cuba and the Isle of Youth. Identification of the genus, species and pathotypes was based on conventional and molecular diagnostic methods. Determination of antimicrobial susceptibility was performed by the Bauer-Kirby method in compliance with guidelines from the Clinical and Laboratory Standards Institute of 2013. Results: A total 108 (58 percent) diarrheagenic Escherichia coli were identified. The following pathotypes were confirmed: Multiplex PCR 1 revealed 5 (6 percent) enteropathogenic, 4 (4 percent) enterotoxigenic and 0 (0 percent ) enterohemorrhagic Escherichia coli. Multiplex PCR 2 found 72 (82 percent) enteroaggregative Escherichia coli, which was the prevailing type in the study. PCR 3 (simple) detected 7 (8 percent) enteroinvasive Escherichia coli. 100 percent of the prevailing pathotype displayed resistance to at least one of the antimicrobials tested, a single resistance pattern to two antimicrobials, and nine multiresistance patterns. Conclusions: The study showed the importance of the use of rapid molecular tests to confirm diarrheagenic E. coli pathotypes, which cause mild dehydration, serious complications and death. Identification could be done of the four most common pathotypes and enteroaggregative E. coli, the one with the highest incidence in the study population. The prevailing pathotype displayed high percentages of antimicrobial resistance to beta-lactams and good antimicrobial sensitivity to third-generation cephalosporins and aminoglycosides. The study contributed knowledge not revealed by previous research about Cuban isolates. Such information is considered to be highly valuable for clinicians, pediatricians and epidemiologists in the country(AU)

Patotipos de Escherichia coli causadores de diarreia em bezerros: uma atualização / Escherichia coli pathotypes associated with diarrhea in calves: an update

A diarreia é uma das doenças mais frequentes de bezerros com até 30 dias de idade e é uma importante causa de perdas econômicas. Sua etiologia é complexa e envolve a interação de diversos fatores infecciosos, nutricionais, imunológicos, gerenciais e ambientais. Os principais sinais clínicos são a diarreia, desidratação progressiva, acidose metabólica, desequilíbrio de eletrólitos e balanço energético negativo com ou sem hipoglicemia, que se não tratados, levam à morte do animal. Escherichia coli se destaca como um importante enteropatógeno envolvido na síndrome diarreica. Cepas de E. coli patogênicas são classificadas em grupos ou patotipos, de acordo com a produção de fatores de virulência e mecanismos pelos quais causam doença. Já foram identificados cinco patotipos de E. coli associados à diarreia em bezerros: E. coli enterotoxigênica (ETEC), E. coli enteropatogênica (EPEC), E. coli enterohemorrágica (EHEC), E. coli produtora de toxina Shiga (STEC) e E. coli necrotoxigênica (NTEC). Nesse artigo apresentamos as principais características e os atuais conhecimentos sobre os patotipos de E. coli causadores de diarreia em bezerros.(AU)

Diarrhea is one of the most frequent diseases in calves up to 30 days of age and is a major cause of economic losses. Its etiology is complex and involves the interaction of various infectious, nutritional, immunological, environmental and managerial factors. The main clinical signs are diarrhea, progressive dehydration, metabolic acidosis, electrolyte imbalance and negative energy balance with or without hypoglycemia, which if left untreated, results in death of the animal. Escherichia coli stands as an important enteropathogen involved in diarrheal syndrome. Pathogenic E. coli strains are classified into groups or pathotypes based on the production of virulence factors and on the mechanisms by which they cause diarrhea. There are five E. coli pathotypes associated with diarrhea in calves: enterotoxigenic E. coli (ETEC), enteropathogenic E. coli (EPEC), enterohemorrhagic E. coli (EHEC), Shiga toxin - producing E. coli (STEC) and necrotoxigenic E. coli (NTEC). In this article, we present the main characteristics and an update on E. coli pathotypes causing calf diarrhea.(AU)

Patotipos de Escherichia coli causadores de diarreia em bezerros: uma atualização / Escherichia coli pathotypes associated with diarrhea in calves: an update

A diarreia é uma das doenças mais frequentes de bezerros com até 30 dias de idade e é uma importante causa de perdas econômicas. Sua etiologia é complexa e envolve a interação de diversos fatores infecciosos, nutricionais, imunológicos, gerenciais e ambientais. Os principais sinais clínicos são a diarreia, desidratação progressiva, acidose metabólica, desequilíbrio de eletrólitos e balanço energético negativo com ou sem hipoglicemia, que se não tratados, levam à morte do animal. Escherichia coli se destaca como um importante enteropatógeno envolvido na síndrome diarreica. Cepas de E. coli patogênicas são classificadas em grupos ou patotipos, de acordo com a produção de fatores de virulência e mecanismos pelos quais causam doença. Já foram identificados cinco patotipos de E. coli associados à diarreia em bezerros: E. coli enterotoxigênica (ETEC), E. coli enteropatogênica (EPEC), E. coli enterohemorrágica (EHEC), E. coli produtora de toxina Shiga (STEC) e E. coli necrotoxigênica (NTEC). Nesse artigo apresentamos as principais características e os atuais conhecimentos sobre os patotipos de E. coli causadores de diarreia em bezerros...

Diarrhea is one of the most frequent diseases in calves up to 30 days of age and is a major cause of economic losses. Its etiology is complex and involves the interaction of various infectious, nutritional, immunological, environmental and managerial factors. The main clinical signs are diarrhea, progressive dehydration, metabolic acidosis, electrolyte imbalance and negative energy balance with or without hypoglycemia, which if left untreated, results in death of the animal. Escherichia coli stands as an important enteropathogen involved in diarrheal syndrome. Pathogenic E. coli strains are classified into groups or pathotypes based on the production of virulence factors and on the mechanisms by which they cause diarrhea. There are five E. coli pathotypes associated with diarrhea in calves: enterotoxigenic E. coli (ETEC), enteropathogenic E. coli (EPEC), enterohemorrhagic E. coli (EHEC), Shiga toxin - producing E. coli (STEC) and necrotoxigenic E. coli (NTEC). In this article, we present the main characteristics and an update on E. coli pathotypes causing calf diarrhea...

Transmissão semente-plântula de colletotrichum lindemuthinum em feijão (phaseolus vulgaris)

ABSTRACT Anthracnose is a disease that attacks the bean crop (Phaseolus vulgaris) and if not previously controlled results in losses of up to 100%. The objective of this study was to verify possible differences in seedplant transmission rates among races 65, 73 and 81 of Colletotrichum lindemuthianum isolated from bean seeds of the Lider cultivar. The seeds were inoculated by the water restriction technique in Mathurs medium modified with sucrose at the osmotic potential 1.0 Mpa. One hundred infected seeds were sowed for each race, divided in 4 repetitions of 25 seeds per tray. Non-inoculated seeds were used as the control. The length of the individual plants was observed as well as the dry weight of each plot. The results indicate that there are differences in the transmission rates among races of C. lindemuthianum. The transmission rates were 75.85, 80.68 and 70.51% respectively for the races 65, 73 and 81. Infected plants showed smaller length of the root system without showing differences in the size of the aerial part nor in dry weight, in relation to the control.

RESUMO A antracnose é uma doença que ataca a cultura do feijoeiro (Phaseolus vulgaris) resultando em perdas que podem chegar 100% em uma lavoura, se esta não for controlada previamente. O objetivo deste estudo foi verificar possíveis diferenças em taxas de transmissão semente-plântula entre as raças 65, 73 e 81 do fungo Colletotrichum lindemuthianum isoladas de sementes de feijão, do cultivar Líder, pertencente à classe branco. As sementes foram inoculadas por meio de restrição hídrica no meio Mathur, modificado osmoticamente com sacarose no potencial osmótico de -1,0 Mpa. Foram semeadas 100 sementes infectadas com cada raça, divididas em quatro repetições de 25 sementes por bandeja, usando como testemunha sementes não inoculadas artificialmente. O comprimento das plântulas foi individualmente observado assim como o peso seco de cada parcela. Os resultados indicam que existem diferenças nas taxas de transmissão entre as raças de C. lindemuthianum. As taxas de transmissão foram de 75,85; 80,68 e 70,51%, para as raças 65, 73 e 81, respectivamente. As plântulas infectadas apresentaram menor comprimento do sistema radicular, porém, não demonstraram diferenças em tamanho de parte aérea e peso seco, em relação à testemunha. Conclui-se que o fungo C. lindemuthianum apresenta taxas de transmissão sementeplanta que variam de 70 a 80% e o patógeno, independentemente de raças, pode interferir negativamente no sistema radicular de Phaseolus vulgaris.