First steps to study the demography of vascular epiphytes in cities / Primeiros passos para estudar a demografia de epífitas vasculares em cidades

Urban ecosystems could jeopardize the existence of vascular epiphytes (VE) given that their occurrence is linked to phorophyte availability and particular climatic conditions. Despite reports of VE in cities, nothing is known about their demography. A first step in this direction is to describe their population structures (PS). We established the PS of VE present in urban parks in Oaxaca City (Mexico), addressing the following questions: 1) what is their demographic status? and 2) are there differences in the structure of populations growing in native versus exotic phorophytes? During 2021, we censused all the trees in six urban parks, recording their origin (native or exotic), the epiphytic species found on them and the development stages present in each VE population. Overall, five VE species were documented: Tillandsia ionantha, T. makoyana, T. sp., T. schiedeana and T. recurvata (Bromeliaceae); the first three with only one individual and the latter two with 95 and 5,694, respectively. A MANOVA test indicated significant differences in PS between T. recurvata (type I structure, suggesting a growing population) and T. schiedeana (type III structure, suggesting a senile population) (Wilkes' λ= 0.821, F-Radio= 11.96 P<0.001). PS showed no differences related to tree origin. Our results indicate that it is necessary to conduct demographic studies to have a more accurate idea of the current condition of vascular epiphytes in cities. For instance, even though we found five VS species, only one of them seems to have viable populations in Oaxaca city.

Ecossistemas urbanos podem comprometer a existência de epífitas vasculares (EV), dado que sua ocorrência está ligada à disponibilidade de forófitos e condições climáticas particulares. Apesar dos relatos de EV nas cidades, nada se sabe sobre sua demografia. Um primeiro passo nessa direção é descrever suas estruturas populacionais (PS). Estabelecemos o PS dos EV presentes nos parques urbanos da cidade de Oaxaca (Mexico), abordando as seguintes questões: 1) qual é a sua situação demográfica? e 2) existem diferenças na estrutura das populações crescendo em forófitos nativos versus exóticos? Durante o ano de 2021, realizamos o censo de todas as árvores em seis parques urbanos, registrando sua origem (nativa ou exótica), as espécies epífitas encontradas nelas e os estágios de desenvolvimento presentes em cada população de EV. Ao todo, cinco espécies de EV foram documentadas: Tillandsia ionantha, T. makoyana, T. sp, T. recurvata e T. schiedeana; as três primeiras com apenas um indivíduo e as duas últimas com 5.694 e 95, respectivamente. Um teste MANOVA indicou diferenças significativas no PS entre T. recurvata (estrutura tipo I, sugerindo uma população crescente) e T. schiedeana (estrutura tipo III, sugerindo uma população senil) (Wilkes' λ= 0,821, F-Radio= 11,96 e P < 0,001). PS não apresentou diferenças relacionadas à origem da árvore. Os resultados do presente trabalho indicam a necessidade de se realizar estudos demográficos para se ter uma ideia mais precisa da condição atual das epífitas vasculares nas cidades. Embora tenhamos encontrado cinco espécies de VS, apenas uma delas parece ter populações viáveis na cidade de Oaxaca.

Genetic structure and diversity in Neochen jubata (Aves: Anatidae) from the Araguaia River, GO, Brazil / Estrutura populacional e diversidade genética de Neochen jubata (Aves: Anatidae) no rio Araguaia, GO, Brasil

Abstract: The Orinoco Goose (Neochen jubata) is a few-known and endemic Anatidae to South America, inhabiting sandy beaches along medium and large rivers, with a well-developed riparian forest and in swamp savannas and large freshwater baths. Recent data indicate the presence of longitudinal migratory behavior, and despite them, there are no records on the genetic profile of this species. The Araguaia River region, in the municipality of Luiz Alves, Goiás, receives an undetermined number of ducks seasonally, and there is little information about the individuals who visit this place, constituting the ideal scenario for a study able to offer a genetic overview perspective of this species and to understand the relationship between these individuals better. For this, we genetically characterized 61 individuals sampled in three distinct years of collection using microsatellite molecular markers and mitochondrial DNA. Genetic diversity analyses revealed low levels of heterozygosity for all sampled groups. However, they are within the equilibrium proposed by Hardy-Weinberg (HWE), as inbreeding or drift are not acting in these groups. The parentage analysis supports it, showing a high number of unrelated individuals over the years. AMOVA showed a significant difference among groups. These results may reflect the structure of this migratory species in that region, with the paired differentiation test of individuals from 2013 and 2014 being more similar to each other than those from other years, indicating a possible genetic structure diagnosed by the years of capture. However, there is a high allelic sharing among the three sampled groups, suggesting that these individuals are a population that connects over time and that they have a philopatric relationship with the location. The results found in this study constitute an initial milestone for the genetic knowledge of the mallard duck that should be raised in many other genetic studies.

Resumo: O ganso-do-orinoco (Neochen jubata) é um anatídeo endêmico da América do Sul, cujo habitat são praias arenosas ao longo de rios médios e grandes, com uma vegetação ripária bem desenvolvida e em savanas do pântano com extensos banhados de água doce. Dados recentes indicam a presença de comportamento migratório longitudinal e, apesar destes, não existem registros sobre o perfil genético dessa espécie. A região do rio Araguaia, no município de Luiz Alves, Goiás, recebe um número indeterminado de patos sazonalmente e há poucas informações sobre os indivíduos que visitam este local, constituindo o cenário ideal para um estudo capaz de oferecer uma perspectiva genética geral dessa espécie e também de entender melhor a relação de parentesco entre esses indivíduos. Para tal, caracterizamos geneticamente 60 indivíduos amostrados em três anos distintos de coleta, utilizando marcadores moleculares microssatélites e DNA mitocondrial. As análises de diversidade genética revelaram baixos níveis de heterozigosidade para todos os grupos amostrados. No entanto, eles estão dentro do Equilíbrio proposto por Hardy-Weinberg (HWE), pois a consanguinidade ou a deriva não estão atuando nesses grupos, a análise de parentesco apoia este resultado indicando um alto número de indivíduos não relacionados ao longo dos anos. A AMOVA apresentou diferença significativa entre os grupos. Esses resultados podem refletir a estrutura dessa espécie migratória naquela região, com o teste de diferenciação pareada de indivíduos de 2013 e 2014 sendo mais semelhantes entre si do que os de outros anos, indicando uma possível estruturação genética diagnosticada pelos anos de captura. No entanto, há um alto compartilhamento alélico entre os três grupos amostrados sugerindo que esses indivíduos são uma população que se conecta ao longo do tempo e que têm uma relação filopátrica com o local. Os resultados aqui encontrados constituem um marco inicial para o conhecimento genético do ganso-do-orinoco que contribuirá para novos estudos sobre esta espécie considerada "quase ameaçada" pela IUCN.

Evaluation of the Romosinuano cattle population structure in Mexico using pedigree analysis / Evaluación de la estructura poblacional de bovinos Romosinuano en México mediante el análisis de pedigrí / Avaliação da estrutura populacional de bovinos Romosinuano no México usando análise de pedigree

Abstract Background: Romosinuano cattle breed in Mexico has endured isolation and it is necessary to characterize it in order to facilitate sustainable genetic management. Objective: To assess the evolution of the structure and genetic diversity of the Romosinuano breed in Mexico, through pedigree analysis. Methods: Pedigree data was obtained from Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). The ENDOG program (4.8 version) was used to analyze two datasets, one that includes upgrading from F1 animals (UP) and the other with only straight-bred cattle (SP). For both datasets, three reference populations were defined: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2), and 2010-2017 (RP3). The pedigree included 3,432 animals in UP and 1,518 in SP. Demographic parameters were: Generation interval (GI), equivalent number of generations (EG), pedigree completeness index (PCI), and gene flow among herds. Genetic parameters were: Inbreeding (F) and average relatedness (AR) coefficients, effective population size (Nec), effective number of founders and ancestors, and number of founder genome equivalents. Results: The GI varied from 6.10 to 6.54 for UP, and from 6.47 to 7.16 yr for SP. The EG of the UP and SP improved >63% from RP1 to RP3. The PCI increased over time. No nucleus or isolated herds were found. For RP3, F and AR reached 2.08 and 5.12% in the UP, and 2.55 and 5.94% in the SP. For RP3, Nec was 57 in the UP and 45 in the SP. Genetic diversity losses were attributed mainly (>66%) to genetic drift, except for RP3 in the SP (44%). Conclusions: A reduction of the genetic diversity has been occurring after the Romosinuano breed association was established in Mexico, and this is mainly due to random loss of genes.

Resumen Antecedentes: La raza bovina Romosinuano ha estado prácticamente aislada en México y requiere ser caracterizada para un manejo genético sostenible. Objetivo: Evaluar la evolución de la estructura y diversidad genética de la raza Romosinuano en México, mediante el análisis del pedigrí. Métodos: Los datos genealógicos provinieron de la Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). Los análisis se realizaron con el programa ENDOG (versión 4.8) para dos bases de datos, una que incluyó animales en cruzamiento absorbente (UP) a partir de F1 y la otra con sólo animales puros (SP). Para ambas bases de datos se definieron tres poblaciones de referencia: 1998-2003 (RP1), 2004- 2009 (RP2), y 2010-2017 (RP3). El pedigrí incluyó 3.432 animales en la UP y 1.518 en la SP. Los parámetros demográficos fueron: intervalo generacional (GI), número de generaciones equivalentes (EG), índice de completitud del pedigrí (PCI), y flujo de genes entre hatos. Los parámetros genéticos fueron: coeficientes de consanguinidad (F) y de relación genética aditiva (AR), tamaño efectivo de la población (Nec), número efectivo de fundadores y ancestros, y número equivalente de genomas fundadores. Resultados: El GI varió de 6,10 a 6,54 para la UP, y de 6,47 a 7,16 años para la SP. El EG de la UP y la SP mejoró >63%, de RP1 a RP3. El PCI aumentó a través de los años, pero más para la SP que para la UP. No se encontraron hatos núcleo o aislados. Para RP3, F y AR alcanzaron 2,08 y 5,12% en la UP, y 2,55 y 5,94% en la SP. Para RP3, Nec fue 57 en la UP y 45 en la SP. Más de 66% de las pérdidas en diversidad genética se debieron a deriva genética, excepto para RP3 en la UP (44%). Conclusiones: una reducción de la diversidad genética ha estado ocurriendo después de que se formó la asociación de criadores de ganado Romosinuano en México, y es debida principalmente a pérdidas aleatorias de genes.

Resumo Antecedentes: A raça bovina Romosinuano tem estado praticamente isolada no México e precisa ser caracterizada para um manejo genético sustentável. Objetivo: Avaliar a evolução da estrutura e diversidade genética da raça Romosinuano no México, através da análise de pedigree. Métodos: Os dados genealógicos vieram da Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Lechero Tropical (AMCROLET). As análises foram feitas com o programa ENDOG (versão 4.8) para duas bases de dados, uma que incluiu animais em cruzamento absorvente (UP) a partir da F1 e a outra base de dados somente com animais puros (SP). Para ambas bases de dados foram definidas três populações de referência: 1998-2003 (RP1), 2004-2009 (RP2) e 2010-2017 (RP3). O pedigree incluiu 3.432 animais na UP e 1.518 na SP. Os parâmetros demográficos foram: intervalo entre gerações (GI), número de gerações equivalentes (EG), índice de completude do pedigree (PCI), e fluxo de genes entre rebanhos. Os parâmetros genéticos foram: coeficiente de consanguinidade (F) e da relação genética aditiva (AR), tamanho efetivo da população (Nec), número efetivo de fundadores e ancestrais, e número equivalente de genomas fundadores. Resultados: O GI variou de 6,10 a 6,54 para a UP, e de 6,47 a 7,16 anos para a SP. EG da UP e a SP melhorou >63%, de RP1 a RP3. O PCI aumentou ao longo dos anos, mas mais para a SP do que para o UP. Não se encontraram rebanhos núcleo ou isolados. Para RP3, F e AR alcançaram 2,08 e 5,12% na UP, e 2,55 e 5,94% na SP. Para RP3, Nec foi 57 na UP e 45 na SP. Mais de 66% das perdas em diversidade genética foram ocasionadas pela deriva genética, exceto para RP3 no UP (44%). Conclusões: Depois que a associação da raça Romosinuano foi estabelecida no México, tem ocorrido uma redução da diversidade genética, principalmente devido a perdas aleatórias de genes.

Life-history traits of Farlowella hahni (Siluriformes, Loricariidae) in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin / Traços de história de vida de Farlowella hahni (Siluriformes, Loricariidae) em riachos da Bacia do rio Ivinhema, Bacia do alto Paraná

Abstract Brazilian laws allow the catch of some species as ornamental fish; however, in the absence of biological information, such catch can threaten species conservation. Therefore, this study aimed to offer population and reproductive information about Farlowella hahni in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin. To accomplish this, a total of 165 F. hahni individuals were analyzed, including 109 females and 48 males, resulting in an important sex ratio difference from 1:1 (χ 2=19.97; p<0.001), indicating a predominance of females throughout the year. Females reach higher standard length than males. Males presented isometric Length-Weight Relationships, while females have positive allometric growth. Gonadosomatic index presented higher values from October through December. The mean fecundity was 100.3±36.4 of vitellogenic oocytes and was positively correlated with standard length (r=0.51; p=0.01). The data presented herein are the first for this species and suggest a need to carefully manage the F. hahni population, considering its low abundance and fecundity.

Resumo As leis brasileiras permitem a captura de algumas espécies de peixes como ornamentais, no entanto, a ausência de informações biológicas pode tornar esta captura uma ameaça para a conservação destas espécies. Este estudo teve como objetivo oferecer informações populacionais e reprodutivas sobre Farlowella hahni em riachos da Bacia do rio Ivinhema, bacia do Alto Paraná. Um total de 165 indivíduos de F. hahni foi analisado, sendo 109 fêmeas e 48 machos. A proporção de sexo foi diferente de 1:1 (χ2=19,97; p<0,001), com predominância de fêmeas ao longo do ano. As fêmeas atingiram maior comprimento padrão do que os machos. Os machos apresentaram crescimento isométrico e as fêmeas crescimento alométrico positivo. O índice gonadossomático apresentou maiores valores de Outubro a Dezembro. A fecundidade média foi de 100,3±36,4 de ovócitos vitelogênicos e foi correlacionada positivamente com o comprimento padrão (r=0,51; p=0,01). Os dados apresentados são os primeiros para essa espécie e sugerem a necessidade de cuidados no manejo da população de F. hahni considerando baixa abundância e fecundidade.

Abundance and population structure of Plesionika narval (Fabricius, 1787) in the Northeastern Atlantic / Abundância e estrutura populacional de Plesionika narval (Fabricius, 1787) no Atlântico Nordeste

Abstract Analysis of abundance and population structure of Plesionika narval was performed on data concerning 5,255 specimens obtained from 62 fishing sets carried out off the Madeira archipelago (Northeastern Atlantic) between 2004 and 2008 in a depth range from 101 to 350 m. Abundance ranged from 0.01 to 19.74 specimens-per-trap and significant differences were found between seasons, probably as a result of an increment of population in the spring during the recruitment season. The analysis of size distribution revealed that the carapace length (CL) ranged from 2.45 to 28.61 mm and that mean female size consistently exceeded that of males. Differences in mean CL were statistically significant between depth strata and seasons. Of the specimens sampled, 57.00% were males, 41.88% females and 1.42% undetermined. Sex ratio also differed significantly between seasons according to depth strata, consolidating the hypothesis of the existence of seasonal migrations related with the reproductive cycle of this species. Ovigerous females showed larger sizes and occurred all year around and remain in shallow waters in winter, summer and autumn and move to deeper waters in spring. The highest frequency of ovigerous females was recorded in summer, between 151 and 200 m deep supporting the hypothesis that spawning of this species occurs in shallow waters, especially in late summer.

Resumo O estudo de abundância e dinâmica populacional de Plesionika narval foi efetuado com 5.255 espécimes provenientes de 62 lances de pesca realizados ao largo do arquipélago da Madeira (Atlântico Nordeste) de 2004 a 2008 entre 101 e 350 m de profundidade. A abundância oscilou entre 0,01 e 19,74 espécimes-por-armadilha com diferenças significativas entre estações provavelmente devido ao aumento da população na primavera durante o período de recrutamento. A análise da distribuição de tamanhos revelou que o comprimento da carapaça (CL) variou entre 2,45 e 28,61 mm e que o tamanho médio das fêmeas excedeu o dos machos. Verificaram-se diferenças significativas no CL médio entre estrato de profundidade e estação. Do total amostrado, 57,00% foram machos, 41,88% fêmeas e 1,42% indeterminados. A razão de sexos também diferiu significativamente entre estações de acordo com a profundidade, consolidando a hipótese da existência de migrações sazonais relacionadas com o ciclo reprodutivo desta espécie. As fêmeas ovadas apresentaram maiores tamanhos e ocorreram durante todo o ano permanecendo em águas pouco profundas no inverno, verão e outono e migrando para águas profundas na primavera. A maior frequência de fêmeas ovadas foi registada no verão, entre 151 e 200 m de profundidade reforçando a hipótese de que a desova desta espécie ocorre em águas menos profundas, especialmente no final do verão.

Estrutura populacional de Drimys angustifolia Miers em um fragmento de Floresta Ombrófila Mista Alto-Montana, Urubici, SC / Population structure of Drimys angustifolia Miers in a fragment of Upper Montane Mixed Ombrophilous Forest, Urubici, SC

O presente estudo teve como objetivo caracterizar a estrutura populacional da espécie arbórea mais abundante em um fragmento de Floresta Ombrófila Mista Alto-Montana em Urubici, Santa Catarina, assim como determinar sua capacidade de regeneração natural na área desmatada adjacente ao fragmento florestal. Para a detecção da espécie mais abundante, foi realizado um levantamento florístico-estrutural no fragmento florestal, por meio da alocação de parcelas, onde todos os indivíduos com diâmetro a altura do peito (DAP) 5 cm foram considerados adultos e inventariados. Para determinar a capacidade de regeneração natural da espécie selecionada na área desmatada adjacente, foram alocadas parcelas, onde os indivíduos considerados como regenerantes (20 cm de altura até 5 cm de DAP) foram amostrados, nos anos de 2014 e 2016. Foi analisada a estrutura diamétrica e a distribuição espacial dos indivíduos adultos da espécie, e a estrutura hipsométrica, espacial e dinâmica dos indivíduos regenerantes. A espécie mais abundante no fragmento foi Drimys angustifolia Miers, que representou 26,4% dos indivíduos. A estrutura populacional dessa espécie obteve distribuição diamétrica tendendo à normalidade e distribuição espacial aleatória para os indivíduos adultos. O componente regenerante apresentou padrão de distribuição espacial agregado (2016) e distribuição hipsométrica normal somente em 2016...(AU)

The present study had as objective to characterize the population structure of the most abundant arboreal species in a fragment of Upper Montane Mixed Ombrophilous Forest in Urubici, Santa Catarina, as well as determining the natural capacity of regeneration in the deforested area adjacent to the forest fragment. To detect the most abundant species, was realized a structural-floristic survey in the forest fragment, through the allocation of plots, in which all individuals with diameter at breast height (DBH) 5 cm were considered adults and inventoried. To determine the natural capacity of regeneration of the selected species in the deforested adjacent area, were allocated plots, where the individuals classified as regenerating (20 cm of height to 5 cm of DAP) was sampled, in the years of 2014 and 2016. It was analyzed the diametric structure and the spatial distribution of the adults individuals of the specie, and the hypsometric, spatial structures and dynamic of the regenerating individuals. Drimys angustifolia Miers was the most abundant species in the fragment, which represented 26.4% of the individuals. The population structure for this species obtained a diametric distribution tending to normality and random spatial distribution for the adults individuals. The regenerated component presented an aggregated spatial distribution pattern (2016) and normal hypsometrical...(AU)

Abundance and population structure of Plesionika narval (Fabricius, 1787) in the Northeastern Atlantic / Abundância e estrutura populacional de Plesionika narval (Fabricius, 1787) no Atlântico Nordeste

Analysis of abundance and population structure of Plesionika narval was performed on data concerning 5,255 specimens obtained from 62 fishing sets carried out off the Madeira archipelago (Northeastern Atlantic) between 2004 and 2008 in a depth range from 101 to 350 m. Abundance ranged from 0.01 to 19.74 specimens-per-trap and significant differences were found between seasons, probably as a result of an increment of population in the spring during the recruitment season. The analysis of size distribution revealed that the carapace length (CL) ranged from 2.45 to 28.61 mm and that mean female size consistently exceeded that of males. Differences in mean CL were statistically significant between depth strata and seasons. Of the specimens sampled, 57.00% were males, 41.88% females and 1.42% undetermined. Sex ratio also differed significantly between seasons according to depth strata, consolidating the hypothesis of the existence of seasonal migrations related with the reproductive cycle of this species. Ovigerous females showed larger sizes and occurred all year around and remain in shallow waters in winter, summer and autumn and move to deeper waters in spring. The highest frequency of ovigerous females was recorded in summer, between 151 and 200 m deep supporting the hypothesis that spawning of this species occurs in shallow waters, especially in late summer.(AU)

O estudo de abundância e dinâmica populacional de Plesionika narval foi efetuado com 5.255 espécimes provenientes de 62 lances de pesca realizados ao largo do arquipélago da Madeira (Atlântico Nordeste) de 2004 a 2008 entre 101 e 350 m de profundidade. A abundância oscilou entre 0,01 e 19,74 espécimes-por-armadilha com diferenças significativas entre estações provavelmente devido ao aumento da população na primavera durante o período de recrutamento. A análise da distribuição de tamanhos revelou que o comprimento da carapaça (CL) variou entre 2,45 e 28,61 mm e que o tamanho médio das fêmeas excedeu o dos machos. Verificaram-se diferenças significativas no CL médio entre estrato de profundidade e estação. Do total amostrado, 57,00% foram machos, 41,88% fêmeas e 1,42% indeterminados. A razão de sexos também diferiu significativamente entre estações de acordo com a profundidade, consolidando a hipótese da existência de migrações sazonais relacionadas com o ciclo reprodutivo desta espécie. As fêmeas ovadas apresentaram maiores tamanhos e ocorreram durante todo o ano permanecendo em águas pouco profundas no inverno, verão e outono e migrando para águas profundas na primavera. A maior frequência de fêmeas ovadas foi registada no verão, entre 151 e 200 m de profundidade reforçando a hipótese de que a desova desta espécie ocorre em águas menos profundas, especialmente no final do verão.(AU)

Life-history traits of Farlowella hahni (Siluriformes, Loricariidae) in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin / Traços de história de vida de Farlowella hahni (Siluriformes, Loricariidae) em riachos da Bacia do rio Ivinhema, Bacia do alto Paraná

Brazilian laws allow the catch of some species as ornamental fish; however, in the absence of biological information, such catch can threaten species conservation. Therefore, this study aimed to offer population and reproductive information about Farlowella hahni in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin. To accomplish this, a total of 165 F. hahni individuals were analyzed, including 109 females and 48 males, resulting in an important sex ratio difference from 1:1 ( 2=19.97; p 0.001), indicating a predominance of females throughout the year. Females reach higher standard length than males. Males presented isometric Length-Weight Relationships, while females have positive allometric growth. Gonadosomatic index presented higher values from October through December. The mean fecundity was 100.3±36.4 of vitellogenic oocytes and was positively correlated with standard length (r=0.51; p=0.01). The data presented herein are the first for this species and suggest a need to carefully manage the F. hahni population, considering its low abundance and fecundity.(AU)

As leis brasileiras permitem a captura de algumas espécies de peixes como ornamentais, no entanto, a ausência de informações biológicas pode tornar esta captura uma ameaça para a conservação destas espécies. Este estudo teve como objetivo oferecer informações populacionais e reprodutivas sobre Farlowella hahni em riachos da Bacia do rio Ivinhema, bacia do Alto Paraná. Um total de 165 indivíduos de F. hahni foi analisado, sendo 109 fêmeas e 48 machos. A proporção de sexo foi diferente de 1:1 (2=19,97; p 0,001), com predominância de fêmeas ao longo do ano. As fêmeas atingiram maior comprimento padrão do que os machos. Os machos apresentaram crescimento isométrico e as fêmeas crescimento alométrico positivo. O índice gonadossomático apresentou maiores valores de Outubro a Dezembro. A fecundidade média foi de 100,3±36,4 de ovócitos vitelogênicos e foi correlacionada positivamente com o comprimento padrão (r=0,51; p=0,01). Os dados apresentados são os primeiros para essa espécie e sugerem a necessidade de cuidados no manejo da população de F. hahni considerando baixa abundância e fecundidade.(AU)

Estrutura populacional de Drimys angustifolia Miers em um fragmento de Floresta Ombrófila Mista Alto-Montana, Urubici, SC / Population structure of Drimys angustifolia Miers in a fragment of Upper Montane Mixed Ombrophilous Forest, Urubici, SC

O presente estudo teve como objetivo caracterizar a estrutura populacional da espécie arbórea mais abundante em um fragmento de Floresta Ombrófila Mista Alto-Montana em Urubici, Santa Catarina, assim como determinar sua capacidade de regeneração natural na área desmatada adjacente ao fragmento florestal. Para a detecção da espécie mais abundante, foi realizado um levantamento florístico-estrutural no fragmento florestal, por meio da alocação de parcelas, onde todos os indivíduos com diâmetro a altura do peito (DAP) 5 cm foram considerados adultos e inventariados. Para determinar a capacidade de regeneração natural da espécie selecionada na área desmatada adjacente, foram alocadas parcelas, onde os indivíduos considerados como regenerantes (20 cm de altura até 5 cm de DAP) foram amostrados, nos anos de 2014 e 2016. Foi analisada a estrutura diamétrica e a distribuição espacial dos indivíduos adultos da espécie, e a estrutura hipsométrica, espacial e dinâmica dos indivíduos regenerantes. A espécie mais abundante no fragmento foi Drimys angustifolia Miers, que representou 26,4% dos indivíduos. A estrutura populacional dessa espécie obteve distribuição diamétrica tendendo à normalidade e distribuição espacial aleatória para os indivíduos adultos. O componente regenerante apresentou padrão de distribuição espacial agregado (2016) e distribuição hipsométrica normal somente em 2016...

The present study had as objective to characterize the population structure of the most abundant arboreal species in a fragment of Upper Montane Mixed Ombrophilous Forest in Urubici, Santa Catarina, as well as determining the natural capacity of regeneration in the deforested area adjacent to the forest fragment. To detect the most abundant species, was realized a structural-floristic survey in the forest fragment, through the allocation of plots, in which all individuals with diameter at breast height (DBH) 5 cm were considered adults and inventoried. To determine the natural capacity of regeneration of the selected species in the deforested adjacent area, were allocated plots, where the individuals classified as regenerating (20 cm of height to 5 cm of DAP) was sampled, in the years of 2014 and 2016. It was analyzed the diametric structure and the spatial distribution of the adults individuals of the specie, and the hypsometric, spatial structures and dynamic of the regenerating individuals. Drimys angustifolia Miers was the most abundant species in the fragment, which represented 26.4% of the individuals. The population structure for this species obtained a diametric distribution tending to normality and random spatial distribution for the adults individuals. The regenerated component presented an aggregated spatial distribution pattern (2016) and normal hypsometrical...

Population structure of Chinese southwest wheat germplasms resistant to stripe rust and powdery mildew using the DArT-seq technique / População de germoplasmas resistentes de trigo empregando a técnica de sequenciamento Dart-seq

Understanding genetic variability in existing wheat accessions is critical for collection, conservation and use of wheat germplasms. In this study, 138 Chinese southwest wheat accessions were investigated by genotyping using two resistance gene makers (Pm21 and Yr26) and DArT-seq technique. Finally, about 50% cultivars (lines) amplified the specific allele for the Yr26 gene (Gwm11) and 40.6% for the Pm21 gene (SCAR1265). By DArT-seq analysis, 30,485 markers (6486 SNPs and 23999 DArTs) were obtained with mean polymorphic information content (PIC) value 0.33 and 0.28 for DArT and SNP marker, respectively. The mean Dice genetic similarity coefficient (GS) was 0.72. Two consistent groups of wheat varieties were identified using principal coordinate analysis (PCoA) at the level of both the chromosome 6AS and the whole-genome, respectively. Group I was composed of non-6VS/6AL translocation lines of different origins, while Group II was composed of 6VS/6AL translocation (T6VS/6AL) lines, most of which carried the Yr26 and Pm21 genes and originated from Guizhou. Besides, a model-based population structure analysis revealed extensive admixture and further divided these wheat accessions into six subgroups (SG1, SG2, SG3, SG4, SG5 and SG6), based on their origin, pedigree or disease resistance. This information is useful for wheat breeding in southwestern China and association mapping for disease resistance using these wheat germplasms in future.(AU)

O conhecimento da estrutura da população é essencial para o mapeamento de associação de resistência a doenças para a população de trigo. Neste estudo, a técnica de DART-seq™ foi usada para genotipar o genoma inteiro de cultivares de trigo. Finalmente, 30,485 marcadores (6486 SNPs e 23999 dardos) foram obtidos, e dois grupos de variedades de trigo foram identificados por meio de análise principal-coordenadas (PCoA) do nível de todo o genoma e o nível 6AS cromossomo. O grupo I foi composto por linhas não T6VS/6Al de diferentes origens, enquanto o Grupo II foi composto de linhas T6VS/6Al, sendo que da maioria destes realizados os genes Yr26 e PM21 originários de Guizhou.(AU)

Abundance and population structure of Plesionika narval (Fabricius, 1787) in the Northeastern Atlantic

Abstract Analysis of abundance and population structure of Plesionika narval was performed on data concerning 5,255 specimens obtained from 62 fishing sets carried out off the Madeira archipelago (Northeastern Atlantic) between 2004 and 2008 in a depth range from 101 to 350 m. Abundance ranged from 0.01 to 19.74 specimens-per-trap and significant differences were found between seasons, probably as a result of an increment of population in the spring during the recruitment season. The analysis of size distribution revealed that the carapace length (CL) ranged from 2.45 to 28.61 mm and that mean female size consistently exceeded that of males. Differences in mean CL were statistically significant between depth strata and seasons. Of the specimens sampled, 57.00% were males, 41.88% females and 1.42% undetermined. Sex ratio also differed significantly between seasons according to depth strata, consolidating the hypothesis of the existence of seasonal migrations related with the reproductive cycle of this species. Ovigerous females showed larger sizes and occurred all year around and remain in shallow waters in winter, summer and autumn and move to deeper waters in spring. The highest frequency of ovigerous females was recorded in summer, between 151 and 200 m deep supporting the hypothesis that spawning of this species occurs in shallow waters, especially in late summer.

Resumo O estudo de abundância e dinâmica populacional de Plesionika narval foi efetuado com 5.255 espécimes provenientes de 62 lances de pesca realizados ao largo do arquipélago da Madeira (Atlântico Nordeste) de 2004 a 2008 entre 101 e 350 m de profundidade. A abundância oscilou entre 0,01 e 19,74 espécimes-por-armadilha com diferenças significativas entre estações provavelmente devido ao aumento da população na primavera durante o período de recrutamento. A análise da distribuição de tamanhos revelou que o comprimento da carapaça (CL) variou entre 2,45 e 28,61 mm e que o tamanho médio das fêmeas excedeu o dos machos. Verificaram-se diferenças significativas no CL médio entre estrato de profundidade e estação. Do total amostrado, 57,00% foram machos, 41,88% fêmeas e 1,42% indeterminados. A razão de sexos também diferiu significativamente entre estações de acordo com a profundidade, consolidando a hipótese da existência de migrações sazonais relacionadas com o ciclo reprodutivo desta espécie. As fêmeas ovadas apresentaram maiores tamanhos e ocorreram durante todo o ano permanecendo em águas pouco profundas no inverno, verão e outono e migrando para águas profundas na primavera. A maior frequência de fêmeas ovadas foi registada no verão, entre 151 e 200 m de profundidade reforçando a hipótese de que a desova desta espécie ocorre em águas menos profundas, especialmente no final do verão.

A influência de um sangradouro na distribuição espaço-temporal do isópode Tholozodium rhombofrontalis (Isopoda, Sphaeromatidae)

The permanent freshwater discharges in sandy beaches, known as washouts, promotes changes in different spatial and temporal scales on the environmental characteristics, and consequently on macrobenthic populations. The aim of this study was to evaluate the changes of abundance, distribution and population structure of the isopod Tholozodium rhombofrontalis (Giambiagi, 1922) in a permanent washout. Seasonal samplings were realized in the Barrancos beach, Pontal do Paraná city, state of Paraná, southern Brazil, in three sites: on the washout (inside washout), intermediate (30 meters away from the washout), and distant (150 meters away from the washout), during four seasons of the years 2012 and 2013. The beach was morphodynamically characterized as an intermediate beach, composed of fine and well sorted sediments. At the washout site the topographic profiles were smoother and longer, and the water table shallowed and fresh. In contrast, in the distant site the profiles were steeper and shorter, and the water table deeper and saline. The intermediate site presented characteristics similar to that of the washout. There was a spatial and temporal variability in the abundance and distribution of the isopod, being the greater abundances in the intermediate and washout sites, with peaks in the spring and summer seasons. These variations were related to the presence of brackish water and high values of chlorophyll a. The juveniles proportion were the higher of all classes, and remained temporally regular, indicating a continuous recruitment. The proportions of females remained similar temporally confirming the population stability. The proportion of males was low at all sites and during all samplings; however, the low representativeness of this class did not negatively affect the establishment of the population. The ovigerous females were present in all sites and in all samplings, with highest proportions in the winter, pointing to a possible preference for a colder season for reproduction. The presence of a permanent washout provided to this beach conditions of estuarine salinities, which possibly favored the establishment of the population.(AU)

As descargas de água doce permanentes em praias arenosas, conhecidas como sangradouros, promovem alterações em diferentes escalas espaciais e temporais sobre as características ambientais, e consequentemente sobre as populações macrobentônicas. O objetivo deste estudo foi avaliar as alterações da abundância, distribuição e estrutura populacional do isópode Tholozodium rhombofrontalis (Giambiagi, 1922) em um sangradouro permanente. Coletas sazonais foram realizadas na praia de Barrancos, cidade de Pontal do Paraná, estado do Paraná, sul do Brasil, em três locais: sangradouro (dentro do sangradouro), intermediário (a 30 m de distância do sangradouro) e distante (a 150 m de distância do sangradouro), durante as quatro estações dos anos de 2012 e 2013. A praia foi morfodinamicamente caracterizada como intermediária, composta de sedimentos finos e bem selecionados. No local sangradouro os perfis topográficos foram suaves e extensos, e o lençol freático raso e doce. Em contrapartida, no local distante os perfis foram íngremes e curtos, e o lençol freático profundo e salino. O local intermediário apresentou características similares ao do sangradouro. Houve uma variabilidade espacial e temporal na abundância e distribuição do isópode, estando as maiores abundâncias nos locais sangradouro e intermediário, com picos nas estações primavera e verão. Tais variações foram relacionadas à presença de águas salobras e altos valores de clorofila a. A proporção de juvenis foi a maior dentre todas as classes, e manteve-se regular temporalmente, indicando um recrutamento contínuo. As proporções de fêmeas mantiveram-se similares temporalmente confirmando a estabilidade da população. A proporção de machos foi baixa em todos os locais e durante todas as coletas, contudo, a baixa representatividade desta classe não afetou negativamente o estabelecimento da população. As fêmeas ovígeras estiveram presentes em todos os locais e em todas as coletas, com as maiores proporções no inverno, apontando uma possível preferência por uma estação mais fria para a reprodução. A presença de um sangradouro permanente proporcionou a esta praia condições de salinidade estuarina, o que possivelmente favoreceu o estabelecimento da população.(AU)

Life-history traits of Farlowella hahni (Siluriformes, Loricariidae) in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin

Abstract Brazilian laws allow the catch of some species as ornamental fish; however, in the absence of biological information, such catch can threaten species conservation. Therefore, this study aimed to offer population and reproductive information about Farlowella hahni in streams of the Ivinhema River Basin, Upper Paraná Basin. To accomplish this, a total of 165 F. hahni individuals were analyzed, including 109 females and 48 males, resulting in an important sex ratio difference from 1:1 ( 2=19.97; p 0.001), indicating a predominance of females throughout the year. Females reach higher standard length than males. Males presented isometric Length-Weight Relationships, while females have positive allometric growth. Gonadosomatic index presented higher values from October through December. The mean fecundity was 100.3±36.4 of vitellogenic oocytes and was positively correlated with standard length (r=0.51; p=0.01). The data presented herein are the first for this species and suggest a need to carefully manage the F. hahni population, considering its low abundance and fecundity.

Resumo As leis brasileiras permitem a captura de algumas espécies de peixes como ornamentais, no entanto, a ausência de informações biológicas pode tornar esta captura uma ameaça para a conservação destas espécies. Este estudo teve como objetivo oferecer informações populacionais e reprodutivas sobre Farlowella hahni em riachos da Bacia do rio Ivinhema, bacia do Alto Paraná. Um total de 165 indivíduos de F. hahni foi analisado, sendo 109 fêmeas e 48 machos. A proporção de sexo foi diferente de 1:1 (2=19,97; p 0,001), com predominância de fêmeas ao longo do ano. As fêmeas atingiram maior comprimento padrão do que os machos. Os machos apresentaram crescimento isométrico e as fêmeas crescimento alométrico positivo. O índice gonadossomático apresentou maiores valores de Outubro a Dezembro. A fecundidade média foi de 100,3±36,4 de ovócitos vitelogênicos e foi correlacionada positivamente com o comprimento padrão (r=0,51; p=0,01). Os dados apresentados são os primeiros para essa espécie e sugerem a necessidade de cuidados no manejo da população de F. hahni considerando baixa abundância e fecundidade.

Population structure of Chinese southwest wheat germplasms resistant to stripe rust and powdery mildew using the DArT-seq technique / População de germoplasmas resistentes de trigo empregando a técnica de sequenciamento Dart-seq

ABSTRACT: Understanding genetic variability in existing wheat accessions is critical for collection, conservation and use of wheat germplasms. In this study, 138 Chinese southwest wheat accessions were investigated by genotyping using two resistance gene makers (Pm21 and Yr26) and DArT-seq technique. Finally, about 50% cultivars (lines) amplified the specific allele for the Yr26 gene (Gwm11) and 40.6% for the Pm21 gene (SCAR1265). By DArT-seq analysis, 30,485 markers (6486 SNPs and 23999 DArTs) were obtained with mean polymorphic information content (PIC) value 0.33 and 0.28 for DArT and SNP marker, respectively. The mean Dice genetic similarity coefficient (GS) was 0.72. Two consistent groups of wheat varieties were identified using principal coordinate analysis (PCoA) at the level of both the chromosome 6AS and the whole-genome, respectively. Group I was composed of non-6VS/6AL translocation lines of different origins, while Group II was composed of 6VS/6AL translocation (T6VS/6AL) lines, most of which carried the Yr26 and Pm21 genes and originated from Guizhou. Besides, a model-based population structure analysis revealed extensive admixture and further divided these wheat accessions into six subgroups (SG1, SG2, SG3, SG4, SG5 and SG6), based on their origin, pedigree or disease resistance. This information is useful for wheat breeding in southwestern China and association mapping for disease resistance using these wheat germplasms in future.

RESUMO: O conhecimento da estrutura da população é essencial para o mapeamento de associação de resistência a doenças para a população de trigo. Neste estudo, a técnica de DART-seq™ foi usada para genotipar o genoma inteiro de cultivares de trigo. Finalmente, 30,485 marcadores (6486 SNPs e 23999 dardos) foram obtidos, e dois grupos de variedades de trigo foram identificados por meio de análise principal-coordenadas (PCoA) do nível de todo o genoma e o nível 6AS cromossomo. O grupo I foi composto por linhas não T6VS/6Al de diferentes origens, enquanto o Grupo II foi composto de linhas T6VS/6Al, sendo que da maioria destes realizados os genes Yr26 e PM21 originários de Guizhou.

Population structure of Chinese southwest wheat germplasms resistant to stripe rust and powdery mildew using the DArT-seq technique / População de germoplasmas resistentes de trigo empregando a técnica de sequenciamento Dart-seq

Understanding genetic variability in existing wheat accessions is critical for collection, conservation and use of wheat germplasms. In this study, 138 Chinese southwest wheat accessions were investigated by genotyping using two resistance gene makers (Pm21 and Yr26) and DArT-seq technique. Finally, about 50% cultivars (lines) amplified the specific allele for the Yr26 gene (Gwm11) and 40.6% for the Pm21 gene (SCAR1265). By DArT-seq analysis, 30,485 markers (6486 SNPs and 23999 DArTs) were obtained with mean polymorphic information content (PIC) value 0.33 and 0.28 for DArT and SNP marker, respectively. The mean Dice genetic similarity coefficient (GS) was 0.72. Two consistent groups of wheat varieties were identified using principal coordinate analysis (PCoA) at the level of both the chromosome 6AS and the whole-genome, respectively. Group I was composed of non-6VS/6AL translocation lines of different origins, while Group II was composed of 6VS/6AL translocation (T6VS/6AL) lines, most of which carried the Yr26 and Pm21 genes and originated from Guizhou. Besides, a model-based population structure analysis revealed extensive admixture and further divided these wheat accessions into six subgroups (SG1, SG2, SG3, SG4, SG5 and SG6), based on their origin, pedigree or disease resistance. This information is useful for wheat breeding in southwestern China and association mapping for disease resistance using these wheat germplasms in future.

O conhecimento da estrutura da população é essencial para o mapeamento de associação de resistência a doenças para a população de trigo. Neste estudo, a técnica de DART-seq™ foi usada para genotipar o genoma inteiro de cultivares de trigo. Finalmente, 30,485 marcadores (6486 SNPs e 23999 dardos) foram obtidos, e dois grupos de variedades de trigo foram identificados por meio de análise principal-coordenadas (PCoA) do nível de todo o genoma e o nível 6AS cromossomo. O grupo I foi composto por linhas não T6VS/6Al de diferentes origens, enquanto o Grupo II foi composto de linhas T6VS/6Al, sendo que da maioria destes realizados os genes Yr26 e PM21 originários de Guizhou.

A influência de um sangradouro na distribuição espaço-temporal do isópode Tholozodium rhombofrontalis (Isopoda, Sphaeromatidae)

The permanent freshwater discharges in sandy beaches, known as washouts, promotes changes in different spatial and temporal scales on the environmental characteristics, and consequently on macrobenthic populations. The aim of this study was to evaluate the changes of abundance, distribution and population structure of the isopod Tholozodium rhombofrontalis (Giambiagi, 1922) in a permanent washout. Seasonal samplings were realized in the Barrancos beach, Pontal do Paraná city, state of Paraná, southern Brazil, in three sites: on the washout (inside washout), intermediate (30 meters away from the washout), and distant (150 meters away from the washout), during four seasons of the years 2012 and 2013. The beach was morphodynamically characterized as an intermediate beach, composed of fine and well sorted sediments. At the washout site the topographic profiles were smoother and longer, and the water table shallowed and fresh. In contrast, in the distant site the profiles were steeper and shorter, and the water table deeper and saline. The intermediate site presented characteristics similar to that of the washout. There was a spatial and temporal variability in the abundance and distribution of the isopod, being the greater abundances in the intermediate and washout sites, with peaks in the spring and summer seasons. These variations were related to the presence of brackish water and high values of chlorophyll a. The juveniles proportion were the higher of all classes, and remained temporally regular, indicating a continuous recruitment. The proportions of females remained similar temporally confirming the population stability. The proportion of males was low at all sites and during all samplings; however, the low representativeness of this class did not negatively affect the establishment of the population. The ovigerous females were present in all sites and in all samplings, with highest proportions in the winter, pointing to a possible preference for a colder season for reproduction. The presence of a permanent washout provided to this beach conditions of estuarine salinities, which possibly favored the establishment of the population.

As descargas de água doce permanentes em praias arenosas, conhecidas como sangradouros, promovem alterações em diferentes escalas espaciais e temporais sobre as características ambientais, e consequentemente sobre as populações macrobentônicas. O objetivo deste estudo foi avaliar as alterações da abundância, distribuição e estrutura populacional do isópode Tholozodium rhombofrontalis (Giambiagi, 1922) em um sangradouro permanente. Coletas sazonais foram realizadas na praia de Barrancos, cidade de Pontal do Paraná, estado do Paraná, sul do Brasil, em três locais: sangradouro (dentro do sangradouro), intermediário (a 30 m de distância do sangradouro) e distante (a 150 m de distância do sangradouro), durante as quatro estações dos anos de 2012 e 2013. A praia foi morfodinamicamente caracterizada como intermediária, composta de sedimentos finos e bem selecionados. No local sangradouro os perfis topográficos foram suaves e extensos, e o lençol freático raso e doce. Em contrapartida, no local distante os perfis foram íngremes e curtos, e o lençol freático profundo e salino. O local intermediário apresentou características similares ao do sangradouro. Houve uma variabilidade espacial e temporal na abundância e distribuição do isópode, estando as maiores abundâncias nos locais sangradouro e intermediário, com picos nas estações primavera e verão. Tais variações foram relacionadas à presença de águas salobras e altos valores de clorofila a. A proporção de juvenis foi a maior dentre todas as classes, e manteve-se regular temporalmente, indicando um recrutamento contínuo. As proporções de fêmeas mantiveram-se similares temporalmente confirmando a estabilidade da população. A proporção de machos foi baixa em todos os locais e durante todas as coletas, contudo, a baixa representatividade desta classe não afetou negativamente o estabelecimento da população. As fêmeas ovígeras estiveram presentes em todos os locais e em todas as coletas, com as maiores proporções no inverno, apontando uma possível preferência por uma estação mais fria para a reprodução. A presença de um sangradouro permanente proporcionou a esta praia condições de salinidade estuarina, o que possivelmente favoreceu o estabelecimento da população.

A influência de um sangradouro na distribuição espaço-temporal do isópode Tholozodium rhombofrontalis (Isopoda, Sphaeromatidae)

ABSTRACT The permanent freshwater discharges in sandy beaches, known as washouts, promotes changes in different spatial and temporal scales on the environmental characteristics, and consequently on macrobenthic populations. The aim of this study was to evaluate the changes of abundance, distribution and population structure of the isopod Tholozodium rhombofrontalis (Giambiagi, 1922) in a permanent washout. Seasonal samplings were realized in the Barrancos beach, Pontal do Paraná city, state of Paraná, southern Brazil, in three sites: on the washout (inside washout), intermediate (30 meters away from the washout), and distant (150 meters away from the washout), during four seasons of the years 2012 and 2013. The beach was morphodynamically characterized as an intermediate beach, composed of fine and well sorted sediments. At the washout site the topographic profiles were smoother and longer, and the water table shallowed and fresh. In contrast, in the distant site the profiles were steeper and shorter, and the water table deeper and saline. The intermediate site presented characteristics similar to that of the washout. There was a spatial and temporal variability in the abundance and distribution of the isopod, being the greater abundances in the intermediate and washout sites, with peaks in the spring and summer seasons. These variations were related to the presence of brackish water and high values of chlorophyll a. The juveniles proportion were the higher of all classes, and remained temporally regular, indicating a continuous recruitment. The proportions of females remained similar temporally confirming the population stability. The proportion of males was low at all sites and during all samplings; however, the low representativeness of this class did not negatively affect the establishment of the population. The ovigerous females were present in all sites and in all samplings, with highest proportions in the winter, pointing to a possible preference for a colder season for reproduction. The presence of a permanent washout provided to this beach conditions of estuarine salinities, which possibly favored the establishment of the population.

RESUMO As descargas de água doce permanentes em praias arenosas, conhecidas como sangradouros, promovem alterações em diferentes escalas espaciais e temporais sobre as características ambientais, e consequentemente sobre as populações macrobentônicas. O objetivo deste estudo foi avaliar as alterações da abundância, distribuição e estrutura populacional do isópode Tholozodium rhombofrontalis (Giambiagi, 1922) em um sangradouro permanente. Coletas sazonais foram realizadas na praia de Barrancos, cidade de Pontal do Paraná, estado do Paraná, sul do Brasil, em três locais: sangradouro (dentro do sangradouro), intermediário (a 30 m de distância do sangradouro) e distante (a 150 m de distância do sangradouro), durante as quatro estações dos anos de 2012 e 2013. A praia foi morfodinamicamente caracterizada como intermediária, composta de sedimentos finos e bem selecionados. No local sangradouro os perfis topográficos foram suaves e extensos, e o lençol freático raso e doce. Em contrapartida, no local distante os perfis foram íngremes e curtos, e o lençol freático profundo e salino. O local intermediário apresentou características similares ao do sangradouro. Houve uma variabilidade espacial e temporal na abundância e distribuição do isópode, estando as maiores abundâncias nos locais sangradouro e intermediário, com picos nas estações primavera e verão. Tais variações foram relacionadas à presença de águas salobras e altos valores de clorofila a. A proporção de juvenis foi a maior dentre todas as classes, e manteve-se regular temporalmente, indicando um recrutamento contínuo. As proporções de fêmeas mantiveram-se similares temporalmente confirmando a estabilidade da população. A proporção de machos foi baixa em todos os locais e durante todas as coletas, contudo, a baixa representatividade desta classe não afetou negativamente o estabelecimento da população. As fêmeas ovígeras estiveram presentes em todos os locais e em todas as coletas, com as maiores proporções no inverno, apontando uma possível preferência por uma estação mais fria para a reprodução. A presença de um sangradouro permanente proporcionou a esta praia condições de salinidade estuarina, o que possivelmente favoreceu o estabelecimento da população.

Biologia populacional do peixe-pedra, Genyatremus luteus (Bloch, 1790), na costa amazônica brasileira / Population biology of torroto grunt, Genyatremus luteus (Bloch, 1790), Brazilian amazonian coast

Genyatremus luteus é uma espécie de peixe de importância comercial no estado do Pará. Neste estudo foi investigada a biologia populacional de G. luteus em um estuário da Amazônia Oriental. Para tanto, realizaram-se coletas de exemplares da espécie no Furo Grande, no período de outubro de 2012 a outubro de 2013, mensalmente, com rede de emalhar tipo block-net. Em laboratório, os indivíduos foram aferidos os comprimentos total, padrão e da cabeça e a altura, além de ser registrado o peso úmido. Após incisão ventral e retirada das gônadas, macroscopicamente, definiu-se o estádio gonadal das fêmeas e dos machos. Foram capturados 460 indivíduos cujos tamanhos e pesos variaram entre 4,50 e 21,40 cm e 1,36 e 148,26 g. As frequências relativas das fêmeas e dos machos foram diferentes do esperado de 1:1 (x2: 8,90; p<0,01), diferindo significativamente por sexo e classe de tamanho (p<0,01). As médias de tamanho (CT) apresentaram diferenças significativas em relação ao sexo (F=22,71; p<0,01), mês (F=35,80; p<0,01), período sazonal (F=6,03; p<0,01), estádio gonadal (F=29,77; p<0,01) e estádio gonadal por período sazonal (F=2,37; p<0,05). O peso úmido não diferiu estatisticamente por estádio gonadal, período sazonal e sexo. O diagrama de ordenação demonstrou que a turbidez da água foi a variável que respondeu pela maior variabilidade dos dados (total de 97%). Os espécimes capturados neste estudo são pequenos em tamanho e peso e reprodutivamente imaturos, com maior ocorrência de fêmeas e em maior número no período seco.(AU)

Genyatremus luteus is specie of commercial importance in the Pará state. In this study, the population biology of G. luteus was investigated in an estuary of the Eastern Amazon, the collections occurred from October 2012 to October 2013, each month, in the tidal channel (Furo grande), with block net. In the laboratory the individuals were gauged the lengths: total, standard, head and height, in addition to weight being recorded. After ventral incision and gonads removal, the gonadal stage was defined for females and males macroscopically. 460 individuals were captured whose sizes and weights ranged from 4.50 to 21.40 cm and 1.36 and 148.26 g. The relative frequencies of females and males were different than expected from 1: 1 (x2: 8.90, p <0.01), differing significantly by sex and size class (p <0.01). The mean size (CT) presented differences significant in relation to sex (F = 22.71, p <0.01), month (F = 35.80, p <0.01) (P <0.01), gonadal stage (F = 29.77, p <0.01) and gonadal stage by seasonal period (F = 2.37, p <0.05). The wet weight did not differ statistically by gonadal stage, seasonal period and sex. The ordering diagram showed that the turbidity was the variable that responded by the greater variability in the data (total of 97%). The specimens captured in this study are small in size and weight and reproductively immature, with higher occurrence of females, in greater numbers in the dry period.(AU)

Biologia populacional do peixe-pedra, Genyatremus luteus (Bloch, 1790), na costa amazônica brasileira / Population biology of torroto grunt, Genyatremus luteus (Bloch, 1790), Brazilian amazonian coast

Genyatremus luteus é uma espécie de peixe de importância comercial no estado do Pará. Neste estudo foi investigada a biologia populacional de G. luteus em um estuário da Amazônia Oriental. Para tanto, realizaram-se coletas de exemplares da espécie no Furo Grande, no período de outubro de 2012 a outubro de 2013, mensalmente, com rede de emalhar tipo block-net. Em laboratório, os indivíduos foram aferidos os comprimentos total, padrão e da cabeça e a altura, além de ser registrado o peso úmido. Após incisão ventral e retirada das gônadas, macroscopicamente, definiu-se o estádio gonadal das fêmeas e dos machos. Foram capturados 460 indivíduos cujos tamanhos e pesos variaram entre 4,50 e 21,40 cm e 1,36 e 148,26 g. As frequências relativas das fêmeas e dos machos foram diferentes do esperado de 1:1 (x2: 8,90; p<0,01), diferindo significativamente por sexo e classe de tamanho (p<0,01). As médias de tamanho (CT) apresentaram diferenças significativas em relação ao sexo (F=22,71; p<0,01), mês (F=35,80; p<0,01), período sazonal (F=6,03; p<0,01), estádio gonadal (F=29,77; p<0,01) e estádio gonadal por período sazonal (F=2,37; p<0,05). O peso úmido não diferiu estatisticamente por estádio gonadal, período sazonal e sexo. O diagrama de ordenação demonstrou que a turbidez da água foi a variável que respondeu pela maior variabilidade dos dados (total de 97%). Os espécimes capturados neste estudo são pequenos em tamanho e peso e reprodutivamente imaturos, com maior ocorrência de fêmeas e em maior número no período seco.

Genyatremus luteus is specie of commercial importance in the Pará state. In this study, the population biology of G. luteus was investigated in an estuary of the Eastern Amazon, the collections occurred from October 2012 to October 2013, each month, in the tidal channel (Furo grande), with block net. In the laboratory the individuals were gauged the lengths: total, standard, head and height, in addition to weight being recorded. After ventral incision and gonads removal, the gonadal stage was defined for females and males macroscopically. 460 individuals were captured whose sizes and weights ranged from 4.50 to 21.40 cm and 1.36 and 148.26 g. The relative frequencies of females and males were different than expected from 1: 1 (x2: 8.90, p <0.01), differing significantly by sex and size class (p <0.01). The mean size (CT) presented differences significant in relation to sex (F = 22.71, p <0.01), month (F = 35.80, p <0.01) (P <0.01), gonadal stage (F = 29.77, p <0.01) and gonadal stage by seasonal period (F = 2.37, p <0.05). The wet weight did not differ statistically by gonadal stage, seasonal period and sex. The ordering diagram showed that the turbidity was the variable that responded by the greater variability in the data (total of 97%). The specimens captured in this study are small in size and weight and reproductively immature, with higher occurrence of females, in greater numbers in the dry period.

Genetic characterization of Colombian indigenous sheep / Caracterización genética de ovinos criollos colombianos / Caracterização genética de ovinos crioulos colombianos

Abstract Background: indigenous breeds are important for poor farmers because of their natural selection against harsh environments and adaptation to regional conditions. However, inbreeding of indigenous sheep populations has increased in Colombia due to indiscriminate cross-breeding with foreign animals and lack of reproductive controls, with subsequent loss in productivity, which poses a great risk for the conservation of valuable genes. Objective: to determine the genetic diversity in Colombian indigenous sheep by using a panel of 10 microsatellite molecular markers. Methods: blood samples from 362 individuals from 43 farms in 11 Colombian provinces were genotyped and analyzed for a panel of 10 microsatellite markers. Results: a total of 134 alleles were found (13.4 alleles/locus on average) with a range of observed and expected heterozygosity of 0.428 to 0.831 and 0.615 to 0.855, respectively, and 0.742 polymorphic information content (PIC). The average Wright F-statistics (FIS ) of the breeds was 0.107, suggesting moderate levels of inbreeding. Colombian sheep showed a low level of genetic differentiation among breeds (FST = 0.054) and STRUCTURE analysis showed complex patterns of admixture in the breeds. Conclusion: overall, Colombian sheep have high genetic variability, which is very important for future conservation programs and genetic improvement.

Resumen Antecedentes: las razas animales autóctonas son importantes para los agricultores de escasos recursos a causa de su selección natural contra el duro ambiente y su adaptación a condiciones regionales. Sin embargo en Colombia, debido al cruce indiscriminado con razas foráneas y a la falta de control de la reproducción, ha aumentado la consanguinidad en las poblaciones de ovinos criollos y por lo tanto la pérdida en la productividad, lo que supone un gran riesgo para la conservación de genes valiosos. Objetivo: determinar la diversidad genética en razas criollas de ovinos colombianos utilizando análisis por microsatélites. Métodos: se visitaron 43 granjas localizadas en 11 departamentos del país, en las cuales se tomaron muestras de sangre a 362 individuos. Las muestras fueron genotipadas y analizadas para un panel de 10 marcadores microsatélites. Resultados: un total de 134 alelos fueron encontrados (13,4 alelos/locus en promedio), con un rango de heterocigocidad observada y esperada de 0,428 a 0,831 y 0,615 a 0,855, respectivamente, y un contenido de información polimórfica (PIC) promedio de 0,742. El Wright F-statistics (FIS) promedio de las razas evaluadas fue 0,107, lo cual sugiere que las razas tienen niveles moderados de consanguinidad. Las ovejas colombianas presentaron un bajo grado de diferenciación genética entre las distintas razas (FST = 0,054) y el análisis de STRUCTURE mostró complejos patrones de mezcla en las razas estudiadas. Conclusión: en términos generales, las ovejas colombianas presentan una alta variabilidad genética lo cual es muy importante para futuros programas de conservación y mejoramiento genético.

Resumo Antecedentes: as raças crioulas, devido a sua seleção natural em ambientes hostis e adaptação às condições regionais, são importantes para os agricultores de poucos recursos econômicos. Porém, na Colômbia, devido ao cruzamento indiscriminado com raças estrangeiras e a falta de controle na reprodução, tem aumentado a consanguinidade nas populações de ovinos crioulos e por tanto tem gerado perda na produtividade, o que faz supor um grande risco para a conservação de genes valiosos. Objetivo: determinar a diversidade genética em raças crioulas colombianas utilizando um painel de 10 marcadores moleculares microssatélites. Métodos: visitaram-se 43 granjas localizadas em 11 departamentos do país, nos quais foram amostrados 362 indivíduos, que foram genotipados e analisados para um painel de 10 marcadores microssatélites. Resultados: um total de 134 alelos foram encontrados (média de 13,4 alelos/locus), com um rango de heterocigocidade observada e esperada de 0,428 a 0,831 e 0,615 a 0,855, respectivamente, e um conteúdo de informação polimórfica (PIC) médio de 0,742. O Wright F-statistics (FIS) médio das raças avaliadas foi de 0,107, o qual sugere que as raças apresentam níveis moderados de consanguinidade. As ovelhas colombianas apresentaram um baixo grau de diferenciação genética entre as diferentes raças (FST = 0,054) e o análise de STRUCTURE mostrou complexos patrões de mistura nas raças estudadas. Conclusão: em termos gerais, as ovelhas colombianas apresentaram uma alta variabilidade genética, o qual é muito importante para futuros programas de conservação e melhoramento genético.