Genetic variability and evidence of founder effect in Hemiodus orthonops (Characiformes: Hemiodontidae) from the upper Paraná River basin, Brazil / Variabilidade genética e evidência do efeito do fundador em Hemiodus orthonops(Characiformes: Hemiodontidae) da bacia do alto rio Paraná, Brasil

Hemiodus orthonops is a small fish of the Hemiodontidae family, order Characiformes, with a maximum of 25 cm standard length. Until recently, H. orthonops was an endemic species from the Paraná-Paraguay basin and it was absent from the upper Paraná River basin. Since 2008, it has started to be collected in the upper Paraná River, representing up to 10% of catches. Two population samples of H. orthonops from two localities of the upper Parana River basin (Porto Camargo and Porto Figueira) were analyzed using the allozymes electrophoresis technique. Twenty-one enzymatic loci were detected. The population sample from Porto Camargo displayed a genetic variability (He = 0.1061) higher than that from Porto Figueira (He = 0.0580) and homozygote excess in both of them. The FST value (0.2081) indicated genetic structure. The excess of homozygotes in both samples was probably due to founder effect in the population.(AU)

Hemiodus orthonops é um pequeno peixe da família Hemiodontidade da Ordem Characiformes com um comprimento padrão máximo de 25 cm. Até recentemente, H. orthonops estava ausente da bacia do alto rio Paraná. Desde 2008 ele passou a ser coletado na bacia do alto rio Paraná, representando até 10% das coletas. Duas amostras populacionais de H. orthonops provenientes de duas localidades da bacia do alto rio Paraná (Porto Camargo e Porto enzimáticos foram detectados. A amostra proveniente de Porto Camargo revelou uma variabilidade genética (He = 0,1017) superior à amostra de Porto Figueira (He = 0,0558) e excesso de homozigotos em ambas as amostras. O valor de FST entre elas (0,2081) indica que há estruturação genética. O excesso de homozigotos nas duas amostras é provavelmente devido ao efeito do fundador.Figueira) foram analisadas pela técnica de eletroforese de aloenzimas. Vinte um loci enzimáticos foram detectados. A amostra proveniente de Porto Camargo revelou uma variabilidade genética (He = 0,1017) superior à amostra de Porto Figueira (He = 0,0558) e excesso de homozigotos em ambas as amostras. O valor de FST entre elas (0,2081) indica que há estruturação genética. O excesso de homozigotos nas duas amostras é provavelmente devido ao efeito do fundador.(AU)

Genetic variability and evidence of founder effect in Hemiodus orthonops (Characiformes: Hemiodontidae) from the upper Paraná River basin, Brazil / Variabilidade genética e evidência do efeito do fundador em Hemiodus orthonops (Characiformes: Hemiodontidae) da bacia do alto rio Paraná, Brasil

Hemiodus orthonops is a small fish of the Hemiodontidae family, order Characiformes, with a maximum of 25 cm standard length. Until recently, H. orthonops was an endemic species from the Paraná-Paraguay basin and it was absent from the upper Paraná River basin. Since 2008, it has started to be collected in the upper Paraná River, representing up to 10% of catches. Two population samples of H. orthonops from two localities of the upper Parana River basin (Porto Camargo and Porto Figueira) were analyzed using the allozymes electrophoresis technique. Twenty-one enzymatic loci were detected. The population sample from Porto Camargo displayed a genetic variability (He = 0.1061) higher than that from Porto Figueira (He = 0.0580) and homozygote excess in both of them. The FST value (0.2081) indicated genetic structure. The excess of homozygotes in both samples was probably due to founder effect in the population.

Hemiodus orthonops é um pequeno peixe da família Hemiodontidade da Ordem Characiformes com um comprimento padrão máximo de 25 cm. Até recentemente, H. orthonops estava ausente da bacia do alto rio Paraná. Desde 2008 ele passou a ser coletado na bacia do alto rio Paraná, representando até 10% das coletas. Duas amostras populacionais de H. orthonops provenientes de duas localidades da bacia do alto rio Paraná (Porto Camargo e Porto Figueira) foram analisadas pela técnica de eletroforese de aloenzimas. Vinte um loci enzimáticos foram detectados. A amostra proveniente de Porto Camargo revelou uma variabilidade genética (He = 0,1017) superior à amostra de Porto Figueira (He = 0,0558) e excesso de homozigotos em ambas as amostras. O valor de F ST entre elas (0,2081) indica que há estruturação genética. O excesso de homozigotos nas duas amostras é provavelmente devido ao efeito do fundador.

Investigation of genetic variability in the Mantiqueira herd through protein polymorphism. I - Genetic characterization and comparative studies / Investigação da variabilidade genética do rebanho mantiqueira através de polimorfismos protéicos I. caracterização genética e estudos comparativos

The Mantiqueira cattle has recently been considered a Brazilian native breed, resultant from one of the selection programs of the Instituto de Zootecnia for milk production on pasture. The characterization of genetic variability was accomplished by electrophoretic analysis of proteins. Some loci were chosen for showing alleles which appeared in specific frequencies or exclusive alleles in breeds belonging to groups Bos indicus and Bos taurus , such as CaZ, Pep-B1 e AlbC and alleles CaF e Pep-B3, respectively. To the Mantiqueira herd the respective frequencies of alleles HbA, HbB, CaS, CaF, Pep-B1, Pep-B2, Pep-B3 Am-I B, Am-Ic, AlbA , A!bB, TfA TfD and TfE were 0.962 ± 0.013 and 0.038 ± 0.013; 0.890 ± 0.022 and 0.110 ± 0.022; 0.118 ± 0.023, 0.818 ± 0.026 and 0.064 ± 0.015; 0.547 ± 0.033 and 0.453 ± 0.033; 0.897 ± 0.021 and 0.103 ± 0.021; 0.256 ± 0.029, 0.573 ± 0.030 and 0.171 ± 0.024. The values of P, PA, Ap e H, that express the genetic variability in the loci Hb, CA, Pep-B, PGD, SOD, Am-I, Alb and Tf were the following: 0.750; 0.8890; 2.3 and 0.1814 ± 0.0683. These high values obtained from Mantiqueira herd when compared to European breeds suggest that this herd displays a remarkable potential for selection and improvement programs. Besides, the non occurrence of specific zebu alleles in the studied herd suggest that, if existed, they were replaced by Holstein aleles many deca

O bovino Mantiqueira é atualmente considerado uma raça nativa brasileira, resultante de um dos programas de seleção do Instituto de Zootecnia para produção de leite a pasto. A caracterização da variabilidade foi realizada através de análises eletroforéticas. Alguns sistemas protéicos foram escolhidos por apresentarem determinados alelos que ocorrem em freqüências específicas, ou alelos exclusivos de raças pertencentes aos grupos Bos indicus eBos taurus, tais como os alelos Caz e Albc e os alelos Caf e Pep-B3, respectivamente. Para o rebanho Mantiqueira, as respectivas freqüências dos alelos HbA, Hbh, Cas, Caf, Pep- B1, Pep-B2, Pep-B3, Am-IB, Am-Ic, AlbA , AlbB, TfA, TfD TfEforam 0,962 ± 0,013 e 0,038 ± 0,013; 0,890 ± 0,022 e 0,110 ± 0,022; 0,118 ± 0,023, 0,818 ± 0,026 e 0,064 ± 0,015; 0,547 ± 0,033 e 0,453 ± 0,033; 0,897 ± 0,021 e 0,103 ± 0,021; 0,256 ± 0,029; 0,573 ± 0,030 e 0,171 ± 0,024. Os valores de P, Pa, Ap e H, que expressam a variabilidade genética existente nos Iocos da Hb, CA, Pep-B, PGD, SOD, Am-I, Alb e Tf, foram os seguintes: 0,750; 0,8890; 2,3 e 0,1814 ± 0,0683. Esses altos valores obtidos no rebanho Mantiqueira, quando comparados com as raças européias, sugerem que esse rebanho apresenta um grande potencial para programas de seleção e melhoramento. Além disso, a não ocorrência de alelos específicos zebuínos no rebanho estudado sugere que, se originalmente presen

Investigation of genetic variability in the Mantiqueira herd through protein polymorphism. I - Genetic characterization and comparative studies / Investigação da variabilidade genética do rebanho mantiqueira através de polimorfismos protéicos I. caracterização genética e estudos comparativos

The Mantiqueira cattle has recently been considered a Brazilian native breed, resultant from one of the selection programs of the Instituto de Zootecnia for milk production on pasture. The characterization of genetic variability was accomplished by electrophoretic analysis of proteins. Some loci were chosen for showing alleles which appeared in specific frequencies or exclusive alleles in breeds belonging to groups Bos indicus and Bos taurus , such as CaZ, Pep-B1 e AlbC and alleles CaF e Pep-B3, respectively. To the Mantiqueira herd the respective frequencies of alleles HbA, HbB, CaS, CaF, Pep-B1, Pep-B2, Pep-B3 Am-I B, Am-Ic, AlbA , A!bB, TfA TfD and TfE were 0.962 ± 0.013 and 0.038 ± 0.013; 0.890 ± 0.022 and 0.110 ± 0.022; 0.118 ± 0.023, 0.818 ± 0.026 and 0.064 ± 0.015; 0.547 ± 0.033 and 0.453 ± 0.033; 0.897 ± 0.021 and 0.103 ± 0.021; 0.256 ± 0.029, 0.573 ± 0.030 and 0.171 ± 0.024. The values of P, PA, Ap e H, that express the genetic variability in the loci Hb, CA, Pep-B, PGD, SOD, Am-I, Alb and Tf were the following: 0.750; 0.8890; 2.3 and 0.1814 ± 0.0683. These high values obtained from Mantiqueira herd when compared to European breeds suggest that this herd displays a remarkable potential for selection and improvement programs. Besides, the non occurrence of specific zebu alleles in the studied herd suggest that, if existed, they were replaced by Holstein aleles many deca

O bovino Mantiqueira é atualmente considerado uma raça nativa brasileira, resultante de um dos programas de seleção do Instituto de Zootecnia para produção de leite a pasto. A caracterização da variabilidade foi realizada através de análises eletroforéticas. Alguns sistemas protéicos foram escolhidos por apresentarem determinados alelos que ocorrem em freqüências específicas, ou alelos exclusivos de raças pertencentes aos grupos Bos indicus eBos taurus, tais como os alelos Caz e Albc e os alelos Caf e Pep-B3, respectivamente. Para o rebanho Mantiqueira, as respectivas freqüências dos alelos HbA, Hbh, Cas, Caf, Pep- B1, Pep-B2, Pep-B3, Am-IB, Am-Ic, AlbA , AlbB, TfA, TfD TfEforam 0,962 ± 0,013 e 0,038 ± 0,013; 0,890 ± 0,022 e 0,110 ± 0,022; 0,118 ± 0,023, 0,818 ± 0,026 e 0,064 ± 0,015; 0,547 ± 0,033 e 0,453 ± 0,033; 0,897 ± 0,021 e 0,103 ± 0,021; 0,256 ± 0,029; 0,573 ± 0,030 e 0,171 ± 0,024. Os valores de P, Pa, Ap e H, que expressam a variabilidade genética existente nos Iocos da Hb, CA, Pep-B, PGD, SOD, Am-I, Alb e Tf, foram os seguintes: 0,750; 0,8890; 2,3 e 0,1814 ± 0,0683. Esses altos valores obtidos no rebanho Mantiqueira, quando comparados com as raças européias, sugerem que esse rebanho apresenta um grande potencial para programas de seleção e melhoramento. Além disso, a não ocorrência de alelos específicos zebuínos no rebanho estudado sugere que, se originalmente presen

Investigation of genetic variability in the Mantiqueira herd through protein polymorphism. II. Estimation of racial composition / Investigação da variabilidade genética do rebanho Mantiqueira através de polimorfismos protéicos II, avaliação da composição racial

The aim of this study was to evaluate the racial composition of the Mantiqueira herd, belonging to Estação Experimental de Zootecnia de Pindamonhangaba. The estimation of the racial admixture was achieved by MISTURA2 and MISTURA3 programs contained in GENIOC, that adopts the Maximum Likelihood Method. The genic frequencies for Hb, CA, Pep-B, Ain-I, Tf and Alb obtained from Holstein, Caracu Caldeano, and Gir breeds and the respective number of phenotypes observed in the Mantiqueira herd, were utilized for this purpose. In accordance with historical records that indicate an hybrid origin of the Mantiqueira cattle, these breeds were employed as possible ancestral of this cattle. The results suggest that the genomic constitution of Mantiqueira herd is approximately 52% of genes from Holstein and 48% from Caracu. Nevertheless, we may raise the hvpothesis that Spanish breeds also contributed to the Mantiqueira herd, because of the occurrence of the allele Pep-B3, that is possibly a genetic marker of those breeds.

No presente estudo, foi estimada a composição racial do rebanho Mantiqueira, pertencente à Estação Experimental de Zootecnia de Pindamonhangaba, empregando-se os programas MISTURA2 e MISTURA3, contidos no GENIOC, que adota o método de Verossimilhança Máxima. Para isso, foram utilizadas as freqüências gênicas dos locos Hb, CA, Pep-B, Am-I, Tf e Alb, obtidas nas raças Holandesa, Caracu Caldeano e Gir e os respectivos números de fenótipos observados no rebanho Mantiqueira. Com base nos relatos históricos que apontam uma origem híbrida do gado Mantiqueira, essas raças foram estudadas, como possíveis ancestrais desses bovinos. Os resultados obtidos sugerem que a constituição genômica do rebanho Mantiqueira é de aproximadamente 52% de genes oriundos de bovinos Holandeses e 48% de bovinos Caracu. Entretanto, não descartamos a hipótese de que na formação desse rebanho Mantiqueira, também tenha havido a participação de raças espanholas, devido à ocorrência do alelo Pep-B3 que acreditamos ser marcador dessas raças.

Investigation of genetic variability in the Mantiqueira herd through protein polymorphism. II. Estimation of racial composition / Investigação da variabilidade genética do rebanho Mantiqueira através de polimorfismos protéicos II, avaliação da composição racial

The aim of this study was to evaluate the racial composition of the Mantiqueira herd, belonging to Estação Experimental de Zootecnia de Pindamonhangaba. The estimation of the racial admixture was achieved by MISTURA2 and MISTURA3 programs contained in GENIOC, that adopts the Maximum Likelihood Method. The genic frequencies for Hb, CA, Pep-B, Ain-I, Tf and Alb obtained from Holstein, Caracu Caldeano, and Gir breeds and the respective number of phenotypes observed in the Mantiqueira herd, were utilized for this purpose. In accordance with historical records that indicate an hybrid origin of the Mantiqueira cattle, these breeds were employed as possible ancestral of this cattle. The results suggest that the genomic constitution of Mantiqueira herd is approximately 52% of genes from Holstein and 48% from Caracu. Nevertheless, we may raise the hvpothesis that Spanish breeds also contributed to the Mantiqueira herd, because of the occurrence of the allele Pep-B3, that is possibly a genetic marker of those breeds.

No presente estudo, foi estimada a composição racial do rebanho Mantiqueira, pertencente à Estação Experimental de Zootecnia de Pindamonhangaba, empregando-se os programas MISTURA2 e MISTURA3, contidos no GENIOC, que adota o método de Verossimilhança Máxima. Para isso, foram utilizadas as freqüências gênicas dos locos Hb, CA, Pep-B, Am-I, Tf e Alb, obtidas nas raças Holandesa, Caracu Caldeano e Gir e os respectivos números de fenótipos observados no rebanho Mantiqueira. Com base nos relatos históricos que apontam uma origem híbrida do gado Mantiqueira, essas raças foram estudadas, como possíveis ancestrais desses bovinos. Os resultados obtidos sugerem que a constituição genômica do rebanho Mantiqueira é de aproximadamente 52% de genes oriundos de bovinos Holandeses e 48% de bovinos Caracu. Entretanto, não descartamos a hipótese de que na formação desse rebanho Mantiqueira, também tenha havido a participação de raças espanholas, devido à ocorrência do alelo Pep-B3 que acreditamos ser marcador dessas raças.