RESUMO
BACKGROUND: HPV16 is a common sexually transmitted infection although few infections lead to cervical precancer/cancer; we cannot distinguish nor mechanistically explain why only certain infections progress. HPV16 can be classified into four main evolutionary-derived variant lineages (A, B, C, D) that have been previously suggested to have varying disease risks. METHODS: We used a high-throughput HPV16 whole-genome sequencing assay to investigate variant lineage risk among 3215 HPV16-infected women. Using sublineages A1/A2 as the reference, we assessed all variant lineage associations with infection outcome over three or more years of follow-up: 1107 control subjects (Assuntos
Carcinoma/virologia
, Papillomavirus Humano 16/classificação
, Papillomavirus Humano 16/genética
, Infecções por Papillomavirus/virologia
, Lesões Pré-Cancerosas/virologia
, Neoplasias do Colo do Útero/virologia
, Adenocarcinoma/etnologia
, Adenocarcinoma/virologia
, Adenocarcinoma in Situ/etnologia
, Adenocarcinoma in Situ/virologia
, Adulto
, Assistência ao Convalescente
, California/epidemiologia
, Carcinoma/etnologia
, Carcinoma de Células Escamosas/etnologia
, Carcinoma de Células Escamosas/virologia
, Feminino
, Genoma
, Sequenciamento de Nucleotídeos em Larga Escala
, Papillomavirus Humano 16/patogenicidade
, Humanos
, Pessoa de Meia-Idade
, Infecções por Papillomavirus/etnologia
, Filogenia
, Lesões Pré-Cancerosas/etnologia
, Fatores de Risco
, Neoplasias do Colo do Útero/etnologia
, Adulto Jovem
, Displasia do Colo do Útero/etnologia
, Displasia do Colo do Útero/virologia