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Biophys J ; 94(1): 193-7, 2008 Jan 01.
Artigo em Inglês | MEDLINE | ID: mdl-17827227

RESUMO

The upstream stimulatory factor 1 (USF1) belongs to the basic helix-loop-helix leucine zipper (b/HLH/Z) transcription factor family, recognizing the CACGTG DNA motive as a dimer and playing an important role in the regulation of transcription in a variety of cellular and viral promoters. In this study we investigate the USF1 b/HLH/Z domain and its complexes with DNA by small angle x-ray scattering. We present low resolution structural models of monomeric b/HLH/Z USF1 in the absence of DNA and USF1 dimeric (b/HLH/Z)(2)-DNA and tetrameric (b/HLH/Z)(4)-DNA(2) complexes. The data reveal a concentration-dependent USF1 dimer (b/HLH/Z)(2)-DNA-tetramer (b/HLH/Z)(4)-DNA(2) equilibrium. The ability of b/HLH/Z USF1 to form a tetrameric assembly on two distant DNA binding sites as a consequence of increased protein concentration suggest a USF1 concentration-dependant mechanism of transcription activation involving DNA loop formation.


Assuntos
DNA/química , DNA/ultraestrutura , Modelos Químicos , Modelos Moleculares , Fatores Estimuladores Upstream/química , Fatores Estimuladores Upstream/ultraestrutura , Difração de Raios X/métodos , Sequência de Bases , Fatores de Transcrição de Zíper de Leucina e Hélice-Alça-Hélix Básicos/química , Fatores de Transcrição de Zíper de Leucina e Hélice-Alça-Hélix Básicos/ultraestrutura , Simulação por Computador , Dados de Sequência Molecular , Conformação de Ácido Nucleico , Conformação Proteica , Estrutura Terciária de Proteína , Espalhamento a Baixo Ângulo
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