Tools of genomic medicine for clinical practice: The example of psychiatry. / Herramientas de la medicina genómica para la práctica clínica: el ejemplo de la psiquiatría.

Most psychiatric disorders are moderate to highly heritable, often with different genetic architectures. Although genetic research in psychiatry has progressed, its findings, interpretation, and impact on clinical psychiatry are unknown to most mental healthcare professionals. This article addresses key genetic concepts to understand some clinical entities, emphasizing genetic terminology and types of mutations. Particularly, we describe the role of heritability in the early days of psychiatry genetic research, the most used study designs, and their main objectives. On the other hand, we review some genetic and genomic databases useful for clinical practice. These include Online Mendelian Inheritance in Man, ClinVar, Ensembl, and The Single Nucleotide Polymorphism Database. Finally, a clinical vignette is presented in which we can apply genomic medicine tools. Since the evidence in psychiatric genetics is based on studies carried out in European or North American ancestral populations, we must develop local studies to increase the knowledge and application of genomic medicine on underrepresented populations.

La mayoría de los trastornos psiquiátricos tienen una heredabilidad de moderada a alta, con diferentes arquitecturas genéticas. Aunque la investigación genética en psiquiatría ha tenido un avance progresivo, sus hallazgos, interpretación e impacto en la psiquiatría clínica resultan desconocidos para la mayoría de los profesionales de salud mental. En este artículo se abordan conceptos clave sobre genética para el entendimiento de algunas entidades clínicas, con énfasis en la nomenclatura genética y los tipos de mutaciones. Particularmente, se plantea el rol de la herencia en los inicios de la investigación genética en psiquiatría, los diseños de estudio más utilizados y sus principales objetivos. Por otro lado, se revisan algunas bases de datos genéticas y genómicas que pueden ser de utilidad para la práctica clínica. Entre ellas destacan , ClinVar, Ensembl y . Finalmente, se plantea una viñeta clínica en donde es posible aplicar algunas de las herramientas de la medicina genómica. Debido a que la evidencia en genética psiquiátrica se basa en estudios realizados en poblaciones con origen ancestral europeo o norteamericano, es de suma relevancia desarrollar estudios locales para incrementar el conocimiento y la aplicación de la medicina genómica sobre poblaciones subrepresentadas.

Herramientas de la medicina genómica para la práctica clínica: el ejemplo de la psiquiatría / Tools of genomic medicine for clinical practice: the example of psychiatry

La mayoría de los trastornos psiquiátricos tienen una heredabilidad de moderada a alta, con diferentes arquitecturas genéticas. Aunque la investigación genética en psiquiatría ha tenido un avance progresivo, sus hallazgos, interpretación e impacto en la psiquiatría clínica resultan desconocidos para la mayoría de los profesionales de salud mental. En este artículo se abordan conceptos clave sobre genética para el entendimiento de algunas entidades clínicas, con énfasis en la nomenclatura genética y los tipos de mutaciones. Particularmente, se plantea el rol de la herencia en los inicios de la investigación genética en psiquiatría, los diseños de estudio más utilizados y sus principales objetivos. Por otro lado, se revisan algunas bases de datos genéticas y genómicas que pueden ser de utilidad para la práctica clínica. Entre ellas destacan , ClinVar, Ensembl y . Finalmente, se plantea una viñeta clínica en donde es posible aplicar algunas de las herramientas de la medicina genómica. Debido a que la evidencia en genética psiquiátrica se basa en estudios realizados en poblaciones con origen ancestral europeo o norteamericano, es de suma relevancia desarrollar estudios locales para incrementar el conocimiento y la aplicación de la medicina genómica sobre poblaciones subrepresentadas.

Most psychiatric disorders are moderate to highly heritable, often with different genetic architectures. Although genetic research in psychiatry has progressed, its findings, interpretation, and impact on clinical psychiatry are unknown to most mental healthcare professionals. This article addresses key genetic concepts to understand some clinical entities, emphasizing genetic terminology and types of mutations. Particularly, we describe the role of heritability in the early days of psychiatry genetic research, the most used study designs, and their main objectives. On the other hand, we review some genetic and genomic databases useful for clinical practice. These include Online Mendelian Inheritance in Man, ClinVar, Ensembl, and The Single Nucleotide Polymorphism Database. Finally, a clinical vignette is presented in which we can apply genomic medicine tools. Since the evidence in psychiatric genetics is based on studies carried out in European or North American ancestral populations, we must develop local studies to increase the knowledge and application of genomic medicine on underrepresented populations.

Hallazgos incidentales en medicina genómica / Incidental Findings in Genomic Medicine

Las técnicas de Biología Molecular de última generación, como es la secuenciación masiva en paralelo o NGS (Next Generation Sequencing), permite obtener gran cantidad de información genómica, la cual muchas veces va más allá de la detección de una variante patogénica en un gen que explique la patología (hallazgo primario). Es así como surgió desde hace años la discusión internacional respecto a la decisión a tomar frente a los hallazgos secundarios accionables, es decir, aquellos hallazgos de variantes clasificadas como patogénicas o probablemente patogénicas que no están relacionadas con el fenotipo del paciente, pero que tiene alguna medida preventiva o tratamiento posible y, por lo tanto, podría ser de utilidad para la salud del paciente. Luego de revisar la bibliografía internacional y debatir entre los expertos del Hospital de Pediatría Garrahan, se logró establecer una política institucional y reforzar el hecho de que se trata de una disciplina multidisciplinaria. Así, fue posible definir que solo se atenderá las cuestiones relacionadas con la edad pediátrica, dejando para un tratamiento posterior aquellas variantes detectadas en genes que sean accionables en edad adulta. En el Hospital Garrahan, ha sido posible definir claramente cómo proceder frente a los hallazgos secundarios, al adaptar el consentimiento informado a esta necesidad, definiendo cuándo serán informados, y sabiendo que serán buscados intencionalmente en los genes clínicamente accionables enlistados en la última publicación del American College of Medical Genetics and Genomics, siempre y cuando el paciente/padre/tutor lo consienta (AU)

The latest generation of molecular biology techniques, including massive parallel sequencing or NGS (Next Generation Sequencing), allows us to obtain a whealth of genomic information, which often goes beyond the detection of a pathogenic variant in a gene that explains the pathology (primary finding). As a result, an international discussion has arisen over the years regarding the decision-making concerning actionable secondary findings, it means, those findings of variants classified as pathogenic or probably pathogenic that are not related to the patient's phenotype, but which have some possible preventive measure or treatment and, therefore, could be useful for the patient's health. After reviewing the international literature and discussing among the experts of the Hospital de Pediatría Garrahan, an institutional policy was established and the concept that this is a multidisciplinary discipline was reinforced. Consequently, it has been defined that only issues related to children will be addressed, reserving those variants detected in genes that are actionable in adulthood for later treatment. At Garrahan Hospital, we were able to clearly define how to proceed with secondary findings by adapting the informed consent to this need, defining when they will be reported, and knowing that they will be intentionally searched for in the clinically actionable genes listed in the latest publication of the American College of Medical Genetics and Genomics, as long as the patient/parent/guardian consents (AU)

Implementación asistencial de estudios genómicos aplicados al diagnóstico molecular / Implementation of genomic studies applied to molecular diagnostics

El Hospital Garrahan ha sido pionero en el diagnóstico molecular de patologías pediátricas en Argentina. Los avances tecnológicos de las últimas décadas en el área de la biología molecular, sentaron las bases para la optimización y ampliación del diagnóstico molecular a partir de la secuenciación masiva en paralelo de múltiples genes. El presente trabajo describe el proceso de implementación de los estudios de secuenciación de nueva generación y el desarrollo de la Unidad de Genómica en un hospital público pediátrico de alta complejidad, así como su impacto en las capacidades diagnósticas de enfermedades poco frecuentes de origen genético. La creación del Grupo Interdisciplinario de Estudios Genómicos constituyó la vía institucional para la toma de decisiones que implican la implementación de nuevos estudios genómicos y el establecimiento de prioridades diagnósticas, extendiendo la disponibilidad del diagnóstico molecular a más disciplinas. La Unidad de Genómica trabaja en diseñar las estrategias que permitan la mayor optimización de los recursos con los que cuenta el hospital, teniendo en cuenta el equipamiento disponible, las prioridades establecidas y la frecuencia de las distintas patologías. Se demuestra el salto significativo operado en nuestras capacidades diagnósticas, tanto en la variedad de enfermedades como en el número de genes analizados, habiendo estudiado a la fecha alrededor de 2.000 pacientes, muchos de los cuales ven de este modo finalizada su odisea diagnóstica. Los estudios de NGS se han convertido en una herramienta de la práctica diaria para la atención de un número importante de pacientes de nuestro hospital. Continuaremos trabajando para ampliar su aplicación a la mayor cantidad de patologías, a través de los mecanismos institucionales ya existentes (AU)

The Garrahan Hospital has been a pioneer in the molecular diagnosis of pediatric diseases in Argentina. The technological advances of the last decades in the area of molecular biology have laid the foundations for the optimization and expansion of molecular diagnostics through massive parallel sequencing of multiple genes. This study describes the process of implementation of next-generation sequencing studies and the development of the Genomics Unit in a public pediatric tertiary hospital, and its impact on the capacity to diagnose rare diseases of genetic origin. The creation of the Interdisciplinary Group of Genomic Studies constituted the institutional pathway for decision-making involving the implementation of new genomic studies and the establishment of diagnostic priorities, extending the availability of molecular diagnostics to additional disciplines. The Genomics Unit is working to design strategies that allow for optimization of the resources available to the hospital, taking into account the equipment available, the priorities established, and the frequency of the different diseases. It demonstrates the significant leap in our diagnostic capabilities, both in the variety of diseases and in the number of genes analyzed. To date, around 2,000 patients have been studies, many of whom have thus completed their diagnostic odyssey. NGS studies have become a tool in daily practice for the care of a significant number of patients in our hospital. We will continue working to expand its application to as many diseases as possible, through the existing institutional mechanisms (AU)

Boletín de la Cooperación Técnica Cuba: "Andar la salud", Septiembre-Diciembre 2022

[Introducción] “Andar la salud” es un boletín elaborado en la Oficina de la Organización Panamericana de la Salud/Organización Mundial de la Salud (OPS/OMS) en Cuba. Su propósito fundamental es compartir lo más relevante de la cooperación técnica de esta Representación con el Ministerio de Salud Pública (MINSAP) y otras instituciones y organismos en el país. Entre los artículos del presente número, destacan los relacionados con: la 30a Conferencia Sanitaria Panamericana y sus resultados más relevantes; la presencia de una delegación de OPS en la IV Convención Internacional “Cuba Salud 2022”, así como la sesión especial que, en el marco de este evento, se les dedicó a los 120 años de la Organización regional; y el cierre del proyecto que se impulsó con la Unión Europea para fortalecer la respuesta del sistema de salud a la COVID-19. Además, es posible encontrar una infografía que muestra los títulos y una sinopsis de los cinco libros preparados con el MINSAP como celebración del aniversario 120 de la OPS, donde se recogen hitos de esta Organización y temas de salud pública relevantes en el contexto cubano.

Genetic/genomic testing: defining the parameters for ethical, legal and social implications (ELSI).

BACKGROUND: Genetic/genomic testing (GGT) are useful tools for improving health and preventing diseases. Still, since GGT deals with sensitive personal information that could significantly impact a patient's life or that of their family, it becomes imperative to consider Ethical, Legal and Social Implications (ELSI). Thus, ELSI studies aim to identify and address concerns raised by genomic research that could affect individuals, their family, and society. However, there are quantitative and qualitative discrepancies in the literature to describe the elements that provide content to the ELSI studies and such problems may result in patient misinformation and harmful choices. METHODS: We analyzed the major international documents published by international organizations to specify the parameters that define ELSI and the recognized criteria for GGT, which may prove useful for researchers, health professionals and policymakers. First, we defined the parameters of the ethical, legal and social fields in GGT to avoid ambiguities when using the acronym ELSI. Then, we selected nine documents from 44 relevant publications by international organizations related to genomic medicine. RESULTS: We identified 29 ELSI sub-criteria concerning to GGT, which were organized and grouped within 10 minimum criteria: two from the ethical field, four from the legal field and four from the social field. An additional analysis of the number of appearances of these 29 sub-criteria in the analyzed documents allowed us to order them and to determine 7 priority criteria for starting to evaluate and propose national regulations for GGT. CONCLUSIONS: We propose that the ELSI criteria identified herein could serve as a starting point to formulate national regulation on personalized genomic medicine, ensuring consistency with international bioethical requirements.