Análisis de la variación intraespecífica de Conidiobolus coronatus usando RAPD y secuencias ITS / Intraspecific variation analysis of Conidiobolus coronatus using RAPD and ITS sequencing

RESUMEN

Introducción El hongo Conidiobolus coronatus (C. coronatus) tiene una extensa distribución de hábitats y organismos; se encuentra en forma saprófita, ataca insectos y mamíferos, incluido el humano, aunque de este los reportes son pocos y están restringidos a zonas tropicales. El objetivo de este trabajo fue determinar si existe o no variación genética entre aislamientos de C. coronatus provenientes de lesiones en humanos y otras fuentes. Métodos Once aislamientos de C. coronatus obtenidos de suelo, insectos y humanos se analizaron con las técnicas de polimorfismo derivado de la amplificación aleatoria de ADN (RAPD) y secuenciación del espaciador interno transcrito (ITS1-5.8S rADN-ITS2); para el análisis de las regiones ITS se usaron los métodos de máxima parsimonia, neighbour-joining (NJ) y mínima evolución. Resultados El análisis de los polimorfismos de C. coronatus con las técnicas RAPD e ITS evidenció altos niveles de variación intraespecífica en los aislamientos evaluados. Los aislamientos obtenidos de lesiones en humanos presentan la mayor divergencia genética respecto de los obtenidos de otras fuentes; la mayor distancia genética entre grupos de aislamientos se da entre los provenientes de humanos y los tomados del insecto Lycoriella ingenua. Conclusiones Este trabajo es el primero en evaluar y demostrar que existe variación intraespecífica a nivel molecular de C. coronatus que, a su vez, está relacionada con la fuente de la que se obtuvieron (AU)

ABSTRACT

Introduction The fungus Conidiobolus coronatus (C. coronatus) has an extensive distribution of habitats and hosts. It is found saprophytically, and attacks insects and mammals, including humans. Although there are few reports on humans, and they are restricted to tropical areas. The aim of this work was to determine whether genetic variation exists between C. coronatus isolates coming from human lesions and other sources. Methods A total of 11 C. coronatus isolates obtained from soil, insects and humans were analyzed with the random amplification of polymorphic ADN (RAPD) and internal transcribed spacer (ITS) techniques; the maximum parsimony, neighbour-joining and minimum evolution methods were used for the ITS analysis. Results The analysis of the C. coronatus polymorphisms showed high intra-species variation levels between the evaluated isolates. The isolates coming from human lesions showed the greatest genetic divergence compared with the remaining isolates. The greatest genetic distance between isolate groups was found between those coming from humans and those taken from the insect Lycoriella ingenua. Conclusions This is the very first work evaluating and demonstrating that within species variation exists at molecular level in C. coronatus, and is related to the source where the isolates were taken from (AU)