Evaluation of the Vitek-MS(TM) system in the identification of Candida isolates from bloodstream infections / Evaluación del sistema VITEK(R) MS(TM) en la identificación de aislamientos de Candida de pacientes con candidemia

ABSTRACT

Background: Matrix-assisted laser desorption-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) represents a revolution in the identification of microorganisms of clinical interest. Many studies have confirmed the accuracy and fastness of this tool with routine strains. Aims: To identify clinical isolates of Candida from patients diagnosed with candidemia. Methods: Vitek-MS(TM) system was used with a collection of 298 blood isolates of the genus Candida represented by 9 different species. Sequencing of the internal transcribed spacer (ITS) region of ribosomal DNA cluster was used as the reference method. Results: The results of Vitek-MS(TM) were concordant with those obtained with the reference method for 279 (93.62%) isolates (Kappa coefficient (κ)=0.91). Vitek-MS(TM) misidentified 10 (3.36%) isolates and did not identify 9 (3.02%) isolates. Conclusions: This study determines the potential of Vitek-MS(TM) in yeast identification, being a reliable and fast alternative in the clinical laboratory, with an acceptable sensitivity of 82% (IC 95% 70-90.6%), in comparison with a 100% (IC 95% 92.9-100%) sensitivity of the conventional methods:

RESUMEN

Antecedentes La espectrometría de absorción de masas mediante láser asistido por una matriz (MALDI-TOF MS) representa una revolución en la identificación de microorganismos de interés clínico. Muchos estudios han confirmado la exactitud y rapidez de esta herramienta con aislamientos de la rutina clínica diaria. Objetivos: Identificar aislamientos clínicos del género Candida procedentes de pacientes con un diagnóstico de candidemia. Métodos: Se utilizó el sistema VITEK(R) MS con un grupo de 298 aislamientos sanguíneos del género Candida, representado por 9 especies diferentes. Se utilizó como método de referencia la secuenciación de la región del espaciador de transcripción interno (ITS, por sus siglas en inglés) del ADN ribosómico. Resultados: Los resultados de VITEK(R) MS coincidieron con aquellos obtenidos por el método de referencia en 279 (93,62%) de los aislamientos (coeficiente Kappa [κ]=0,91), mientras que clasificó erróneamente a 10 (3,36%) aislamientos y no identificó otros 9 (3,02%). Conclusiones: VITEK(R) MS es una alternativa fiable y rápida en la identificación de levaduras en el laboratorio clínico, con una sensibilidad aceptable del 82% (IC 95%70-90,6%) en comparación con una sensibilidad del 100% (IC 95%92,9-100%) de los métodos convencionales