Comparison of two methods skipping cell lysis and protein extraction for identification of bacteria from blood cultures by matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass-spectrometry / Comparación de dos métodos que eluden la lisis celular y la extracción de proteínas para la identificación de bacterias crecidas en hemocultivos mediante espectrometría de masas MALDI-TOF

ABSTRACT

OBJECTIVE: Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass-spectrometry (MALDI-TOF MS) is widely used for fast identification of bacteria from blood cultures (BC). We compared the performance of two procedures, one including a pre-enrichment step in brain heart infusion and the other a direct method using vacutainer separator gel tubes (DI), for identification of bacteria from blood cultures by MALDI-TOF MS. MATERIAL AND METHODS: We first prepared a training set of 20 simulated bacteremia specimens, including 10 Gram-negative and 10 Gram-positive species. A total of 145 non-consecutive BCs flagged as positive (68 Gram-negative rods, and 77 Gram-positive cocci) were prospectively analyzed (validation set). RESULTS: A total of 82% and 49% of isolates were correctly identified to the species level by the respective methods. CONCLUSION: The pre-enrichment method outperformed the DI method for identification of virtually all bacterial species included in the panels

RESUMEN

OBJETIVO: La espectrometría de masas MALDI-TOF se utiliza comúnmente para la identificación rápida de bacterias crecidas en hemocultivos (HC). Hemos comparado el rendimiento de dos procedimientos, uno que incluye un paso previo del enriquecimiento en caldo corazón-cerebro y el otro un método directo que usa tubos vacutainer con gel separador (DI), para la identificación de bacterias a partir de hemocultivos mediante MALDI-TOF MS. MATERIAL Y MÉTODOS: Analizamos prospectivamente un total de 145 HC no consecutivos (68 con crecimiento de bacterias gramnegativas y 77 de cocos grampositivos). RESULTADOS: Un total de 82% y 49% de los aislamientos fueron identificados correctamente a nivel de especie por los dos métodos, respectivamente. CONCLUSIÓN: El rendimiento del método de pre-enriquecimiento en caldo corazón-cerebro fue mejor que el del método DI para la identificación de la práctica totalidad de las especies bacterianas incluidas en el panel de estudio