Optimized identification of microorganisms directly from positive blood cultures by MALDI-TOF to improve antimicrobial treatment / Optimización en el proceso de identificación directamente de hemocultivos positivos por MALDI-TOF para mejorar el tratamiento antimicrobiano

ABSTRACT

Introduction. Bacteriemia is a major cause of morbidityand mortality among hospitalized patients worldwide. Earlyidentification of microorganisms from blood culture can leadto improvement of treatment and outcomes.Methods. The study was divided into two phases. Thefirst phase when a comparison of the methods was made tocheck the concordance between them, using as a reference thestandard method implemented in the laboratory. In a secondphase, both methods are combined. We used the rapid identification method and when it could not identify we used thestandard method. The microorganisms that were not identifiedby either of the two methods were identified from colony at24 hoursResults. A total of 589 microbial positive blood cultures have been included in the present study. With the rapidmethod we obtained 96% and 88% identification results forGram-negative bacilli (GNB) and Gram-positive cocci (GPC)respectively. In this study we observed that the combinationof the rapid and standard method achieved identifications of98% and 97% for GNB and GPC respectively.Conclusions. The data analysed shows that both methodscombined perform better than individually. We achieved anoptimization of the identification of microorganisms directlyfrom positive blood cultures by MALDI-TOF. This combinationidentified 98% of the microorganisms in between ten minutesto one hour and a half since the blood culture flagged positive (AU)

RESUMEN

Introducción. La bacteriemia es una de las principalescausas de morbilidad y mortalidad entre los pacientes hospitalizados de todo el mundo. La identificación temprana de losmicroorganismos que están en la sangre, permite optimizar lostratamientos y conseguir mejores resultados.Material y métodos. El estudio se dividió en dos fases. Enla primera fase se realizó una comparación de los dos métodospara comprobar la concordancia entre ambos, tomando comoreferencia el método estándar implementado en el laboratorio.La segunda fase combinó ambos métodos para la identificación de hemocultivos positivos. Se utilizó el método de identificación rápida como primera opción y el método estándarsolo cuando no se consiguió identificar por la primera opción.Los microorganismos que no fueron identificados por ningunode los dos métodos, se identificaron directamente de la coloniacrecida a las 24 horas.Resultados. Se analizaron un total de 589 hemocultivospositivos en este estudio. Con el método rápido obtuvimos un96% y 88% de identificación de bacilos gramnegativos y cocosgrampositivos respectivamente. En este estudio observamosque la combinación del método rápido y el método estándarconsiguió identificaciones del 98% y 97% para bacilos gramnegativos y cocos grampositivos respectivamente.Conclusiones. Los datos analizados muestran que ambosmétodos combinados consiguen mejores resultados que utilizados de forma individual. Logramos una optimización de laidentificación de microorganismos directamente a partir dehemocultivos positivos por MALDI-TOF. Con esta combinaciónse identificó el 98% de los microorganismos entre los primeros10 minutos y hora y media de hemocultivo positivo. (AU)