Concordancia entre características fenotípicas y PCR-REA en la identificación de especies de Malassezia / Concordance between phenotypical features and PCR-REA for the identification of Malassezia spp

RESUMEN

El género Malassezia ha sido revisado recientemente y, hasta el momento,se acepta que incluye 11 especies, que no siempre pueden ser diferenciadasmediante pruebas fisiológicas y morfológicas. En este trabajo se investigó laconcordancia entre las pruebas fenotípicas y un método molecular rápido enla identificación de especies de ese género. Se analizaron 92 aislamientosclínicos de Malassezia spp. obtenidos de pacientes argentinos entre 2001 y2005 y tres cepas de referencia (Malassezia furfur CBS-7019, Malasseziasympodialis CBS-7222 y Malassezia slooffiae CBS-7956). El método molecular,basado en amplificación del ADN por PCR y su digestión con tres diferentesendonucleasas (PCR-REA), permitió identificar inequívocamente los 92aislamientos clínicos (63 M. sympodialis, 18 M. furfur, 10 Malassezia globosa yuna Malassezia obtusa) y las tres cepas de referencia. Mediante las pruebasfenotípicas se logró tipificar 85 aislamientos y dos de las cepas de referencia(concordancia total > 91%). Para las especies más frecuentementeinvolucradas en patología humana, tales como M. sympodialis, M. furfur yM. globosa, la concordancia osciló entre 84-96%, lo que indicaría que losestudios fenotípicos son útiles para la identificación presuntiva de estosmiembros del género en laboratorios que aún no tienen acceso a lametodología molecular(AU)

ABSTRACT

The genus Malassezia has been recently revised and nowadays includes11 species that cannot always be differentiated from each other byphysiological and morphological tests. This study was aimed to evaluate thecorrelation between a molecular method and conventional phenotypic featuresin the identification of Malassezia spp. To achieve this aim, 92 Argentineanclinical strains isolated between 2001 and 2005 were analyzed along withthree reference strains (Malassezia furfur CBS 7019, Malassezia sympodialisCBS 7222 and Malassezia slooffiae CBS 7956). By using PCR and restrictionenzyme analysis with three different DNA endonucleases (PCR-REA), themolecular method consistently identified all three reference strains and all92 clinical isolates as follows 63 M. sympodialis, 18 M. furfur, 10 Malasseziaglobosa and one Malassezia obtusa. Phenotypic studies undentified 85 clinicalisolates and two of the reference strains (total agreement > 91%). In particularfor M. sympodialis, M. furfur and M. globosa, the species more frequentlyinvolved in human pathology, the agreement ranged between 84 and 96%.This result suggests that phenotypic studies are suitable for the presumptiveidentification of important Malassezia species in the clinical medical mycologylaboratories where molecular methodologies are not available(AU)