Distribution of DNA repair-related ESTs in sugarcane

RESUMO

As vias de reparo de DNA säo requeridas para manter a necessária estabilidade genômica e garantir a sobrevivência do organismo, frente aos efeitos deletérios causados por fatores endógenos e exógenos. Neste trabalho, realizamos a análise dos padrões de expressäo dos genes de reparo de DNA encontrados na cana-de-açúcar, pela determinaçäo da distribuiçäo de ESTs nas diferentes bibliotecas de cDNA no projeto de transcriptoma SUCEST. Três vias de reparo - fotorreativaçäo, reparo por excisäo de bases e reparo por excisäo de nucleotídeos - foram estudadas através do uso de proteínas de reparo como sondas para identificaçäo de ESTs homólogos em cana-de-açúcar, com base na procura computacional de similaridade. Os resultados indicam que os genes de reparo de DNA possuem uma expressäo diferencial nos tecidos, dependendo da via de reparo analisada. Esses dados in silico fornecem importantes indícios da expressäo diferencial, a qual deve ser confirmada por análises bioquímicas diretas.