Sugarcane genes related to mitochondrial function
Genet. mol. biol
; 24(1/4): 175-181, 2001. ilus, tab
Article
in English
| LILACS
| ID: lil-313888
Responsible library:
BR26.1
RESUMO
A mitocôndria funciona como uma usina geradora metabólica por meio da fosforilaçäo oxidativa e tem sido alvo de um renovado interesse devido aos progressos no entendimento de sua biogênese e na descriçäo de novos papéis ligados à senescência, morte celular e montagem dos centros Fe/S. Uma análise global dos genes de planta ligados a esta organela é agora possível. A base de dados do projeto SUCEST foi examinada para detecçäo de ESTs com similaridade a genes nucleares relacionados às funções mitocondriais usando-se proteínas de Saccharomyces cerevisiae, Homo sapiens e Arabidopsis thaliana. Foram utilizadas 869 seqüências de proteínas para varrer o banco de ESTs do projeto SUCEST por meio do programa de busca de similaridade TBLASTN, sendo examinados 81.223 agrupamentos. Encontramos 367 agrupamentos com E-value>10-10 que representam os prováveis ortólogos em cana-de-açúcar dos genes correspondentes humanos, de levedura e de Arabidopsis. Encontramos produtos gênicos relacionados a todas as categorias funcionais ligados à atividade mitocondrial de maneira que este estudo serve de ponto de partida para a identificaçäo dos genes de cana-de-açúcar envolvidos na biogênese e funçäo da organela e para o estudo da estrutura e fisiologia destes genes.
Full text:
Available
Collection:
International databases
Database:
LILACS
Main subject:
Plants
/
Expressed Sequence Tags
/
Mitochondria
Limits:
Humans
Language:
English
Journal:
Genet. mol. biol
Journal subject:
Genetics
Year:
2001
Document type:
Article
/
Project document
Affiliation country:
Brazil
Institution/Affiliation country:
UNIVAP/BR