Optimization of randomly amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction for molecular typing of Salmonella enterica serovar Typhi
Rev. Soc. Bras. Med. Trop
; 37(2): 143-147, mar. 2004. ilus, tab
Article
in English
| LILACS
| ID: lil-357440
Responsible library:
BR1.1
RESUMO
A otimização da reação de RAPD para a caracterização de cepas de Salmonella enterica sorovar Typhi foi estudada com o objetivo de assegurar a reprodutibilidade e o poder discriminatório desta técnica. Oito cepas de Salmonella sorovar Typhi isoladas de algumas regiões do Brasil foram usadas para examinar os padrões de fragmentação produzidos quando foram empregadas concentrações diferentes do DNA molde, do iniciador, do MgCl2 e da enzima Taq DNA polimerase. Com a utilização de dois diferentes perfis de ciclos termais de baixa estringência, foram comparados os padrões de bandeamento obtidos. Um conjunto de dezesseis iniciadores foi avaliado quanto à capacidade de produzir elevado número de fragmentos distintos. Observou-se que variações associadas a todos os parâmetros testados modificaram os padrões de bandeamento. Para as amostras de Salmonella enterica sorovar Typhi utilizadas neste experimento, definiu-se um conjunto de condições para a reação de RAPD-PCR que resultou num método de tipagem simples, rápido e reprodutível.
Full text:
Available
Collection:
International databases
Health context:
Neglected Diseases
Health problem:
Neglected Diseases
/
Zoonoses
Database:
LILACS
Main subject:
DNA, Bacterial
/
Bacterial Typing Techniques
/
Salmonella enterica
Type of study:
Controlled clinical trial
Limits:
Humans
Country/Region as subject:
South America
/
Brazil
Language:
English
Journal:
Rev. Soc. Bras. Med. Trop
Journal subject:
Tropical Medicine
Year:
2004
Document type:
Article
Affiliation country:
Brazil
Institution/Affiliation country:
Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães/BR
/
Fundação Oswaldo Cruz/BR