Quantitative analysis of Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) microbial community profiles: peak height data showed to be more reproducible than peak area / Análise quantitativa de perfis de T-RFLP de comunidades microbianas: dados de altura de picos mostraram-se mais reprodutíveis do que os de área

ABSTRACT

Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) is a culture-independent fingerprinting method for microbial community analysis. Profiles generated by an automated electrophoresis system can be analysed quantitatively using either peak height or peak area data. Statistical testing demontrated that peak height data showed to be more reproducible than peak area data.

RESUMO

Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism (T-RFLP) é um método molecular, independente de cultivo, para análise de comunidades microbianas. Perfis gerados por um sistema automatizado de eletroforese podem ser analisados quantitativamente usando dados de altura ou área dos picos. Os dados de altura mostraram-se mais reprodutíveis do que os de área.