Mapeo computacional de epítopos de células B presentes en el virus del dengue / B-cell epitopes mapping of dengue virus
Rev. Inst. Nac. Hig
; 44(1): 25-29, jun. 2013. tab
Article
in Es
| LILACS, LIVECS
| ID: lil-740429
Responsible library:
VE9.1
RESUMEN
Dengue es una infección viral de importancia en salud pública. El desarrollo de una vacuna va a depender del conocimiento de aquello epítopos que neutralicen la infección y por ello, se generaron e identificaron computacionalmente aquellos epítopos lineales consenso de células B presentes en el virus del dengue, a partir de los datos depositados en la base de datos Immune Epitope Database (IEDB). Posteriormente, se agruparon en bloques de ocho aminoácidos por cada serotipo mediante el programa Nomad, y cada uno de ellos fue reevaluado con el programa BepiPred para determinar su antigenicidad. Se lograron postular 172 de los 1.239 obtenidos en la IEDB.
ABSTRACT
Dengue virus has emerged as a major public health problem. An epitope-based approach to the development of vaccines, and for this reason, based on Immune Epitope Database database (IEDB), linear consensus B-cell epitopes were computationally generated and identified from dengue virus. Then, amino acids were grouped into blocks of eight amino acids per serotype through Nomad program. Each block was evaluated using BepiPred for determining antigenic prediction. 172 out of 1239 were obtained from IEDB.
Key words
Full text:
1
Collection:
01-internacional
Database:
LILACS
/
LIVECS
Main subject:
Vaccines
/
Computational Biology
/
Aedes
/
Immune System
/
Epitopes
Type of study:
Evaluation_studies
/
Prognostic_studies
Limits:
Female
/
Humans
/
Male
Language:
Es
Journal:
Rev. Inst. Nac. Hig
Journal subject:
SAUDE PUBLICA
Year:
2013
Document type:
Article
Affiliation country:
Venezuela
Country of publication:
Venezuela