An in silico data mining of the ammonium transporter gene family in Ananas comosus L / Uma mineração de dados in silico da família do gene transportador de amônio em Ananas comosus L

ABSTRACT

Arguably, the nitrogen (N) is an important and essential component for plant growth and development. Among the sources of N available, the ammonium is a major inorganic nitrogen source for plants is mobilized by ammonium transporter (AMT). In this study, data mining revealed that the Ananas comosus L. genome was identified eight genes of the AMT family. Based on this information, we conducted a comprehensive analysis using some bioinformatics tools in order to individually characterize the identified genes. The comprehensive analysis of AMT will provide an important foundation for further investigation of the regulatory mechanisms of AcoAMTs in A. comosus L.

RESUMO

Indiscutivelmente, o nitrogênio (N) é um componente importante e essencial para o crescimento e desenvolvimento das plantas. Dentre as fontes de N disponíveis, o amônio é a principal fonte de nitrogênio inorgânico para as plantas, sendo mobilizado pelo transportador de amônio (AMT). Neste estudo, a mineração de dados revelou que no genoma de Ananas comosus L. foram identificados oito genes da família AMT. Com base nessas informações, realizamos uma análise abrangente usando algumas ferramentas de bionformática com a finalidade de caracterizar individualmente os genes identificados. A análise abrangente do AMT fornecerá uma base importante para uma investigação mais aprofundada dos mecanismos regulatórios de AcoAMTs em A. comosus L.