Protein-ligand pose and affinity prediction: Lessons from D3R Grand Challenge 3.

Koukos, Panagiotis I; Xue, Li C; Bonvin, Alexandre M J J

Koukos, Panagiotis I; Xue, Li C; Bonvin, Alexandre M J J.

Afiliación

Koukos PI; Bijvoet Center for Biomolecular Research, Faculty of Science - Chemistry, Utrecht University, Padualaan 8, 3584 CH, Utrecht, The Netherlands.
Xue LC; Bijvoet Center for Biomolecular Research, Faculty of Science - Chemistry, Utrecht University, Padualaan 8, 3584 CH, Utrecht, The Netherlands.
Bonvin AMJJ; Bijvoet Center for Biomolecular Research, Faculty of Science - Chemistry, Utrecht University, Padualaan 8, 3584 CH, Utrecht, The Netherlands. a.m.j.j.bonvin@uu.nl.

J Comput Aided Mol Des ; 33(1): 83-91, 2019 01.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30128928

Asunto(s)

Catepsinas/química; Simulación del Acoplamiento Molecular/métodos; Proteínas Quinasas/química; Sitios de Unión; Diseño Asistido por Computadora; Cristalografía por Rayos X; Bases de Datos de Proteínas; Diseño de Fármacos; Ligandos; Conformación Molecular; Unión Proteica; Termodinámica

Palabras clave

Binding affinity; D3R; Docking; Drug Design Data Resource; HADDOCK; Ranking

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas Quinasas / Catepsinas / Simulación del Acoplamiento Molecular Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: J Comput Aided Mol Des Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / ENGENHARIA BIOMEDICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Países Bajos

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