iSEE: Interface structure, evolution, and energy-based machine learning predictor of binding affinity changes upon mutations.

Geng, Cunliang; Vangone, Anna; Folkers, Gert E; Xue, Li C; Bonvin, Alexandre M J J

Geng, Cunliang; Vangone, Anna; Folkers, Gert E; Xue, Li C; Bonvin, Alexandre M J J.

Afiliación

Geng C; Bijvoet Center for Biomolecular Research, Faculty of Science - Chemistry, Utrecht University, Utrecht, The Netherlands.
Vangone A; Bijvoet Center for Biomolecular Research, Faculty of Science - Chemistry, Utrecht University, Utrecht, The Netherlands.
Folkers GE; Roche Pharmaceutical Research and Early Development, Large Molecule Research, Roche Innovation Center Penzberg, Penzberg, Germany.
Xue LC; Bijvoet Center for Biomolecular Research, Faculty of Science - Chemistry, Utrecht University, Utrecht, The Netherlands.
Bonvin AMJJ; Bijvoet Center for Biomolecular Research, Faculty of Science - Chemistry, Utrecht University, Utrecht, The Netherlands.

Proteins ; 87(2): 110-119, 2019 02.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-30417935

Asunto(s)

Biología Computacional/métodos; Aprendizaje Automático; Mutación; Proteínas/genética; Unión Competitiva; Evolución Molecular; Modelos Moleculares; Unión Proteica; Dominios Proteicos; Proteínas/química; Proteínas/metabolismo; Proteínas Proto-Oncogénicas c-mdm2/química; Proteínas Proto-Oncogénicas c-mdm2/genética; Proteínas Proto-Oncogénicas c-mdm2/metabolismo; Termodinámica; Proteína p53 Supresora de Tumor/química; Proteína p53 Supresora de Tumor/genética; Proteína p53 Supresora de Tumor/metabolismo

Palabras clave

binding affinity; full mutation scanning; machine learning; protein-protein interactions; single point mutation

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Proteínas / Biología Computacional / Aprendizaje Automático / Mutación Tipo de estudio: Clinical_trials / Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Proteins Asunto de la revista: BIOQUIMICA Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Países Bajos Pais de publicación: Estados Unidos

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