Amplified fragment length polymorphism and whole genome sequencing: a comparison of methods in the investigation of a nosocomial outbreak with vancomycin resistant enterococci.

Janes, Victoria A; Notermans, Daan W; Spijkerman, Ingrid J B; Visser, Caroline E; Jakobs, Marja E; van Houdt, Robin; Willems, Rob J L; de Jong, Menno D; Schultsz, Constance; Matamoros, Sébastien

Janes, Victoria A; Notermans, Daan W; Spijkerman, Ingrid J B; Visser, Caroline E; Jakobs, Marja E; van Houdt, Robin; Willems, Rob J L; de Jong, Menno D; Schultsz, Constance; Matamoros, Sébastien.

Afiliación

Janes VA; 1Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Medical Microbiology, Amsterdam, The Netherlands.
Notermans DW; 1Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Medical Microbiology, Amsterdam, The Netherlands.
Spijkerman IJB; 1Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Medical Microbiology, Amsterdam, The Netherlands.
Visser CE; 1Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Medical Microbiology, Amsterdam, The Netherlands.
Jakobs ME; 2Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Clinical Genetics, Core Facility Genomics, Amsterdam, The Netherlands.
van Houdt R; 3Amsterdam UMC, Vrije Universiteit, Medical Microbiology, Amsterdam, The Netherlands.
Willems RJL; 4Department of Medical Microbiology, University Medical Center Utrecht, Utrecht, The Netherlands.
de Jong MD; 1Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Medical Microbiology, Amsterdam, The Netherlands.
Schultsz C; 1Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Medical Microbiology, Amsterdam, The Netherlands.
Matamoros S; 5Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Global Health - Amsterdam Institute for Global Health and Development (AIGHD), Amsterdam, The Netherlands.

Antimicrob Resist Infect Control ; 8: 153, 2019.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31572571

Asunto(s)

Análisis del Polimorfismo de Longitud de Fragmentos Amplificados/métodos; Infección Hospitalaria/microbiología; Infecciones por Bacterias Grampositivas/diagnóstico; Enterococos Resistentes a la Vancomicina/aislamiento & purificación; Secuenciación Completa del Genoma/métodos; Proteínas Bacterianas/genética; Portador Sano/diagnóstico; Portador Sano/microbiología; Análisis por Conglomerados; Brotes de Enfermedades; Enterococcus faecium/clasificación; Enterococcus faecium/genética; Enterococcus faecium/aislamiento & purificación; Genoma Bacteriano; Humanos; Tipificación Molecular; Filogenia; Polimorfismo de Nucleótido Simple; Estudios Retrospectivos; Centros de Atención Terciaria; Factores de Tiempo; Enterococos Resistentes a la Vancomicina/clasificación; Enterococos Resistentes a la Vancomicina/genética

Palabras clave

AFLP; Molecular typing; Nosocomial outbreak; VRE; WGS

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Infección Hospitalaria / Infecciones por Bacterias Grampositivas / Análisis del Polimorfismo de Longitud de Fragmentos Amplificados / Enterococos Resistentes a la Vancomicina / Secuenciación Completa del Genoma Tipo de estudio: Diagnostic_studies / Observational_studies / Risk_factors_studies Límite: Humans Idioma: En Revista: Antimicrob Resist Infect Control Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Países Bajos Pais de publicación: Reino Unido

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