PAT-Seq: A Method for Simultaneous Quantitation of Gene Expression, Poly(A)-Site Selection and Poly(A)-Length Distribution in Yeast Transcriptomes.

Swaminathan, Angavai; Harrison, Paul F; Preiss, Thomas; Beilharz, Traude H

Swaminathan, Angavai; Harrison, Paul F; Preiss, Thomas; Beilharz, Traude H.

Afiliación

Swaminathan A; Development and Stem Cells Program, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Monash Biomedicine Discovery Institute, Monash University, Melbourne, VIC, Australia.
Harrison PF; Monash Bioinformatics Platform, Monash University, Melbourne, VIC, Australia.
Preiss T; Department of Genome Sciences, The John Curtin School of Medical Research, The Australian National University, Canberra, ACT, Australia.
Beilharz TH; Victor Chang Cardiac Research Institute, Darlinghurst, NSW, Australia.

Methods Mol Biol ; 2049: 141-164, 2019.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-31602610

Asunto(s)

Poli A/metabolismo; Saccharomyces cerevisiae/genética; Saccharomyces cerevisiae/metabolismo; Transcriptoma/genética; Perfilación de la Expresión Génica; Secuenciación de Nucleótidos de Alto Rendimiento; Poli A/genética; Poliadenilación; Análisis de Secuencia de ARN

Palabras clave

Alternative polyadenylation; Digital gene expression; PAT assay; Poly(A)-tail; RNA-seq; ePAT

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Poli A / Saccharomyces cerevisiae / Transcriptoma Idioma: En Revista: Methods Mol Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR Año: 2019 Tipo del documento: Article País de afiliación: Australia Pais de publicación: Estados Unidos

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