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Molecular characterization of Epstein-Barr virus variants detected in the oral cavity of adolescents in Cali, Colombia / [Caracterización molecular de las variantes del virus de Epstein-Barr detectadas en la cavidad oral de adolescentes de Cali, Colombia].
Arturo-Terranova, Daniela; Giraldo-Ocampo, Sebastián; Castillo, Andrés.
Afiliación
  • Arturo-Terranova D; Departamento de Biología, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad del Valle, Cali, Colombia; Posgrado en Ciencias Biomédicas, Escuela de Ciencias Básicas, Facultad de Salud, Universidad del Valle, Cali, Colombia. daniela.arturo@correounivalle.edu.co.
  • Giraldo-Ocampo S; Posgrado en Ciencias Biomédicas, Escuela de Ciencias Básicas, Facultad de Salud, Universidad del Valle, Cali, Colombia. sebastian.giraldo.ocampo@correounivalle.edu.co.
  • Castillo A; Departamento de Biología, Facultad de Ciencias Naturales y Exactas, Universidad del Valle, Cali, Colombia. andres.castillo.g@correounivalle.edu.co.
Biomedica ; 40(Supl. 1): 76-88, 2020 05 01.
Article en En, Es | MEDLINE | ID: mdl-32463610
RESUMEN
Introducción. El virus de Epstein-Barr (EBV) es un virus ubicuo y oncogénico, asociado con el desarrollo de enfermedades como la mononucleosis infecciosa, el linfoma de Burkitt, el carcinoma nasofaríngeo y otras neoplasias. Actualmente, se reconocen dos subtipos: EBV-1 y EBV- 2, que tienen diferencias genéticas con sus antígenos nucleares (Epstein-Barr Nuclear Antigens, EBNA). Debido a la gran heterogeneidad y variabilidad encontradas en la proteína LMP1 del virus, se han descrito variantes asociadas con ciertas enfermedades o con regiones geográficas específicas. Objetivo. Identificar y caracterizar molecularmente las variantes del EBV detectadas en la cavidad oral de 84 adolescentes de Cali, Colombia. Materiales y métodos. Se hizo la amplificación por reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase Chain Reaction, PCR) convencional, así como la purificación y la secuenciación del gen EBNA3C se realizó para subtipificar el virus y del dominio C-ter de la proteína LMP1 para identificar variantes. Además, se llevó a cabo un análisis filogenético y de variantes nucleotídicas de las secuencias obtenidas comparadas con variantes patogénicas y geográficas reportadas en el GenBank (National Center for Biotechnology Information, NCBI). Resultados. El subtipo viral predominante fue el EBV-1 (79 %); el 72,6 % se agrupó con la variante patogénica Raji, derivada de linfocitos B de un paciente con linfoma de Burkitt; el 13,7 % se relacionó con una variante de origen geográfico del Mediterráneo y otro 13,7 % no se agrupó con ninguna de las variantes de referencia. Conclusiones. Este es el primer estudio que reporta variantes del gen LMP1-EBV en Cali, Colombia. Se requieren nuevos estudios para caracterizar la variante sin identificar y determinar si es patogénica o si es una variante geográfica presente exclusivamente en la ciudad.
Asunto(s)
Palabras clave

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Herpesvirus Humano 4 / Boca Límite: Adolescent / Humans País/Región como asunto: America do sul / Colombia Idioma: En / Es Revista: Biomedica Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Colombia Pais de publicación: Colombia

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Herpesvirus Humano 4 / Boca Límite: Adolescent / Humans País/Región como asunto: America do sul / Colombia Idioma: En / Es Revista: Biomedica Año: 2020 Tipo del documento: Article País de afiliación: Colombia Pais de publicación: Colombia