PPred-PCKSM: A multi-layer predictor for identifying promoter and its variants using position based features.

Bhukya, Raju; Kumari, Archana; Amilpur, Santhosh; Dasari, Chandra Mohan

Bhukya, Raju; Kumari, Archana; Amilpur, Santhosh; Dasari, Chandra Mohan.

Afiliación

Bhukya R; National Institute of Technology, Warangal, Telangana 506004, India.
Kumari A; National Institute of Technology, Warangal, Telangana 506004, India. Electronic address: kumari_cs19132@student.nitw.ac.in.
Amilpur S; National Institute of Technology, Warangal, Telangana 506004, India. Electronic address: santosh0511@student.nitw.ac.in.
Dasari CM; VIT-AP University, Amaravati, Andhra Pradesh 522237, India. Electronic address: chandu.nitw44@gmail.com.

Comput Biol Chem ; 97: 107623, 2022 Apr.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35065417

Asunto(s)

ARN Polimerasas Dirigidas por ADN; Factor sigma; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/genética; ARN Polimerasas Dirigidas por ADN/metabolismo; Escherichia coli/genética; Escherichia coli/metabolismo; Regiones Promotoras Genéticas/genética; Factor sigma/genética; Factor sigma/metabolismo; Transcripción Genética

Palabras clave

Artificial neural network; Gene regulation; Machine learning; Position-correlation based k-mer scoring matrix (PCKSM); Promoters; Sigma factors

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Factor sigma / ARN Polimerasas Dirigidas por ADN Tipo de estudio: Prognostic_studies / Risk_factors_studies Idioma: En Revista: Comput Biol Chem Asunto de la revista: BIOLOGIA / INFORMATICA MEDICA / QUIMICA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: India Pais de publicación: Reino Unido

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