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Genomic analyses of ciprofloxacin-resistant Neisseria gonorrhoeae isolates recovered from the largest South American metropolitan area.
Cassu-Corsi, Dandara; Santos, Fernanda F; Cayô, Rodrigo; Martins, Willames M B S; Nodari, Carolina S; Almeida, Luiz G P; Martins, Rafael A; Carvalho da Silva, Roberto J; Vasconcelos, Ana Tereza R; Pignatari, Antônio C C; Gales, Ana C.
Afiliación
  • Cassu-Corsi D; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil; Programa de Pós Graduação em Medicina Translacional, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo
  • Santos FF; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil. Electronic address: ff.santos@unifesp.br.
  • Cayô R; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório de Bacteriologia e Imunologia (LIB), Setor de Biologia Molecular,
  • Martins WMBS; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil.
  • Nodari CS; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil.
  • Almeida LGP; Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC), Petrópolis, RJ, Brazil.
  • Martins RA; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil.
  • Carvalho da Silva RJ; Centro de Referência e Treinamento de Doenças Sexualmente Transmissíveis (CRT/AIDS), São Paulo, SP, Brazil.
  • Vasconcelos ATR; Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC), Petrópolis, RJ, Brazil.
  • Pignatari ACC; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório Especial de Microbiologia Clínica (LEMC), Disciplina de Infectolog
  • Gales AC; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório ALERTA, Disciplina de Infectologia, Departamento de Medicina, Escola Paulista de Medicina (EPM), São Paulo, SP, Brazil; Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP), Laboratório Especial de Microbiologia Clínica (LEMC), Disciplina de Infectolog
Genomics ; 114(2): 110287, 2022 03.
Article en En | MEDLINE | ID: mdl-35131478
We sequenced 13 Neisseria gonorrhoeae isolates exhibiting distinct susceptibility profiles and which were recovered over 12 years in the metropolitan region of São Paulo, Brazil. Whole Genome Sequencing (WGS) was performed on an Illumina MiSeq™ 2 × 300 bp paired-end reads. Bioinformatics analyses were carried out using CGE, PATRIC, and BLAST databases for manual curation of obtained genomes. Multilocus sequence typing (MLST) analysis identified seven STs, namely ST1580, ST1590, ST1901, ST1902, ST8161, ST9363, and ST15640. Moreover, a diversity of mutations was observed in MtrR/G45D-A39T, PIB/G120K-A121S, and PBP1/L421P. Mutations associated with sulfonamides (DHPS/R228S) and rifampicin (RNAP/H552N) were also detected, as well as tetracycline resistance determinants, namely rpsJ/V57M and tet(M). The results presented herein can contribute to the knowledge of N. gonorrhoeae strains circulating in Sao Paulo, Brazil.
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Gonorrea / Neisseria gonorrhoeae Límite: Humans País/Región como asunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2022 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Estados Unidos
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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Gonorrea / Neisseria gonorrhoeae Límite: Humans País/Región como asunto: America do sul / Brasil Idioma: En Revista: Genomics Asunto de la revista: GENETICA Año: 2022 Tipo del documento: Article Pais de publicación: Estados Unidos