Clustering Deviation Index (CDI): a robust and accurate internal measure for evaluating scRNA-seq data clustering.

Fang, Jiyuan; Chan, Cliburn; Owzar, Kouros; Wang, Liuyang; Qin, Diyuan; Li, Qi-Jing; Xie, Jichun

Fang, Jiyuan; Chan, Cliburn; Owzar, Kouros; Wang, Liuyang; Qin, Diyuan; Li, Qi-Jing; Xie, Jichun.

Afiliación

Fang J; Department of Biostatistics and Bioinformatics, Duke University School of Medicine, Durham, USA.
Chan C; Center for Human Systems Immunology, School of Medicine, Duke University, Durham, USA.
Owzar K; Department of Biostatistics and Bioinformatics, Duke University School of Medicine, Durham, USA.
Wang L; Center for Human Systems Immunology, School of Medicine, Duke University, Durham, USA.
Qin D; Department of Biostatistics and Bioinformatics, Duke University School of Medicine, Durham, USA.
Li QJ; Center for Human Systems Immunology, School of Medicine, Duke University, Durham, USA.
Xie J; Department of Molecular Genetics and Microbiology, School of Medicine, Duke University, Durham, USA.

Genome Biol ; 23(1): 269, 2022 12 27.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-36575517

Asunto(s)

Algoritmos; Perfilación de la Expresión Génica; Perfilación de la Expresión Génica/métodos; Análisis de Secuencia de ARN/métodos; Análisis de Expresión Génica de una Sola Célula; Análisis de la Célula Individual/métodos; Análisis por Conglomerados

Palabras clave

Assessment; Clustering; RNA-sequencing; Single-cell

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Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Algoritmos / Perfilación de la Expresión Génica Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2022 Tipo del documento: Article País de afiliación: Estados Unidos Pais de publicación: Reino Unido

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