GET_PANGENES: calling pangenes from plant genome alignments confirms presence-absence variation.

Contreras-Moreira, Bruno; Saraf, Shradha; Naamati, Guy; Casas, Ana M; Amberkar, Sandeep S; Flicek, Paul; Jones, Andrew R; Dyer, Sarah

Contreras-Moreira, Bruno; Saraf, Shradha; Naamati, Guy; Casas, Ana M; Amberkar, Sandeep S; Flicek, Paul; Jones, Andrew R; Dyer, Sarah.

Afiliación

Contreras-Moreira B; European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Hinxton, UK. bcontreras@eead.csic.es.
Saraf S; Estación Experimental Aula Dei-CSIC, 50059, Zaragoza, Spain. bcontreras@eead.csic.es.
Naamati G; European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Hinxton, UK.
Casas AM; European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Hinxton, UK.
Amberkar SS; Estación Experimental Aula Dei-CSIC, 50059, Zaragoza, Spain.
Flicek P; Institute of Systems, Molecular and Integrative Biology, University of Liverpool, Liverpool, UK.
Jones AR; European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Hinxton, UK.
Dyer S; Institute of Systems, Molecular and Integrative Biology, University of Liverpool, Liverpool, UK.

Genome Biol ; 24(1): 223, 2023 10 05.

Article en En | MEDLINE | ID: mdl-37798615

Asunto(s)

Genoma de Planta; Programas Informáticos

Palabras clave

Collinearity; Gene annotation; Pangene; Plant genome; Presence-absence variation; Whole genome alignment

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google

Texto completo: 1 Colección: 01-internacional Base de datos: MEDLINE Asunto principal: Programas Informáticos / Genoma de Planta Idioma: En Revista: Genome Biol Asunto de la revista: BIOLOGIA MOLECULAR / GENETICA Año: 2023 Tipo del documento: Article País de afiliación: Reino Unido Pais de publicación: Reino Unido

Texto completo

Añadir a Mi BVS

Imprimir

XML

PubMed Links

Buscar en Google