Asociación entre rotavirus y la presencia de diarrea en lechones de granjas tecnificadas / Association between rotavirus and the presence of diarrhea in piglets from intensive pig farms

RESUMEN

El objetivo del estudio fue cuantificar la frecuencia del rotavirus y su asociación con la presentación de diarrea en lechones de dos granjas tecnificadas en la zona de Lima. El rotavirus fue identificado mediante la detección del genoma viral por electroforesis en gel de poliacrilamida (PAGE) en muestras de heces diarreicas (n=69) y no diarreicas (n=73) de lechones de 1 a 4 semanas de edad. Se empleó el diseño epidemiológico caso-control no pareado para establecer la asociación entre presentación de diarrea y presencia de rotavirus en heces, a través de una prueba de regresión logística múltiple (tipo de heces, procedencia, edad). La frecuencia de rotavirus porcino grupo A en heces diarreicas de la granja 1 fue de 41.4% (12/29) y en la granja 2 de 16.6% (4/24), y en heces no diarreicas se detectó una muestra positiva en cada granja. La presencia de rotavirus porcino versus la ocurrencia de diarrea, ajustada a potenciales variables confundentes (edad y procedencia) presentó un Odds Ratio de 12.6 con un IC del 95% entre 2.7 y 59.3%, indicando que la presencia de rotavirus porcino representa un factor de riesgo para la ocurrencia de diarrea en lechones neonatos de granjas tecnificadas de la zona de Lima. Adicionalmente, se hallaron dos segmentos de ARN pertenecientes al genoma del Picobirnavirus porcino.

ABSTRACT

The objective of the study was to determine the frequency of rotavirus and its association with the occurrence of diarrhea in piglets reared in two intensive pig farms in Lima valley, Peru. The presence of rotavirus was determined by the identification of the viral genome using polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) in diarrheic (n=69) and non-diarrheic (n=73) fecal samples from 1 to 4 week-old piglets. The case-control epidemiological design was used to establish the association between the occurrence of diarrhea and the presence of rotavirus in feces, using a multiple logistic regression (type of feces, age, and origin). The frequency of porcine rotavirus group A in diarrheic stool samples from pig farm 1 was 41.4% (12/29) and from pig farm 2 was 16.6% (4/24), and one positive was found in non diarrheic stool from each pig farm. The presence of porcine rotavirus versus occurrence of diarrhea, adjusted to potential confusing variables (age and origin) resulted in an Odds Ratio of 12.6 with a confidence interval between 2.7 and 59.3%. Additionally, two segments of RNA from the genome of porcine Picobirnavirus were found. It is concluded that the presence of porcine rotavirus represents a risk factor for the presentation of diarrhea in newborn piglets from intensive pig farms in Lima.